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koichikawamura65
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1.
がん予防法研究支援シス テムの開発
2.
目的 • メタ研究・レビュー研究を支援 • 当面は「科学的根拠に基づく発がん性・がん予防効果の 評価とがん予防ガイドライン提言に関する研究」での活 用を主眼とする
3.
機能 • 自動検索機能 • エビデンス・データベース機能 •
フォーラム機能
4.
機能 • 自動検索機能 • エビデンス・データベース機能 •
フォーラム機能
5.
自動検索機能 • Entrez /
Pubmed の公開されているAPIにアクセスしてが んの要因に関する研究を自動的・系統的に検索
6.
多次元マトリクスにそった系統的な検索
7.
要因・がん部位をツリー型階層構造で登 録
8.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守 •
サーバーにかかる負荷を低減するために、利用ガイドラ インが定められている • 行儀の悪い利用者はIPブロックされることがある
9.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守
10.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守
11.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守 •
アクセス頻度・時間帯⇒1秒間に3回以内、大きな処理は 米国東部時間21時から5時の間
12.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守
13.
Entrez API 利用ガイドラインの尊守 •
できるだけ検索負荷をかけない⇒中間結果の保存機能を 活用
14.
機能 • 自動検索機能 • エビデンス・データベース機能 •
フォーラム機能
15.
エビデンス・データベース機能 • 検索で得られたエビデンスを集団、がん部位、要因、研
究デザインといった属性情報、対応状況、関係強度とあ わせてデータベース化する • データベースは利用者が共同でメンテナンスする e.g. 誤 分類の修正、関係のない研究の排除、対応状況、関係強 度などの入力
16.
エビデンス・データベース機能 • Pubmedに登録されていない研究の手動登録機能 • メタ研究・レビューと個別研究の参照、非参照関係も データベース化する
17.
機能 • 自動検索機能 • エビデンス・データベース機能 •
フォーラム機能
18.
フォーラム機能 • 各種フォーラム(掲示板)を設置して、研究者間のコ ミュニケーションの便宜を図る。
19.
利用イメージ • 公開サーバー上で稼働するWebアプリケーションとし、 地理的に離れた拠点の研究者がインターネット経由でブ ラウザーを用いてアクセス・利用する。
20.
開発計画 • 定評のあるオープン・ソース・ソフトウェアを活用し、 効率の良い開発を目指す
21.
開発計画 • 実際に動作するシステムを囲んで開発者・利用者間で討
議を繰り返し、仕様を煮詰めながら段階的にシステムの 完成度を高めていく(アジャイル開発的な手法) • 開発→試作品リリース→仕様の検討や修正・問題点洗い 出し→設計の再検討・修正→開発→試作品リリース→…、 といったサイクルを短い周期で繰り返し、有用で完成度 の高いシステムの完成を目指す • 機能は基本的な部分から順次実装していく
22.
進捗状況(イメージ)
0% 25% 50% 75% 100% 自動検索 75% エビデンス・データベース 50% フォーラム 0%
23.
目下の開発課題 • 自動検索やエビデンス・データベースがある程度動作す
るようになっているので、そろそろ公開サーバーにデプ ロイしてテストする段階⇒準備中⇒公開後はテストにご協 力お願いします! • 検索を定期的に自動実行するように • ユーザー管理機能とフォーラム機能の追加 • UIの整理・改善 • エビデンス・データベースの改良(参照関係など) • 検索語の検討・MeSHの活用など