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Ecologia de Populações


Modelagem do Nicho Ecológico:

Uma ferramenta para avaliar os padrões de
        distribuição de populações


      Prof. Dr. Harold Gordon Fowler
         popecologia@hotmail.com
O conceito do nicho e populações

                  Nicho Fundamental        R0 < 1.0




                                              Fator II
                                  predação
Nicho Realizado   R0 > 1.0



                              competição



                        Fator I
Paisagem
             Características da espécie
Índices de   • densidade em ecotopos diferentes
             • tamanho da área vital
Paisagem     • distancia de dispersão
             • barreiras específica a espécie
De escalas
                        Padrões de
ecológicas
                      Sustentabilidade
                  Específicos a espécie


      sustentabilidade
Modelagem do Nicho Ecológico
  Espaço geográfico
  Geographic Space
                                                    Espaço ecológico
                                                   Ecological Space




                                       Modelagem de nicho ecológico
                                        ecological niche modeling


                                                             Modelo das dimensões
                                                              Model of niche in ecological
                                                                do nicho ecológico
                                                                     dimensions
     occurrence points on native distribution
     Pontos de ocorrência




                                                               precipitation
     na amplitude original




                                                          Variável 2
                                                                                temperature
                                                                               Variável 1


                                         Projeção a geografia
                                          Projection back onto geography


  Amplituderange prediction
       Native original prevista




  Previsão da amplitude após
       Invaded range prediction
Modelagem do Nicho Ecológico
Modelagem do conjunto de condições ambientais,
 recursos, interações e outras nas quais uma espécie é
 capaz manter populações sem imigração




                       projete
1.   Semântica
 Exemplo: Integração de                                   2.   Escalas compatíveis
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                                                          4.
                                                               Re-projetar
                                                               Amostragem novo do grão
Ocorrência de uma Espécie                                 5.   Amostrar ocorrências



       Arquivo deExcel         Amostra 1, latitude, longitude, espécies, presença
     Arquivo de Access
                                         Sample 3, lat, long, species, absence espécies, presença
                                         Amostra 3, latitude, longitude,
 Tipo de vegetação
                                     Sample 2, lat, long, species, presence espécies, presença
                                     Amostra 2, latitude, longitude,
                                                                         Dados integrados

 Altitude (m)                                                            P, juniper, 2200m,
                                                                         16C
                                                                         P, pinão, 2320m,
                                                                         14C
                                                                         A, creosote, 1535m,
                                                                         22C

 Temperatura anual média (C)
 Mean annual temperature (C)
Exemplo hipotético
das ocorrências
conhecidas (círculos)
e inferências dessa
informação
O que é o modelagem do nicho
           ecológico

A idéia é que as ocorrências conhecidas de uma espécie
  numa paisagem podem ser relacionadas a dados de
  raster de SIG que resumem a variação ambiental da
  paisagem para obter uma representação quantitativa
  da distribuição ecológica da espécie.

O MNE caracteriza a distribuição de uma espécie no
  espaço definido por parâmetros ambientais, os quais
  controlam a distribuição geográfica da espécie sob a
  definição do nicho ecológico de Grinnell.
Garp


GARP é um algoritmo genético que cria os modelos do
  nicho ecológico de uma espécie. Os modelos
  descrevem as condições ambientais sob quais a
  espécie deve ser capaz de manter suas populações.
  For input, GARP usa um conjunto de localidades
  pontuais onde a espécie é conhecida ocorrer e um
  conjunto de layers geográficos que representam os
  parâmetros ambientais que possam limitar a
  capacidade de sobrevivência da espécie.
Essência da Modelagem do Nicho Ecológico
                 Espaço geográfico                                Espaço ecológico


                                                      Modelagem do Nicho Ecológico

                                                                                      Modelo das dimensões do
                                                                                          nicho ecológico
                   Pontos deOcorrencia sobre a distribuição
                                   nativa
 As aplicações de MNE como GARP




                                                                               precipitaçap
 podem demonstrar uma capacidade
de previsão excelente para amostras
              pequenas
                                                                                              temperatura




                                                        Projeção a geografia


                         Previsão da amplitude
                         nativa




                       Previsão da amplitude
                       da invasão
As aplicações de MNE
     Entendimento da Ecologia de Doenças

Em muitos casos, os detalhes dos parâmetros ecológicos
  associados com as ocorrências de doenças ou de
  espécies que participam na transmissão de doenças
  (como vetores, hospedeiros, patogenos) pode ser
  ambíguos devido a tamanhos pequenos de amostras,
  vieses, ou simplesmente a carência de análise
  geográfica ou ecológica detalhada.

