SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 23
Genetiniuose tyrimuose naudojamų stuomeninių
augalų apžvalga istoriniu, sistematiniu, pasirinkimo
    priežasties ir taikymo krypties požiūriais.
                                               Vilniaus Universitetas
                                              Molekulinės biologijos
                                                 I kurso studentai:
                                           Kristina Bastytė
 2012.04.20                                Ingrida Olendraitė
                                           Vilmantė Žitkutė
                                           Tomas Šimkevičius
                                           Vilius Vilčinskas
Turinys:

•Genetikos priešistorė.
•Pagrindiniai genetikos dėsniai.
•Genetikoje naudojami augalai:
1) Lathyrus odoratus L.
2) Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
3) Rumex acetoca L.
4) Zea mays L.
• Apibendrinimas
Gregoras Mendelis - genetikos
       tėvas (1822 - 1884)

• Austrijos mokslininkas ir Augustinų
  vienuolis, ţinomas kaip genetikos mokslo
  pradininkas.
• 1854 m. vienuolyno sode pasisodino
  ţirnių, kad galėtų tyrinėti paveldimumo
  pasikeitimus.
• 1865 m. Brno gamtos istorijos draugijai
  nurodė paveldimumo dėsningumus ir
  parodė, jog jie gali būti aprašomi
  matematinės statistikos principais.
                                             Gregoras Mendelis
Gregoras Mendelis - genetikos
       tėvas (1822 - 1884)

• Mendelio darbas mokslui nebuvo ţinomas
  iki 1900 m.
• ,,Darvinas tiesiog fantazavo be jokio
  eksperimento pagrindo, kad yra specialūs
  paveldimumo vienetai”
  (V.Rančelis, “Augalų genetika” , 2008.)




                               Gregoras Mendelis
Mendelio įnašas į šiuolaikinę
      genetiką
• Pirmasis metodas paveldimumui tirti.
• Paveldėjimo vienetai gali būti dviejų formų (alelių).
• Mendelio dėsniai:
1) pirmosios hibridų kartos (F1) vienodumo/dominavimo.
2) poţymių skilimo.
3) nepriklausomo poţymių paveldėjimo.
• Reciprokinis (abipusis) ir analitinis kryţminimo
   metodai.
• Raidinis poţymių ţymėjimas.




                                              Monohibridinio kryţminimo rezultatai dviejuose
                                                palikuonių kartose:F1 ir F2 (ţiedų spalva)
Lathyrus odoratus L. Kvapnusis
        pelėžirnis
• žirniai yra savidulkis augalas.
• hibridai gaunami tik motininiam augalui dirbtinai pašalinus kuokelius ir
  apvaisinus tokį augalą kito augalo žiedadulkėmis.
• tipiškas augalas, naudotas pirmuose genetikos bandymuose.



                                              Karalystė:   Plantae
                                              Skyrius:     Magnaliophyta
                                              Klasė:        Magnaliopsida
                                              Poklasis:     Rosidae
                                              Eilė:         Fabales
                                              Šeima:        Fabacea
                                              Gentis:      Lathyrus L.
                                              Rūšis:       Lathyrus odoratus L.
   Photo:Ph.
   Daget, Prancūzija


                                         .
                       Lathyrus odoratus L
Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
                Baltaţiedis vairenis
Karalystė: Plantae (Augalai)
                                                            Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
Skyrius:    Magnoliophyta (Magnolijūnai)                          Baltaţiedis vairenis
Klasė:      Magnoliopsida (Magnolijainiai)
Poklasis: Dilleniidae (Dilenijaţiedţiai)
Šeima:       Brassicaceae (Bastutiniai)
Gentis:      Arabidopsis (Vairenis)
Rūšis:      Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
(Baltaţiedis vairenis)




                                              White Clay Creek State Park - Judge
Termo Fisher SCIENTIFIC”                           Morris Estate March 2006
Vilmantė Ţitkutė
Keletas faktų apie
      Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
•5 chromosomos.
•Nedidelis genomas, iš viso 114.5 Mbp / 125 Mbp.
•Greitas gyvenimo ciklas: apie 6 savaitės nuo sudygimo
iki sėklos subrendimo.
•Lengva auginti nedideliame plote (pvz., mėgintuvėlyje).




