SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 35
Descargar para leer sin conexión
Carla Badia
Laura Monton
Natàlia Muñoz
    Maria Vilà
INTRODUCCIÓ

En aquest treball us volem presentar la pràctica, realitzada al
laboratori de Biotecnologia Vegetal Aplicada de l’Escola
Tècnica Superior d’Enginyeria Agrària de la Universitat de
Lleida, sobre el processament de les mostres d’ADN per
conèixer la seva qualitat i la possibilitat de posteriors
aplicacions en el camp de la transgènesi.




 L’ADN, o àcid desoxirribonucleic, és la molècula que conté la informació
 genètica de tots els éssers vius, amb excepció d’alguns virus.
Guió del procediment de la pràctica:
1.Procés d’extracció d’ADN:
- Lisi inicial de les cèl·lules de la mostra.
- Separació del ADN de la resta de molècules de la
  cèl·lules.
2. Anàlisi de la mostra d’ADN per conèixer el seu estat:
- Electroforesi
- Transil·luminador

3. Aplicació de diverses tècniques relacionades amb la
   transgènesi a la mostra en bon estat.
1.EXTRACCIÓ D’ADN
1. Prenem les mostres (fulles de blat de moro) i les
congelem en nitrogen líquid.


                                   -A partir d’una fulla de blat de moro,
                                   tallem 4 fragments que aproximadament
                                   pesessin uns 20 grams.

                                   -Els emboliquem amb paper d’alumini per
                                   tal de tenir la mostra controlada i evitar
                                   que s’esmicolin, quan les posem en
                                   Nitrogen líquid.

Tallant i pesant les mostres per
tal de que mesurin aprox. uns
20 grams.
- Aboquem una certa quantitat
                                    de nitrogen líquid del tanc gran
                                    a un petit bidó per poder
                                    treballar amb més comoditat.
                                    Hem de vigilar de no tocar el
                                    nitrogen líquid perquè ens
                                    podríem cremar.
Tanc de nitrogen líquid

                                    - Col·loquem les 4 mostres dins
                                    del bidó i les hi deixem durant
                                    un minut.




          Bidó de nitrogen líquid
2. Triturem les mostres congelades amb l’ajuda d’un
morter, i en presència de nitrogen líquid, fins a obtenir
una pols fina.

                     -Amb l’ajuda d’unes pinces
                     agafem les mostres de
                     l’interior del bidó.

                     -Les desemboliquem i en
                     posem una a cada morter.
                                                  Morter i espàtula



  Traient les
                                                    Desembolicant
  mostres del bidó
                                                    una mostra
- Afegim nitrogen líquid dins del
                                      morter junt amb la mostra i el
                                      comencem a triturar. Cal afegir
                                      nitrogen al morter cada cop que
                                      s’hagi evaporat per tal que no es
                                      degradi l’ADN.




Triturant les fulles de blat
de moro amb el nitrogen
líquid.

       - Cal repetir l’operació anterior
       fins que la mostra quedi
       totalment una pols fina.
3. Transferim la pols a un tub i hi afegim tampó
d’extracció.
                            - Amb una espàtula de metall, passem la
                            pols que tenim al morter cap al tub.




Passant la pols del morter al tub.

-    Amb una pipeta afegim tampó
d’extracció al tub on ja hi tenim la pols
transferida.


El tampó d’extracció és una solució que conté detergents i sals, entre
altres compostos, que provocaran la disrupció de les membranes
cel·lulars i el trencament de les cèl·lules de la mostra.
4. Barregem bé la mostra i la deixem en agitació.

                       - Barregem bé la mostra amb el tampó d’extracció. Per tal
                       que quedi tot ben barrejat, utilitzem l’aparell que es veu
                       en la fotografia.




Barrejant la mostra.


  - Un cop barrejat, ho deixem
  en agitació durant 10 minuts.                En agitació durant 10 minuts.
5. Incubem els tubs a 65ºC durant 10 minuts.

- Després de 10 minuts en agitació,
posem els tubs a la incubadora a 65ºC
durant 10 minuts.
- La temperatura de la incubadora es
regula segons la temperatura de
l’aigua que hi ha, i els tubs es
mantenen al bany maria.