O MNE incorpora um conjunto de fermentas que
  relacionam as ocorrências conhecidas dessas espécies
  ou fenômenos aos layers de rasters de sistemas de
  informação geográfica que resumem a variação em
  várias dimensões ambientais.
As aplicações de MNE
     Entendimento da Ecologia de Doenças


O resultado é uma visão objetiva e quantitativa de o
  que se sabe sobre uma espécie o fenômeno e como
  isso se relaciona a variação ambiental do paisagem.

Exemplos de estudos usando essas técnicas incluem a
  avaliação das diferencias ecológicas dos vetores
  variados do Mal de Chagas no Brasil e uma
  caracterização dos atributos ecológicos de surtos
  de febre hemorrágica causada pelo vírus de Ebola
  e Marburg
Am. J. Trop. Med. Hygiene 67:516-520
The Triatoma brasiliensis species
           complex
A matriz de similaridade ecológica entre populações
  baseadas na capacidade do modelo de uma
  população prever a distribuição de outra
Aplicações de MNE
   Caracterização de Áreas de Amplitude
                Geográfica
O MNE é usado para investigar paisagens para
  detectar áreas que correspondem as
  necessidades ecológicas da espécie


O resultado é uma interpolação entre as locais
  conhecidos de amostragem ajudado por
  associações observadas entre as espécies e os
  atributos ambientais.
Aplicações de MNE
        Caracterização de Áreas de Amplitude
                        Geográfica

O MNE produz previsões estatisticamente robustas das
  distribuições geográficas de espécies ou fenômenos
  (ainda em áreas não amostradas), excedendo as
  expectações sob modelos aleatórios (nulos). Vários
  exemplos de essa aplicação a estudos de sistemas de
  doença existem.
Aplicações de MNE
Identificação de áreas de invasão potencial a
               outras regiões

Os MNEs caracterizam as condições ambientais
  gerais da ocorrência de uma espécie.

Se o modelo foi calibrado corretamente, pode ser
  usado para procurar áreas de distribuição
  potencial.

Por isso, os MNEs podem ser usados para
  identificar áreas que correspondem as condições
  ecológicas necessárias para uma espécie, ainda se
  a espécie não está presente.
Vital, M. V. C. 2005. Modelagem de nicho ecológico utilizando algoritmos genéticos. Dissertação de
Mestrado, Biologia (Ecologia), ICB / UFG, 43 p., Goiânia, GO.
Aplicações de MNE
Identificação de áreas de invasão
   potencial a outras regiões
Aplicações de MNE
    Antecipando áreas de risco a mudanças
                 climáticas
Uma extensão lógica do MNE é identificar áreas
  potenciais de distribuição para responder perguntas
  sobre mudanças geográficas de espécies sob cenários
  de mudança climática ou uso da terra.


Esse método é usado no estudo da biodiversidade, com
  testes e validações, e com aplicação ampla entre
  faunas e floras. Um estudo usou as mudanças de
  amplitude induzidas por mudanças climáticas para
  inferir a identidade dos vetores Lutzomyia de
  leishmaniasis no Brasil.
Aplicações de MNE
   Identificação de Vetores o Hospedeiros
                Desconhecidos
Os métodos de MNE podem ser aplicados a várias partes do ciclo de
   transmissão de doenças para identificar elementos desconhecidos do
   sistema.
A geografia da distribuição dos casos clínicos pode proporcionar
   indicadores de quais clades são reservatórios potenciais. Para os
   hospedeiros mamíferos do grupo de vetores do Mal de Chagas
   relacionados a Triatoma protracta no México, foram identificados
   mamíferos de 5 das 5 espécies existentes.
Outras aplicações dos métodos de MNE enfocam no reservatório
   misterioso do filoviruses (Ebolae Marburg) ao comparar as
   distriabuições dos mamíferos áfricanos com os surtos de filovirus.
Resultados de MNE




