1. MASTER DE SCIENCES ET TECHNOLOGIES
Rééducation et ingénierie médicale (RIM)
Initiation à la recherche documentaire
Université Pierre-
et-Marie-Curie
Formation_Bu_Medecine
(at)scd.upmc.fr
www.upmc.fr
Master RIM
2. Plan de l’intervention
1. Les bibliothèques
2. Ebooks et bases de données
3. Articles scientifiques : circuit et évaluation
4. Lire une bibliographie
Master RIM 2
5. Bibliothèque de la Pitié
• 91, boulevard de l’Hôpital
• Ouverte de 9h à 23h, du lundi au vendredi
• Le samedi, ouverture de 10h à 20h (17 septembre 2011 au 30 juin 2012
inclus)
• Inscriptions jusqu’à 18h45 (17h15 le samedi).
• Carte (ou attestation) indispensable pour l’inscription
• Prêts et retours sur les automates après cette heure
• Possibilité d’acheter des cartes pour photocopier / imprimer
• Ressources spécialisées en orthophonie & psychomotricité
• En savoir plus : http://www.jubil.upmc.fr/fr/bibliotheques_medecine/bib_pitie.html
Master RIM 5
8. Le classement NLM
• Classement NLM (National Library of Medicine)
• Principales subdivisions :
– Généralités, sciences fondamentales (B à QZ)
– Médecine générale (W, WA, WB)
– Spécialités (WC à WZ)
Exemple : WP 145 DES = gynécologie/tumeurs/Descamps
Master RIM 8
9. Le classement NLM
•WG Cardiovascular System
•WH Hemic and Lymphatic Systems
Preclinical Sciences: •WI Digestive System
• QS Human Anatomy •WJ Urogenital System
• QT Physiology •WK Endocrine System
• QU Biochemistry •WL Nervous System
• QV Pharmacology •WM Psychiatry
• QW Microbiology and Immunology •WN Radiology. Diagnostic Imaging
•WO Surgery
• QX Parasitology
•WP Gynecology
• QY Clinical Pathology •WQ Obstetrics
• QZ Pathology •WR Dermatology
•WS Pediatrics
• Medicine and Related Subjects: •WT Geriatrics. Chronic Disease
• W Health Professions •WU Dentistry. Oral Surgery
• WA Public Health •WV Otolaryngology
• WB Practice of Medicine •WW Ophthalmology
•WX Hospitals and Other Health Facilities
• WC Communicable Diseases •WY Nursing
• WD Disorders of Systemic, Metabolic •WZ History of Medicine
or Environmental Origin, etc. •19th Century Schedule
• WE Musculoskeletal System
• WF Respiratory System
Master RIM 9
10. Le classement
Quelques cotes propres aux paramédicaux
(dont sujets enseignés en master RIM)
BF Psychologie
GN Anthropologie
LB Education
QS Anatomie humaine
QZ Pathologies
WE Appareil locomoteur
WL Neurologie
WM Psychiatrie, psychothérapie
WN Imagerie
WS Pédiatrie (et psychiatrie de l’enfant)
WT Gériatrie
WV ORL
Master RIM 10
11. Bibliothèque Saint-Antoine
• 27, rue de Chaligny, 12e arr.