                         Dimitris Beis / Ben           Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
                         Scheres, Utrecht University             genomas
Kodėl Arabidopsis thaliana
         naudojama genetikoje?




                                   Arabidopsis thaliana L.


•Šiuo metu yra sukaupta be galo daug ţinių apie jo genomą.
•Vairenis labai lengvai regeneruoja iš meristeminių kultūrų.
•Būdinga savidulka.
•Lengva gauti hibridus.
•Sėklos labai smulkios (0,5 mm), bet nuo vieno augalo jų
gaunama labai daug.
http://www.arabidopsis.org/
Rumex acetoca L. Rūgštynė


                                                        Karalystė: Plantea ( Augalai )
                                                        Skyrius:     Magnoliophyta
                                                        (Magnolijūnai)
                                                        Klasė:       Magnoliopsida
                                                        ( Magnolijainiai)
                                                        Poklasis:    Caryophyllidae
                                                        (Gvazdikiečiai)
Photo: Marinella
Zepigi                                                  Šeima:        Polygonales
                                                        (Rūgtiniai)
                                                        Gentis:      Rumex L. (Rūgštinių )
                                                        Atstovas Rumex acetosa L.




                                                      Rumex acetoca L.
   Tompkins Ithaca, Cornell     Photo:Zeynel Cebeci
   University Campus            Turkija
Keletas faktų apie R. Acetosa L.

   •Naudojamos maistui ir medicinoje, bei genetikos tyrimams.
   •Nereikia jokių ypatingų salygų augimui.
   •Auga kompaktiškai.
   •Dvinamis augalas, turintis lyties chromosomas.




 The role of repetitive DNA in structure and evolution of sex
chromosomes in plants
E Kejnovsky, R Hobza, T Cermak, Z Kubat and B Vyskot
Kodėl naudojamas genetiniams
            tyrimams?

•Lytines chromosomas mot. individe XX vyr. individe
XY1Y2.
•7 chromosomų poros.
•Naudojama evoliuciniams tyrimams.
•Manoma, kad tai ganėtinai jaunas augalas 15 - 20
mln metų.




   Historical pictures of meiotic preparations showing terminal pairing of X and Y chromosomes in male
       flowers of: a, white campion (2n = 24, XY, metaphase I; van Nigtevecht, 1966); b, hop (2n =
       20, XY, early anaphase I, arrows;Moutchen et al., 1973); and c, sorrel (Rumex acetosa; 2n =
          15, XY1Y2, metaphase I, with sex-trivalent XY1Y2 in convergent orientation; Parker and
                                                 Clark, 1991).
‘Zea mays L.’
                        paprastasis kukurūzas
                                                       Kingdom:          Plantae
                         Forest and Kim Starr -
                         Plants of Hawaii              Division:         Magnoliophyta
                                                       Class:            Liliopsida
                                                       Subclass:         Commelinidae
                                                       Order:            Cyperales
                                                       Family:            Poaceae
                                                       Genus:             Zea L.
                                                       Species :          „Zea mays L.‟




‘Zea mays L.’vyriškas
      individas


                        ‘Zea mays L.’ moteriškas
                               individas           Photo by Aldo De Bastiani
Bendra charakteristika:

•Paprastasis kukurūzas („Zea
mays L.’) - kultūrinis
augalas, pradėtas auginti
maţdaug prieš 9000 m.
•Žolinis, vienametis augalas
•Vienanamis. Vyriškieji ţiedai
susitelkę viršūninėse
šluotelėse, moteriškieji – lapų
paţastyje, burbuolėje
•Vaisius - grūdas
Reikšmė genetikoje:

Paprastasis kukurūzas –
modelinis augalas
genetiniams tyrimams:
•Kruopščiausiai ištyrinėtas
genomas lyginant su kitais
javais, tokiais kaip ryţiai
(Oryza sativa), sorgai
(Soghum bicolor) ir kt.
•Didelė gausa mutantinių
formų.
•Genetinis panašumas į
giminingus augalus.                Keith Weller photographer
Ramosa (ra) genų mutantinės
                 formos

