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BASES QUIMICAS DE LA
                   VIDA




SEGUNDA UNIDAD.
LIC. BIOLOGIA Y QUIMICA
PEM. DENISE GRIJALVA.
Unidad II.
   Bases
Químicas de la
    Vida
CONCEPTOS IMPORTANTES

 Elementos
 Compuestos

 Química Inorgánica

 Química Orgánica

 Agua

 Biomoléculas
CONTEXTO QUIMICO DE LA VIDA

 Evolución química como base de la evolución
  biológica
 Elementos y compuestos químicos que
  componen la materia orgánica en el cuerpo de
  los seres vivos y su entorno
 El agua, molécula fundamental para la vida

 Biomoléculas (carbohidratos, lípidos, proteínas,
  ácidos nucleicos y código genético)
CONCEPTOS BÁSICOS
ELEMENTO, COMPUESTO




    Sodio       Cloro   Cloruro de sodio
TABLE 2-1
PROPIEDADES DE UN ELEMENTO

   Partículas subatómicas
     Protones
                             Nube de
                             Carga               Electrones
     Neutrones              negativa

     Electrones                        Núcleo


 Número atómico
 Masa atómica

 Isótopos
FUNCIONES DE
ELEMENTOS IMPORTANTES

 OXIGENO: procesos metabólicos
 CARBONO: química orgánica

 HIDRÓGENO: formación de molécula de agua,
  puentes de hidrógeno metabolismo
 SODIO Y POTASIO: favorecen transmisión del
  impulso nervioso y contracción muscular
NIVELES DE ENERGÍA DE LOS
ELECTRONES
 Energía: capacidad para causar cambio.
 Energía potencial: es la energía que la
  materia posee debido a su localización o
  estructura.
 Los diferentes estados de energía potencial
  que los electrones tienen en un átomo se
  denominan Niveles de energía = órbitas de
  electrones
LE 2-7B




  Tercer nivel de energía
  (órbita)


                             Energía
  Segundo nivel de energía
                             absorbida
  (órbita)



  Primer nivel de energía
  (órbita)
                                         Energía
                                         Liberada

                   Núcleo
                   átomico
LE 2-8




             Hydrogen                                                      2          Atomic number        Helium
                1H                                                        He                                2He

    primer                                       Atomic mass              4.00       Element symbol
    órbita
                                                                                     Electron-órbita
                                                                                     diagram



             Lithium    Beryllium    Boron     Carbon          Nitrogen          Oxygen         Fluorine   Neon
                3Li       4Be         5B         6C               7N               8O              9F      10Ne

   Second
    órbita




             Sodium     Magnesium   Aluminum   Silicon     Phosphorus            Sulfur         Chlorine   Argon
              11Na        12Mg         12Al     14Si          15P                 16S             17Cl      18Ar

    Third
    órbita
LE 2-9




      Órbitales
   electronicos                                                            y
                                                   x


                                                                z
                    orbital          orbital 2s                                1s, 2s, and 2p orbitals
                      1s                               Tres orbitales 2p



   Diagramas de
      Órbitas de
       electrones


                    primera órbita                Second órbita                Neon, con dos
                    (máximo                       (máximo                      órbitas llenas
                    2 electrones)                 8 electrones)                (10 electrones)
LAS MOLÉCULAS
   La formación y la función dependen de los
    enlaces químicos entre los átomos
     Enlaces   covalentes
        Enlace covalente no polar
        Enalce covalente polar

     Enlaces iónicos
     Enlaces químicos débiles
        Enlaces de hidrógeno
        Enlaces de van der walals
MMMM
LE 2-12


                   –




                         O




               H               H

                                   +
          +            H2 O
LE 2-13




          Na              Cl            Na+                  Cl–
      Sodium atom    Chlorine atom   Sodium ion          Chlorine ion
     (an uncharged   (an uncharged    (a cation)          (an anion)
         atom)           atom)
                                          Sodium chloride (NaCl)
LE 2-13A




                 Na              Cl
            Sodium atom    Chlorine atom
           (an uncharged   (an uncharged
               atom)           atom)
LE 2-13B




              Na+                  Cl–
           Sodium ion          Chlorine ion
            (a cation)          (an anion)


                Sodium chloride (NaCl)
LE 2-14




          Na+
          Cl–
LE 2-15
                     –              +


           Agua
           (H2O)




                               +
                                    Enlace de hidrógeno
                               –



          Ammonio
           (NH3)




                    +              +



                          +
LAS REACCIONES ROMPEN Y
UNEN ENLACES QUÍMICOS




2 H2               O2               2 H 2O
       Reactivos        Reacción   Productos
AGUA, LA MOLÉCULA QUE
SUSTENTA LA VIDA
 El agua es el medio biológico de la tierra.
 La vida en la tierra comenzó en el agua.