• Métros Faidherbe-Chaligny (ligne 8) ou Reuilly-Diderot (ligne 1)
• Ouverte de 9h à 22h, du lundi au vendredi
• Inscriptions et prêt d’ouvrages jusqu’à 18h45
• Prêt / retour sur les automates de prêt après cette heure
En savoir plus : http://www.jubil.upmc.fr/fr/bibliotheques_medecine/bib_stantoine.html
Master RIM 11
12. Bibliothèques médicales spécialisées
• Axial-Caroli (Saint-Antoine) : bâtiment Caroli, hépato-
gastroentérologie
• Charcot (Pitié) : dans l’ICM, spécialisée en neurosciences
(collections anciennes)
• Dechaume (Pitié) : à côté de l’amphi de stomatologie,
spécialisée en stomatologie, odontologie, chirurgie
maxillo-faciale + orthophonie, anatomie pathologique
• Tenon-Meyniel : à côté de l’amphi Béclère, cancérologie,
obstétrique, soins palliatifs
• Trousseau : pavillon. L.-Chigot (entresol), spécialisée en
pédiatrie
Master RIM 12
13. Bibliothèque L1-L2 (Jussieu)
• À partir du 17 septembre ouverture le
samedi
• À partir du 19 septembre, nocturnes
jusqu’à 21h
En savoir plus : http://www.jubil.upmc.fr/fr/bibliotheques_sciences/bib_l1l2.html
Master RIM 13
14. Les revues paramédicales à la Pitié
• Le Langage et l’homme
• Actualités orthophoniques • La Lettre aux psychomotriciens
• ANAE • Motricité cérébrale
• Bulletin de la Société Française • Neuro-psy
d’Éducation et de Rééducation • Neuropsychiatrie de l’enfance et de
Psychomotrice l’adolescence
• Entretiens d’orthophonie • Orthophoniste
• Ortho-magazine
• Entretiens de psychomotricité
• Perspectives psychiatriques
• Évolutions psychomotrices • Pratiques corporelles
• Glossa : cahiers de l’UNADREO • Psychiatrie de l’enfant
• Handicap : cahiers du CTNERHI • Psychomotricité
• Information psychiatrique • Rééducation orthophonique
• Thérapie psychomotrice et recherche
Master RIM 14
15. Les mémoires à la Pitié
À la Pitié, dans la salle au fond à gauche
Ouverte comme le reste de la bibliothèque
Master RIM 15
16. Trouver les mémoires
• Lire la cote pour trouver le mémoire :
MOR2008P43
• Avant 1983 : les mémoires sont à Marne-la-Vallée
Master RIM 16
17. La testothèque à la Pitié
• Environ 60 tests à la Pitié, dans l’armoire
derrière la banque de prêt
• Non empruntables / Pas de photocopie
• Lecture sur place, en échange de la carte
d’étudiant
• Pas accessible après 19h, le samedi après 17h30
Master RIM 17
20. Sur MonUPMC, des outils pour
se former à l’informatique
Master RIM 20
21. Les mêmes codes servent pour
la messagerie de l’UPMC
http://webmail.etu.upmc.fr
Y aller au moins une
fois pour rediriger les
courriels de l’université
sur votre boîte perso
Master RIM 21
22. Problèmes d’accès ?
Si vos codes d’identification ne fonctionnent
plus (ou si vous ne les avez plus),
adressez-vous à votre scolarité
ou au bureau 216 (2e étage du 91, bd de
l’Hôpital)
Master RIM 22
32. Si le livre n’est pas dans les
catalogues de l’UPMC
• Consulter le
SUDOC
(Système
Universitaire de
DOCumentation)
• Ouvrages de toutes
les bibliothèques
universitaires de
France (livres, revues,
thèses…)
Master RIM 32
36. SUDOC : où trouver le document
Les bibliothèques qui
possèdent
le livre peuvent
l’envoyer dans votre
Master RIM 36