                                            Incubadora amb els tubs.


- La temperatura elevada agilitza el procés de disrupció cel·lular.
6. Realitzem una extracció amb fenol-
cloroform.
- Aquest procediment permet retirar les
proteïnes de la mostra, juntament amb
altres restes cel·lulars.



                                               Fenol-cloroform que vam utilitzar a la pràctica




 El fenol-cloroform desnaturalitza les proteïnes que s’han alliberat
 a la dissolució amb el trencament de les cèl·lules, i que podrien
 lligar-se a l’ADN o degradar-lo, en el cas d’alguns enzims.
7. Tractament amb RNAsa durant una hora a 37ºC.



Ribonucleasa, més coneguda com RNAsa, és un
enzim (nucleasa) que catalitza la hidròlisi d'ARN en
components més petits. Poden classificar-se en
endonucleases i exonucleases, i comprenen diverses
subclasses dins de les classes d'enzims EC 3.1



8. Repetim l’extracció amb fenol-cloroform per
retirar l’enzim RNAsa de la mostra. Obtindrem una
solució aquosa on hi haurà bàsicament ADN i
diverses sals.
9. Afegim isopropanol a la solució aquosa.
- L’ADN no és soluble en alcohol i, per tant, l’addició d’isopropanol
provoca la precipitació d’aquest. Quan precipita, les diferents
molècules d’ADN de la mostra s’agrupen formant un aglomerat que,
si hi ha prou quantitat, es fa visible amb un color blanquinós.




  Afegint l’isopropanol.
L' isopropanol és un alcohol incolor, inflamable, amb una olor intensa.
És molt miscible amb l’aigua. La seva fórmula química semi
desenvolupada és H3C-HCOH-CH3. És l’exemple més senzill
d’alcohol sencundari, on el carboni del grup de l’alcohol està unit als
altres dos carbonis. És un isòmer del propanol.

L' isopropanol s’utilitza molt en la neteja de les lents d’objectius
fotogràfics i contactes d’aparells electrònics, ja que no deixa marques
i és de ràpida evaporació.

La seva obtenció es dóna per mitjà de l’oxidació del propè amb àcid
sulfúric o per hidrogenització de l’acetona.



                                                                Fórmula química
                                                                de l’ isopropanol
10. Efectuem una etapa de rentat amb una solució
d’etanol al 70% per tal de retirar part de les sals
associades a l’ADN.


11. Retirem l’etanol i diluïm l’ADN en el volum
d’aigua que desitgem.


12. Agafem l’ADN precipitat amb l’ajuda d’una
pipeta, i el dissolem en el volum d’aigua que
desitgem.
2. ANÀLISI DE LA
MOSTRA DE DNA:
ELECTROFORESI
Tècnica de l’electroforesi
   Consisteix en introduir una mostra del nostre ADN en un gel porós (gel
    d’agarosa)    sota l’influencia d’un camp elèctric que provocarà el
    desplaçament de les molècules d’ ADN a través del gel.

   Les molècules d’ADN estan carregades negativament, de manera que
    es desplaçaran cap al pol positiu. Totes les molècules d’ ADN tenen la
    mateixa càrrega per unitat de mida, i per tant el seu desplaçament a
    través del gel depèn del tamany de la molècula.

   En acabar l’electroforesi tindrem un gel on es trobaran separades les
    diferents molècules d’ ADN segons la seva mida, distribuïdes en diferents
    bandes.

   Per dur a terme una electroforesi, primer cal preparar el gel i les mostres:
Preparació del gel d’agarosa
   L’agarosa és un polímer que a temperatures elevades es troba en estat
    líquid i quan es deixa refredar adquireix una consistència gelosa.

   Agafem agarosa en pols i el tampó TBE i afegim aigua destil·lada.

   Posem la mostra al microones per tal d’escalfar-la a uns 50-60ºC, per
    obtenir-ne una consistència líquida.

   Afegim el bromur d’etidi:
    El bromur d’etidi es lliga a l’ADN tot intercalant-se amb les bases dels àcids
    nucleics, i produeix fluorescència de color taronja - vermell en exposar-se a
    la llum ultraviolada, cosa que permet detectar la presència de l’ADN dins el
    gel en passar la mostra resultant de l’electroforesi pel transil·luminador.
   El deixem refredar una mica, procurant que encara no agafi consistència
    gelatinosa.