 La mayoría de seres vivos estamos
  compuestos entre el 70-95% de agua.
 Los seres humanos NO podríamos vivir
  más de una semana sin agua.
CARACTERÍSTICAS DEL AGUA

                           Enlaces de
                           hidrogeno
Cohesión




   Movimiento de agua en
    plantas.
   También explica la tensión
    superficial del agua
REGULACIÓN DE LA TEMPERATURA
   Absorbe o libera calor con apenas un leve
    cambio en la temperatura
     Calor específico elevado
     Calor de vaporización elevado

     Calor de fusión elevado
Enlace de
                           Hidrogeno


          Hielo                          Agua Líquida
Los enlaces son estables               Los enlaces se rompen y se
                                        forman constantemente
AISLAMIENTO DE GRANDES
MASAS DE AGUA POR HIELO
FLOTANTE
   Debido a que el hielo es menos denso que
    el agua líquida, esto permite que exista
    vida debajo del hielo.
EL AGUA COMO SOLVENTE DE LA
                    –

VIDA             –
                        +

                        +
                            –

            –                   –
                Na+
                        –
                                + +           –
            +                    Na
      Cl–       Cl–                               +
                        +   –         +               –
            –                             –
                                          Na+
                 +                                +
                        –             –                   –
            +
                –                                 –
            –                             Cl–
                                      +                   +
                            Cl–                   +   –
                                      –
                                          +
                                                  –
                                      +
                                          –
                                      –
CONDICIONES ÁCIDAS O BÁSICAS
                  Ion Hidronio   Ion Hidróxido
0

                  1     Acido de Baterías


                  2     Jugo gástrico, zumo
                        de limón
                        Vinagre, cerveza,
                  3     vino




    Acidez
                  4     Zumo de tomate

                        Café puro, agua de
                  5     lluvia

                  6      Orina


Neutralidad       7     Agua Pura


                  8
                         Agua Marina
                  9
                  10
      Basicidad




                  11
                        Amoniaco doméstico
                  12    Blanqueador doméstico


                  13
                       Limpiador de hornos
                  14
LA QUÍMICA DEL CARBONO Y LA VIDA

    BIOMOLÉCULAS
Una de las hipótesis del órigen de la vida, es la de la átmosfera
primitiva, experimento realizado por Miller, en 1053
Todos los organismos están
  constituidos por compuestos
químicos basados principalmente
    en el elemento Carbono
Esqueletos de carbono de unidos por
         enlaces covalentes




      Compuestos Orgánicos
 Constituyentes   estructurales de las
  células y tejidos.
 Participan y regulan el metabolismo-

 Transmiten información.

 Participan en el proceso de evolución
  de las especies
 Fuente de energía.
LE 4-3



   Fórmula                  Fórmula        Modelo de         Modelo
   Molecular               Estructural   Eferas y varillas   espacial




         Metano




         Etano




         Eteno (etileno)
LE 4-4




    Hidrogeno         Oxigeno          Nitrogeno        Carbono
   (valencia = 1)   (valencia = 2)   (valencia = 3)   (valencia = 4)
Ethane                Propane
           Longitud




VARIACIÓ
N DE LOS
ESQUELET              Butane           2-methylpropane
                                   (commonly called isobutane)

OS         Ramificación


CARBONA
DOS
                      1-Butene             2-Butene
           Dobles enlaces




                     Cyclohexane             Benzene
           anillos
LOS
HIDROCARBUROS
                       Gotitas de grasa (teñidas de rojo)




                                              100 µm
 Molécula de lípidos    Células adiposas de mamífero
Los Isómeros




Isómeros estructurales
LE 4-7B




          Isómeros geométricos
LE 4-7C




                  L-isomero   D-isomeror




          Enantiómeros
GRUPOS FUNCIONALES

            Estructura



             (puede escribirse HO—)

                                        Etanol, alcohol, presente en las
                                        Bebidas alcohólicas



                                      Propiedades funcionales
Nombre de los compuestos
                                          Es polar como resultado del
Alcoholes (sus nombres específicos        Átomo de oxígeno electronegativo
Generalmente teminan en -ol)              Que arrastra electrones hacia el mismo


                                          Atrae moléculas de agua, lo que
                                          Ayuda a disolver compuestos
                                          Orgánicos como los azúcares.
Estructura                            Ejemplo




                                         Acetona, la acetona más simple




Nombre de los compuestos                 Popanal

Cetonas, el grupo carbonilo esta
Dentro del esqueleto de carbono          Propiedades funcionales
Aldehídos, el grupo carbonilo esta
                                           Una cetona y un aldehído pueden ser
En le extremo del esqueleto de carbono
                                           Isómeros estructurales con diferentes
                                           Propiedades, como es el caso de la
                                           Acetona y propanal
Estructura                               Ejemplo




                                         Ácido acético, que le da al vinagre
                                         Su gusto agrio




Nombre de los compuestos                 Propiedades funcionales
Ácidos carboxilicos o ácidos orgánicos      Tiene propiedades ácidas porque
                                            Es un fuente de iones (H+)

                                            El enlace covalente entre el oxigeno
                                            Y el hidrógeno es tan polar que los
                                            Iones hidrogeno (H+) tienden a
                                            Disociarse de forma reversible




                                         Acido acético       Ion Acetato
                                            En las células se encuentran en
                                            Forma iónica y se denomina grupo
                                            carboxilato.
Estructura                    Ejemplo




