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GENETICA
2017-2018
Gli stomi regolano la traspirazione delle
piante
L’espressione di AtMYB60 nelle cellule
guardiane precede la loro apertura
La leptina è nota anche come ormone
della sazietà.
Un ridotto rilascio di leptina, o una
ridotta sensibilità alla leptina dei
recettori ipotalamici, conducono
all’obesità
Nel 2014 è stato approvato negli USA e
in Giappone un farmaco (Myalept) che
cura i deficit di leptina
Neandertal. Un nostro antenato?
Caratteri tipicamente africani
Fronte verticale
Regione occipitale
poco prominente
Mento
Eppure abbiamo in comune con loro
più di quanto si pensasse
Svante Pääbo
Forse la nostra diversità genetica risente anche
dell’ibridazione con altre forme umane, oggi estinte?
Stoneking & Krause (2011)
Peter J. Russell
Genetica. Un approccio molecolare
Pearson € 69
Materiale di supporto: http://hpe.pearson.it.russell
Dipartimento di Scienze della Vita e Biotecnologie
g.barbujani@unife.it
Ricevimento: stanza 12, lunedì 14.30 – 16.00
Capitolo 1
Introduzione alla genetica
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
http://http://www.guidobarbujani.it/index.php/1-genetica
Quattro cose importanti
• Variabilità
• Eredità
• Il pensiero evoluzionista
• La genetica
Variabilità
Variabilità morfologica in strawberry poison frog
(Dendrobates pumilio)
Albinismo: un
carattere
moderatamente
patologico
Melanomi: caratteri
patologici
Variabilità diacronica
Homo georgicus
Variabilità: il punto di partenza
per ogni analisi genetica o
evoluzionistica è l’osservazione
che un certo carattere, o
complesso di caratteri, è variabile
o polimorfico nei diversi individui
Quattro cose importanti
• Variabilità
• Eredità
• Il pensiero evoluzionista
• La genetica
Eredità
Genitori e figli si assomigliano
Individui imparentati si assomigliano
Individui di popolazioni vicine si assomigliano
Individui di specie affini si assomigliano
Perché?
Ieri: Perché hanno in comune dei fattori ereditari (geni) che
determinano l’eredità di caratteri comuni: Genetica formale
Oggi: Perché hanno in comune tratti di DNA ereditati dai genitori:
Genetica molecolare
Il nostro genoma è molto piccolo
0,005 – 0,020 millimetri
Ma il nostro genoma è molto grande
Nella doppia elica del DNA di ogni nostra cellula ci sono 6 miliardi di basi
.
Le istruzioni ereditarie per far funzionare il nostro organismo sono scritte in questo testo.
Dogma centrale: Il DNA fa l’RNA, l’RNA fa le
proteine, e mai viceversa
Più precisamente:
l’informazione biologica
procede, con pochissime
eccezioni, dal DNA all’RNA
e dall’RNA alle proteine
Figura 1.2
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
Le tecnologie del DNA
ricombinante hanno
permesso di
modificare
geneticamente vari
organismi,
sviluppando molti
prodotti di interesse
commerciale
Quattro cose importanti
• Variabilità
• Eredità
• Il pensiero evoluzionista
• La genetica
L’origine del pensiero
evoluzionista
• Tutti gli esseri creati
• La grande catena
degli esseri (Ray
1690)
Stime dell’età della Terra
James Ussher (1650): 22 ottobre 4004 a.C.
Annales veteris testamenti, a prima mundi origine
deducti
John Lightfoot (1645-1650): 3929 a.C.
The Harmony of the Four Evangelists among
themselves, and with the Old Testament, with an
explanation of the chiefest difficulties both in
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George-Louis Leclerc, Conte di Buffon (1774):
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dallo stato incandescente all’attuale temperatura
William Thomson, Lord Kelvin (1862): da 24 a
400 milioni di anni.
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L’origine del pensiero evoluzionista
Lamarck (1809):
La vita sorge spontaneamente dalla
materia inanimata.
Organismi diversi discendono da
antenati comuni.
L’ambiente guida il cambiamento da
forme viventi semplici a forme
complesse.
L’uso e il disuso alterano la
morfologia
L’origine del pensiero evoluzionista
• Malthus (1789): Lotta per l’esistenza
• Wallace (1858): Selezione naturale
L’origine del pensiero evoluzionista
Darwin (1859): L’Origine delle specie per
selezione naturale:
1. Tutti gli organismi discendono con
modifiche da antenati comuni
2. Le modifiche dipendono principalmente
dall’azione della selezione naturale su una
variabilità preesistente.
