O documento discute a ecologia de populações e a importância da classificação e nomenclatura científica de organismos. A classificação coloca organismos em grupos com base em suas similaridades e relações evolutivas para organizar o estudo da natureza. A nomenclatura científica binomial padronizada, desenvolvida por Linnaeus, permite que cientistas de diferentes países se comuniquem sobre os mesmos organismos sem confusão.
2. Por que classificar?
Após desenvolver a fala, o
Homem quis organizar seu
mundo e começou agrupar, ou
classificar, todo em seu
mundo
3. Descrição
= separar atributos
Caráter = um atributo (como o cor da
pétala)
Estados de Caráter = duas ou mais
formas de um caráter ( “branco,”
“vermelho”).
4. Por que classificar?
Animais que nadam
Animais que voam
Animais que rasteam
Animais que caminham com quatro
pernas
Animais que mastigam sua comida
Animais que engulam sua comida
Animais que são tóxicos
5. Classificação
Colocando objetos, como seres vivos, em
algum tipo de ordem.
Classificação fenotípica
– Baseada na similaridade geral
– Os objetos mais similares são classificados
mais próximos
6. Problema com a classificação fenotípica
Pode ser arbitrária,
Como classificar essas formas?
10. Existem mais de 50 nomes comunes parar
o animal das últimas duas transparencias.
Os nomes vulgares variam por região.
Então, o que fazer?
11. Por que classificar?
Para ajudar o estudo da
natureza
Para ajudar a organização das
espécies descobertas . .
12. Classificação e Identificação
Classificação: A colocação de organismos em
grupos de espécies com parentesco. Listas das
características de organismos conhecidos.
Identificação: Comparando as características
de um organismo desconhecido a listas de
organismos conhecidos.
– Identificação no Campo
– Identificação no laboratório
– Identificação no museu/herbário
– Identificação clínica
13. Identificação
= associar um desconhecido com um
conhecido
Como? Somente uma: Decisões binárias
Chave taxonômica;
Árvore …………………………………….…………… 1
Folhas simples …….………………………… A
Folhas pentas …….………..…..…..…… B
Herbácea …………………………………….…………… 2
Flores vermelhas …….…………………………… A
Flores brancas …….…………………..…… B
14. Interpretação da Literatura
Diferencia entre identificação errada e
sinônimo não sempre fica clara
– Lista dos nomes de um nome taxonômico numa
revisão taxonômica as vezes tem ambos!
Autores diferentes usam classificações
diferentes
Importância de uma base de dados inteligente,
que ajuda interpretar os nomes
– Precisa ter informação de sinônimo, variações…
15. Espécies de Organismos
Existem 13 bilhões de organismos
conhecidos
Mas é somente 5% de todos os
organismos que viveram!!!!!
Organismos novos ainda são
descobertos e identificados
16. Por que classificar?
Para dar nome a cada espécie
baseado num método
padronizado de forma que os
cientistas de países
diferentes podem falar sobre
o mesmo animal sem confusão
17. O que é a Classificação?
A classificação é o arranjo de
organismos em grupos
ordenados a base de suas
similaridades
A classificação também é
chamada taxonomia
Os taxonomistas são cientistas
que identificam e dão nomes aos
organismos
17
18. Taxonomia
A ciência que lida com
– Nomenclatura: dar nomes ‘científicos’ as espécies
• Regulado severamente, códigos diferentes para botânica,
zoologia, bactéria
– Classificação: criar e nomear grupos, ‘taxa’
‘Sistemática’ é usado como equivalente
19. A Taxonomia é...
“A reclassificação perpétua de
espécies com nomes errados.”
“Um mal necessário.”
- Randall Kosaki
20. Taxonomistas Antigos
Há 2000 anos, o
primeiro taxonomista
foi Aristóteles
Aristóteles dividiu
os organismos em
plantas e animais
Os organismos eram
classificados pelo
seu habitat ---
habitantes da terra,
oceano, ou ar 20
21. Teofrasto (370-285 B.C.)
• Pai da Botânica, aluno de
Aristóteles.
• Classificou as plantas a base de
forma.
– Árvore
– Arbusto
– Subarbusto
– Herbácea
22. Taxonomistas Antigos
John Ray, botânico,
foi o primeiro de
usar Latim para
nomear e foi o
primeiro usar
espécie
Seus nomes eram
compridos com
descrições sobre
todo sobre a planta
22
23.