                                          Glicina
                           Debido a que también tiene un grupo
                           Carboxilo, la glicina es tanto una amina
                           Como un ácido carboxilico; los compuestos
                           Con ambos grupos se denominan
                           aminoácidos



Nombre de los compuestos   Propiedades funcionales
Aminas                       Actúa como una base, puede captar
                             Un protón de la solución circundante




                               (no ioinizado) (ionizado)
                             Ionizado, con carga de 1+ en condiciones
                             Celulares
Estructura                            Ejemplo




             (puede escribirse HS—)


                                                 Etanotiol




Nombre de los compuestos              Propiedades funcionales

 Tioles                                 Dos grupos sulfidrilos pueden
                                        Interactuar para ayudar a estabi-
                                        Zar la estructura proteínica
LE 4-10BC




              Estructura               Ejemplo




                                 Glicerol fosfato




 Nombre de los compuestos   Propiedades funcionales

  Fosfatos orgánicos          Forma de anión (ion cargado
                              negativamente) de la molécula de
                              La que forma parte .

                              Puede transferir energía entre
                              Moléculas orgánicas.
Adenosina   P   P   P
LE 4-UN66B




      Adenosina   P   P + Pi
¿CUÁL SERÁ EL CARBONO
ASIMÉTRICO EN ESTA
MOLÉCULA?



      a      b      c   d   e
MOLÉCULAS BIOLÓGICAS


         Carbohidratos

            Lípidos

           Proteínas

        Ácidos   Nucleicos
Monómeros



Polímeros
Reacción de condensación
 - Síntesis por deshidratación
 - Se pierde una molécula de agua

    -OH + -H                H2O


       +                     -
LE 5-2A




                     Short polymer                             Unlinked monomer


                  Dehydration removes a water
                  molecule, forming a new bond




                                     Longer polymer
          Dehydration reaction in the synthesis of a polymer
   Hidrólisis
    - Literalmente: romper con agua

         H2 O                  -OH + -H

         -                       +
LE 5-2B




                       Hydrolysis adds a water
                       molecule, breaking a bond




          Hydrolysis of a polymer
CARBOHIDRATOS
FUNCIONES


 Fuente de energía para las células
  Almidones y azúcares
 Componentes estructurales

  Celulosa
CLASIFICACIÓN:

         Número de átomos de Carbono

             Triosas           3
                Tetrosas   4
             Pentosas          5
             Hexosas           6
             Heptosas          7
LE 5-3
           Triose sugars    Pentose sugars             Hexose sugars
              (C3H6O3)        (C5H10O5)                  (C5H12O6)




         Glyceraldehyde



                              Ribose
                                             Glucose               Galactose




         Dihydroxyacetone


                              Ribulose
                                                        Fructose
LE 5-4A




          Linear and
          ring forms
LE 5-4B




          Abbreviated ring structure
LE 5-5A




                                                        1–4
                                                     glycosidic
                                                      linkage




          Glucose   Glucose                          Maltose

                              Dehydration
                              reaction in the
                              synthesis of maltose
LE 5-5B




                                                          1–2
                                                       glycosidic
                                                        linkage




          Glucose   Fructose                          Sucrose
                               Dehydration
                               reaction in the
                               synthesis of sucrose
POLISACÁRIDOS


Polímeros con cientos a miles de moléculas
      unidas por enlaces glucosídicos.
POLISACÁRIDOS IMPORTANTES

           Almidón
           Celulosa

          Glucógeno

           Quitina
GLUCOSA
LE 5-7A




          a Glucose                         b Glucose



          a and b glucose ring structures
LE 5-7B



          Almidón




          Starch: 1–4 linkage of a glucose monomers.
AMILOSA
AMILOPECTINA
LE 5-7C




          Celulosa




          Cellulose: 1–4 linkage of b glucose monomers.
LE 5-6A
               Chloroplast       Starch




                                            1 µm




          Amylose                          Amylopectin




          Starch: a plant polysaccharide
LE 5-6B
               Mitochondria   Glycogen granules




                                             0.5 µm




                                       Glycogen



          Glycogen: an animal polysaccharide
LE 5-8



                              Cellulose microfibrils
                              in a plant cell wall




                                        Microfibril

                 Cell walls      0.5 µm


         Plant cells




                                                       Cellulose
                                                       molecules




                b Glucose
                monomer
FIGURE 5-09
LE 5-10




          The structure of chitin.   Chitin forms the exoskeleton of arthropods.   Chitin is used to make a strong and
                                     This cicada is molting, shedding its old      flexible surgical thread that decomposes
                                     exoskeleton and emerging in adult form.       after the wound or incision heals.
LIPIDOS
LE 5-11




                                                 Fatty acid
                                               (palmitic acid)




          Dehydration reaction in the synthesis of a fat

           Ester linkage




          Fat molecule (triacylglycerol)
LE 5-11A




                                                    Fatty acid
                                                  (palmitic acid)



      Glycerol
           Dehydration reaction in the synthesis of a fat
LE 5-11B


            Ester linkage




           Fat molecule (triacylglycerol)
LE 5-12




                                                   Stearic acid




          Saturated fat and fatty acid.




