1. PARÉ à
INNOVER
Lettre d’information de l’innovation en bretagne
numéro spécial
supplément au n°8
janvier - février 2002
Génopole OUEST,
un nouveau levier
pour la recherche
et le transfert
de technologie
Editorial
Editorial
Génopole OUEST :
Chercheurs à l'unisson Sommaire
Sommaire
Le long travail de structuration et de matura- de nouvelles perspectives tant au niveau for-
tion du secteur de la biologie dans les secteurs mation qu'au niveau de la valorisation pour P.2 Le projet
de la mer, de l'agro alimentaire et de la santé a accueillir de nouveaux chercheurs et favoriser
permis la création au 1er janvier 2002 d'une le transfert de technologies et la création d'en- Génopole OUEST
génopole interrégionale Bretagne - Pays de la treprises de biotechnologies dans l'Ouest. Je
Loire. Actuellement 750 chercheurs et 47 uni- profite de l'opportunité de cet éditorial pour
tés de recherche sont mobilisés autour de pro- remercier tous les partenaires associés à la
grammes de génomique et post génomique à
grande échelle. A ce jour, les recherches sont
génopole et tout particulièrement les deux
Conseils Régionaux et les deux DRRT de
P.3 Zoom sur la
orientées autour de 5 plates-formes : bio- Bretagne et Pays de La Loire qui dès le départ valorisation
informatique, séquençage-génotypage, explo- nous ont soutenus, et pour vous offrir tous nos
ration fonctionnelle, bio puce et protéomique. meilleurs vœux pour 2002 au nom du comité
Elles sont pour certaines déjà opérationnelles, de pilotage de Génopole OUEST.
et pour d'autres, elles le seront dans leurs
formes optimales d'ici le printemps 2002. Un Michel Renard
P.4 Bio Informatique,
autre défi de la labellisation est d'ouvrir aussi Directeur de génopole OUEST. Infos pratiques
et petit lexique

2. PARÉ à Lettre d’information de l’innovation en bretagne
INNOVER
Génopole OUEST Le projet…
Les domaines de la génomique et de la post-génomique ouvrent des perspectives
considérables dans les domaines de l’agrobiologie, de la mer et de la santé. La géno-
mique consiste en l’étude du génome et, depuis quelques années, la révolution géno-
mique bouleverse incontestablement l'approche technologique et la connaissance du
vivant. En effet, grâce au séquençage massif et systématique de nombreux génomes,
dont le génome humain, une formidable source d'informations est désormais dispo-
nible. La post-génomique prend alors le relais car elle s’applique à l’étude de l’expres-
sion de ces gènes et à l’identification de leurs fonctions biologiques.
S’associer pour capitaliser Volet scientifique
les expériences Mettre en commun des
Génopole OUEST est un projet stratégique Enfin, Génopole OUEST s’appuiera sur le
outils et des compétences
pour la formation supérieure et la recherche réseau des Technopoles et des Centres de Quels que soient les espèces et les
dans le domaine des sciences du vivant, de la Transfert de Technologie pour promouvoir la domaines, les questions fondamentales de la
bio-informatique et pour le développement valorisation des activités scientifiques vers le génomique restent les mêmes ainsi que les
économique dans les domaines de la mer, de secteur privé et la création de nouvelles outils méthodologiques à mettre en œuvre
l’agroalimentaire et de la santé. entreprises. pour y répondre. C’est sur ce constat que
repose la conception de Génopole OUEST.
