SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 27
Descargar para leer sin conexión
Onko
kaksostutkimuksella
annettavaa geenitiedon
aikakaudella?
Geneettinen tulevaisuutemme
8.12.2015
Jaakko Kaprio
HY ja THL
Ympäristö vai geenit?
• Periytyykö?
Kuolleisuuden muutokset Suomessa
Keski-ikäisten miesten ikävakioitu kuolleisuus 100 000 tuhatta kohti
PKP laajeni
P Karjala Projekti alkoi
PK -85%
Koko maa -80%
Kuolleisuus per 100 000
1969-
1971
2006 Muutos
1969-1971
vuoteen
2006
Kokonais-
kuolleisuus
1328 583 -56%
SVT 680 172 -75%
Sepelvaltimo-
tauti
489 103 -79%
Kaikki syövät 262 124 -53%
Sepelvaltimotauti
Miesten elinajan odote kasvanut noin
20v sodan jälkeen; geenit eivät selitä
sitä
17.12.2015 Pekka Puska, Director General
Tupakoiva, runsaasti juova ammattitaidoton mies elää
19v vähemmän kuin tupakoimaton, raitis tai vähän
juova johtavassa asemassa oleva mies
15 797 miestä,
seurattu 35,7 v
vuodesta 1976
Elinajan-
odotteet ovat
68v ja 87v
Ympäristö vai geenit?
• Periytyykö?
• Jos niin, miten
Yhden perheen sukupuu
ominaisuus jonka ilmaantuvuus on 2,2/100 000
Kaksosuus/Monisikiöisyys
• Pohjoismaissa hyvät rekisterit jo 1600-luvulta
(www.genealogia.fi)
• Alan klassikko on prof. Aldur Eriksson
väitöskirja vuodelta 1973 ”Human twinning in
and around the Åland islands”
012345
Kolmossynnytyksiper10000
05
101520
Kaksossynnytyksetper1000
1960 1970 1980 1990 2000 2010
Vuosi
1900-luvun alusta 1970-luvulle Suomessa ja
muissa teollistuneissa maissa ilmaantuvuus
lievästi laskeva.
Voimakas nousu 1980-luvulla (sinisenä
kaksoset ja punaisena kolmoset)
Monotsygoottiset eli samanmunaiset identtiset
kaksoset
• varhainen jakautuminen 1-3
vrk - erilliset vesi- ja
suonikalvot (30%)
• 4-8 vrk yhteinen suonikalvo
(68%)
• > 8 vrk yhteinen vesikalvo
(2%)
• > 14 vrk yhteenkasvaminen
Ditsygoottiset eli erimunaiset, ei-
identtiset kaksoset
• samanaikainen kahden munasolun
hedelmöittyminen
• erilliset suoni- ja vesikalvot
• Englanniksi dizygotic (DZ), joskus näkee
’fraternal’
• Poika-poika, tyttö-tyttö ja poika-tyttö parien
odotusarvot on noin 1:1:2
Ovatko kaksoset erilaisia kuin
yksöset?
• Syntyvät pienempinä, mutta aikuisina ei ole enää eroa
• Käyttäytymisen osalta ei eroa (Pulkkinen ym, Twin Research
2003) – verrattiin 1874 11-12v kaksosta ja heidän 23 200
luokkatoveria Kaksosten Kehitys ja Terveys-tutkimuksessa
• Kaksosten vuorovaikutuksessa nuoruudessa eroa koska heillä
samanikäinen sisarus (FT Varpu Penninkilampi-Kerolan
väitöskirja 2006)
• Syöpäilmaantuvuus ja kuolleisuus aikuisilla suomalaisilla
kaksosilla ei eroa väestöstä.
Mortality (three year moving average) among twins, and the general population in Denmark,
age 6-89 years.
Christensen K et al. BMJ 1995;310:432-436
©1995 by British Medical Journal Publishing Group
Aikuisiän
sairastuvuudessa ja
kuolleisuudessa ei
ole eroa kaksosten
ja yksösten välillä
Sama tulos saatu Ruotsissa kokonaiskuolleisuuden osalta kun verrataan kaksosia saman perheen muihin
sisaruksiin ja perheisiin joissa vain yksi lapsi.
Perimän merkityksen arviointi
kaksostutkimuksen avulla
Perimän merkityksen
arvioiminen
kaksostutkimuksen avulla
Monotsygoottiparit (monozygotic - MZ) muodostuvat alunperin yhdestä
hedelmöittyneestä munasolusta, joka jakautuu raskauden alussa
Monotsygoottiparin kaksoset ovat perimältään identtisiä eli heidän genominsa
sekvenssi on sama
Erot MZ kaksosten välillä eivät johdu geeneistä
DZ-kaksoset ovat geneettisesti sisaruksia
DZ-parit voivat olla samaa tai eri sukupuolta
MZ-parien suurempi samankaltaisuus taudin tai ominaisuuden suhteen verrattuna
DZ-pareihin verrattuna viittaa perimän vaikutuksesta