                                                          Oleic acid




                                            cis double bond
                                            causes bending
          Unsaturated fat and fatty acid.
LE 5-13A


                                  Choline


                                Phosphate

                                  Glycerol




                                Fatty acids




           Structural formula                 Space-filling model
LE 5-13B




                           Hydrophilic
                           head




                           Hydrophobic
                           tails




           Phospholipid symbol
LE 5-14




                        WATER
          Hydrophilic
          head




          Hydrophobic
                        WATER
          tails
FIGURE 5-15
PROTEÍNAS
FUNCIONES

 Enzimas
 Sostén
 Almacenamiento de energía
 Transporte
 Hormonas
 Comunicación celular
 Movimiento
 Inmunológica
Poseen estructura muy compleja
   sintetizadas a partir de 20
           aminoácidos
LE 5-UN78


                    a carbon




            Amino    Carboxyl
            group    group
LE 5-17A




                        Glycine (Gly)    Alanine (Ala)        Valine (Val)           Leucine (Leu)   Isoleucine (Ile)

           Nonpolar




                      Methionine (Met)       Phenylalanine (Phe)             Tryptophan (Trp)        Proline (Pro)
LE 5-17B




           Polar




                   Serine (Ser)   Threonine (Thr)   Cysteine (Cys)   Tyrosine (Tyr)   Asparagine (Asn)   Glutamine (Gln)
Formación de polímeros
LE 5-18

              Peptide
              bond




                                           Side chains
                         Peptide
                         bond



                                           Backbone




           Amino acid       Carboxyl end
          (N-terminus)      (C-terminus)
ESTRUCTURA
LE 5-19A




                            Groove




           A ribbon model
LE 5-19B




                                   Groove




           A space-filling model
ESTRUCTURA PRIMARIA

 Secuencia única de aminoácidos
LE 5-20A

           Amino end      Amino acid
                           subunits




                       Carboxyl end
ESTRUCTURA SECUNDARIA
 Patrones repetidos en la cadena
       carbonada principal
LE 5-20B




                  b pleated sheet


     Amino acid
      subunits




                                    a helix
ESTRUCTURA TERCIARIA
  Forma global resultante de las
 interacciones entre los grupos R.
 Enlaces de H entre grupos R
 Atracción iónica

 Interacciones hidrófobas

 Enlaces entre átomos de S
LE 5-20DB
                                          Hydrophobic
                                          interactions and
                                          van der Waals
                                          interactions

                                              Polypeptide
                                              backbone

            Hydrogen
            bond



                       Disulfide bridge




                  Ionic bond
LE 5-20D




                                         Hydrophobic
                                         interactions and
                                         van der Waals
                                         interactions
                                             Polypeptide
                                             backbone
           Hydrogen
           bond


                      Disulfide bridge




                 Ionic bond
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Estructura proteica que resulta de la
    acumulación de subunidades
             polipeptidíca
LE 5-20E




                           Polypeptide
                           chain          b Chains




                                                       Iron
                                                      Heme

                                          a Chains
     Polypeptide chain   Collagen        Hemoglobin
LE 5-20




                             b pleated sheet
      +H
           3N
    Amino end   Amino acid
                 subunits




                                               a helix
LE 5-21A




                                      10 µm                                     10 µm

    Red blood    Normal cells are             Red blood    Fibers of abnormal
    cell shape   full of individual           cell shape   hemoglobin deform
                 hemoglobin                                cell into sickle
                 molecules, each                           shape.
                 carrying oxygen.
LE 5-21B


                                Normal hemoglobin                                                       Sickle-cell hemoglobin
    Primary             Val   His       Leu   Thr   Pro       Glu     Glu   Primary               Val    His       Leu   Thr   Pro   Val     Glu
    structure            1      2        3    4     5         6       7     structure              1     2          3    4     5     6       7
                                                                                             Exposed
    Secondary                                                               Secondary        hydrophobic
    and tertiary                                                b subunit   and tertiary     region                                        b subunit
    structures                                                              structures




                                                                  b                                            a
                                    a
                                                                                                                                       b
    Quaternary     Normal                                                   Quaternary       Sickle-cell
    structure      hemoglobin                                               structure        hemoglobin                               a
                   (top view)                                                                                  b
                                     b                    a



    Function       Molecules do                                             Function       Molecules
                   not associate                                                           interact with
                   with one                                                                one another to
                   another; each                                                           crystallize into
                   carries oxygen.                                                         a fiber; capacity
                                                                                           to carry oxygen
                                                                                           is greatly reduced.
ÁCIDOS NUCLEICOS

 Almacenan información
 Transmiten información

 Son los que permiten a los organismos vivos
  reproducir sus complejos. componentes de una
  generación a la siguiente.
 ADN

 ARN
LE 5-25
                                     DNA




            Sintesis de mRNA en
            `nucleo
                                    mRNA




              NUCLEUS
                                                        CYTOPLASM


                                           mRNA
            Movimiento de RNAm
          Hacia el citoplasma a
                                                  Ribosome
          Través del poro nuclear




