El documento describe las herramientas geográficas desarrolladas en el proyecto EDIT. Se construyó una infraestructura centralizada de datos geográficos y se desarrollaron dos aplicaciones web: mapREST services, que permite visualizar información georreferenciada de diferentes fuentes, y EDIT mapViewer, una herramienta web para publicar mapas de fácil uso. Las herramientas cumplen estándares abiertos y permiten análisis espacial como el número de registros por unidad espacial.
1. Instituto Nacional de Biodiversidad (INBIO)
20 agosto 2009, Heredia
Desarrollo de herramientas geográficas
en el proyecto EDIT
Pere Roca Ristol
Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC), España
2. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
Areas de trabajo en WP 5:
-taxonomic editing
-publishing of edited data
-data storage and exchange
-collections & specimens
-descriptions;
-fieldwork
-literature
-geography
3. Se detectaron dos necesidades básicas:
-herramienta web de fácil uso para la publicación de mapas
EDIT mapViewer
-visualizar información georeferenciada proveniente de diferentes fuentes
mapREST services
Pasos:
1) Construcción de una infraestructura centralizada de datos geográficos
-edición capas GIS
-introducción en bases de datos (postGIS)
-instalación de programario servidor (GeoServer, ImageMagick, PHP…)
2)Desarrollo de las aplicaciones web (mapRest services y EDIT mapViewer)
Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
4. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
Elementos centrales para el desarrollo
Herramientas del servidor: generación y
manipulación de imágenes para
descarga, conexión base de datos…
Estándares para servicions
geoespaciales
EDIT mapViewer mapREST services
Servidores de mapas
Bases de datos geográfica
Todas las herramientas usadas y creadas son gratuitas y de código abierto
5. Base datos geográfica
en Madrid (CSIC)
Mi base de datos remota
El usuario construye las URLs con su
información y los parámetros de
simbolización deseados
ejemplo: especie 1 presente en áreas
con código 1, 2 y 3.
especie 2 en áreas 4 y 5.
Aplicar estilo “a” a especie 1, y estilo
“b” a especie 2
Usuario define el estilo “a” como..
color azul, borde negro, grosor 5…
Imagen (mapa)
Archivo de
simbolización
(usar en aplicación web local)
Especialmente útil en bases de datos distribuidas.
Nos da total independencia en la simbolización
Ejemplos en uso:
1) Distribuciones
EDIT PalmWeb portal
EDIT Diptera portal
EDIT Cichorieae portal
2) Registros
Mercantour/Alpi Marittime ATBI
Gemer ATBI
Uso para distribuciones (polígonos) y registros (puntos)
mapREST services
Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
6. archivo CSV
EDIT mapViewer http://edit.csic.es/geo/mapviewer/edit_cr.html
Datos georeferenciados en
latitud / longitud y datum
WGS84 y con notación
decimal
Operaciones básicas:
-Composición del mapa (añadir/quitar
capas) y navegación (zoom in/out, pan…)
-Simbolización datos propios
-Acceso información propia (query)
-Leyenda, escala
-Impresión en diferentes formatos y
resoluciones
-acceso información de GBIF
Operaciones más complejas:
-creación y simbolización de nuestros propios
polígonos
-Análisis geo-espacial:
1) Número de registros por unidad espacial
(polígono)
2) Número de géneros por unidad espacial
3) Relación número de géneros/núm. Registros
4) Análisis completitud del inventario
Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
8. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
Análisis de la fiabilidad de los inventarios (I): Número géneros / número de registros
Número de registros Número de géneros
Área muy muestrada, con
poca diversidad (géneros).
Las posibilidades de
encontrar nuevos géneros
es baja
Área muypoco muestrada,
con relativamante alta
diversidad.
Las posibilidades de
encontrar nuevos géneros
es baja
Número de géneros/Número de registros
9. Alta pendiente al final de la curva.
Si siguiéramos muestreando
encontraríamos nuevas especies.
Zona mal muestreada (inventario
incompleto)
Baja pendiente al final de la curva.
Aunque aumentemos las
observaciones no encontrariamos
nuevas especies
La unidad territorial está
biológicamente exhausta
Zona bien muestreada
Visualización en
forma de mapa
Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
Análisis de la fiabilidad de los inventarios (II): curvas de acumulación/colecta
10. Algunos videos… y alguna pregunta? gracias!
mapREST services: http://www.screencast.com/t/iFRTfDDB1
Análisis espacial: http://www.screencast.com/t/RUfWGvui
Simbolización datos puntuales: http://www.screencast.com/t/kb5YNSvZ
Uso herramienta GBIF: http://www.screencast.com/t/iXCFJ5GB
Interrogación datos: http://www.screencast.com/t/TLclIQRGQk8
Impresión mapas: http://www.screencast.com/t/eBSYhc5EHBi
Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT