informe fago lambda

1. IES SARDIÑEIRA
ENSAYOS BIOTECNOLÓGICOS
Noelia Deibe Pérez
Alba Gándara Crespo
Paula Pérez Morandeira
LACC2
M1
Curso 2013/2014

2. PV92
Imagen del gel:
Resultados observados para la secuencia ALU en nuestra mesa:
Noelia  Homocigoto (-/-)
Alba Gándara  No aparece resultado
Paula Pérez  Homocigoto (-/-)
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Frecuencias genotípicas para la clase:
Categoría
Número
Frecuencia
(Frecuencia del genotipo/Total)
Homocigoto (+/+)
1
0.1
Heterocigoto (+/-)
3
0.3
Homocigoto (-/-)
6
0.6
Total
10
1.0
Categoría
Número
Frecuencia
(Frecuencia de alelos (+ o -)/Total)
Alelos (+)
5
p=0.25
Alelos (-)
15
q=0.75
Total
20
1.00
Frecuencias alélicas para la clase:
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Conclusiones y observaciones:
Como se puede observar en la imagen del gel, ha habido un miembro de nuestra mesa para el que no aparece ningún resultado (no
aparece ninguna banda). Este hecho puede ser debido a varios factores que detallaremos a continuación:
-
-
-
-
La etapa de extracción de las células epiteliales bucales no se ha realizado adecuadamente: Hemos descartado esta
posibilidad ya que tras la centrifugación de la solución salina con la que se realiza el enjuague bucal aparece un sedimento
celular que se aprecia claramente.
El número de células extraídas es excesivo: Así como una cantidad de células insuficiente puede influir negativamente en el
resultado de esta práctica también lo puede hacer una cantidad excesiva de las mismas. Esto se debe a que las células,
cuando son demasiadas, pueden llegar a saturar la capacidad de la InstaGene, lo que provoca que la amplificación se
reduzca o incluso no tenga lugar debido a la degradación enzimática del ADN extraído.
La matriz InstaGene no se ha transferido correctamente: Es necesario agitar los tubos que contienen las alícuotas de la matriz
InstaGene antes de pipetear su contenido para lograr que las partículas microscópicas que la componen se mantengan en
suspensión puesto que, si estas partículas no se transfieren a los tubos que contendrán las alícuotas de la solución salina con el
ADN extraído, no podrán atrapar los cationes metálicos presentes en dicha solución de modo que los mismo podrán degradar a
su antojo el ADN extraído y se inhibirá por lo tanto la reacción de PCR. Esta posibilidad también ha sido descartada al
comprobar que para todos los demás miembros del grupo, los cuales han pipeteado la matriz InstaGene de la misma botella, se
han obtenido resultados claros.
Ha habido problemas en la etapa de la PCR: Aunque como ya se ha dicho en el apartado anterior es importante que las
partículas microscópicas que componen la matriz InstaGene se transfieran a los tubos que contendrán las alícuotas de la
solución salina con el ADN extraído, también lo es que dichas partículas no pasen a los tubos en los que tendrá lugar la reacción
de PCR ya que de lo contrario, los iones de magnesio que necesita la Taq ADN polimerasa serán eliminados y se inhibirá esa
reacción.
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Así, y tras analizar los factores que condicionan la aparición de resultados, parece que las causas más probables de que no se haya
obtenido ninguna banda para este miembro de la mesa son que la cantidad de células extraídas haya sido excesiva o bien que se
haya producido algún fallo en la etapa de transferencia de la muestra a los tubos de PCR, alicuotándose restos de la matriz InstaGene
en los mismos.
Añadiremos también que estos mismos factores son los que afectarían a todas aquellas muestras para las que no se han obtenido
resultados, sin poder precisar cuáles de ellos afectan a cada una de las muestras, por desconocimiento del proceso seguido por cada
individuo de la clase.
Por otro lado, es importante tener en cuenta que a la hora de determinar la frecuencia de los individuos heterocigotos (+/-) podemos
cometer errores al confundir las bandas que aparecen con las de un individuo homocigoto (-/-). Esto se debe a que la banda que
indica la presencia de la secuencia ALU (+) es menos intensa que la que indica la presencia de la secuencia ALU (-) ya que la primera
de ellas es más pesada que la segunda, de modo que se amplifica de forma menos eficiente que esta última. De esto modo, las
copias del fragmento más pequeño se pueden hacer a un ritmo más rápido que las del fragmento más grande por lo que se crean
más copias del primero de ellos por ciclo, lo que hace que las bandas a las que da lugar dicho fragmento sean más intensas. Para
evitar cometer estos errores hemos de examinar concienzudamente los resultados obtenidos en el gel.
Finalmente intentaremos comparar los resultados obtenidos para la clase, puesto que para hacerlo sólo con los de nuestra mesa los
datos se quedan muy escasos, con los resultados de diferentes estudios realizados para tamaños de población mayores. Así, y como
vemos en las tablas adjuntas, la frecuencia alélica para algunas poblaciones españolas (Tabla 1) y para poblaciones europeas (Tabla
2) se asemeja bastante a los datos obtenidos pues toma, en ambos casos, valores menores que 0,2; mientras que, para el resto de
poblaciones, las frecuencias alélicas toman valores más elevados de modo que se alejan de los resultados obtenidos. De este modo
podemos concluir que la mayoría de la población, tanto española como europea, no presenta la secuencia ALU en sus genes.
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Tabla 2
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Fuentes de información:
Manual: Chromosome 16: PV92 PCR Informatics Kit.
http://www.scielo.org.co/pdf/rcan/v48n1/v48n1a10.pdf
http://archivo.50megs.com/genetica1/table_1_alu_insertion_frequencie.htm
Documentos gráficos
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