            Sintesís
          De la Proteína



                                                    Amino
                    Polypeptide                     acids
LE 5-26A
              5 end




                                               Nucleosido
                                                 Nitrogenous
                                                     base




                                 Phosphate
                                   group       Pentose
                                                sugar
                                  Nucleotide

             3 end
            Polynucleotide, or
           nucleic acid
LE 5-26B
                         Nitrogenous bases
                             Pyrimidines




              Cytosine     Thymine (in DNA)       Uracil (in RNA)
                 C                T                      U


                                  Purines




                    Adenine                 Guanine
                       A                      G

                           Pentose sugars




           Deoxyribose (in DNA)             Ribose (in RNA)

             Nucleoside components
LE 5-27
                         5 end     3 end


                                        Columna vertebral
                                        De azucar-fosfato

                                             Par de bases (unidas
                                             Por enlaces de hidro-
                                             geno

                                             Old strands

                                             Nucleótidos
                                             A punto de
                                             Agregarse a
                                             La nueva cadena



                           5 end


                       Nuevas
                       cadenas



          3 end                                               5 end

              5 end                                  3 end
CODONES Y ANTICODONES
   Codones: Secuencia de tres nucléotidos de ADN o
    ARNm que específica un aminoácido particular o una
    señal de terminación; unidad básica del código
    genético.

   Anticodones: triplete de bases especializado situado
    en el extremo de una molécula de ARNt que reconoce
    un codón complementario particular en una molécula
    de ARNm
EJEMPLOS

   Codones que se forman a partir del siguiente
    gen (ADN)
     TAA GCT GGC ATT
     ATT CGA CCG TAA RESPUESTA