•Ramosa (lot. ramus – šaka) genai lemia ţiedynų vystymąsi
ţoliniuose augaluose.
•Ţoliniai augalai skiriasi ţiedynų šakų, varpučių, ţiedų
išsidėstymu, kiekiu.
•Šių genų kukurūzai mutantai turi neįprastai smarkiai šakotus
vyriškus ir moteriškus ţiedynus.
Normalaus; ra1, ra2 mutanto;
 ryţių ţiedynų palyginimas
Kukurūzo ra mutantų
                       pavyzdţiai:




‘Zea mays L.’ ra
 geno mutacijos
Išvados:

•Gregoras Mendelis - genetikos pradininkas.
•Tobulėjant mokslui, padaryta akivaizdi paţanga
genetikos srityje.
•Dėl savo tinkamų savybių šios augalų rūšys plačiai
naudojamos genetiniuose tyrimuose:
1)   Lathyrus odoratus L.
2)   Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
3)   Rumex acetoca L.
4)   Zea mays L.
•    Genetikos mokslų paţanga atnešė daug ekonominių
     ir agrikultūrinių laimėjimų, palengvinusių ţmogaus
     gyvenimą.
Naudoti šaltiniai:

1) http://en.wikipedia.org/wiki/Plant_genetics
2) http://fhc.amb.edu.pl/archives/fulltxt/vol43/43_3/08_M
    OSIO.pdf
3) http://www.springerlink.com/content/g23716634604732
    t/
4) http://www.accessexcellence.org/RC/AB/BC/Gregor_M
    endel.php
5) http://www.mendelmuseum.muni.cz/en/mendel-s-
    experiment/
6) http://en.wikipedia.org/wiki/Sweet_pea
7) http://www.arabidopsis.org/portals/education/aboutarab
    idopsis.jsp#top
8) http://en.wikipedia.org/wiki/Arabidopsis_thaliana
9) http://www.nature.com/nature/journal/v436/n7054/full/n
    ature03892.html
10) http://www.plantcell.org/content/18/3/518.full
11) http://epmb.berkeley.edu/vfs/PIs/Hake-SC/web/Bortiri-
    et-al.pdf
12) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20147033
13) Vytautas Rančelis ,,Augalų genetika” 2008
Dėkojame uţ
jūsų dėmesį!!!
Gal turite mums
  klausimų?