       Construção d teste de modelos.             Padrões geográficos de riqueza de 17 espécies
a) dados de treinamento; b) modelo de previsão.               nativas de roedores.
         Peterson, Ball e Cohoon, 2002              Sanchez-Cordero e Martinez-Meyer, 2000
Desafios da modelagem do nicho
           ecológico (MNE)
O MNE tem raízes antigas mas é uma ferramenta nova
  na ecologia de distribuições e a biogeografia. Por isso
  existem muitos desafios para refinar técnicas para
  ter métodos mais sintéticos e inferenciais.

O melhoramento da capacidade de interpolação com
  precisão e extrapolar com eficiência fica os grandes
  desafios do MNE.

Outro desafio inclua detalhas da MNE é testar e avaliar
  os resultados dos modelos.As técnicas atuais se
  enfocam na capacidade de prever dados de ocorrência
  independentes data na menor área prevista. Mas,
  previsões eficientes podem não descrever bem a
  amplitude geográfica de uma espécie
Desafios da modelagem do nicho
           ecológico (MNE)
O desafio principal é entender o papel da escala
  temporal e espacial. Nosso conhecimento atual sugere
  que acertando as escalas temporais e espaciais na
  análise podem proporcionar boas oportunidades para a
  previsão precisa do comportamento de mudanças
  geográficas, invasões e a disseminações de pragas e
  doenças


Por isso, a escolha certa de conjuntos de dados
  ambientais precisa de muito mais pesquisa.
Desafios da modelagem do nicho
          ecológico (MNE)
Os dados de clima proporcionam uma aplicação temporal
  maior, mas os dados de sensoriamento remoto da
  superfície da Terra podem fornecer uma resolução
  espacial mais fina e podem medir aspectos de
  paisagens ecológicas que os parâmetros de clima não
  capturam.
Além disso, porque os sistemas ecológicos geralmente
  refletiam interações complexas entre várias espécies,
  precisamos detalhar regas de análise e modelagem.
Conclusões
MNE pode resolver vários problemas da resolução
  espacial de resumos de risco geográfico e previsão de
  amplitudes geográficas.


MNE ainda é um campo novo e deve crescer
  exponencialmente no futuro – se ligam.


O uso extensivo de MNE para a biodiversidade pode
  servir como marco de qualidade a aceitação dos
  resultados

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Modelagem do nicho ecologico