24. Historia da Nomenclatura
Científica
Naturalistas Gregos e Romanos, herbalistas
medievais; taxonomistas caipiras: nomes populares Os
naturalistas antes de Lineu:
nomes em Latim
nomina specifica; nome binominal, trinominal ou até polinominal
(e.g. Iris perpusilla saxatilis Norbonensis a caulis ferme)
nomes inconsistentes e muitas vezes muito cumpridos (propósitos
de diagnoses, descrição e identificação)
26. Carolus Linnaeus
1707 – 1778
Taxonomista do
século
Classificou os
organismos pela sua
estrutura
Desenvolveu o
sistema de
nomeclatura usada
até hoje
27. Carolus Linnaeus
1707-1778
Image: Wikimedia CommonsLibrary
Biodiversity Heritage
28. Nomenclatura Binomial
Bi indicaa dois
Nomen é nome
A nomenclatura binomial é um
sistema de classificação que
usa dois nomes para
identificar um organismo
29. Carolus Linnaeus
• O pai da taxonomia
• Desenvolveu o sistema de nomenclatura
binomial
• Nome de duas palavras (Gênero e espécie)
• Os sistemas de classificação [Species
plantarum (1753) e Systema naturae (1758)]
nomina trivialia; sempre com estrutura
binomial
• Gênero e espécie.
• Exemplo.
– Nepeta cataria L.
– “Nepeta floribus interrupte spicatus
pedunculatis”
estilo diagnostico
• Necessidade de códigos universais 29
30. Nomes Científicos
No princípio, Latim ou nomes Latinizados
Regulado pelos códigos:
– Códigos são escritos e mantidos por Comissões
• International Code for Zoological Nomenclature
• International Code for Botanical Nomenclature
• International Code for Bacterial Nomenclature
– Comissões são juízes das disputas
Problema: muitos organismos unicelulares não
são plantas ou animais e tem dois nomes
– Alga verde azul = cianobactéria
31. Os Nomes Científicos estão em
Latim
Regras da gramatica Latim
Concordância no genro
Mastigocerca capucina Wierzejski e Zacharias, 1893
Rattulus capucinus : Jennings, 1903
Trichocerca capucina (Wierzejski e Zacharias, 1893) Harring,
1913
32. Benefícios da Classificação
Identifica or organismos de forma
precisa e padronizada
Evita nomes estúpidos
”Cavalo”
do mar??
Usa a mesma linguagem (Latim ou
Grego) para todos os nomes
32
33. Nomes são únicos
… mas não absolutamente
– O nome botânico pode ser o mesmo do nome
zoológico
– Não existe um cadastro central (ainda), o
que permite espaço amplo para erros
• Nome ‘Já ocupado’
– Precisa ser substituído com outro nome – nome de
‘substituição’
34. Nomes são únicos?
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Pomacanthus imperator Holacanthus bishopi
35. Nomes são únicos?
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Pomacanthus imperator
= Holacanthus bishopi
Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)
Centropyge flavissima Centropyge flavissima
36. Nomes são únicos?
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Pomacanthus imperator
= Holacanthus bishopi
Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)
Centropyge flavissima Centropyge heraldi
= Centropyge flavissima
37. Por que classificar?
Pneumocystis jirovecii
foi classificado como
uma protozoa até a
analise de DNA
demonstrou que era
um fungo. Isso tem
importância de se um
organismo é
classificado como
protozoa ou fungo?
38. A classificação pode mudar
Filogenia = estudo científico,
– Resultados da pesquisa pode mudar nosso
entendimento
– Interpretação dos fatos pode ser diferente entre
os cientistas
Difícil construir uma classificação completa e
consistente
Pode levar a mudança de nomes
– A espécie muda de um gênero a outro…
– Quando o gênero tem outro genro
39. O que tem em um nome?
Monostyla closterocerca Schmarda, 1853
combinação nova:
Lecane closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935
Com nome do sub-gênero:
Lecane (Monostyla) closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935
Curto:
Lecane (M.) closterocerca (Shmarda, 1853) Or: L. closterocerca
Com nome de subespécie: trinominal
Lecane (Monostyla) closterocerca amazonica Koste,
1972
Ou: L. closterocerca amazonica
40. O que tem num Nome?
O que é um Nome?
Anthias “Nome” num texto: 13
Pseudanthias “Nome” sensu Botânica: 9
Anthias (Pseudanthias)
Anthias ventralis “Nome” sensu Zoologia: 4
Anthias hawaiiensis Anthias
Anthias (Pseudanthias) ventralis Pseudanthias
Anthias (Pseudanthias) hawaiiensis ventralis
Pseudanthias ventralis hawaiiensis
Pseudanthias hawaiiensis
Pseudanthias ventralis ventralis
Pseudanthias ventralis hawaiiensis
Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis ventralis
Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis hawaiiensis
41. Requerimentos Formais do ICZN
O nome ou ato de nomenclatura precisa ser
publicado;
Os nomes científicos precisam ser escritos usando as
26 letras do Alfabeto Latim;
A derivação: um nome pode ser derivado de
qualquer idioma, ou ainda de uma combinação
arbitraria de letras se foi formada para ser
usada como uma palava (não cbafdg);
=> muita liberdade!