L’objectif est ainsi de : participer col- D’autre part, il était primordial de construire
lectivement à l’évolution tech- ce dispositif de grande échelle en s’appuyant
nologique, dynamiser et struc- sur les forces régionales déjà existantes.
turer la recherche, la forma- La mise en commun des outils et des com-
tion et le développement pétences (Mer, Agro, Santé, Bio-Info) doit
économique, et enfin réaliser permettre à l’Ouest de réaliser des pro-
le changement d’échelle pour grammes de Biologie d’envergure internatio-
renforcer l’excellence scienti- nale tout en tenant compte des secteurs
fique du Grand Ouest. d’importance économique régionale :
La Génopole OUEST est Application de la recherche scientifique dans
constituée de 3 volets : les secteurs clés de la génomique…
• le volet scientifique
• le volet formation
• le volet valorisation
et de 5 plateaux techniques :
• Puces à ADN
Mer :
• Génotypage/Séquençage • Explorer la diversité marine,
• Protéomique • Mieux gérer les populations marines d’intérêt
• Exploration Fonctionnelle économique,
• Bio-Informatique • Développer des recherches sur les modèles
marins de biologie fondamentale
• Exploiter les océans par l’utilisation de gènes
d’intérêt.
Volet valorisation Volet formation Contact : Catherine Boyen
CNRS / Goëmar (Roscoff) • 02 98 29 23 30
La Bretagne et les Pays de la Loire se situent au Concourir à faire boyen@sb-roscoff.fr
2ème rang national pour le nombre d’entre-
prises spécialisées en biotechnologie. de l’Ouest un pôle
L’interrégionalité de la Génopole OUEST pré-
d’excellence Agronomie
sente ainsi un terrain particulièrement favorable
à la valorisation des résultats de recherche en Etudier les organismes vivants d’intérêt pour
Génopole OUEST regroupe 400 doctorants l’agriculture et la transformation des produits
génomique et post-génomique. en biologie. Un DEA de "Génomique et
Les deux Régions présentent des structures Informatique" a été créé en 2000. L’originalité alimentaires. Un intérêt particulier sera porté
professionnalisées performantes pour le trans- de ce DEA réside dans le double recrutement aux espèces d’importance économique pour le
fert de technologies et la création d’entreprises de biologistes et d’informaticiens. Grand Ouest.
en biotechnologie : CRITT Santé Bretagne et Un DESS "Entrepreunariat" a été ouvert en Contact : Madeleine Douaire
Pays de la Loire Innovation, BBV et CBB 2001, couplé à un Diplôme Universitaire INRA-ENSAR • 02 23 48 54 62
Développement. "Création d’Entreprises Technologiques"
Au total, 10 Technopoles sur les deux Régions madeleine.douaire@roazhon.inra.fr
ouverts aux créateurs.
vont participer à la création d’entreprises de Enfin, Génopole OUEST a mis en place pour
biotechnologie via deux incubateurs Atlanpole les chercheurs, enseignants-chercheurs et
en Pays de la Loire et Emergys en Bretagne.
Enfin, l’ensemble des établissements et des
ingénieurs des formations spécifiques en
Protéomique, en Bio-Informatique et sur la
Santé :
grands organismes impliqués présentent des préparation des Puces à ADN. Etendre les recherches concernant les patholo-
structures de valorisation pour les aspects de gies humaines les plus répandues dans le Grand
propriété industrielle, de formalisation des Ouest pour lesquelles les scientifiques de
contrats et de suivi de dossiers. Ces struc- Bretagne et Pays de la Loire ont une expertise
tures travaillent déjà en réseau. Contact : reconnue internationalement.
