El documento resume los conceptos de estabilidad termodinámica y cinética en proteínas de dos y tres estados. Explica que la estabilidad termodinámica se refiere a la diferencia de energía libre entre los estados plegado y desplegado, mientras que la estabilidad cinética se refiere a las tasas de plegamiento y desplegamiento. Los estudios de mutaciones en múltiples proteínas muestran que el plegamiento se ve afectado negativamente pero el desplegamiento y la estabilidad general se ven afectados

1. ¿Cuál es la estabilidad
relevante de las proteínas?
R. Godoy-Ruiz, J.M. Sánchez-Ruiz,
I.E. Sánchez
Laboratorio de
fisiología proteica

2. Sí, pero ¿a quién
le importa?
Dobson and Karplus 1999

3. Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGfolding
ΔGunfolding
ΔGequilibrium

4. Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGfolding
ΔGunfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad termodinámica
(Steipe 1994)

5. Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGfolding
ΔGunfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad cinética
Estabilidad termodinámica
(Godoy-Ruiz 2006)
(Steipe 1994)

6. Proteínas de 2 estados
Folding
(Shakhnovich 1996) E.T.
ΔGfolding
ΔGunfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad cinética
Estabilidad termodinámica
(Godoy-Ruiz 2006)
(Steipe 1994)

7. Cómo medir presiones evolutivas
(Steipe 1994)
• Las proteínas homólogas comparten
similares requerimientos evolutivos
• Cada posición del alineamiento evoluciona de
forma independiente
• Las distribuciones de residuos han alcanzado
el equilibrio
$ fracciónAla22 '
Leu22Ala FamiliaX )
""G evolución = #RTln&
& )
% fracciónLeu22 (
FamiliaX
!

8. Proteínas de 2 estados
Estabilidad  Folding  Unfolding 
22 proteínas, 583 mutaciones

9. Proteínas de 2 estados
Estabilidad  Folding  Unfolding 
22 proteínas, 583 mutaciones

10. Proteínas de 2 estados
Estabilidad  Folding  Unfolding 
22 proteínas, 583 mutaciones

11. Efecto de las mutaciones en distintas
condiciones de desplegamiento
Fisiológicas No fisiológicas
Unfolding 
5 proteínas, 139 mutaciones

12. Proteínas de 3 estados
ΔGIU
ΔGNU
ΔGNI
Estabilidad termodinámica
(Steipe 1994)

13. Proteínas de 3 estados
ΔGIU
ΔGNU
ΔGNI
Estabilidad termodinámica
(Steipe 1994)
Estabilidad respecto al intermedio
(Sancho 2002)

14. Proteínas de 3 estados
N vs. U  N vs. I  I vs. U 
4 proteínas, 61 mutaciones

15. Proteínas de 3 estados
N vs. U  N vs. I  I vs. U 
4 proteínas, 61 mutaciones

16. Proteínas de 3 estados
N vs. U  N vs. I  I vs. U 
4 proteínas, 61 mutaciones

17. Conclusiones
• Proteínas de 2 estados
Estabilidad  Folding  Unfolding 
• Proteínas de 3 estados
N vs. U  N vs. I  I vs. U 
• ¡Queda mucho por explorar!

18. Laboratorio de
fisiología proteica
www.proteinphysiologylab.tk
Universidad de Buenos Aires, FCEyN, Departamento
de Química Biológica
Diego U. Ferreiro, Ignacio E. Sánchez
Objetivo: integrar información de secuencia, estructura
y función para entender cómo las proteínas
responden de forma compleja a estímulos.

19. Folding 