Mortalità differenziale
Fertilità differenziale
L’evoluzione come fatto e come teoria
• Ci sono diverse teorie evoluzionistiche, che
differiscono per il ruolo assegnato al caso e alla
selezione naturale
• Ma che gli organismi siano discesi da antenati
comuni attraverso cambiamenti evolutivi è un
fatto, che le varie teorie cercano di spiegare
Joachim Neumann 1650-1680
Johann Carl Fuhlrott
Hermann Schaaffhausen
Rudolf Virchow
Ernst Haeckel
Il contesto ecologico del cambiamento
evolutivo
• Distribuzione spaziale delle risorse
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• Tasso di crescita della popolazione
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1. Esiste una variabilità
2. Questa variabilità è, almeno in parte, ereditaria
3. Nel contesto ambientale in cui si trovano, individui diversi
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4. Le caratteristiche degli individui che lasciano più
discendenti si diffondono nella popolazione: adattamento
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sintesi moderna
L’evoluzione è il cambiamento delle caratteristiche genetiche di
una popolazione, per effetto della selezione naturale, o del caso,
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E allora:
Solo le popolazioni, non gli individui possono evolversi: la
genetica evoluzionistica studia le popolazioni
Quattro cose importanti
• Variabilità
• Eredità
• Il pensiero evoluzionista
• La genetica
Hugo de Vries
Erich Von TschermakCarl Correns
Un po’ di date
• 1856-1863 Esperimenti di Mendel sui piselli
• 1900 de Vries, Correns e von Tschermak riscoprono i principi dell’eredità
• 1905-1909 Nascono le parole “genetica” (Bateson) e “gene” (Johannsen)
• 1910-1911 Morgan scopre l’eredità legata al sesso e l’associazione dei geni sui
cromosomi
• 1928 Griffith identifica un “principio trasformante”
• 1941 Beadle e Tatum propongono la corrispondenza “un gene un enzima”
• 1944 Avery, MacLeod e McCarthy dimostrano che il principio trasformante è il
DNA
• 1953 Watson e Crick propongono il modello della doppia elica
• 1966 Nirenberg e Khorana decifrano il codice genetico
• 1977 Gilbert e Sanger sviluppano il metodo di sequenziamento del DNA
• 1980 Chambon dimostra che i geni Eucarioti sono interrotti da introni
• 1986 Mullis sviluppa la PCR, polymerase chain reaction
• 2003 Viene completata la prima sequenza genomica umana
• 2010 “Next generation sequencing”
Figura 1.4 (segue)
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
Organismi modello
Figura 1.4 (continuazione)
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
Organismi modello
Figura 1.5
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
Figura 1.6
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
Aploidia, diploidia
Come sono fatti i cromosomi
Mitosi
Sono i microtubuli a far migrare i cromatidi
Meiosi
Nella meiosi i cromosomi omologhi si scambiano tratti di DNA:
crossing-over
divisione del centromero
Alla meiosi si formano nuove combinazioni di cromosomi
e i cromosomi non
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Ad ogni generazione
compaiono delle novità:
quante?
Ogni genitore ha 2 copie dei 23 cromosomi
Ammettendo che non ci sia crossing-over, può formare 223
combinazioni di
cromosomi
Sono più di 8 milioni di combinazioni
Ma se c’è in media un crossing-over per coppia (in realtà sono ben di
più), questo numero diventa 423
: più di 16 mila miliardi di combinazioni
Lo stesso vale per l’altro genitore
Quindi, gli zigoti diversi che ogni coppia può produrre sono 423
x 423
, cioè
256 milioni di miliardi di miliardi
Sintesi 1
• Senza variabilità non si fa genetica
• La genetica studia la trasmissione ereditaria delle caratteristiche
biologiche
• Cose da ricordare sulla cellula
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01 introduzione

  • 2.
  • 3.