   Omplim el motlle en el que es dura a terme l’electroforesi.

   Quan el gel ha adquirit la consistència gelatinosa, omplim la cubeta amb
    buffer d’electroforesi, que és l’encarregat de donar unes condicions
    òptimes per tal de que les molècules d’ADN puguin córrer a través del gel.




        Pesant la pols d’agarosa.         Barrejant l’agarosa, el
                                          tampó i l’aigua
                                          destil·lada, en calent.
Preparació de les mostres
   Per preparar les mostres barregem l’ADN amb tampó de càrrega, cosa que
    permet que la mostra caigui directament al pou, quan és injectada en el
    gel, i que en canvi no es dissolgui amb el buffer d’electroforesi.

   Preparem cinc mostres de les quals dos estan formades per ADN no
    transgènic, dos per ADN convencional i la última per un marcador de pes
    molecular.

    EL MARCADOR DE PES MOLECULAR
    És una dissolució que conté una barreja de molècules d’ADN amb unes
    mides determinades, de manera que després de l'electroforesi formen un
    patró de bandes concret que ens serveix per conèixer la mida de les
    bandes de les nostres mostres mitjançant la comparació de les mostres
Preparant la mostra: en la primera imatge, col·locant el
tampó de carrega i en la segona les mostres d’ADN en si.
   Procedim a introduir les mostres en el gel d’agarosa, muntem el kit
    d’electroforesi i el posem en funcionament durant 30 minuts
    aproximadament.




       Introduint les mostres un cop      Kit d’electroforesi ja muntat
       ja han estat preparades en el      i en ple funcionament.
       gel d’agarosa.
Transil·luminador

   En acabar el procediment, introduïm el gel en un transil·luminador que ens
    permetrà obtenir una visió de les bandes d’ADN dins del gel, i
    posteriorment analitzem els resultats obtinguts.




                                         Introduint del motlle
                                         resultant de l’electroforesi en
                                         el transil·luminador.
Resultats
   Els resultats obtinguts gràcies al transil·luminador ens permeten veure
    l’estat de l’ADN de les mostres.

   En la imatge obtinguda, podem veure que les tres primeres mostres
    començant per l’esquerra són molt deficients en quan a qualitat de l’ADN,
    ja que és una molècula que té un pes molt elevat, i per tant si queda per
    sota vol dir o que està degradat o que no és ADN sinó que és ARN.

   En les dues últimes mostres, el resultat és òptim ja que les mostres es
    queden a dalt, cosa que vol dir que pesen més i que per tant són mostres
    formades per ADN en bon estat. A partir d’aquí treballarem amb les
    mostres que ens han donat el millor resultat.

   El cas que totes ens haguessin sortit deficients, hauríem de tornar a fer
    l’extracció d’ADN.
Imatge del motlle resultant de
l’electroforesi obtinguda amb el
transil·luminador.
3. APLICACIÓ DE
DIVERSES TÈCNIQUES
RELACIONADES AMB LA
TRANSGÈNESI A LA
MOSTRA EN BON ESTAT
Tècniques relacionades amb la
transgènesi a la mostra en bon estat
Presentem a continuació les principals opcions que tenim:

   Si volem comprovar si la planta, de la que hem extret l’ADN, és
    transgènica o no, podem fer una PCR que ens permet amplificar la
    seqüència d’ADN del transgen.

   Si dessitgem aïllar un gen "X" del genoma de la planta per exemple
    per caracteritzar-lo, també faríem una PCR.

   Per saber, en cas que es tracti d'una planta transgènica, si el
    transgen s'ha integrat en un sol lloc del genoma o, si per contra,
    tenim diverses còpies del transgen repartides en diferents posicions
    del genoma de la planta, es podria realitzar un Southern Blot.
   PCR:
Reacció en cadena de la polimerasa:
És una tècnica de biologia molecular desenvolupada en 1986, amb
l’objectiu d’obtenir un gran nombre de copies d’un fragment d’ADN
particular.