Il faut souligner, pour finir, les initiatives com- Daniel Boujard • UMR CNRS Rennes
munes pour proposer aux jeunes des "bourses Contact : Jean-François Bouhours
02 23 23 63 76 INSERM Nantes • 02 40 41 28 35
à la création d’entreprise", et pour créer un
fond d’amorçage commun. Daniel.Boujard@univ-rennes1.fr jfb@nantes.inserm.fr
2 Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002

3. PARÉ à
INNOVER
Zoom de la valorisation. valorisation
Des acteurs
sur la Zoom sur la valorisation
CRITT Santé
Bretagne Biotechnologie CBB Développement Bretagne
La concertation entre les cher-
Végétale (BBV) : Avec plus de 15 ans d’expérience dans le transfert des biotechnolo-
gies, CBB Développement est l’un des partenaires de Génopole cheurs, les DRRT (Direction régio-
Le développement des outils de biologie moléculaire, comme le OUEST pour la valorisation de la recherche dans le secteur de la nale de la recherche et de la
séquençage de l’ADN a ouvert de nouveaux horizons aux applications biotechnologie. technologie) et les conseils régio-
des biotechnologies pour le végétal. Pour BBV, les travaux de géno- Les secteurs médicaux et agricoles étant confiés à BBV et au CRITT naux des deux régions se concré-
mique sont déterminants. Santé, CBB Développement couvre les autres thématiques horizon- tisent par un soutien d’animation
"BBV est partenaire de Génopole OUEST au titre de la valorisation tales : le diagnostic, la chimie ou l’environnement. et de coordination via le CRITT
des résultats de la recherche. Notre objectif est d’appliquer les A terme, fin 2002, voire 2003, les travaux de recherches engagés Santé Bretagne
résultats de la génomique et de profiter des transferts de connais- aujourd’hui devront se traduire par des réalisations concrètes :
sance en la matière. Par exemple, nous allons pouvoir exploiter les transferts de technologies et créations d’entreprises avec l’incuba- Le CRITT Santé Bretagne (Centre
recherches qui sont faites sur des ‘plantes cousines’ du chou-fleur, teur Emergys. Régional d’Innovation et Transfert
comme le colza, pour accélérer nos propres travaux portant sur ce "Plus concrètement, pour l’année 2002, notre rôle portera sur 3 de Technologies) est un centre
légume typique de notre région. points : d’interface dédié au secteur de la
La plate-forme Génotypage-Séquençage prévue par le projet sera • la veille technologique, au sens économique (et non scientifique), santé.
établie au CNRS de Roscoff, ce qui est un atout en terme de proxi- c’est à dire réaliser un état de l’art sur les marchés, sur la concur- Ses missions concernent la diffu-
mité. Ses équipements ultra-modernes, parfois tout juste sortis du rence, sur les choix qui sont faits dans le monde, et les paris tech- sion de technologies, l’interface
stade prototype, donc souvent trop coûteux pour BBV, seront éga- nologiques à faire ;
lement à notre disposition pour nos recherches." • la communication, créer des espaces de rencontres entre les cher- entre la recherche et l’industrie, le
cheurs et les applicateurs, qui se traduira par une aide logistique conseil technologique, l’ingénierie
Contact : pour participer à des événements tels que Génom’Expo, Bio 2002 de projets et l’accompagnement
Serge Mabeau / Stéphane Boury • BBV ou le Carrefour des Biotechnologies. de projets innovants.
• une réflexion sur l’expertise économique que les centres de trans- Les missions spécifiques dans le
02 98 29 06 44 cadre de Génopole OUEST sont
fert peuvent apporter aux plates-formes technologiques afin de
boury@bbv.fr mieux analyser les développements industriels possibles." destinées à accompagner et
conseiller les promoteurs de la
Contact : génopole OUEST , à mettre en
Gilbert Blanchard • CBB Développement place une animation en concerta-
02 99 38 33 30 tion avec le comité de pilotage, à
info@cbb-developpement.com soutenir la mise en place des
plate-formes et à accompagner
Une illustration du principe de valorisation les programmes qui reposent sur
une complémentarité de compé-
tences, de thématiques et de
après la recherche fondamentale : les tests, moyens à l’échelle des deux
régions.
puis les applications Nouvelle recrue au CRITT Santé
Biotrial teste pour le CNRS Biopredic : Efficacité et pour la Génopole Ouest
un possible substitut sanguin Sécurité des produits Depuis le 7 janvier 2002,
Jocelyne Le Seyec a rejoint
Biotrial, laboratoire de recherche en pharmacologie s’est vu
récemment confié par le CNRS de la station Biologique de
cosmétiques, pharmaceutiques l’équipe du CRITT Santé Bretagne
au poste d’animateur/coordina-
Roscoff les tests sur l’arénicole, un petit ver marin utilisé
comme appât par les pêcheurs.
et compléments santé teur pour la Génopole OUEST.