bibliothèque
37. Le prêt entre bibliothèques
(PEB)
• Intérêt du SUDOC : trouver un livre, un mémoire ou une revue
qui ne sont pas dans une bibliothèque de l’UPMC
• Si l’ouvrage ou la revue ne sont pas dans une bibliothèque
proche, on peut se les procurer via le PEB
• Payant : 6 € par ouvrage, 3 € par article (50 pages max.) pour
des photocopies
• Quelques jours après, vous venez retirer l’ouvrage ou les
photocopies dans votre bibliothèque
Master RIM 37
38. Trouver un article sur un sujet
• Les catalogues vous permettent de savoir
dans quelle bibliothèque se trouve un livre
ou une revue
• Ils n’indexent pas (encore) les articles à
l’intérieur des revues
Master RIM 38
40. Ce qu’on trouve sur JUBIL
• Des ressources « papier » : catalogues
(livres + revues + mémoires)
• Des ressources électroniques :
– Livres (ebooks, Jubilothèque)
– Revues électroniques
– Bases de données (références d’articles
dans des revues)
Master RIM 40
41. Trouver des ebooks (en plus de ceux déjà présents
dans le catalogue général)
Master RIM 41
48. Bases de données
bibliographiques
• Si on cherche des articles sans savoir dans
quelle revue on va les trouver :
• ATTENTION : Les catalogues des bibliothèques
ne répertorient que des titres de revues, pas des
titres d’articles
• Il faut passer par des bases de données
bibliographiques : PubMed, EM-Premium, Web
of Science…
Master RIM 48
49. PubMed / MedLine :
présentation
- MEDLINE (Medical Literature Analysis and
Retrieval System Online)
- Base de données bibliographiques
(= références d’articles ≠ texte des articles) en
sciences biologiques et biomédicales
- Base gérée et mise à jour par la bibliothèque
nationale de médecine des États-Unis (NLM)
Master RIM 49
50. PubMed / MedLine : contenu
- MedLine = le contenu (base de données)
≠ PubMed = le contenant (accès à MedLine +
autres bases)
- 21 millions de références d’articles, tirés de
5 000 revues, depuis les années 1950
- Une centaine de titres français
- Liste des revues :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/citmatch_help.html#JournalLists
Master RIM 50
51. PubMed via JUBIL
PubMed est accessible gratuitement sur
Internet mais si on passe par JUBIL pour
s’y connecter :
On garde l’interface classique
+ lien vers texte intégral si nos
bibliothèques sont abonnées
Master RIM 51
55. Interroger PubMed
• Pour avoir des résultats pertinents, rechercher en anglais
• Les articles sont indexés avec un système de mots-clefs
hiérarchisés : le MeSH
• MeSH pour Medical Subject Headings
• Intérêt du MeSH : gère les synonymes (Trisomy 21 = Down
Syndrome = Mongolism)
+ permet de chercher sur le sujet seulement des articles :
exemple de la revue Cell ou du docteur Cell
+ permet de réaliser des recherches fines, en allant du général
au particulier
Master RIM 55
56. Qu’est-ce que le MeSH ?
• Plus de 25 000 termes, hiérarchisés entre eux,
répartis en 16 grandes catégories
• Mise à jour annuelle
• Traduction française
par l’INSERM
Master RIM 56
57. Le MeSH est accessible via PubMed
Master RIM 57
59. Exemple d’un terme dans
l’arborescence du MeSH (on part du
général pour arriver au plus précis)