    SOUTHERN BLOT:
    És una tècnica de biologia molecular que té com a objectiu hibridar
    un fragment d’una cadena d’ADN amb una sonda marcada d’ADN
    complementari per a facilitar la seva detecció i estudi.
Valoració

Un cop acabat el treball, tot el grup participant coincidim en la nostra opinió:

-Realitzar un treball relacionat amb els transgènics, amb una part pràctica
que, a més, ha estat realitzada en un laboratori específic, ens ha aportat
una visió molt diferent de la que teníem sobre el tema.

-Després de realitzar la pràctica, recopilar les dades i fer el treball, podem
dir que hem pogut gaudir d’una experiència molt interessant.

-Hem treballat amb gent molt qualificada que en tot moment ha donat
resposta a tots els nostres dubtes, hem après tècniques de laboratori, com
manipular aparells específics i productes nocius i hem satisfet els objectius
principals de la nostra participació en aquest projecte.

Per tot això la nostra valoració és absolutament positiva.
Agraïments
Volem agrair:

   A l’Eduard Pérez Massot i la Gemma Farré Martínez, investigadors del
    Grup de Biotecnologia Vegetal Aplicada de l’Escola Tècnica Superior
    d’Enginyeria Agrària de la Universitat de Lleida, per mostrar-nos com és la
    seva feina al laboratori, amb tanta dedicació i paciència, i deixar-nos-hi
    participar.

   A en Jordi Bermúdez Mas, del Departament de Ciències Fisiològiques II de
    la Universitat de Barcelona, que com a coordinador del projecte Investiga
    la Ciència de la Societat Catalana de Biologia, s’ha preocupat per atendre
    les nostres demandes i ha fet tot el possible per facilitar-nos la nostra
    participació en aquest projecte.

   A la Fundación Española para la Ciencia y la Tecnologia (FECYT) que ha
    posat els mitjans econòmics per a que el projecte sigui una realitat.
Blat de moro_de_laboratori

Más contenido relacionado

Destacado

2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by HubspotMarius Sescu
 
Everything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPTEverything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPTExpeed Software
 
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage EngineeringsProduct Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage EngineeringsPixeldarts
 
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental HealthHow Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental HealthThinkNow
 
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdfAI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdfmarketingartwork
 
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024Neil Kimberley
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)contently
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024Albert Qian
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsKurio // The Social Media Age(ncy)
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Search Engine Journal
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summarySpeakerHub
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Tessa Mero
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentLily Ray
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best PracticesVit Horky
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementMindGenius
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...RachelPearson36
 

Destacado (20)

2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot
 
Everything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPTEverything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPT
 
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage EngineeringsProduct Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
 
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental HealthHow Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
 
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdfAI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
 
Skeleton Culture Code
Skeleton Culture CodeSkeleton Culture Code
Skeleton Culture Code
 
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
 
How to have difficult conversations
How to have difficult conversations How to have difficult conversations
How to have difficult conversations
 
Introduction to Data Science
Introduction to Data ScienceIntroduction to Data Science
Introduction to Data Science
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best Practices
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project management
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
 