  • 4. Gli stomi regolano la traspirazione delle piante L’espressione di AtMYB60 nelle cellule guardiane precede la loro apertura
  • 5. La leptina è nota anche come ormone della sazietà. Un ridotto rilascio di leptina, o una ridotta sensibilità alla leptina dei recettori ipotalamici, conducono all’obesità Nel 2014 è stato approvato negli USA e in Giappone un farmaco (Myalept) che cura i deficit di leptina
  • 7. Caratteri tipicamente africani Fronte verticale Regione occipitale poco prominente Mento
  • 8. Eppure abbiamo in comune con loro più di quanto si pensasse Svante Pääbo
  • 9. Forse la nostra diversità genetica risente anche dell’ibridazione con altre forme umane, oggi estinte? Stoneking & Krause (2011)
  • 10. Peter J. Russell Genetica. Un approccio molecolare Pearson € 69 Materiale di supporto: http://hpe.pearson.it.russell
  • 11. Dipartimento di Scienze della Vita e Biotecnologie g.barbujani@unife.it Ricevimento: stanza 12, lunedì 14.30 – 16.00
  • 12. Capitolo 1 Introduzione alla genetica Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A http://http://www.guidobarbujani.it/index.php/1-genetica
  • 13. Quattro cose importanti • Variabilità • Eredità • Il pensiero evoluzionista • La genetica
  • 15. Variabilità morfologica in strawberry poison frog (Dendrobates pumilio)
  • 20. Variabilità: il punto di partenza per ogni analisi genetica o evoluzionistica è l’osservazione che un certo carattere, o complesso di caratteri, è variabile o polimorfico nei diversi individui
  • 21. Quattro cose importanti • Variabilità • Eredità • Il pensiero evoluzionista • La genetica
  • 22. Eredità Genitori e figli si assomigliano Individui imparentati si assomigliano Individui di popolazioni vicine si assomigliano Individui di specie affini si assomigliano Perché? Ieri: Perché hanno in comune dei fattori ereditari (geni) che determinano l’eredità di caratteri comuni: Genetica formale Oggi: Perché hanno in comune tratti di DNA ereditati dai genitori: Genetica molecolare
  • 23. Il nostro genoma è molto piccolo 0,005 – 0,020 millimetri Ma il nostro genoma è molto grande Nella doppia elica del DNA di ogni nostra cellula ci sono 6 miliardi di basi . Le istruzioni ereditarie per far funzionare il nostro organismo sono scritte in questo testo.
  • 24.
  • 25.
  • 26. Dogma centrale: Il DNA fa l’RNA, l’RNA fa le proteine, e mai viceversa Più precisamente: l’informazione biologica procede, con pochissime eccezioni, dal DNA all’RNA e dall’RNA alle proteine
  • 27. Figura 1.2 Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A Le tecnologie del DNA ricombinante hanno permesso di modificare geneticamente vari organismi, sviluppando molti prodotti di interesse commerciale
  • 28. Quattro cose importanti • Variabilità • Eredità • Il pensiero evoluzionista • La genetica
  • 29. L’origine del pensiero evoluzionista • Tutti gli esseri creati • La grande catena degli esseri (Ray 1690)
  • 30.
  • 31.
  • 32. Stime dell’età della Terra James Ussher (1650): 22 ottobre 4004 a.C. Annales veteris testamenti, a prima mundi origine deducti John Lightfoot (1645-1650): 3929 a.C. The Harmony of the Four Evangelists among themselves, and with the Old Testament, with an explanation of the chiefest difficulties both in Language and Sense
  • 34. George-Louis Leclerc, Conte di Buffon (1774): 75.000 anni. Stima del tempo necessario alla Terra per passare dallo stato incandescente all’attuale temperatura William Thomson, Lord Kelvin (1862): da 24 a 400 milioni di anni. Stime dell’età della Terra
  • 35.