MZ/DZ vertailun avulla voidaan arvioida:
 perimän osuutta
 yhteisten ulkoisten tekijöiden merkitystä
Mitä ‘geenien osuus’ tarkoittaa?
Yksilöiden välisten geneettisten erojen osuus
väestön sairausriskin kokonaisvaihtelusta
Geenien osuus on abstraktio (kuten taudin
ilmaantuvuus tai kuolevuus)
Se on tutkitun väestön, ei yksilöiden ominaisuus
Sillä ei ole yhtä tai oikeata arvoa, vaan se voi
vaihdella ajan ja väestön muiden ominaisuuksien
mukaan
englanniksi ’heritability’
Perimän osuuden arvionti
polkumallin avulla
Twin 1 Twin 2
A1 A2C1 C2E1 E2
1.0 (MZ) / .5 (DZ) 1.0
rMZ = a*a + c*c
rDZ = 0.5*a*a + c*c
Yksinkertaistaen
a2 = 2(rMZ- rDZ)
Eli 2*(0.78 – 0.37)
= 2* .41
= .82
Jossa ’a’ on perimän
(A1 tai A2)
polkukerroin
ilmiasuun (Twin1 tai
Twin 2)
a2
m:0.20
f:0.47
c2
m:0.42
f:0.18
e2
m:0.39
f:0.35
a2
m:0.84
f:0.90
e2
m:0.16
f:0.10
PI at birth BMI at 16 y
r
m: 0.11, f: 0.09
re m: 0.16, f: 0.07
Twin 1
Variable 1
A A A AC C C CE E E E
1.0 (0.5) 1.0 1.0 (0.5) 1.0
Twin 1
Variable 2
Twin 2
Variable 1
Twin 2
Variable 2
ra
rc re ra rc re
Monimuuttuja-analyysin avulla osoitetaan
että syntymäpainon ja nuoruusiän
lihavuuden yhteys johtuu mm. yhteisistä
geeneistä
(Pietiläinen et al, Obes Res 2002)
ra m: 0.21, f: 0.13
FinnTwin16
2015
Syövän perimäosuuksien arviointi
0,0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
Heritability(95%CI)
Cancer Site or Type
• Yhteensä 104 251 naista mukana
• Seuranta-aika 32 v
• Rintasyövän elinaikainen riski 9.4%
• Identtiset parit:
– 124 molemmilla
– 1175 vain toisella
– Pareittainen riski 28.1%
• Epäidenttiset parit:
– 141 molemmilla
– 2223 toisella
– Pareittainen riski 20%
• Periytyvyysarvio:
– 31% (95%LV 11-51)
– V2000 27%
• Yhteisten ympäristötekijöiden osuus:
– 16% (0-31%)
Mucci LA, Hjelmborg JB, Harris JR, Czene K, Havelick DJ, Scheike T, Graff RE, Holst K, Möller S,
Unger RH, McIntosh C, Nuttall E, Brandt I, Penney KL, Hartman M, Kraft P, Parmigiani G,
Christensen K, Koskenvuo M, Holm NV, Heikkilä K, Pukkala E, Skytthe A, Adami H-O, Kaprio J :
Familial risk and heritability of cancer among twins in the Nordic countries. JAMA (in press).
Geeni-ympäristö
vuorovaikutukset
Liikunta muokkaa perimän osuutta lihavuudessa
Mustelin L et al, Int J Obes 2009 (based on Finntwin16 adults). Toistettu useasti
(Vietnam Era vets – MaCaffery et al, AJCN 2009, & FinnTwin12, Geminakar -
Silventoinen et al, AJCN 2009)
0
20406080
100
Heritability%
Low Medium High
Leisure time physical activity
Sukupuolierojen synnystä
• Biologiset syyt
• Raskaudenaikaiset vaikutukset –
testosteronille altistumisen hypoteesi
• Sosiaaliset syyt kasvun aikana
• Verrataan erisukupuolta olevien kaksosparien
naisia ja samaa sukupuolta olevien parien
naisia – vaikuttaako kaksosveli?
Mental Rotation Test (MRT)
Miehet suoriutuvat paremmin
Fig. 1. Mean mental rotation test scores (with 95% confidence intervals) for females and
males from same-sex and opposite-sex twin pairs.
Vuoksimaa E et al. Psychological Science 2010;21:1069-
1071
Copyright © by Association for Psychological Science
Perimän vaikutuksen vakioiminen – taudin
tai ominaisuuden suhteen diskordantit parit
Twin A
Twin B
centile
Lihavuuteen liittyvät metabolian
muutokset näkyvät jo varhain
Naukkarinen J, Rissanen A, Kaprio J, Pietiläinen KH. Causes and consequences of obesity:
the contribution of recent twin studies. Int J Obes (Lond). 2011 Oct 11. doi: 10.1038/ijo.2011.192. [Epub ahead of print]
Alkoholinkäyttö (vuosien 1975 ja 1981 kyselyjen perusteella ) ja
kuolleisuus 1981-2011. N= 14,787 24-60 vuotiasta tervettä aikuista
kaksoskohortista.
Sipilä P, Rose RJ ja Kaprio J, Addiction 2015

