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1.
Introduction Microarray Chip
Speaker : Jong-Waye Ou 2009/7/20
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
DNA Double Helix
( 雙股螺旋) (1)
11.
DNA Double Helix
( 雙股螺旋) (2)
12.
13.
14.
15.
16.
17.
18.
↑ 染色體層次圖 (
由左至右 ) ← 染色體結構圖 ( 由上至下 ) 染色體的股線緊密折疊,一般認為染色體是由很長的 DNA 雙螺旋鏈 盤捲在組織蛋白質 (histone) 分子上,像珠子串在一條線上的形式形成 染色質 (chromatin) 。例如,一條人類染色體之 DNA 平均長度為 5Omm 。 DNA 分子繞組織蛋白質分子結合成為 核體 (nucleosome) 單位 ,核體單位折疊緊縮形成 染色質纖維 (chromatin fiber) ,染色質纖維高度折疊形成 染色體的延伸部份 ,而纏繞又折疊形成 染色體的緊縮部份 。
19.
DNA 雙股螺旋
20.
DNA 中核甘酸間之鍵結
21.
22.
DNA 四種含氮鹼基
23.
DNA 序列形狀
24.
DNA 序列
25.
26.
27.
轉錄與轉譯作用
28.
29.
DNA 的複製 (Replication)--
動畫
30.
DNA RNA
轉錄 (Transcription) – 動畫
31.
RNA 蛋白質
轉譯 (Translation) – 動畫
32.
蛋白質 (Protein) 的組成
胺基酸 (Amino Acid) 為蛋白質的基本單位, 共 20 種
33.
蛋白質分子形狀
34.
胺基酸分子形狀
35.
36.
37.
38.
39.
40.
SDS 有一個極性頭部
( sodium dodecyl sulfate, 硫酸十二酯鈉 ) 與一條非極性尾巴。 因此 SDS 可以介入極性與非極性基團之間,是一種 界面活性劑 ,就是俗稱的 清潔劑 。 SDS 可以把非極性尾巴鑲入蛋白質三級構造的內部,而以其極性頭部與外界的水分子結合,因而使得蛋白質變性。
41.
理論上 SDS
是很均勻的吸附到蛋白質上,因此不管原來蛋白質分子的大小,每種蛋白質分子上 所吸附的負電荷密度是相同的 。
42.
蛋白質 Z
在左邊的 native-PAGE 中無法向下泳動,但在右邊的 SDS-PAGE 則可以依其分子量正確泳動;因此一般使用上, SDS-PAGE 的應用較廣泛。 在 SDS-PAGE 下,雖然 X 分子被解構成單元體,因此分子量由 160 kD 變成 40 kD ;但若在較為溫和的樣本處理條件下,有可能看到未完全解構的 160 kD 蛋白質色帶。
43.
44.
PCR 放大過程–動畫
45.
PCR 流程簡圖
PCR 機器
46.
47.
48.
49.
50.
51.
52.
西方墨點的應用–檢測玉米是否基因改造–動畫
53.
54.
55.
56.
← Ezspot
Arrayer 左圖為生物晶片打點機,下方為其玻璃載片或薄膜載片。此機種為 DNA 及蛋白質皆適用多功能機型。
57.
58.
59.
60.
61.
62.
63.
Protein Chip
64.
65.
生物晶片載片型式
66.
67.
68.
69.
70.
71.
72.
Spotting Robot
73.
74.
75.
76.
77.
78.
生物晶片設計製造操作–動畫
79.
80.
81.
82.
83.
84.
85.
86.
87.
資料正規化範例 左圖為未正規化資料,右圖則是已正規化之資料 明顯可看出正規化後的顏色較為鮮明易辨認。
88.
89.
90.
91.
92.
93.
94.
95.
生物晶片醫療市場預測
96.
97.
98.
Notas del editor
http://www.nj13z.cn/bio/Article_Special.asp?SpecialID=11 http://www.gmw.cn/content/2004-07/12/content_56177.htm
http://www.nj13z.cn/bio/Article_Show.asp?ArticleID=620
http://www.ascc.net/nl/92/1920/02.txt
http://forums.chinatimes.com.tw/special/genome/img/genome_project.jpg
http://pck.bio.ncue.edu.tw/pckweb/database/data2/ck/ch08/supply/8-1-4.htm
http://pck.bio.ncue.edu.tw/pckweb/database/data2/ck/ch08/supply/chromosome.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://news.bbc.co.uk/chinese/simp/hi/newsid_1420000/newsid_1427700/1427749.stm 有疑義
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p3.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p7.htm#e
http://juang.bst.ntu.edu.tw/Protein/Analysis/A3.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://natsci.york.cuny.edu/~tok/PCR.JPG http://microvet.arizona.edu/Courses/MIC328/Waynes%20World/328%20images/PCR%20fig.jpeg
http://bioteach.ttu.edu.tw/bioterm/blotting.htm
http://www.bio.miami.edu/dana/250/southern.jpg
http://bioteach.ttu.edu.tw/bioterm/blotting.htm
http://bioteach.ttu.edu.tw/bioterm/blotting.htm
http://bioteach.ttu.edu.tw/bioterm/blotting.htm
http://bioteach.ttu.edu.tw/bioterm/blotting.htm
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://www.ncku.edu.tw/~cbst/biochip.htm
http://140.130.177.203/jgtsay/jg3-42e4.html
http://www.bertec.com.tw/microarray.htm
http://140.130.177.203/jgtsay/jg3-42e4.html
http://140.130.177.203/jgtsay/jg3-42e4.html
http://140.130.177.203/jgtsay/jg3-42e4.html
http://www.biochip.org.tw/chiptype.asp
http://www.biochip.org.tw/chiptype.asp http://www.getgoal.com.tw/epaper/index-11.htm
http://www.getgoal.com.tw/epaper/index-11.htm
http://home.pchome.com.tw/discover/biochipmaster/BiochipChinese.pdf
http://home.pchome.com.tw/discover/biochipmaster/BiochipChinese.pdf
http://home.pchome.com.tw/discover/biochipmaster/BiochipChinese.pdf
http://home.pchome.com.tw/discover/biochipmaster/BiochipChinese.pdf
http://www.maths.tcd.ie/~ecoli/JSPDFS/harrington.pdf
http://www.maths.tcd.ie/~ecoli/JSPDFS/harrington.pdf
http://www.maths.tcd.ie/~ecoli/JSPDFS/harrington.pdf
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/mbcf/overview_ma.jsp
http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/mbcf/overview_ma.jsp
http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/mbcf/overview_ma.jsp
http://protein.ncu.edu.tw/p2.htm
http://www.rdmag.com/features/0204micro23.asp http://www.agilent.com/about/newsroom/features/2004feb03_humangenome.html
http://www.nature.com/ng/journal/v27/n3/pdf/ng0301_232.pdf
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
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Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
Reference: Microarray pdf file by Yuki Juan in NTUST, May 26, 2003
http://home.pchome.com.tw/discover/biochipmaster/BiochipChinese.pdf
http://www.ncku.edu.tw/~cbst/biochip.htm
http://www.ncku.edu.tw/~cbst/biochip.htm
http://www.getgoal.com.tw/epaper/index-11.htm
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