Metanógenas: son anaerobias. Reduciendo el CO2 hasta CH4. Fuente del N el NH3, viven en fondos de pantanos, ciénagas. Hipertermófilas: viven en aguas geotérmicas o próximas a volcanes submarinos. Utilizan el azufre de esas aguas para su metabolismo que es quimiorganótrofo. Cianobacterias: Realizan la fotosíntesis oxigénica. Tienen nutrición autótrofa y muchas asimilan nitrógeno atmosférico, gracias a la enzima nitrogenasa. Por eso habitan cualquier ambiente siendo sus preferidos: manantiales, rocas mojadas, aguas dulces y el suelo. También pueden vivir en cuevas (condiciones extremas de luminosidad) colonizando paredes húmedas y formando una pátina pegajosa. Los hay simbiontes con otros vegetales (helechos acuáticos, colonizan los arrozales asiáticos aportando nitrógeno, se asocian con lentejas de agua).