Más contenido relacionado

Destacado

Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
Andreu Paytuví
 

Destacado (9)

Active information in quantum physics, biology and beyond. Argumenta lecture
Active information in quantum physics, biology and beyond. Argumenta lectureActive information in quantum physics, biology and beyond. Argumenta lecture
Active information in quantum physics, biology and beyond. Argumenta lecture
 
9 5-2014 pgs prevention connect
9 5-2014 pgs prevention connect9 5-2014 pgs prevention connect
9 5-2014 pgs prevention connect
 
PGS-NGS 360°™
PGS-NGS 360°™PGS-NGS 360°™
PGS-NGS 360°™
 
Organelle DNA
Organelle DNAOrganelle DNA
Organelle DNA
 
Mitochondrial dna
Mitochondrial dnaMitochondrial dna
Mitochondrial dna
 
Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
Application of NGS technologies to Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD)
 
Mitochondrial dna
Mitochondrial dnaMitochondrial dna
Mitochondrial dna
 
Next generation sequencing in preimplantation genetic screening (NGS in PGS)
Next generation sequencing in preimplantation genetic screening (NGS in PGS)Next generation sequencing in preimplantation genetic screening (NGS in PGS)
Next generation sequencing in preimplantation genetic screening (NGS in PGS)
 
NGS - Basic principles and sequencing platforms
NGS - Basic principles and sequencing platformsNGS - Basic principles and sequencing platforms
NGS - Basic principles and sequencing platforms
 

Similar a Geneettinen_tulevaisuutemme_8.12.JaakkoKaprio

Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudetProteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
Reijo Laatikainen
 

Similar a Geneettinen_tulevaisuutemme_8.12.JaakkoKaprio (9)