  • 1. Ecologia de Populações Modelagem do Nicho Ecológico: Uma ferramenta para avaliar os padrões de distribuição de populações Prof. Dr. Harold Gordon Fowler popecologia@hotmail.com
  • 2. O conceito do nicho e populações Nicho Fundamental R0 < 1.0 Fator II predação Nicho Realizado R0 > 1.0 competição Fator I
  • 3. Paisagem Características da espécie Índices de • densidade em ecotopos diferentes • tamanho da área vital Paisagem • distancia de dispersão • barreiras específica a espécie De escalas Padrões de ecológicas Sustentabilidade Específicos a espécie sustentabilidade
  • 4. Modelagem do Nicho Ecológico Espaço geográfico Geographic Space Espaço ecológico Ecological Space Modelagem de nicho ecológico ecological niche modeling Modelo das dimensões Model of niche in ecological do nicho ecológico dimensions occurrence points on native distribution Pontos de ocorrência precipitation na amplitude original Variável 2 temperature Variável 1 Projeção a geografia Projection back onto geography Amplituderange prediction Native original prevista Previsão da amplitude após Invaded range prediction
  • 5. Modelagem do Nicho Ecológico Modelagem do conjunto de condições ambientais, recursos, interações e outras nas quais uma espécie é capaz manter populações sem imigração projete
  • 6. 1. Semântica Exemplo: Integração de 2. Escalas compatíveis Pontos e Imagens da 3. 4. Re-projetar Amostragem novo do grão Ocorrência de uma Espécie 5. Amostrar ocorrências Arquivo deExcel Amostra 1, latitude, longitude, espécies, presença Arquivo de Access Sample 3, lat, long, species, absence espécies, presença Amostra 3, latitude, longitude, Tipo de vegetação Sample 2, lat, long, species, presence espécies, presença Amostra 2, latitude, longitude, Dados integrados Altitude (m) P, juniper, 2200m, 16C P, pinão, 2320m, 14C A, creosote, 1535m, 22C Temperatura anual média (C) Mean annual temperature (C)
  • 7. Exemplo hipotético das ocorrências conhecidas (círculos) e inferências dessa informação
  • 8. O que é o modelagem do nicho ecológico A idéia é que as ocorrências conhecidas de uma espécie numa paisagem podem ser relacionadas a dados de raster de SIG que resumem a variação ambiental da paisagem para obter uma representação quantitativa da distribuição ecológica da espécie. O MNE caracteriza a distribuição de uma espécie no espaço definido por parâmetros ambientais, os quais controlam a distribuição geográfica da espécie sob a definição do nicho ecológico de Grinnell.
  • 9. Garp GARP é um algoritmo genético que cria os modelos do nicho ecológico de uma espécie. Os modelos descrevem as condições ambientais sob quais a espécie deve ser capaz de manter suas populações. For input, GARP usa um conjunto de localidades pontuais onde a espécie é conhecida ocorrer e um conjunto de layers geográficos que representam os parâmetros ambientais que possam limitar a capacidade de sobrevivência da espécie.
  • 10. Essência da Modelagem do Nicho Ecológico Espaço geográfico Espaço ecológico Modelagem do Nicho Ecológico Modelo das dimensões do nicho ecológico Pontos deOcorrencia sobre a distribuição nativa As aplicações de MNE como GARP precipitaçap podem demonstrar uma capacidade de previsão excelente para amostras pequenas temperatura Projeção a geografia Previsão da amplitude nativa Previsão da amplitude da invasão
  • 11. As aplicações de MNE Entendimento da Ecologia de Doenças Em muitos casos, os detalhes dos parâmetros ecológicos associados com as ocorrências de doenças ou de espécies que participam na transmissão de doenças (como vetores, hospedeiros, patogenos) pode ser ambíguos devido a tamanhos pequenos de amostras, vieses, ou simplesmente a carência de análise geográfica ou ecológica detalhada. O MNE incorpora um conjunto de fermentas que relacionam as ocorrências conhecidas dessas espécies ou fenômenos aos layers de rasters de sistemas de informação geográfica que resumem a variação em várias dimensões ambientais.
  • 12. As aplicações de MNE Entendimento da Ecologia de Doenças O resultado é uma visão objetiva e quantitativa de o que se sabe sobre uma espécie o fenômeno e como isso se relaciona a variação ambiental do paisagem. Exemplos de estudos usando essas técnicas incluem a avaliação das diferencias ecológicas dos vetores variados do Mal de Chagas no Brasil e uma caracterização dos atributos ecológicos de surtos de febre hemorrágica causada pelo vírus de Ebola e Marburg
  • 13. Am. J. Trop. Med. Hygiene 67:516-520 The Triatoma brasiliensis species complex
  • 14.
  • 15. A matriz de similaridade ecológica entre populações baseadas na capacidade do modelo de uma população prever a distribuição de outra