Master RIM 59
60. Un même terme peut appartenir à
plusieurs arborescences
Master RIM 60
61. Une recherche dans l’idéal :
Étape 1 : trouver le mot-clef de départ en français
• On détermine un mot-clef intéressant en
français
• On cherche l’équivalent de ce mot-clef dans le
MeSH français
• Le site du CISMeF propose la traduction
française du vocabulaire MeSH
Master RIM 61
65. Étape 2 : choix des qualificatifs
Master RIM 65
66. Les qualificatifs du MeSH
Le MeSH comprend 83 qualificatifs
Chaque mot-clef du MeSH ne peut être associé
qu’avec certains qualificatifs
AB Abnormalities EM Embryology PP Physiopathology
AD Administration and Dosage EN Enzymology PO Poisoning
AE Adverse Effects EP Epidemiology PC Prevention and Control
AG Agonists ES Ethics PX Psychology
AA Analogs and Derivatives EH Ethnology RE Radiation Effects
AN Analysis ET Etiology RA Radiography
AH Anatomy and Histology GE Genetics RI Radionuclide Imaging
AI Antagonists and Inhibitors GD Growth and Development RT Radiotherapy
BI Biosynthesis HI History RH Rehabilitation
BS Blood Supply IM Immunology SC Secondary
BL Blood IN Injuries SE Secretion
CF Cerebrospinal Fluid IR Innervation ST Standards
CS Chemical Synthesis IS Instrumentation SN Statistics and Numerical Data
CI Chemically Induced IP Isolation and Purification SD Supply and Distribution
CH Chemistry LJ Legislation and Jurisprudence SU Surgery
CL Classification MA Manpower TU Therapeutic Use
CO Complications ME Metabolism TH Therapy
CN Congenital MT Methods TO Toxicity
CT Contraindications MI Microbiology TM Transmission
CY Cytology MO Mortality TR Transplantation
DF Deficiency NU Nursing TD Trends
DI Diagnosis OG Organization and Administration US Ultrasonography
DU Diagnostic Use PS Parasitology UL Ultrastructure
DH Diet Therapy PY Pathogenicity UR Urine
DE Drug Effects PA Pathology UT Utilization
DT Drug Therapy PK Pharmacokinetics VE Veterinary
EC Economics PD Pharmacology VI Virology
ED Education PH Physiology
Master RIM 66
67. Pourquoi utiliser le MeSH ?
• Recherche dans PubMed
– Avec « moelle épinière » : 85 articles seulement
– Avec « moelle spinale » : 1 article seulement
– Avec « spinal cord » (directement) :
plus de 145 000 articles
– Avec « spinal cord [MeSH] » : 73 000 articles
– Avec un qualificatif « "Spinal Cord/surgery"[Mesh] » :
2 600 articles
Master RIM 67
68. Combiner les termes recherchés
• Opérateurs booléens (en majuscules)
AND / OR / NOT
• (AND) par défaut (en majuscule !)
• Troncature (transpl*) + guillemets
(« kidney allograft »)
Master RIM 68
71. Limiter le nombre de résultats (par langue, type de
document, population…)
Master RIM 71
71
72. Consulter les articles trouvés
• Sur papier dans les bibliothèques (JUBIL)
• En ligne, sur les postes des bibliothèques
• Et maintenant de chez vous, via l’accès
distant
Master RIM 72
73. Lien direct vers le PDF ?
• Quand on est sur un ordinateur de l’université
• OU connecté en accès distant via JUBIL
• ET SI l’université est abonnée aux revues en
ligne où est paru l’article recherché
• Alors icône pour accès direct au PDF
Master RIM 73
75. EM-Premium
• Anciennement EMC (encyclopédie
médico-chirurgicale)
• Puis EM-Consulte (Elsevier-Masson)
• Traités depuis 1970 + articles des revues
Elsevier en français (150 000 articles de
30 revues).
Master RIM 75
76. Recherche d’informations médicales : outils
Plate-forme de l’Encyclopédie Médicale Continue – EM-Consulte
Objectifs :
• Regrouper l'ensemble des traités EMC et des revues médicales
Contenus :
• 76 traités d’EMC (43 en français),
•Traités :
• ORL (pathologie de l’audition, audiophonologie)
• Médecine physique réadaptation
• Pédopsychiatrie, psychiatrie
• Neurologie
• des articles de traités d'EMB (Evidence Based Medicine),
• 130 revues en français, 2 000 en anglais
• Archives de pédiatrie
• Annales médico-psychologiques
• Neuropsychiatrie de l’enfance et de l’adolescence
• Ortho-magazine (pas dans nos abonnements : aller à la BIU
Santé)
• Revue neurologique
• iconographies et tableaux,
Master RIM
• + de 300 ouvrages. 76
77. Accès via JUBIL
(ressources en ligne / revues)
Master RIM 77
79. Recherche d’informations médicales : outils
Plate-forme de l’Encyclopédie Médicale Continue – EM-Consulte
Titre en vert = accessible à l’UPMC
Titre en noir = pas abonné
Master RIM 79
80. Recherche d’informations médicales : outils
Plate-forme de l’Encyclopédie Médicale Continue – EM-Consulte
Attention : articles archivés avant 2003 pas disponibles en ligne !
Master RIM 80
82. Recherche d’informations médicales : outils
Un moteur académique généraliste, Google Scholar
http://scholar.google.com/
Saisie Options
recherche recherche
• Grand nombre de documents : articles à comité de lecture, thèses, livres,
résumés analytiques… (mais la liste des sources moissonnées n’est
pas connue avec exactitude)
• Grand nombre de sources : éditeurs scientifiques, sociétés savantes,
référentiels de prépublication, universités et organismes de recherche
• Affichage par ordre décroissant de pertinence
Master RIM 82
83. Recherche d’informations médicales : outils
Un moteur académique généraliste, Google scholar
Limites
• Accès au texte intégral rare. On peut seulement lire l’intégralité
des articles Open Access ou, si on est sur un poste dont l’IP est
déclarée, les articles dont l’accès est payé par l’UPMC.