Ruokavalio ja sydän- ja verisuonisairaudet Suomessa
Ruokavalio ja sydän- ja verisuonisairaudet SuomessaRuokavalio ja sydän- ja verisuonisairaudet Suomessa
Ruokavalio ja sydän- ja verisuonisairaudet Suomessa
 
Genetiikanopetuksesta seminaari110313
Genetiikanopetuksesta seminaari110313Genetiikanopetuksesta seminaari110313
Genetiikanopetuksesta seminaari110313
 
Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudetProteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
Proteiinipitoiset ruuat ja vakavat sairaudet
 
Hyvinvoinnin ja terveyden maantiede
Hyvinvoinnin ja terveyden maantiedeHyvinvoinnin ja terveyden maantiede
Hyvinvoinnin ja terveyden maantiede
 
Lasten ja nuorten urheiluvammojen yleisyys. Mari Leppänen
Lasten ja nuorten urheiluvammojen yleisyys. Mari LeppänenLasten ja nuorten urheiluvammojen yleisyys. Mari Leppänen
Lasten ja nuorten urheiluvammojen yleisyys. Mari Leppänen
 
Elli Leppä Geenit kertovat riskeistä ja ohjaavat hoitoa 5.6.2015
Elli Leppä Geenit kertovat riskeistä ja ohjaavat hoitoa 5.6.2015Elli Leppä Geenit kertovat riskeistä ja ohjaavat hoitoa 5.6.2015
Elli Leppä Geenit kertovat riskeistä ja ohjaavat hoitoa 5.6.2015
 
Täytyykö aikuisen juoda maitoa?
Täytyykö aikuisen juoda maitoa?Täytyykö aikuisen juoda maitoa?
Täytyykö aikuisen juoda maitoa?
 
Marketta Dalla Valle:Lapsen lihavuuden puheeksiotto.
Marketta Dalla Valle:Lapsen lihavuuden puheeksiotto.Marketta Dalla Valle:Lapsen lihavuuden puheeksiotto.
Marketta Dalla Valle:Lapsen lihavuuden puheeksiotto.
 
Kuntotestin kertomaa – totta vai tarua? Jaana Suni
Kuntotestin kertomaa – totta vai tarua? Jaana SuniKuntotestin kertomaa – totta vai tarua? Jaana Suni
Kuntotestin kertomaa – totta vai tarua? Jaana Suni
 