Blat de moro_de_laboratori

  • 2. INTRODUCCIÓ En aquest treball us volem presentar la pràctica, realitzada al laboratori de Biotecnologia Vegetal Aplicada de l’Escola Tècnica Superior d’Enginyeria Agrària de la Universitat de Lleida, sobre el processament de les mostres d’ADN per conèixer la seva qualitat i la possibilitat de posteriors aplicacions en el camp de la transgènesi. L’ADN, o àcid desoxirribonucleic, és la molècula que conté la informació genètica de tots els éssers vius, amb excepció d’alguns virus.
  • 3. Guió del procediment de la pràctica: 1.Procés d’extracció d’ADN: - Lisi inicial de les cèl·lules de la mostra. - Separació del ADN de la resta de molècules de la cèl·lules. 2. Anàlisi de la mostra d’ADN per conèixer el seu estat: - Electroforesi - Transil·luminador 3. Aplicació de diverses tècniques relacionades amb la transgènesi a la mostra en bon estat.
  • 5.
  • 6. 1. Prenem les mostres (fulles de blat de moro) i les congelem en nitrogen líquid. -A partir d’una fulla de blat de moro, tallem 4 fragments que aproximadament pesessin uns 20 grams. -Els emboliquem amb paper d’alumini per tal de tenir la mostra controlada i evitar que s’esmicolin, quan les posem en Nitrogen líquid. Tallant i pesant les mostres per tal de que mesurin aprox. uns 20 grams.
  • 7. - Aboquem una certa quantitat de nitrogen líquid del tanc gran a un petit bidó per poder treballar amb més comoditat. Hem de vigilar de no tocar el nitrogen líquid perquè ens podríem cremar. Tanc de nitrogen líquid - Col·loquem les 4 mostres dins del bidó i les hi deixem durant un minut. Bidó de nitrogen líquid
  • 8. 2. Triturem les mostres congelades amb l’ajuda d’un morter, i en presència de nitrogen líquid, fins a obtenir una pols fina. -Amb l’ajuda d’unes pinces agafem les mostres de l’interior del bidó. -Les desemboliquem i en posem una a cada morter. Morter i espàtula Traient les Desembolicant mostres del bidó una mostra
  • 9. - Afegim nitrogen líquid dins del morter junt amb la mostra i el comencem a triturar. Cal afegir nitrogen al morter cada cop que s’hagi evaporat per tal que no es degradi l’ADN. Triturant les fulles de blat de moro amb el nitrogen líquid. - Cal repetir l’operació anterior fins que la mostra quedi totalment una pols fina.
  • 10. 3. Transferim la pols a un tub i hi afegim tampó d’extracció. - Amb una espàtula de metall, passem la pols que tenim al morter cap al tub. Passant la pols del morter al tub. - Amb una pipeta afegim tampó d’extracció al tub on ja hi tenim la pols transferida. El tampó d’extracció és una solució que conté detergents i sals, entre altres compostos, que provocaran la disrupció de les membranes cel·lulars i el trencament de les cèl·lules de la mostra.
  • 11. 4. Barregem bé la mostra i la deixem en agitació. - Barregem bé la mostra amb el tampó d’extracció. Per tal que quedi tot ben barrejat, utilitzem l’aparell que es veu en la fotografia. Barrejant la mostra. - Un cop barrejat, ho deixem en agitació durant 10 minuts. En agitació durant 10 minuts.
  • 12. 5. Incubem els tubs a 65ºC durant 10 minuts. - Després de 10 minuts en agitació, posem els tubs a la incubadora a 65ºC durant 10 minuts. - La temperatura de la incubadora es regula segons la temperatura de l’aigua que hi ha, i els tubs es mantenen al bany maria. Incubadora amb els tubs. - La temperatura elevada agilitza el procés de disrupció cel·lular.
  • 13. 6. Realitzem una extracció amb fenol- cloroform. - Aquest procediment permet retirar les proteïnes de la mostra, juntament amb altres restes cel·lulars. Fenol-cloroform que vam utilitzar a la pràctica El fenol-cloroform desnaturalitza les proteïnes que s’han alliberat a la dissolució amb el trencament de les cèl·lules, i que podrien lligar-se a l’ADN o degradar-lo, en el cas d’alguns enzims.
  • 14. 7. Tractament amb RNAsa durant una hora a 37ºC. Ribonucleasa, més coneguda com RNAsa, és un enzim (nucleasa) que catalitza la hidròlisi d'ARN en components més petits. Poden classificar-se en endonucleases i exonucleases, i comprenen diverses subclasses dins de les classes d'enzims EC 3.1 8. Repetim l’extracció amb fenol-cloroform per retirar l’enzim RNAsa de la mostra. Obtindrem una solució aquosa on hi haurà bàsicament ADN i diverses sals.
