9. 評価1:キャリブレータの染色強度によるスコアの評価(2/2) 9
スコアの自動評価ソフトへの適用
• デジタル病理画像解析用のオープンソースソフトウェアQuPathを利用[6][7]
― 染色強度分類(1+、2+、3+)の閾値に
キャリブレータのレベルごとの濃さの平均値を利用
― 病理医がスコア診断に用いた領域を評価(20倍表示5視野)
[6] QuPath: Open source software for digital pathology image analysis. Peter Bankhead et al., Sci. Rep. 2017; 7: 16878
[7] The role of infiltrating lymphocytes in the neo-adjuvant treatment of women with HER2-positive breast cancer. A. J. Eustace et al., Breast Canc.2021;187:635
結果
None
:0
Strong
:3+
Weak
:1+
Staining
intensity
Moderate
:2+
1 10
1+ ratio=(1+と分類されたセル数)/(抽出された全セル数)%
H-score=(1+ratio*1) + (2+ratio*2) + (3+ratio*3)
IHC FISH 1+ ratio [%] 2+ ratio [%] 3+ ratio [%] H-score
case1 1+~2+ positive 40.0 18.8 4.5 91.2
case2 3+ positive 16.9 10.4 33.2 137.4
QuPath
pathologist
• 病理医の判定と一致した評価結果が得られることを確認
QuPathのスコア評価の流れ
1.領域を設定しセルを抽出
2.各セルの強度を閾値に基づき分類