Epidémiologie moléculaire - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Valérie ANDRIANTSOANIRINA - Etudiant/Chercheur - Institut Pasteur de Madagascar - landyvalerie@yahoo.fr
2. PLANPLAN
• avant la biologie moléculaire
• avec la biologie moléculaire
• exemple: suivi de la résistance à la chloroquine
(pfcrt)
• avantages et limites
• conclusion
3. Définition : étude de la répartition et des déterminants des
évènements de santé dans les populations
Définition du sujet : Surveillance par méthode moléculaire
des phénomènes épidémiologiques dont principalement
l’apparition des résistances aux médicaments
INTRODUCTIONINTRODUCTION
4. Avantages : pas d’extrapolation sur autres espèces et
expériences en labo
Inconvénients :
• contraintes éthiques imposées par expérimentation humaine
• Protocole lourd
– temps
– argent
• Comparaison inter études (standardisation)
In vivo : essai direct sur l’homme
In vitro : culture cellulaire
Epidémiologie avant la biologieEpidémiologie avant la biologie
moléculairemoléculaire
5. suivi de la chloroquinosuivi de la chloroquino--resistanceresistance
dans le mondedans le monde
OMSOMS
6. Définition : mettre en relation les données
recueillies avec la recherche des causes d’une
maladie sur le plan moléculaire
« Mutant = résistant »
suivi d’une résistance suivi mutation associée
à une résistance.
Epidémiologie avec la biologie
moléculaire
7. Suivi de résistance à la CQ
(Pfcrt T76)
Marqueur moléculaire Pfcrt 76 : substitution de la: substitution de la
Lysine K à la position 76 (K76) en thréonine TLysine K à la position 76 (K76) en thréonine T
(Chromosome 7)(Chromosome 7)
PrPréésents chez les isolats rsents chez les isolats réésistants et non chezsistants et non chez
les sensiblesles sensibles
DjimdDjimdéé et al., 2001 : association entre leet al., 2001 : association entre le PfcrtPfcrt T76T76
et det dééveloppement de rveloppement de réésistancesistance àà la CQ pendant lela CQ pendant le
traitement.traitement.
(Djimdé et al., 2001)
8. Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001
SSéélection pour la T76 in vivolection pour la T76 in vivo
AprAprèès traitement seuls les mutants rs traitement seuls les mutants réésistentsistent
9. Pourquoi ce choix ?Pourquoi ce choix ?
• déterminant essentiel de la résistance à la chloroquine
Djimdé, 2001; Fidock et al., 2001
• Djimdé et al., 2001 : association entre le Pfcrt T76 et
développement de résistance à la CQ pendant le
traitement.
• outil de surveillance à la résistance à la chloroquine
11. Exemple 2: Madagascar
• Mutation pfcrt K76T par PCR/RFLP : grande
première à Madagascar.
• 3,3% : 6/183 sur isolats de Plasmodium falciparum
étudiés
• Génotypage du pfcrt est un outil utile pour la
surveillance de la résistance à la CQ
Randrianarivelojosia et al., 2006Randrianarivelojosia et al., 2006
13. Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001
Exemple 2 : suivi de résistance à Mali
1424 patients, 1997-1999, la prévalence de pfcrt T76 est mesurée et comparée avec
la parasite
14. • L’approche d’épidémiologie moléculaire : perspectives
d’interventions stratégiques ciblant des facteurs de virulence du
parasite
• Connaissance mutation connaissance résistance changement
de lutte
ವ D P « O L R U D W L R Q G H V W U D W « J L H V G H G « S L V W D J H
ವ D S S U « F L D W L R Q G H O ಬ H I I L F D F L W « G H V P H V X U H V G H S U « Y H Q W L R Q
ವ ' L P L Q X W L R Q « F K H F W K « U D S H X W L T X H
Conclusion et perspectives
15. Références
• Greenwood B. The molecular epidemiology of malaria. Tropical Medicine
and International Health, 2000 volume 7 (12); 1012–1021.
• Djimdé A et al. A molecular marker of chloroquine-resistant falciparum
malaria. N Engl J Med, Vol. 344 (4) January 25, 2001.
• Djimdé et al. Application of a molecular marker for surveillance of
chloroquine-resistant falciparum malaria. The lancet, Vol. 358 (9285); 890-
891, 2001.
• Abel. Apport de l’épidémiologie génétique pour l’étude de la
susceptibilité/résistance au paludisme dans les populations humaines, Paris
1999.
• Schulte A. A conceptual and historical framework for molecular
epidemiology. In : Schulte A.P et Perera P.F. Molecular epidemiology :
principles and practices. London: academic press, 1993; 4-19
• Randrianarivelojosia et al. First evidence of pfcrt mutant Plasmodium
falciparum in Madagascar. Trans R Soc Trop Med H, 2006
16. • Détection de la résistance aux
médicaments
• Détection de la résistance
à l’insecticide
• Différenciation entre rechute et
réinfection
• Cytokines, TNF…
• Analyse de l’origine du
repas de sang
• Recherche de marqueurs
génétiques de virulence
• HLA cl I et II
• Etude de la corrélation
génétique entre populations
de moustiques
• Etude de la multiplicité de
l’infection
• Malformation des GR
• Différenciation d’espèces
et sous-espèces
• Détection d’infections mixtes• Hémoglobinopathies
VecteurParasiteHôte
Applications de la biologie
moléculaire à l’épidémiologie