Se analizan los siguientes anticodones
     UCG AUU GCA GGC
     AGC TAA CGA CCG

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  • 1. BASES QUIMICAS DE LA VIDA SEGUNDA UNIDAD. LIC. BIOLOGIA Y QUIMICA PEM. DENISE GRIJALVA.
  • 2. Unidad II. Bases Químicas de la Vida
  • 3. CONCEPTOS IMPORTANTES  Elementos  Compuestos  Química Inorgánica  Química Orgánica  Agua  Biomoléculas
  • 4. CONTEXTO QUIMICO DE LA VIDA  Evolución química como base de la evolución biológica  Elementos y compuestos químicos que componen la materia orgánica en el cuerpo de los seres vivos y su entorno  El agua, molécula fundamental para la vida  Biomoléculas (carbohidratos, lípidos, proteínas, ácidos nucleicos y código genético)
  • 5. CONCEPTOS BÁSICOS ELEMENTO, COMPUESTO Sodio Cloro Cloruro de sodio
  • 7. PROPIEDADES DE UN ELEMENTO  Partículas subatómicas  Protones Nube de Carga Electrones  Neutrones negativa  Electrones Núcleo  Número atómico  Masa atómica  Isótopos
  • 8. FUNCIONES DE ELEMENTOS IMPORTANTES  OXIGENO: procesos metabólicos  CARBONO: química orgánica  HIDRÓGENO: formación de molécula de agua, puentes de hidrógeno metabolismo  SODIO Y POTASIO: favorecen transmisión del impulso nervioso y contracción muscular
  • 9. NIVELES DE ENERGÍA DE LOS ELECTRONES  Energía: capacidad para causar cambio.  Energía potencial: es la energía que la materia posee debido a su localización o estructura.  Los diferentes estados de energía potencial que los electrones tienen en un átomo se denominan Niveles de energía = órbitas de electrones
  • 10. LE 2-7B Tercer nivel de energía (órbita) Energía Segundo nivel de energía absorbida (órbita) Primer nivel de energía (órbita) Energía Liberada Núcleo átomico
  • 11. LE 2-8 Hydrogen 2 Atomic number Helium 1H He 2He primer Atomic mass 4.00 Element symbol órbita Electron-órbita diagram Lithium Beryllium Boron Carbon Nitrogen Oxygen Fluorine Neon 3Li 4Be 5B 6C 7N 8O 9F 10Ne Second órbita Sodium Magnesium Aluminum Silicon Phosphorus Sulfur Chlorine Argon 11Na 12Mg 12Al 14Si 15P 16S 17Cl 18Ar Third órbita
  • 12. LE 2-9 Órbitales electronicos y x z orbital orbital 2s 1s, 2s, and 2p orbitals 1s Tres orbitales 2p Diagramas de Órbitas de electrones primera órbita Second órbita Neon, con dos (máximo (máximo órbitas llenas 2 electrones) 8 electrones) (10 electrones)
  • 13. LAS MOLÉCULAS  La formación y la función dependen de los enlaces químicos entre los átomos  Enlaces covalentes  Enlace covalente no polar  Enalce covalente polar  Enlaces iónicos  Enlaces químicos débiles  Enlaces de hidrógeno  Enlaces de van der walals
  • 14. MMMM
  • 15. LE 2-12 – O H H + + H2 O
  • 16. LE 2-13 Na Cl Na+ Cl– Sodium atom Chlorine atom Sodium ion Chlorine ion (an uncharged (an uncharged (a cation) (an anion) atom) atom) Sodium chloride (NaCl)
  • 17. LE 2-13A Na Cl Sodium atom Chlorine atom (an uncharged (an uncharged atom) atom)
  • 18. LE 2-13B Na+ Cl– Sodium ion Chlorine ion (a cation) (an anion) Sodium chloride (NaCl)
  • 19. LE 2-14 Na+ Cl–
  • 20. LE 2-15 – + Agua (H2O) + Enlace de hidrógeno – Ammonio (NH3) + + +
  • 21. LAS REACCIONES ROMPEN Y UNEN ENLACES QUÍMICOS 2 H2 O2 2 H 2O Reactivos Reacción Productos
  • 22.
  • 23. AGUA, LA MOLÉCULA QUE SUSTENTA LA VIDA
  • 24.  El agua es el medio biológico de la tierra.  La vida en la tierra comenzó en el agua.  La mayoría de seres vivos estamos compuestos entre el 70-95% de agua.  Los seres humanos NO podríamos vivir más de una semana sin agua.
  • 25. CARACTERÍSTICAS DEL AGUA Enlaces de hidrogeno
  • 26. Cohesión  Movimiento de agua en plantas.  También explica la tensión superficial del agua
  • 27. REGULACIÓN DE LA TEMPERATURA  Absorbe o libera calor con apenas un leve cambio en la temperatura  Calor específico elevado  Calor de vaporización elevado  Calor de fusión elevado
  • 28. Enlace de Hidrogeno Hielo Agua Líquida Los enlaces son estables Los enlaces se rompen y se forman constantemente
  • 29. AISLAMIENTO DE GRANDES MASAS DE AGUA POR HIELO FLOTANTE  Debido a que el hielo es menos denso que el agua líquida, esto permite que exista vida debajo del hielo.
  • 30.
  • 31. EL AGUA COMO SOLVENTE DE LA – VIDA – + + – – – Na+ – + + – + Na Cl– Cl– + + – + – – – Na+ + + – – – + – – – Cl– + + Cl– + – – + – + – –
  • 32. CONDICIONES ÁCIDAS O BÁSICAS Ion Hidronio Ion Hidróxido
  • 33. 0 1 Acido de Baterías 2 Jugo gástrico, zumo de limón Vinagre, cerveza, 3 vino Acidez 4 Zumo de tomate Café puro, agua de 5 lluvia 6 Orina Neutralidad 7 Agua Pura 8 Agua Marina 9 10 Basicidad 11 Amoniaco doméstico 12 Blanqueador doméstico 13 Limpiador de hornos 14
  • 34. LA QUÍMICA DEL CARBONO Y LA VIDA BIOMOLÉCULAS
  • 35. Una de las hipótesis del órigen de la vida, es la de la átmosfera primitiva, experimento realizado por Miller, en 1053
  • 36. Todos los organismos están constituidos por compuestos químicos basados principalmente en el elemento Carbono
  • 37. Esqueletos de carbono de unidos por enlaces covalentes Compuestos Orgánicos