Genetiniuose tyrimuose naudojamų stuomeninių augalų apžvalga istoriniu vlm

  • 1. Genetiniuose tyrimuose naudojamų stuomeninių augalų apžvalga istoriniu, sistematiniu, pasirinkimo priežasties ir taikymo krypties požiūriais. Vilniaus Universitetas Molekulinės biologijos I kurso studentai: Kristina Bastytė 2012.04.20 Ingrida Olendraitė Vilmantė Žitkutė Tomas Šimkevičius Vilius Vilčinskas
  • 2. Turinys: •Genetikos priešistorė. •Pagrindiniai genetikos dėsniai. •Genetikoje naudojami augalai: 1) Lathyrus odoratus L. 2) Arabidopsis thaliana (L.) Heynh 3) Rumex acetoca L. 4) Zea mays L. • Apibendrinimas
  • 3. Gregoras Mendelis - genetikos tėvas (1822 - 1884) • Austrijos mokslininkas ir Augustinų vienuolis, ţinomas kaip genetikos mokslo pradininkas. • 1854 m. vienuolyno sode pasisodino ţirnių, kad galėtų tyrinėti paveldimumo pasikeitimus. • 1865 m. Brno gamtos istorijos draugijai nurodė paveldimumo dėsningumus ir parodė, jog jie gali būti aprašomi matematinės statistikos principais. Gregoras Mendelis
  • 4. Gregoras Mendelis - genetikos tėvas (1822 - 1884) • Mendelio darbas mokslui nebuvo ţinomas iki 1900 m. • ,,Darvinas tiesiog fantazavo be jokio eksperimento pagrindo, kad yra specialūs paveldimumo vienetai” (V.Rančelis, “Augalų genetika” , 2008.) Gregoras Mendelis
  • 5. Mendelio įnašas į šiuolaikinę genetiką • Pirmasis metodas paveldimumui tirti. • Paveldėjimo vienetai gali būti dviejų formų (alelių). • Mendelio dėsniai: 1) pirmosios hibridų kartos (F1) vienodumo/dominavimo. 2) poţymių skilimo. 3) nepriklausomo poţymių paveldėjimo. • Reciprokinis (abipusis) ir analitinis kryţminimo metodai. • Raidinis poţymių ţymėjimas. Monohibridinio kryţminimo rezultatai dviejuose palikuonių kartose:F1 ir F2 (ţiedų spalva)
  • 6. Lathyrus odoratus L. Kvapnusis pelėžirnis • žirniai yra savidulkis augalas. • hibridai gaunami tik motininiam augalui dirbtinai pašalinus kuokelius ir apvaisinus tokį augalą kito augalo žiedadulkėmis. • tipiškas augalas, naudotas pirmuose genetikos bandymuose. Karalystė: Plantae Skyrius: Magnaliophyta Klasė: Magnaliopsida Poklasis: Rosidae Eilė: Fabales Šeima: Fabacea Gentis: Lathyrus L. Rūšis: Lathyrus odoratus L. Photo:Ph. Daget, Prancūzija . Lathyrus odoratus L
  • 7. Arabidopsis thaliana (L.) Heynh Baltaţiedis vairenis Karalystė: Plantae (Augalai) Arabidopsis thaliana (L.) Heynh Skyrius: Magnoliophyta (Magnolijūnai) Baltaţiedis vairenis Klasė: Magnoliopsida (Magnolijainiai) Poklasis: Dilleniidae (Dilenijaţiedţiai) Šeima: Brassicaceae (Bastutiniai) Gentis: Arabidopsis (Vairenis) Rūšis: Arabidopsis thaliana (L.) Heynh (Baltaţiedis vairenis) White Clay Creek State Park - Judge Termo Fisher SCIENTIFIC” Morris Estate March 2006 Vilmantė Ţitkutė
  • 8. Keletas faktų apie Arabidopsis thaliana (L.) Heynh •5 chromosomos. •Nedidelis genomas, iš viso 114.5 Mbp / 125 Mbp. •Greitas gyvenimo ciklas: apie 6 savaitės nuo sudygimo iki sėklos subrendimo. •Lengva auginti nedideliame plote (pvz., mėgintuvėlyje). Dimitris Beis / Ben Arabidopsis thaliana (L.) Heynh Scheres, Utrecht University genomas
  • 9. Kodėl Arabidopsis thaliana naudojama genetikoje? Arabidopsis thaliana L. •Šiuo metu yra sukaupta be galo daug ţinių apie jo genomą. •Vairenis labai lengvai regeneruoja iš meristeminių kultūrų. •Būdinga savidulka. •Lengva gauti hibridus. •Sėklos labai smulkios (0,5 mm), bet nuo vieno augalo jų gaunama labai daug.
  • 11. Rumex acetoca L. Rūgštynė Karalystė: Plantea ( Augalai ) Skyrius: Magnoliophyta (Magnolijūnai) Klasė: Magnoliopsida ( Magnolijainiai) Poklasis: Caryophyllidae (Gvazdikiečiai) Photo: Marinella Zepigi Šeima: Polygonales (Rūgtiniai) Gentis: Rumex L. (Rūgštinių ) Atstovas Rumex acetosa L. Rumex acetoca L. Tompkins Ithaca, Cornell Photo:Zeynel Cebeci University Campus Turkija