Geneettinen_tulevaisuutemme_8.12.JaakkoKaprio

  • 3. Kuolleisuuden muutokset Suomessa Keski-ikäisten miesten ikävakioitu kuolleisuus 100 000 tuhatta kohti PKP laajeni P Karjala Projekti alkoi PK -85% Koko maa -80% Kuolleisuus per 100 000 1969- 1971 2006 Muutos 1969-1971 vuoteen 2006 Kokonais- kuolleisuus 1328 583 -56% SVT 680 172 -75% Sepelvaltimo- tauti 489 103 -79% Kaikki syövät 262 124 -53% Sepelvaltimotauti Miesten elinajan odote kasvanut noin 20v sodan jälkeen; geenit eivät selitä sitä 17.12.2015 Pekka Puska, Director General
  • 4. Tupakoiva, runsaasti juova ammattitaidoton mies elää 19v vähemmän kuin tupakoimaton, raitis tai vähän juova johtavassa asemassa oleva mies 15 797 miestä, seurattu 35,7 v vuodesta 1976 Elinajan- odotteet ovat 68v ja 87v
  • 5. Ympäristö vai geenit? • Periytyykö? • Jos niin, miten
  • 6. Yhden perheen sukupuu ominaisuus jonka ilmaantuvuus on 2,2/100 000
  • 7. Kaksosuus/Monisikiöisyys • Pohjoismaissa hyvät rekisterit jo 1600-luvulta (www.genealogia.fi) • Alan klassikko on prof. Aldur Eriksson väitöskirja vuodelta 1973 ”Human twinning in and around the Åland islands” 012345 Kolmossynnytyksiper10000 05 101520 Kaksossynnytyksetper1000 1960 1970 1980 1990 2000 2010 Vuosi 1900-luvun alusta 1970-luvulle Suomessa ja muissa teollistuneissa maissa ilmaantuvuus lievästi laskeva. Voimakas nousu 1980-luvulla (sinisenä kaksoset ja punaisena kolmoset)
  • 8. Monotsygoottiset eli samanmunaiset identtiset kaksoset • varhainen jakautuminen 1-3 vrk - erilliset vesi- ja suonikalvot (30%) • 4-8 vrk yhteinen suonikalvo (68%) • > 8 vrk yhteinen vesikalvo (2%) • > 14 vrk yhteenkasvaminen
  • 9. Ditsygoottiset eli erimunaiset, ei- identtiset kaksoset • samanaikainen kahden munasolun hedelmöittyminen • erilliset suoni- ja vesikalvot • Englanniksi dizygotic (DZ), joskus näkee ’fraternal’ • Poika-poika, tyttö-tyttö ja poika-tyttö parien odotusarvot on noin 1:1:2
  • 10. Ovatko kaksoset erilaisia kuin yksöset? • Syntyvät pienempinä, mutta aikuisina ei ole enää eroa • Käyttäytymisen osalta ei eroa (Pulkkinen ym, Twin Research 2003) – verrattiin 1874 11-12v kaksosta ja heidän 23 200 luokkatoveria Kaksosten Kehitys ja Terveys-tutkimuksessa • Kaksosten vuorovaikutuksessa nuoruudessa eroa koska heillä samanikäinen sisarus (FT Varpu Penninkilampi-Kerolan väitöskirja 2006) • Syöpäilmaantuvuus ja kuolleisuus aikuisilla suomalaisilla kaksosilla ei eroa väestöstä.
  • 11. Mortality (three year moving average) among twins, and the general population in Denmark, age 6-89 years. Christensen K et al. BMJ 1995;310:432-436 ©1995 by British Medical Journal Publishing Group Aikuisiän sairastuvuudessa ja kuolleisuudessa ei ole eroa kaksosten ja yksösten välillä Sama tulos saatu Ruotsissa kokonaiskuolleisuuden osalta kun verrataan kaksosia saman perheen muihin sisaruksiin ja perheisiin joissa vain yksi lapsi.
  • 13. Perimän merkityksen arvioiminen kaksostutkimuksen avulla Monotsygoottiparit (monozygotic - MZ) muodostuvat alunperin yhdestä hedelmöittyneestä munasolusta, joka jakautuu raskauden alussa Monotsygoottiparin kaksoset ovat perimältään identtisiä eli heidän genominsa sekvenssi on sama Erot MZ kaksosten välillä eivät johdu geeneistä DZ-kaksoset ovat geneettisesti sisaruksia DZ-parit voivat olla samaa tai eri sukupuolta MZ-parien suurempi samankaltaisuus taudin tai ominaisuuden suhteen verrattuna DZ-pareihin verrattuna viittaa perimän vaikutuksesta MZ/DZ vertailun avulla voidaan arvioida:  perimän osuutta  yhteisten ulkoisten tekijöiden merkitystä