L’arénicole est notre ‘cousin’ sanguin. Une molécule extra- Biopredic a été créée en 1987 par Christophe Chesné, l’actuel Docteur en Biologie Moléculaire et
cellulaire de ce ver présente des propriétés similaires aux Directeur Général de la société. Cellulaire de l’Université de Rennes 1,
nôtres. Son sang pourrait donc se révéler être un substitut A l’origine de cette PME rennaise : un transfert de technologie que suivi d’un post-doctorat de 2 ans
sanguin efficace et Christophe Chesné a entrepris avec l’INSERM - l’Institut National en Finlande, elle occupait un poste
pourrait ainsi pallier à de la Santé et de la Recherche Médicale. Ce transfert portait sur la de chef de projet dans la société
la pénurie des dons. culture de cellules du foie, une technique qu’il a ensuite exploitée de biotechnologie ValiGen à Paris.
La recherche fonda- pour développer toute une série de tests in vitro.
mentale a été effec- Biopredic compte aujourd’hui 25 salariés et propose aux entreprises de : Contact :
tuée par le docteur • tester in vitro les interactions médicamenteuses, établir le profil Jocelyne Le seyec
Franck Zal du CNRS. Arénicole métabolique des médicaments
Des premiers tests CRITT Santé Bretagne
ont d’ores et déjà été effectués sur des souris et se sont • réaliser les études consommateurs pour évaluer l’efficacité des 02 23 23 45 81
révélés encourageants. Biotrial gère aujourd’hui les tests pré- compléments alimentaires et produits cosmétiques crittgbm.bretagne@univ-rennes1.fr
cliniques sur d’autres animaux. • réaliser les essais nécessaires pour assurer la sécurité des produits
Ces tests doivent déterminer si l’hémoglobine d’arénicole cosmétiques
remplit tous les critères d’efficacité et de sécurité pour pou- En 1993, Christophe Chesné a également lancé Biopredic
voir être transfusés à l’homme. Le cas échéant, une synthèse International. Cette société permet à ses clients de réaliser leurs
par génie génétique ou bien l’élevage de ces arénicoles propres tests produits grâce à l’utilisation de kits diagnostics déve-
(aquaculture) pourrait être envisagé dans la région. loppés par Biopredic International.
Contact : Contact :
Jean-Marc Gandon / Christophe Drieu La Rochelle Christophe Chesné • Biopredic
Biotrial • 02 99 59 91 91 02 99 14 36 14
christophe.drieu@biotrial.com christophe.chesne@biopredic.com
3

4. PARÉ à Lettre d’information de l’innovation en bretagne
INNOVER
Petit lexique …
Si comme certains
Bio-informatique
Bio-informatique
d’entre nous,
vous n’êtes pas
Relever le défi du décryptage des
des "pros" de la génomes : la Bio-informatique
génomique… Dans le projet de la Génopole OUEST, la bio-infor- nées massives de la génomique et leur analyse au
L’ADN matique prend naturellement une place stratégique. quotidien Celle-ci repose sur des moyens de cal-
C’est une macromolécule servant de Il s’agit de mettre à disposition des biologistes une culs puissants, coordonnés par l’Irisa de Rennes, et
support à l'information génétique infrastructure performante pour la gestion des don- articulés au sein du réseau régional haut débit
chez la plupart des êtres vivants.
Mégalis. Il s’agit ensuite de relever le formidable
Le gène Radiographie ADN défi du décryptage des génomes nouvellement
C’est une portion d’ADN contenue dans séquencés, c’est à dire de développer des
le chromosome qui va conditionner la recherches en collaboration étroite entre biolo-
transmission et la manifestation d’un gistes et informaticiens, nécessaires au passage de
caractère héréditaire donné. données expérimentales brutes à de véritables
Le génome
connaissances sur le fonctionnement du vivant.