  • 12. Keletas faktų apie R. Acetosa L. •Naudojamos maistui ir medicinoje, bei genetikos tyrimams. •Nereikia jokių ypatingų salygų augimui. •Auga kompaktiškai. •Dvinamis augalas, turintis lyties chromosomas. The role of repetitive DNA in structure and evolution of sex chromosomes in plants E Kejnovsky, R Hobza, T Cermak, Z Kubat and B Vyskot
  • 13. Kodėl naudojamas genetiniams tyrimams? •Lytines chromosomas mot. individe XX vyr. individe XY1Y2. •7 chromosomų poros. •Naudojama evoliuciniams tyrimams. •Manoma, kad tai ganėtinai jaunas augalas 15 - 20 mln metų. Historical pictures of meiotic preparations showing terminal pairing of X and Y chromosomes in male flowers of: a, white campion (2n = 24, XY, metaphase I; van Nigtevecht, 1966); b, hop (2n = 20, XY, early anaphase I, arrows;Moutchen et al., 1973); and c, sorrel (Rumex acetosa; 2n = 15, XY1Y2, metaphase I, with sex-trivalent XY1Y2 in convergent orientation; Parker and Clark, 1991).
  • 14. ‘Zea mays L.’ paprastasis kukurūzas Kingdom: Plantae Forest and Kim Starr - Plants of Hawaii Division: Magnoliophyta Class: Liliopsida Subclass: Commelinidae Order: Cyperales Family: Poaceae Genus: Zea L. Species : „Zea mays L.‟ ‘Zea mays L.’vyriškas individas ‘Zea mays L.’ moteriškas individas Photo by Aldo De Bastiani
  • 15. Bendra charakteristika: •Paprastasis kukurūzas („Zea mays L.’) - kultūrinis augalas, pradėtas auginti maţdaug prieš 9000 m. •Žolinis, vienametis augalas •Vienanamis. Vyriškieji ţiedai susitelkę viršūninėse šluotelėse, moteriškieji – lapų paţastyje, burbuolėje •Vaisius - grūdas
  • 16. Reikšmė genetikoje: Paprastasis kukurūzas – modelinis augalas genetiniams tyrimams: •Kruopščiausiai ištyrinėtas genomas lyginant su kitais javais, tokiais kaip ryţiai (Oryza sativa), sorgai (Soghum bicolor) ir kt. •Didelė gausa mutantinių formų. •Genetinis panašumas į giminingus augalus. Keith Weller photographer
  • 17. Ramosa (ra) genų mutantinės formos •Ramosa (lot. ramus – šaka) genai lemia ţiedynų vystymąsi ţoliniuose augaluose. •Ţoliniai augalai skiriasi ţiedynų šakų, varpučių, ţiedų išsidėstymu, kiekiu. •Šių genų kukurūzai mutantai turi neįprastai smarkiai šakotus vyriškus ir moteriškus ţiedynus.
  • 18. Normalaus; ra1, ra2 mutanto; ryţių ţiedynų palyginimas
  • 19. Kukurūzo ra mutantų pavyzdţiai: ‘Zea mays L.’ ra geno mutacijos
  • 20. Išvados: •Gregoras Mendelis - genetikos pradininkas. •Tobulėjant mokslui, padaryta akivaizdi paţanga genetikos srityje. •Dėl savo tinkamų savybių šios augalų rūšys plačiai naudojamos genetiniuose tyrimuose: 1) Lathyrus odoratus L. 2) Arabidopsis thaliana (L.) Heynh 3) Rumex acetoca L. 4) Zea mays L. • Genetikos mokslų paţanga atnešė daug ekonominių ir agrikultūrinių laimėjimų, palengvinusių ţmogaus gyvenimą.
  • 21. Naudoti šaltiniai: 1) http://en.wikipedia.org/wiki/Plant_genetics 2) http://fhc.amb.edu.pl/archives/fulltxt/vol43/43_3/08_M OSIO.pdf 3) http://www.springerlink.com/content/g23716634604732 t/ 4) http://www.accessexcellence.org/RC/AB/BC/Gregor_M endel.php 5) http://www.mendelmuseum.muni.cz/en/mendel-s- experiment/ 6) http://en.wikipedia.org/wiki/Sweet_pea 7) http://www.arabidopsis.org/portals/education/aboutarab idopsis.jsp#top 8) http://en.wikipedia.org/wiki/Arabidopsis_thaliana 9) http://www.nature.com/nature/journal/v436/n7054/full/n ature03892.html 10) http://www.plantcell.org/content/18/3/518.full 11) http://epmb.berkeley.edu/vfs/PIs/Hake-SC/web/Bortiri- et-al.pdf 12) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20147033 13) Vytautas Rančelis ,,Augalų genetika” 2008
  • 23. Gal turite mums klausimų?