  • 15.
  • 16. 9. Afegim isopropanol a la solució aquosa. - L’ADN no és soluble en alcohol i, per tant, l’addició d’isopropanol provoca la precipitació d’aquest. Quan precipita, les diferents molècules d’ADN de la mostra s’agrupen formant un aglomerat que, si hi ha prou quantitat, es fa visible amb un color blanquinós. Afegint l’isopropanol.
  • 17. L' isopropanol és un alcohol incolor, inflamable, amb una olor intensa. És molt miscible amb l’aigua. La seva fórmula química semi desenvolupada és H3C-HCOH-CH3. És l’exemple més senzill d’alcohol sencundari, on el carboni del grup de l’alcohol està unit als altres dos carbonis. És un isòmer del propanol. L' isopropanol s’utilitza molt en la neteja de les lents d’objectius fotogràfics i contactes d’aparells electrònics, ja que no deixa marques i és de ràpida evaporació. La seva obtenció es dóna per mitjà de l’oxidació del propè amb àcid sulfúric o per hidrogenització de l’acetona. Fórmula química de l’ isopropanol
  • 18. 10. Efectuem una etapa de rentat amb una solució d’etanol al 70% per tal de retirar part de les sals associades a l’ADN. 11. Retirem l’etanol i diluïm l’ADN en el volum d’aigua que desitgem. 12. Agafem l’ADN precipitat amb l’ajuda d’una pipeta, i el dissolem en el volum d’aigua que desitgem.
  • 19. 2. ANÀLISI DE LA MOSTRA DE DNA: ELECTROFORESI
  • 20.
  • 21. Tècnica de l’electroforesi  Consisteix en introduir una mostra del nostre ADN en un gel porós (gel d’agarosa) sota l’influencia d’un camp elèctric que provocarà el desplaçament de les molècules d’ ADN a través del gel.  Les molècules d’ADN estan carregades negativament, de manera que es desplaçaran cap al pol positiu. Totes les molècules d’ ADN tenen la mateixa càrrega per unitat de mida, i per tant el seu desplaçament a través del gel depèn del tamany de la molècula.  En acabar l’electroforesi tindrem un gel on es trobaran separades les diferents molècules d’ ADN segons la seva mida, distribuïdes en diferents bandes.  Per dur a terme una electroforesi, primer cal preparar el gel i les mostres:
  • 22. Preparació del gel d’agarosa  L’agarosa és un polímer que a temperatures elevades es troba en estat líquid i quan es deixa refredar adquireix una consistència gelosa.  Agafem agarosa en pols i el tampó TBE i afegim aigua destil·lada.  Posem la mostra al microones per tal d’escalfar-la a uns 50-60ºC, per obtenir-ne una consistència líquida.  Afegim el bromur d’etidi: El bromur d’etidi es lliga a l’ADN tot intercalant-se amb les bases dels àcids nucleics, i produeix fluorescència de color taronja - vermell en exposar-se a la llum ultraviolada, cosa que permet detectar la presència de l’ADN dins el gel en passar la mostra resultant de l’electroforesi pel transil·luminador.
  • 23. El deixem refredar una mica, procurant que encara no agafi consistència gelatinosa.  Omplim el motlle en el que es dura a terme l’electroforesi.  Quan el gel ha adquirit la consistència gelatinosa, omplim la cubeta amb buffer d’electroforesi, que és l’encarregat de donar unes condicions òptimes per tal de que les molècules d’ADN puguin córrer a través del gel. Pesant la pols d’agarosa. Barrejant l’agarosa, el tampó i l’aigua destil·lada, en calent.
  • 24. Preparació de les mostres  Per preparar les mostres barregem l’ADN amb tampó de càrrega, cosa que permet que la mostra caigui directament al pou, quan és injectada en el gel, i que en canvi no es dissolgui amb el buffer d’electroforesi.  Preparem cinc mostres de les quals dos estan formades per ADN no transgènic, dos per ADN convencional i la última per un marcador de pes molecular. EL MARCADOR DE PES MOLECULAR És una dissolució que conté una barreja de molècules d’ADN amb unes mides determinades, de manera que després de l'electroforesi formen un patró de bandes concret que ens serveix per conèixer la mida de les bandes de les nostres mostres mitjançant la comparació de les mostres
  • 25. Preparant la mostra: en la primera imatge, col·locant el tampó de carrega i en la segona les mostres d’ADN en si.