  • 36. L’origine del pensiero evoluzionista Lamarck (1809): La vita sorge spontaneamente dalla materia inanimata. Organismi diversi discendono da antenati comuni. L’ambiente guida il cambiamento da forme viventi semplici a forme complesse. L’uso e il disuso alterano la morfologia
  • 37. L’origine del pensiero evoluzionista • Malthus (1789): Lotta per l’esistenza • Wallace (1858): Selezione naturale
  • 38. L’origine del pensiero evoluzionista Darwin (1859): L’Origine delle specie per selezione naturale: 1. Tutti gli organismi discendono con modifiche da antenati comuni 2. Le modifiche dipendono principalmente dall’azione della selezione naturale su una variabilità preesistente. Mortalità differenziale Fertilità differenziale
  • 39. L’evoluzione come fatto e come teoria • Ci sono diverse teorie evoluzionistiche, che differiscono per il ruolo assegnato al caso e alla selezione naturale • Ma che gli organismi siano discesi da antenati comuni attraverso cambiamenti evolutivi è un fatto, che le varie teorie cercano di spiegare
  • 40. Joachim Neumann 1650-1680 Johann Carl Fuhlrott Hermann Schaaffhausen Rudolf Virchow
  • 42. Il contesto ecologico del cambiamento evolutivo • Distribuzione spaziale delle risorse • Distribuzione degli individui • Tasso di crescita della popolazione • Rapporti fra preda e predatore • Parassitismo • Commensalismo • ecc. Fattori abiologici Fattori biologici
  • 43. Il contesto ecologico del cambiamento evolutivo In un certo contesto ambientale: (a) Mortalità differenziale: X vive più a lungo di Y e perciò lascia più discendenti (b) Fertilità differenziale: nello stesso lasso di tempo X si riproduce più efficacemente di Y e perciò lascia più discendenti
  • 44. Evoluzione darwiniana 1. Esiste una variabilità 2. Questa variabilità è, almeno in parte, ereditaria 3. Nel contesto ambientale in cui si trovano, individui diversi hanno fertilità o mortalità diverse 4. Le caratteristiche degli individui che lasciano più discendenti si diffondono nella popolazione: adattamento
  • 45. Evoluzione darwiniana: la sintesi moderna L’evoluzione è il cambiamento delle caratteristiche genetiche di una popolazione, per effetto della selezione naturale, o del caso, o di tutti e due E allora: Solo le popolazioni, non gli individui possono evolversi: la genetica evoluzionistica studia le popolazioni
  • 46. Quattro cose importanti • Variabilità • Eredità • Il pensiero evoluzionista • La genetica
  • 47. Hugo de Vries Erich Von TschermakCarl Correns
  • 48. Un po’ di date • 1856-1863 Esperimenti di Mendel sui piselli • 1900 de Vries, Correns e von Tschermak riscoprono i principi dell’eredità • 1905-1909 Nascono le parole “genetica” (Bateson) e “gene” (Johannsen) • 1910-1911 Morgan scopre l’eredità legata al sesso e l’associazione dei geni sui cromosomi • 1928 Griffith identifica un “principio trasformante” • 1941 Beadle e Tatum propongono la corrispondenza “un gene un enzima” • 1944 Avery, MacLeod e McCarthy dimostrano che il principio trasformante è il DNA • 1953 Watson e Crick propongono il modello della doppia elica • 1966 Nirenberg e Khorana decifrano il codice genetico • 1977 Gilbert e Sanger sviluppano il metodo di sequenziamento del DNA • 1980 Chambon dimostra che i geni Eucarioti sono interrotti da introni • 1986 Mullis sviluppa la PCR, polymerase chain reaction • 2003 Viene completata la prima sequenza genomica umana • 2010 “Next generation sequencing”
  • 49. Figura 1.4 (segue) Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A Organismi modello
  • 50. Figura 1.4 (continuazione) Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A Organismi modello
  • 51. Figura 1.5 Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
  • 52. Figura 1.6 Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
  • 54. Come sono fatti i cromosomi
  • 55.
  • 57. Sono i microtubuli a far migrare i cromatidi
  • 59. Nella meiosi i cromosomi omologhi si scambiano tratti di DNA: crossing-over
  • 60.
  • 62. Alla meiosi si formano nuove combinazioni di cromosomi e i cromosomi non sono più gli stessi Ad ogni generazione compaiono delle novità: quante?
  • 63. Ogni genitore ha 2 copie dei 23 cromosomi Ammettendo che non ci sia crossing-over, può formare 223 combinazioni di cromosomi Sono più di 8 milioni di combinazioni Ma se c’è in media un crossing-over per coppia (in realtà sono ben di più), questo numero diventa 423 : più di 16 mila miliardi di combinazioni Lo stesso vale per l’altro genitore Quindi, gli zigoti diversi che ogni coppia può produrre sono 423 x 423 , cioè 256 milioni di miliardi di miliardi
  • 64. Sintesi 1 • Senza variabilità non si fa genetica • La genetica studia la trasmissione ereditaria delle caratteristiche biologiche • Cose da ricordare sulla cellula – DNA, RNA, proteine – Cellula eucariote e procariote – Cromosomi – Mitosi e meiosi Theodosius Dobzhansky: Niente ha senso in biologia se non viene interpretato alla luce dell’evoluzione