46. Níveis Taxonômicos Acima do
Nível da Espécie
• Espécie: Apis mellifera
• Gênero: Apis
• Família: Apidae
• Ordem: Hymenoptera
• Classw: Insecta
• Filo: Artrópode
• Com exceção da espécie, esses níveis não
têm base biológica clara, mas devem ser
monofileticas
47. Taxons
A maioria dos gêneros contêm
um número de espécies
similares
Como poucos, o gênero Homo
faz parte da exceção
(somente incluía o Homem
moderno)
A classificação tem base nas
relações evolutivas 47
48. Classificação
• 1,700,000 nomes! É necessário ter um
sistema para organizar essa informação
– Classificação hierarquia
• Classificação se baseia na filogenia
(descendência comum)
– Hipótese: a vida originou somente uma vez;
todos os organismos evoluíram de um
ancestral comum
– Base da objetividade da classificação
49. Nomenclatura Científica
Nomes vulgares
– Variam com as idiomas
– Variam com a geografia
• Nomenclatura Binomial (Gênero +
espécie)
– Usado mundialmente
– Escherichia coli
– Homo sapiens
50. Qualquer organismo leva
dois nomes
• Canis lupus e o nome científico do lobo cinza.
• Canis é o nome do gênero
• lupus é o nome da espécie
51. Gênero
Um gênero consiste de um grupo de espécies
com parentesco próximo
Outros membros do grupo de Canis são os
cachorros e coiotes
O nome do gênero sempre escreve em letras
maiúsculas
Canis lantans Canis lupus Canis lupus familaris
52. Espécie
Uma espécie consiste de animais que podem
cruzar e produzir proles férteis
Somente o lobo cinza tem o nome de lupus.
O nome da espécie é sempre escrito em
minúsculos
54. Nomes Científicos
Binomial (dois nomes) Gênero primeiro e a
primeira letra em maiúscula seguida pela
espécie em minúscula
– Nome do gênero, nome da espécie
– Homo sapiens –
– Homo troglodytis (Seu ex-namorado?)
– Canis familiaris – Seu cachorrinho
– Felis domesticus – Seu gatinho (algumas pessoas
esquisitas precisam ter Felis leo ou Felis tigris)
– Canis latrans – Convida seu gatinho para jantar
– Canis lupus - ____________? aparece
55. Nomenclatura Binomial
Ursus maritmus
Ursus arctos
Ailuropoda melanoleuca
Qual par tem mais parentescod? 55
56. Nomes Científicos
Binomial Fonte do nome Fonte do Nome
Científico do Gênero da Espécie
Klebsiella Em homenagem a A doença
pneumoniae Klebs
Pfiesteria piscicida Em homenagem a Doença em peixes
Lois Pfiester
Salmonella Em homenagem a estupor (typh-)
typhimurium Daniel Salmon em ratos (muri-)
Streptococcus Cadeias de células Forma pus (pyo-)
pyogenes (strepto-)
Penicillium Como mecha Produz um
chrysogenum (penicill-) pigmento amarelo
(chryso-)
Trypanosoma cruzi Como saca rolha Em homenagem a
(trypano-, borer; Oswaldo Cruz
soma-, corpo)
57. Nomes de Micoorganismos
Nomenclatura binomial (científica)
Da a cada micróbio dois nomes:
– Gênero - substantivo, sempre começa com
letra maiúscula
– espécie - adjetive, sempre escrito no
minúsculo
Ambos em itálicos
– Staphylococcus aureus (S. aureus)
– Bacillus subtilis (B. subtilis)
– Escherichia coli (E. coli)
58. Nomenclatura
Publicação
– Para ser válido, o nome precisa ser
publicado numa revista aceita pelo código
O nome precisa ser único dentro do
domínio do código
– Os nomes zoológicos e botânicos podem ser
os mesmos
Tipificação
– O nome precisa ter um tipo como prova
59. Formato de nomes taxonômicos
Os nomes de gêneros e taxa inferiores são
escritos em italicos
– Exemplos: ‘Homo’ e ‘Homo sapiens’
O subgênero se escreve entre { } após o
gênero e o epíteto da espécie
– Holothuria (Thymiosicya) impatiens
O subgênero e níveis superiores são escritas
com a letra inicial em maiuscula
O nome do Gênero é frequentemente
abreviado a primeira em referencias
posteriore
– Exemplo: H. sapiens
60. Epíteto Específico
Segunda parte do nome de uma espécie
Geralmente é um adjetivo
– Toma o genro do nome do gênero (que sempre é um
substantivo)
Não precisa ser um adjetivo
– Substantivo em aposição
– Localidade
– Nomeado em homenagem a uma pessoa
• genitivo
61. Os Nomes em Latim são entendidos
por cientistas
61
62. Mudança de Nome
O Epíteto específico é frequentemente um
adjetivo, precisa ter declinação segundo as
regras da gramática latim
– Turbo littoreus Linnaeus, 1758
– Littorina littorea (Linnaeus, 1758)
O Epíteto específico pode ser um substantivo,
que tem seu próprio genro
– Tellina (Moerella) pygmaeus Lovén, 1846
– Taxonomistas, e especialmente outros usuários de
nomes taxonômicos, fazem erros!