  • 38.  Constituyentes estructurales de las células y tejidos.  Participan y regulan el metabolismo-  Transmiten información.  Participan en el proceso de evolución de las especies  Fuente de energía.
  • 39. LE 4-3 Fórmula Fórmula Modelo de Modelo Molecular Estructural Eferas y varillas espacial Metano Etano Eteno (etileno)
  • 40. LE 4-4 Hidrogeno Oxigeno Nitrogeno Carbono (valencia = 1) (valencia = 2) (valencia = 3) (valencia = 4)
  • 41. Ethane Propane Longitud VARIACIÓ N DE LOS ESQUELET Butane 2-methylpropane (commonly called isobutane) OS Ramificación CARBONA DOS 1-Butene 2-Butene Dobles enlaces Cyclohexane Benzene anillos
  • 42. LOS HIDROCARBUROS Gotitas de grasa (teñidas de rojo) 100 µm Molécula de lípidos Células adiposas de mamífero
  • 44. LE 4-7B Isómeros geométricos
  • 45. LE 4-7C L-isomero D-isomeror Enantiómeros
  • 46. GRUPOS FUNCIONALES Estructura (puede escribirse HO—) Etanol, alcohol, presente en las Bebidas alcohólicas Propiedades funcionales Nombre de los compuestos Es polar como resultado del Alcoholes (sus nombres específicos Átomo de oxígeno electronegativo Generalmente teminan en -ol) Que arrastra electrones hacia el mismo Atrae moléculas de agua, lo que Ayuda a disolver compuestos Orgánicos como los azúcares.
  • 47. Estructura Ejemplo Acetona, la acetona más simple Nombre de los compuestos Popanal Cetonas, el grupo carbonilo esta Dentro del esqueleto de carbono Propiedades funcionales Aldehídos, el grupo carbonilo esta Una cetona y un aldehído pueden ser En le extremo del esqueleto de carbono Isómeros estructurales con diferentes Propiedades, como es el caso de la Acetona y propanal
  • 48. Estructura Ejemplo Ácido acético, que le da al vinagre Su gusto agrio Nombre de los compuestos Propiedades funcionales Ácidos carboxilicos o ácidos orgánicos Tiene propiedades ácidas porque Es un fuente de iones (H+) El enlace covalente entre el oxigeno Y el hidrógeno es tan polar que los Iones hidrogeno (H+) tienden a Disociarse de forma reversible Acido acético Ion Acetato En las células se encuentran en Forma iónica y se denomina grupo carboxilato.
  • 49. Estructura Ejemplo Glicina Debido a que también tiene un grupo Carboxilo, la glicina es tanto una amina Como un ácido carboxilico; los compuestos Con ambos grupos se denominan aminoácidos Nombre de los compuestos Propiedades funcionales Aminas Actúa como una base, puede captar Un protón de la solución circundante (no ioinizado) (ionizado) Ionizado, con carga de 1+ en condiciones Celulares
  • 50. Estructura Ejemplo (puede escribirse HS—) Etanotiol Nombre de los compuestos Propiedades funcionales Tioles Dos grupos sulfidrilos pueden Interactuar para ayudar a estabi- Zar la estructura proteínica
  • 51. LE 4-10BC Estructura Ejemplo Glicerol fosfato Nombre de los compuestos Propiedades funcionales Fosfatos orgánicos Forma de anión (ion cargado negativamente) de la molécula de La que forma parte . Puede transferir energía entre Moléculas orgánicas.
  • 52. Adenosina P P P
  • 53. LE 4-UN66B Adenosina P P + Pi
  • 54. ¿CUÁL SERÁ EL CARBONO ASIMÉTRICO EN ESTA MOLÉCULA? a b c d e
  • 55. MOLÉCULAS BIOLÓGICAS  Carbohidratos  Lípidos  Proteínas  Ácidos Nucleicos
  • 57. Reacción de condensación - Síntesis por deshidratación - Se pierde una molécula de agua -OH + -H H2O + -
  • 58. LE 5-2A Short polymer Unlinked monomer Dehydration removes a water molecule, forming a new bond Longer polymer Dehydration reaction in the synthesis of a polymer
  • 59. Hidrólisis - Literalmente: romper con agua H2 O -OH + -H - +
  • 60. LE 5-2B Hydrolysis adds a water molecule, breaking a bond Hydrolysis of a polymer
  • 62. FUNCIONES  Fuente de energía para las células Almidones y azúcares  Componentes estructurales Celulosa
  • 63. CLASIFICACIÓN: Número de átomos de Carbono  Triosas 3  Tetrosas 4  Pentosas 5  Hexosas 6  Heptosas 7
  • 64. LE 5-3 Triose sugars Pentose sugars Hexose sugars (C3H6O3) (C5H10O5) (C5H12O6) Glyceraldehyde Ribose Glucose Galactose Dihydroxyacetone Ribulose Fructose
  • 65. LE 5-4A Linear and ring forms
  • 66. LE 5-4B Abbreviated ring structure
  • 67. LE 5-5A 1–4 glycosidic linkage Glucose Glucose Maltose Dehydration reaction in the synthesis of maltose
  • 68. LE 5-5B 1–2 glycosidic linkage Glucose Fructose Sucrose Dehydration reaction in the synthesis of sucrose
  • 69. POLISACÁRIDOS Polímeros con cientos a miles de moléculas unidas por enlaces glucosídicos.
  • 70. POLISACÁRIDOS IMPORTANTES  Almidón  Celulosa  Glucógeno  Quitina
  • 72. LE 5-7A a Glucose b Glucose a and b glucose ring structures
  • 73. LE 5-7B Almidón Starch: 1–4 linkage of a glucose monomers.
  • 76. LE 5-7C Celulosa Cellulose: 1–4 linkage of b glucose monomers.
  • 77. LE 5-6A Chloroplast Starch 1 µm Amylose Amylopectin Starch: a plant polysaccharide
  • 78. LE 5-6B Mitochondria Glycogen granules 0.5 µm Glycogen Glycogen: an animal polysaccharide
  • 79. LE 5-8 Cellulose microfibrils in a plant cell wall Microfibril Cell walls 0.5 µm Plant cells Cellulose molecules b Glucose monomer