  • 26. Procedim a introduir les mostres en el gel d’agarosa, muntem el kit d’electroforesi i el posem en funcionament durant 30 minuts aproximadament. Introduint les mostres un cop Kit d’electroforesi ja muntat ja han estat preparades en el i en ple funcionament. gel d’agarosa.
  • 27. Transil·luminador  En acabar el procediment, introduïm el gel en un transil·luminador que ens permetrà obtenir una visió de les bandes d’ADN dins del gel, i posteriorment analitzem els resultats obtinguts. Introduint del motlle resultant de l’electroforesi en el transil·luminador.
  • 28. Resultats  Els resultats obtinguts gràcies al transil·luminador ens permeten veure l’estat de l’ADN de les mostres.  En la imatge obtinguda, podem veure que les tres primeres mostres començant per l’esquerra són molt deficients en quan a qualitat de l’ADN, ja que és una molècula que té un pes molt elevat, i per tant si queda per sota vol dir o que està degradat o que no és ADN sinó que és ARN.  En les dues últimes mostres, el resultat és òptim ja que les mostres es queden a dalt, cosa que vol dir que pesen més i que per tant són mostres formades per ADN en bon estat. A partir d’aquí treballarem amb les mostres que ens han donat el millor resultat.  El cas que totes ens haguessin sortit deficients, hauríem de tornar a fer l’extracció d’ADN.
  • 29. Imatge del motlle resultant de l’electroforesi obtinguda amb el transil·luminador.
  • 30. 3. APLICACIÓ DE DIVERSES TÈCNIQUES RELACIONADES AMB LA TRANSGÈNESI A LA MOSTRA EN BON ESTAT
  • 31. Tècniques relacionades amb la transgènesi a la mostra en bon estat Presentem a continuació les principals opcions que tenim:  Si volem comprovar si la planta, de la que hem extret l’ADN, és transgènica o no, podem fer una PCR que ens permet amplificar la seqüència d’ADN del transgen.  Si dessitgem aïllar un gen "X" del genoma de la planta per exemple per caracteritzar-lo, també faríem una PCR.  Per saber, en cas que es tracti d'una planta transgènica, si el transgen s'ha integrat en un sol lloc del genoma o, si per contra, tenim diverses còpies del transgen repartides en diferents posicions del genoma de la planta, es podria realitzar un Southern Blot.
  • 32. PCR: Reacció en cadena de la polimerasa: És una tècnica de biologia molecular desenvolupada en 1986, amb l’objectiu d’obtenir un gran nombre de copies d’un fragment d’ADN particular.  SOUTHERN BLOT: És una tècnica de biologia molecular que té com a objectiu hibridar un fragment d’una cadena d’ADN amb una sonda marcada d’ADN complementari per a facilitar la seva detecció i estudi.
  • 33. Valoració Un cop acabat el treball, tot el grup participant coincidim en la nostra opinió: -Realitzar un treball relacionat amb els transgènics, amb una part pràctica que, a més, ha estat realitzada en un laboratori específic, ens ha aportat una visió molt diferent de la que teníem sobre el tema. -Després de realitzar la pràctica, recopilar les dades i fer el treball, podem dir que hem pogut gaudir d’una experiència molt interessant. -Hem treballat amb gent molt qualificada que en tot moment ha donat resposta a tots els nostres dubtes, hem après tècniques de laboratori, com manipular aparells específics i productes nocius i hem satisfet els objectius principals de la nostra participació en aquest projecte. Per tot això la nostra valoració és absolutament positiva.
  • 34. Agraïments Volem agrair:  A l’Eduard Pérez Massot i la Gemma Farré Martínez, investigadors del Grup de Biotecnologia Vegetal Aplicada de l’Escola Tècnica Superior d’Enginyeria Agrària de la Universitat de Lleida, per mostrar-nos com és la seva feina al laboratori, amb tanta dedicació i paciència, i deixar-nos-hi participar.  A en Jordi Bermúdez Mas, del Departament de Ciències Fisiològiques II de la Universitat de Barcelona, que com a coordinador del projecte Investiga la Ciència de la Societat Catalana de Biologia, s’ha preocupat per atendre les nostres demandes i ha fet tot el possible per facilitar-nos la nostra participació en aquest projecte.  A la Fundación Española para la Ciencia y la Tecnologia (FECYT) que ha posat els mitjans econòmics per a que el projecte sigui una realitat.