El Consejo Escolar es el máximo órgano de gobierno de los centros educativos. Está compuesto por el director, maestros, padres de alumnos y representantes municipales. Se reúne al menos una vez por trimestre para tomar decisiones sobre la elaboración y evaluación del proyecto educativo, elección del director, admisión de alumnos, presupuesto y más. Cada dos años se renuevan la mitad de sus miembros, excepto el equipo directivo. También constituye comisiones como la de convivencia.