  • 81. LE 5-10 The structure of chitin. Chitin forms the exoskeleton of arthropods. Chitin is used to make a strong and This cicada is molting, shedding its old flexible surgical thread that decomposes exoskeleton and emerging in adult form. after the wound or incision heals.
  • 83. LE 5-11 Fatty acid (palmitic acid) Dehydration reaction in the synthesis of a fat Ester linkage Fat molecule (triacylglycerol)
  • 84. LE 5-11A Fatty acid (palmitic acid) Glycerol Dehydration reaction in the synthesis of a fat
  • 85. LE 5-11B Ester linkage Fat molecule (triacylglycerol)
  • 86. LE 5-12 Stearic acid Saturated fat and fatty acid. Oleic acid cis double bond causes bending Unsaturated fat and fatty acid.
  • 87. LE 5-13A Choline Phosphate Glycerol Fatty acids Structural formula Space-filling model
  • 88. LE 5-13B Hydrophilic head Hydrophobic tails Phospholipid symbol
  • 89. LE 5-14 WATER Hydrophilic head Hydrophobic WATER tails
  • 92. FUNCIONES  Enzimas  Sostén  Almacenamiento de energía  Transporte  Hormonas  Comunicación celular  Movimiento  Inmunológica
  • 93. Poseen estructura muy compleja sintetizadas a partir de 20 aminoácidos
  • 94. LE 5-UN78 a carbon Amino Carboxyl group group
  • 95. LE 5-17A Glycine (Gly) Alanine (Ala) Valine (Val) Leucine (Leu) Isoleucine (Ile) Nonpolar Methionine (Met) Phenylalanine (Phe) Tryptophan (Trp) Proline (Pro)
  • 96. LE 5-17B Polar Serine (Ser) Threonine (Thr) Cysteine (Cys) Tyrosine (Tyr) Asparagine (Asn) Glutamine (Gln)
  • 98. LE 5-18 Peptide bond Side chains Peptide bond Backbone Amino acid Carboxyl end (N-terminus) (C-terminus)
  • 100. LE 5-19A Groove A ribbon model
  • 101. LE 5-19B Groove A space-filling model
  • 102. ESTRUCTURA PRIMARIA Secuencia única de aminoácidos
  • 103. LE 5-20A Amino end Amino acid subunits Carboxyl end
  • 104. ESTRUCTURA SECUNDARIA Patrones repetidos en la cadena carbonada principal
  • 105. LE 5-20B b pleated sheet Amino acid subunits a helix
  • 106. ESTRUCTURA TERCIARIA Forma global resultante de las interacciones entre los grupos R.
  • 107.  Enlaces de H entre grupos R  Atracción iónica  Interacciones hidrófobas  Enlaces entre átomos de S
  • 108. LE 5-20DB Hydrophobic interactions and van der Waals interactions Polypeptide backbone Hydrogen bond Disulfide bridge Ionic bond
  • 109. LE 5-20D Hydrophobic interactions and van der Waals interactions Polypeptide backbone Hydrogen bond Disulfide bridge Ionic bond
  • 110. ESTRUCTURA CUATERNARIA Estructura proteica que resulta de la acumulación de subunidades polipeptidíca
  • 111. LE 5-20E Polypeptide chain b Chains Iron Heme a Chains Polypeptide chain Collagen Hemoglobin
  • 112. LE 5-20 b pleated sheet +H 3N Amino end Amino acid subunits a helix
  • 113. LE 5-21A 10 µm 10 µm Red blood Normal cells are Red blood Fibers of abnormal cell shape full of individual cell shape hemoglobin deform hemoglobin cell into sickle molecules, each shape. carrying oxygen.
  • 114. LE 5-21B Normal hemoglobin Sickle-cell hemoglobin Primary Val His Leu Thr Pro Glu Glu Primary Val His Leu Thr Pro Val Glu structure 1 2 3 4 5 6 7 structure 1 2 3 4 5 6 7 Exposed Secondary Secondary hydrophobic and tertiary b subunit and tertiary region b subunit structures structures b a a b Quaternary Normal Quaternary Sickle-cell structure hemoglobin structure hemoglobin a (top view) b b a Function Molecules do Function Molecules not associate interact with with one one another to another; each crystallize into carries oxygen. a fiber; capacity to carry oxygen is greatly reduced.
  • 115. ÁCIDOS NUCLEICOS  Almacenan información  Transmiten información  Son los que permiten a los organismos vivos reproducir sus complejos. componentes de una generación a la siguiente.  ADN  ARN
  • 116. LE 5-25 DNA Sintesis de mRNA en `nucleo mRNA NUCLEUS CYTOPLASM mRNA Movimiento de RNAm Hacia el citoplasma a Ribosome Través del poro nuclear Sintesís De la Proteína Amino Polypeptide acids
  • 117. LE 5-26A 5 end Nucleosido Nitrogenous base Phosphate group Pentose sugar Nucleotide 3 end Polynucleotide, or nucleic acid
  • 118. LE 5-26B Nitrogenous bases Pyrimidines Cytosine Thymine (in DNA) Uracil (in RNA) C T U Purines Adenine Guanine A G Pentose sugars Deoxyribose (in DNA) Ribose (in RNA) Nucleoside components
  • 119. LE 5-27 5 end 3 end Columna vertebral De azucar-fosfato Par de bases (unidas Por enlaces de hidro- geno Old strands Nucleótidos A punto de Agregarse a La nueva cadena 5 end Nuevas cadenas 3 end 5 end 5 end 3 end
  • 120. CODONES Y ANTICODONES  Codones: Secuencia de tres nucléotidos de ADN o ARNm que específica un aminoácido particular o una señal de terminación; unidad básica del código genético.  Anticodones: triplete de bases especializado situado en el extremo de una molécula de ARNt que reconoce un codón complementario particular en una molécula de ARNm
  • 121. EJEMPLOS  Codones que se forman a partir del siguiente gen (ADN)  TAA GCT GGC ATT  ATT CGA CCG TAA RESPUESTA Se analizan los siguientes anticodones  UCG AUU GCA GGC  AGC TAA CGA CCG