• Certaines sources web n'incluent pas la date des publications.
Une recherche par date ne renverra donc pas les articles pour
lesquels Google Scholar est incapable de définir la date de
publication. (Conseil : si on ne trouve pas l’article cherché avec
sa date, relancer la recherche sans limite de date)
• Pas d’indexation matière (recherche par sujet)
• Pas de thésaurus
• Pas de recherche avec l’option troncature
Master RIM 83
84. Sites Internet
• CNRS : biblioshs.inist.fr
• INSERM : biblioinserm.inist.fr
Master RIM 84
84
85. Reconnaître un site de qualité sur
Internet
• En dehors des signets de JUBIL
ou de la BnF, repérer le sigle
HON sur les sites
(certification pour le compte de
la Haute autorité de Santé)
HON : Health on the Net
Master RIM 85
86. Certification HON : 8 principes
• 1. Autorité : Indiquer la qualification des rédacteurs
• 2. Complémentarité : Compléter et non remplacer la relation patient-
médecin
• 3. Confidentialité : Préserver la confidentialité des informations
personnelles soumises par les visiteurs du site
• 4. Attribution : Citer la/les source(s) des informations publiées et dater
les pages de santé
• 5. Justification : Justifier toute affirmation sur les bienfaits ou les
inconvénients de produits ou traitements
• 6. Professionnalisme : Rendre l’information la plus accessible
possible, identifier le webmestre, et fournir une adresse de contact
• 7.Transparence du financement : Présenter les sources de
financements
• 8. Honnêteté dans la publicité et la politique éditoriale
Master RIM 86
88. De la production à l’évaluation de l’information
Circuit de publication et de validation des informations
Définition d’une publication scientifique ou médicale
• un document (sur support imprimé, électronique, etc.)
• rédigé par des chercheurs
• décrivant un travail original
• validé par des pairs (peer-review)
Contrôle des pairs
• nouveauté du travail
• intérêt scientifique significatif
• validité des processus expérimentaux
• fiabilité des résultats
• qualité de l’interprétation des résultats
• présentation : longueur, rédaction, bibliographie
Master RIM 88
89. De la production à l’évaluation de l’information
Circuit de publication et de validation : les articles
Choix de la
revue dans
laquelle publier
Respect des
conseils aux PUBLICATION
auteurs
ACCEPTATION
Rédaction Relecture
des
épreuves
ÉDITEUR
Soumission de la
du manuscrit
REVUE
original
Comité de DEMANDE de
MODIFICATIONS ACCEPTATION
lecture :
Évaluation 1à3
rapporteurs Soumission Relecture
(referees) des des
corrections épreuves
REFUS
Master RIM 89
90. Bibliométrie
Le modèle de l’ISI
Le facteur d’impact (accès payant)
Nombre de citations reçues pour les années n-1 et n-2
I.F. année n = ---------------------------------------------------------------------------
Nombre d’articles publiés pour les années n-1 et n-2
Estimation de la fréquence de citation d’un article « lambda » d’une
revue pour une année donnée (calculée à partir des citations au cours des
deux années précédentes)
Évaluation de l’importance relative d’une revue par rapport à une ou
plusieurs autres du même domaine
Master RIM 90
91. Bibliométrie
Le modèle de l’ISI
http://admin-apps.isiknowledge.com/JCR/JCR
Les facteurs d’impact des principales revues en médecine générale et interne
Master RIM 91
92. IF 2008 = 7.4 : chaque article publié par J Neuroscience en 2006 & 2007 a
été cité en moyenne 7.4 fois par d’autres revues.