  • 16. Aplicações de MNE Caracterização de Áreas de Amplitude Geográfica O MNE é usado para investigar paisagens para detectar áreas que correspondem as necessidades ecológicas da espécie O resultado é uma interpolação entre as locais conhecidos de amostragem ajudado por associações observadas entre as espécies e os atributos ambientais.
  • 17. Aplicações de MNE Caracterização de Áreas de Amplitude Geográfica O MNE produz previsões estatisticamente robustas das distribuições geográficas de espécies ou fenômenos (ainda em áreas não amostradas), excedendo as expectações sob modelos aleatórios (nulos). Vários exemplos de essa aplicação a estudos de sistemas de doença existem.
  • 18.
  • 19. Aplicações de MNE Identificação de áreas de invasão potencial a outras regiões Os MNEs caracterizam as condições ambientais gerais da ocorrência de uma espécie. Se o modelo foi calibrado corretamente, pode ser usado para procurar áreas de distribuição potencial. Por isso, os MNEs podem ser usados para identificar áreas que correspondem as condições ecológicas necessárias para uma espécie, ainda se a espécie não está presente.
  • 20. Vital, M. V. C. 2005. Modelagem de nicho ecológico utilizando algoritmos genéticos. Dissertação de Mestrado, Biologia (Ecologia), ICB / UFG, 43 p., Goiânia, GO.
  • 21. Aplicações de MNE Identificação de áreas de invasão potencial a outras regiões
  • 22.
  • 23. Aplicações de MNE Antecipando áreas de risco a mudanças climáticas Uma extensão lógica do MNE é identificar áreas potenciais de distribuição para responder perguntas sobre mudanças geográficas de espécies sob cenários de mudança climática ou uso da terra. Esse método é usado no estudo da biodiversidade, com testes e validações, e com aplicação ampla entre faunas e floras. Um estudo usou as mudanças de amplitude induzidas por mudanças climáticas para inferir a identidade dos vetores Lutzomyia de leishmaniasis no Brasil.
  • 24.
  • 25. Aplicações de MNE Identificação de Vetores o Hospedeiros Desconhecidos Os métodos de MNE podem ser aplicados a várias partes do ciclo de transmissão de doenças para identificar elementos desconhecidos do sistema. A geografia da distribuição dos casos clínicos pode proporcionar indicadores de quais clades são reservatórios potenciais. Para os hospedeiros mamíferos do grupo de vetores do Mal de Chagas relacionados a Triatoma protracta no México, foram identificados mamíferos de 5 das 5 espécies existentes. Outras aplicações dos métodos de MNE enfocam no reservatório misterioso do filoviruses (Ebolae Marburg) ao comparar as distriabuições dos mamíferos áfricanos com os surtos de filovirus.
  • 26.
  • 27. Resultados de MNE Construção d teste de modelos. Padrões geográficos de riqueza de 17 espécies a) dados de treinamento; b) modelo de previsão. nativas de roedores. Peterson, Ball e Cohoon, 2002 Sanchez-Cordero e Martinez-Meyer, 2000
  • 28. Desafios da modelagem do nicho ecológico (MNE) O MNE tem raízes antigas mas é uma ferramenta nova na ecologia de distribuições e a biogeografia. Por isso existem muitos desafios para refinar técnicas para ter métodos mais sintéticos e inferenciais. O melhoramento da capacidade de interpolação com precisão e extrapolar com eficiência fica os grandes desafios do MNE. Outro desafio inclua detalhas da MNE é testar e avaliar os resultados dos modelos.As técnicas atuais se enfocam na capacidade de prever dados de ocorrência independentes data na menor área prevista. Mas, previsões eficientes podem não descrever bem a amplitude geográfica de uma espécie
  • 29. Desafios da modelagem do nicho ecológico (MNE) O desafio principal é entender o papel da escala temporal e espacial. Nosso conhecimento atual sugere que acertando as escalas temporais e espaciais na análise podem proporcionar boas oportunidades para a previsão precisa do comportamento de mudanças geográficas, invasões e a disseminações de pragas e doenças Por isso, a escolha certa de conjuntos de dados ambientais precisa de muito mais pesquisa.
  • 30. Desafios da modelagem do nicho ecológico (MNE) Os dados de clima proporcionam uma aplicação temporal maior, mas os dados de sensoriamento remoto da superfície da Terra podem fornecer uma resolução espacial mais fina e podem medir aspectos de paisagens ecológicas que os parâmetros de clima não capturam. Além disso, porque os sistemas ecológicos geralmente refletiam interações complexas entre várias espécies, precisamos detalhar regas de análise e modelagem.
  • 31. Conclusões MNE pode resolver vários problemas da resolução espacial de resumos de risco geográfico e previsão de amplitudes geográficas. MNE ainda é um campo novo e deve crescer exponencialmente no futuro – se ligam. O uso extensivo de MNE para a biodiversidade pode servir como marco de qualidade a aceitação dos resultados