C’est la carte d’identité de l’individu Contact :
c’est à dire l’ensemble des gènes qu’il Jacques Nicolas • IRISA Rennes
transmet à sa descendance.
02 99 84 73 12
Le génotype Jacques.Nicolas@irisa.fr
C’est l'ensemble des caractères hérédi-
taires propres à un individu et contenu
dans le génome.
La génétique
Infos pratiques
Infos pratiques
C’est l’étude de la structure des gènes. Les chiffres clés
La génomique
C’est l’étude de la structure et des Secteur mer : Secteur agronomique :
fonctions des génomes.
Economiquement, le secteur de la mer dans L’activité agronomique en Bretagne et Pays de
La protéomique l’Ouest c’est : la Loire est très importante puisque ces deux
C’est l’étude de la structure et des régions produisent par rapport à la produc-
fonctions des protéines codées par les • Pour la pêche : tion nationale :
gênes pour transmettre les informa- 50 % de la production nationale de poisson
tions relatives aux caractères hérédi- (350 000 tonnes) et 100 % de la production • 70 % de choux-fleurs, • 42 % de viande de volaille,
taires. Déceler parmi les protéines d’algues (50 000 tonnes) sont réalisées dans l’ouest. • 33 % de pommes de terre, • 31 % de veau,
celles qui sont responsables de mala- • 36 % de primeurs, • 20 % de lait,
dies peut permettre à l’industrie phar- • Pour l’aquaculture :
maceutique de mettre au point de 30% de la production nationale provient • 30 % de pommes, • 47 % d’œuf,
nouveaux traitements thérapeutiques. de l’ouest. • 56 % de porc, • 45 % d’aliment pour le bétail.
Les puces à ADN (ou biopuces) • Pour la conserverie : Sans compter les industries agroalimentaires
Les puces à ADN sont des supports (sili- 80 % des conserves nationales de poissons, qui réalisent à elles seules (produits finis, salai-
cium, plastique, verre, etc.) d'une taille sardines, maquereaux, thons sont issues de la sons…) le plus gros chiffre d’affaires de l’indus-
d'environ 1 cm2 sur lesquels sont greffés production de l’ouest. trie régionale dans l’Ouest.
des sondes d’ADN qui vont reconnaître
une séquence d’ADN donnée. Les bio-
puces sont appelées à devenir des outils
de choix pour les chercheurs qui tra-
vaillent dans la génomique.
Le séquençage (des gènes)
Agenda Kiosque
C’est le décryptage des séquences Quelques dates à retenir pour 2002 Tout comprendre de la génomique
moléculaires composant un gène, une
protéine 6ème congrès annuel de la Société Française
en trois clics
de Pharmacologie Si vous souhaitez en savoir plus, le site
Rennes du 8 au 10 avril. www.sciences-en-ligne.com vous propose des
http://www.pharmacol-fr.org/rennes2002 modules animés pour comprendre le génome et la
génétique, une sélection d’ouvrages, des infos scienti-
BIO 2002 à Toronto fiques, techniques et industrielles sur la génomique.
(Canada) du 9 au 13 juin
http://www.bio.org
JOBIM (Journées Ouvertes Biologie Informatique
Mathématique)
Directeur de Publication : St Malo du 10 au 12 juin.
Michel Kervoas
Rédaction : équipe de Bretagne Innovation http://www.irisa.fr/JOBIM
et correspondants
Création et réalisation : 1er Carrefour européen des biotechnologies et
Agence de création autrement Loïc Bohuon 6ème Carrefour Français
Impression : Imprimerie CPS Lille les 15-16 octobre.
ISSN : 1624-8589 • Tirage 5500 ex http://www.biotech-lille.com
Avec le soutien du
Conseil Régional de Bretagne
Bretagne Innovation • 18 place de la gare
CS 26927 - 35069 Rennes cedex 4 Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002
contact@bretagne-innovation.tm.fr