  • 14. Mitä ‘geenien osuus’ tarkoittaa? Yksilöiden välisten geneettisten erojen osuus väestön sairausriskin kokonaisvaihtelusta Geenien osuus on abstraktio (kuten taudin ilmaantuvuus tai kuolevuus) Se on tutkitun väestön, ei yksilöiden ominaisuus Sillä ei ole yhtä tai oikeata arvoa, vaan se voi vaihdella ajan ja väestön muiden ominaisuuksien mukaan englanniksi ’heritability’
  • 15. Perimän osuuden arvionti polkumallin avulla Twin 1 Twin 2 A1 A2C1 C2E1 E2 1.0 (MZ) / .5 (DZ) 1.0 rMZ = a*a + c*c rDZ = 0.5*a*a + c*c Yksinkertaistaen a2 = 2(rMZ- rDZ) Eli 2*(0.78 – 0.37) = 2* .41 = .82 Jossa ’a’ on perimän (A1 tai A2) polkukerroin ilmiasuun (Twin1 tai Twin 2)
  • 16. a2 m:0.20 f:0.47 c2 m:0.42 f:0.18 e2 m:0.39 f:0.35 a2 m:0.84 f:0.90 e2 m:0.16 f:0.10 PI at birth BMI at 16 y r m: 0.11, f: 0.09 re m: 0.16, f: 0.07 Twin 1 Variable 1 A A A AC C C CE E E E 1.0 (0.5) 1.0 1.0 (0.5) 1.0 Twin 1 Variable 2 Twin 2 Variable 1 Twin 2 Variable 2 ra rc re ra rc re Monimuuttuja-analyysin avulla osoitetaan että syntymäpainon ja nuoruusiän lihavuuden yhteys johtuu mm. yhteisistä geeneistä (Pietiläinen et al, Obes Res 2002) ra m: 0.21, f: 0.13 FinnTwin16
  • 17. 2015
  • 19. • Yhteensä 104 251 naista mukana • Seuranta-aika 32 v • Rintasyövän elinaikainen riski 9.4% • Identtiset parit: – 124 molemmilla – 1175 vain toisella – Pareittainen riski 28.1% • Epäidenttiset parit: – 141 molemmilla – 2223 toisella – Pareittainen riski 20% • Periytyvyysarvio: – 31% (95%LV 11-51) – V2000 27% • Yhteisten ympäristötekijöiden osuus: – 16% (0-31%) Mucci LA, Hjelmborg JB, Harris JR, Czene K, Havelick DJ, Scheike T, Graff RE, Holst K, Möller S, Unger RH, McIntosh C, Nuttall E, Brandt I, Penney KL, Hartman M, Kraft P, Parmigiani G, Christensen K, Koskenvuo M, Holm NV, Heikkilä K, Pukkala E, Skytthe A, Adami H-O, Kaprio J : Familial risk and heritability of cancer among twins in the Nordic countries. JAMA (in press).
  • 21. Liikunta muokkaa perimän osuutta lihavuudessa Mustelin L et al, Int J Obes 2009 (based on Finntwin16 adults). Toistettu useasti (Vietnam Era vets – MaCaffery et al, AJCN 2009, & FinnTwin12, Geminakar - Silventoinen et al, AJCN 2009) 0 20406080 100 Heritability% Low Medium High Leisure time physical activity
  • 22. Sukupuolierojen synnystä • Biologiset syyt • Raskaudenaikaiset vaikutukset – testosteronille altistumisen hypoteesi • Sosiaaliset syyt kasvun aikana • Verrataan erisukupuolta olevien kaksosparien naisia ja samaa sukupuolta olevien parien naisia – vaikuttaako kaksosveli?
  • 23. Mental Rotation Test (MRT) Miehet suoriutuvat paremmin
  • 24. Fig. 1. Mean mental rotation test scores (with 95% confidence intervals) for females and males from same-sex and opposite-sex twin pairs. Vuoksimaa E et al. Psychological Science 2010;21:1069- 1071 Copyright © by Association for Psychological Science
  • 25. Perimän vaikutuksen vakioiminen – taudin tai ominaisuuden suhteen diskordantit parit Twin A Twin B centile
  • 26. Lihavuuteen liittyvät metabolian muutokset näkyvät jo varhain Naukkarinen J, Rissanen A, Kaprio J, Pietiläinen KH. Causes and consequences of obesity: the contribution of recent twin studies. Int J Obes (Lond). 2011 Oct 11. doi: 10.1038/ijo.2011.192. [Epub ahead of print]
  • 27. Alkoholinkäyttö (vuosien 1975 ja 1981 kyselyjen perusteella ) ja kuolleisuus 1981-2011. N= 14,787 24-60 vuotiasta tervettä aikuista kaksoskohortista. Sipilä P, Rose RJ ja Kaprio J, Addiction 2015