Master RIM 92
93. Bibliométrie
Les limites du modèle de l’ISI
Mode de calcul des indices
• Délai de 2 ans du facteur d’impact critiquable
S’agissant du facteur d’impact
• Décalage (les changements récents ne sont pas pris en
compte)
• Extrapolation (périodique -> articles, lissage)
• Valorisation/dévalorisation en fonction de la nature des
travaux
Master RIM 93
94. Bibliométrie
Les alternatives
Citebase - http://www.citebase.org
Rapport téléchargements / citations
Google Scholar - http://scholar.google.fr
Comptage brut des citations, réservoir de sources non défini
Outil ouvert, mais algorithme protégé et couverture non définie
Indice h - http://www.pnas.org
Coïncidence nombre total de publications / citations
Ex : P.-G. de Gennes = 79 (~ 79 publications citées au - 79 fois)
F1000 factor - http://www.facultyof1000.com
créé par BioMed Central - 2002
Panel de chercheurs attribue un indice (note 3, 6 ou 9)
Qualification et catégorisation des articles
Master RIM 94
96. Lire une bibliographie
• Bibliographie : liste des ouvrages, articles,
mémoires… consultés pour une recherche
• Après avoir appris comment organiser une
bibliographie, on peut lire celle des autres
• Cf. erreur article/ouvrage
Master RIM 96
97. Lire une bibliographie
Ordre alphabétique auteurs pour une bibliographie
courte
Organisation thématique
Organisation par type de document : documents
généraux/spécialisés, ouvrages/revues/Internet…
Règles de présentation des références bibliographiques :
Voir Doc’INSA : http://tinyurl.com/lbp8xw
Master RIM 97
98. Quelques exemples
? BROCA, Alain de. Douleurs, soins palliatifs, deuils. 2e éd. Paris :
Masson, 2005, 173 p.
? LEGOUT, Valérie, MOYSE, Dominique. Douleur chronique :
Recommandations cliniques et méthodes d’évaluation. Revue.
Douleurs, 2006, vol. 7, n° 2, p. 63-67
? YANG, Chue-Koua. Évaluation du réseau ville-hôpital de soins
palliatifs Quiétude. Thèse pour le doctorat de médecine. Paris :
Université Pierre et Marie Curie, 2003, 115 p.
? SFAP. Histoire des soins palliatifs et de l’accompagnement [en
ligne]. Disponible sur : <http://www.sfap.org/content/view/6/29/>
(consulté le 26/09/06)
Master RIM 98
99. Quelques exemples
Livre AUTEUR, Prénom. Titre de l’ouvrage. Édition. Lieu de publication :
Éditeur, année de publication, nombre de pages
Ex : BROCA, Alain de. Douleurs, soins palliatifs, deuils. 2e éd. Paris : Masson, 2005,
173 p.
Article AUTEUR, Prénom. Titre de l’article. Titre de la revue, année,
de revue volume, numéro, pagination
Ex : LEGOUT, Valérie, MOYSE, Dominique. Douleur chronique : Recommandations
cliniques et méthodes d’évaluation. Revue. Douleurs, 2006, vol. 7, n° 2, p. 63-67
Thèse, AUTEUR, Prénom. Titre. Niveau et discipline. Lieu de soutenance :
mémoire Université, année, nombre de pages
Ex : YANG, Chue-Koua. Évaluation du réseau ville-hôpital de soins palliatifs
Quiétude. Thèse pour le doctorat de médecine. Paris : Université Pierre et Marie Curie,
2003, 115 p.
Article AUTEUR, Prénom. Titre de la ressource [en ligne]. Disponible sur :
sur <URL du site> (date de la consultation)
Internet Ex : SFAP. Histoire des soins palliatifs et de l’accompagnement [en ligne]. Disponible
sur : <http://www.sfap.org/content/view/6/29/> (consulté le 26/09/06)
Master RIM 99
101. Exemples de citations en norme
J. Neuroscience
1. Descamps C, Darcheville J-C (2009) Introduction aux
neurosciences comportementales. Paris: Dunod.
2. Roy M (2009) Approche neuroscientifique de l'apprentissage et de
l'enseignement essai en mathématique (science de l'apprentissage).
Montréal: Éditions Quebecor.
3. Daouzli AM (2009) Systèmes neuromorphiques
étude et implantation de fonctions d'apprentissage et de plasticité.
S. l: Bordeaux 1.
4. Perie S, St Guily JL, Callard P, Sebille A (1997) Innervation of
adult human laryngeal muscle fibers. J Neurol Sci 149:81-86.
Master RIM 101