• Tellina pygmaea: errado!!
63. Por que os nomes mudam?
Aumento de entendimento
científico Aplicação coreta dos códigos de
(descobrimentos; mudanças no nomenclatura
conceito de espécie (sensu lato) e (correção de erros; homônimos;…)
entendimento filogenético)
64. Mudança de Nome
Se uma espécie é transferido de um gênero a
outro, o nome da espécie muda
Zoologia: o nome do autor original é colocado
entre ( )
– Spongia aurea Montagu, 1818
– Hymeniacidon aurea (Montagu, 1818)
Botânica: parênteses + autor da ‘combinação’
nova
– Halophila stipulacea (Forsskål) Ascherson
65. Por que os nomes mudam?
Toda mudança é governada por convenções legais e neutras
cientificamente: os códigos de nomenclatura
Exemplo.: o ICZN (1999; http://www.iczn.org/iczn/index.jsp)
consiste de:
Preâmbulo
90 Artigos, agrupados em 18 capítulos
Uma ou mais provisão mandatória
Recomendações não mandatórias
Exemplos
Glossário
66. A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Ridley 16060 K
Alyxia pachyphylla Merr.
Coletor nativo 2224 PNH
67. A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Ridley 16060 K
Alyxia pachyphylla Merr.
Coletor nativo 2224 PNH
68. A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Ridley 16060 K
?
Alyxia pachyphylla Merr.
Coletor nativo 2224 PNH
69. A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Ridley 16060 K
J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915) ?
Alyxia pachyphylla Merr.
Coletor nativo 2224 PNH
J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc.
77 (1917)
70. A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Ridley 16060 K
J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915)
Alyxia pachyphylla Merr.
Coletor nativo 2224 PNH
J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc.
77 (1917)
Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
71. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria
Hunteria gracilis A.DC.
72. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria Gynopogon
K. Schum.
Hunteria gracilis A.DC.
73. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria Gynopogon
K. Schum.
?
Hunteria gracilis A.DC.
74. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria Gynopogon
Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.
Hunteria gracilis A.DC.
75. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Gynopogon Alyxia
Hook. f.
Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.
76. Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Gynopogon Alyxia
Hook. f.
Alyxia gracilis (A.DC.) Hook. f.
77. Tipos de sistemas de
informação taxonômica
• ‘Nomenclatores’: lista de nomes
• Taxonômicos
– Lista de nomes, mais informação taxonômica
(autor, referencia da publicação da descrição…)
– Who’s valid??
• Bancos de Dados de Espécies
– Informação da biologia, identificação…
• Distribuição
– Para um grupo de espécies ou para uma região
78. Nomenclatores
• Índice Fungorum
• Animais
– Nomenclator Zoologicus (nível do gênero)
– Index Animalium
• Plantas
– International Plant Names Index
79. Bases de Dados Taxonômicos
• Global
– Integrated Taxonomic Information System (ITIS)
– Species 2000
– Systema Naturae 2000
– UNESCO Register of Marine Organisms
• Regional
– Species 2000 Europe, European Register of Marine
Species (ERMS)
– Marine Species Database for Eastern Africa
(MASDEA)
• Taxonômico
– Fungi…
80. Bases de dados biogeográficos
• Global Biodiversity Information Facility
(GBIF)
• OBIS
– E seus nodos regionais
Os nomes taxonômicos não sempre estão
integrados
81. Bancos de Dados de Espécies
• FishBase
• Hexacorallia, Algaebase, CephBase,
Brachnet, NeMys…
• www.marinespecies.org
• Projeto árvore da vida
– http://tolweb.org/tree/phylogeny.html
82. Referencias
International Journal of Artigos com evidencia de
Systematic and Evolutionary espécies ou classificação
Microbiology novas
Bergey’s Manual of Systematic Proporciona informação
Bacteriology filogenética de bactéria e
arqueia
Approved Lists of Bacterial Alista as espécies
Names conhecidas de procariontes
a base de artigos publicados
83. Referencias
Bergey’s Manual of Morfologia, coloração
Determinative Bacteriology diferencial, e testes
Proporciona esquemas de bioquímicos
identificação para identificar
bactéria e arqueis
Bergey’s Manual of Systematic Baseada no sequenciamento
Bacteriology de rRNA
Proporciona informação
filogenética de bactéria e
arqueia