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de
Datos
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BasesDE DATOS
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Bases
DE DATOS
Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html
Entidadadministradora:BasedeDatosInternacionaldeSecuenciasdeNucleótidos.
Descripción: Base de datos de secuencias genéticas. Proporciona reciente y detallada informa-
ción sobre secuencias de ADN. Incluye una descripción concisa de la secuencia, el nombre
científico y taxonomía del organismo, fuente, y una tabla de características que identifican las re-
giones de codificación y otros sitios de significancia biológica, tales como unidades de trans-
cripción,sitiosdemutaciones,yrepeticiones.
Link:http://www.medbioworld.com/
Entidadadministradora:Healthnostics,Inc.
Descripción: Directorio médico y de biociencias más grande en Internet. Posee actualmente 8200
revistas dentro de 80 especialidades médicas y 101 campos de biociencias, 7000 asociaciones
médicas y de biociencias, 30000 nuevos artículos de Salud e Industria Reuters, 3100 bases de
datosmédicasydebiocienciasymásde2000empresasdebiocienciasasociadas.
GenBank
MedBioWorld
Biological & Environmental Research Abstracts Database
Link:http://www.osti.gov/oberabstracts/
2
BasesDE DATOS
Bases
de
Datos
Entidad administradora: Oficina de Investigaciones Biológicas y Ambientales. Departamento de
EnergíadelosEstadosUnidos.
Descripción: Esta base de datos contiene resúmenes de proyectos de investigación en cuatro
áreas específicas: ciencias biológicas, investigación de cambios climáticos, remediación am-
biental y ciencias médicas. Los proyectos son apoyados por el programa de Investigaciones Bioló-
gicasyAmbientales.
Link:http://www.biosupplynet.com/biotoolkit/
Entidadadministradora:BioSupplyNet.
Descripción: Base de datos con más de 900 recursos en línea de interés para biólogos y neuro-
biólogos moleculares. Está dividida en cinco secciones: Análisis del ácido nucleico, Recursos so-
bregenómica,ProyeccióndeimagenyAnálisisestructuraldelaproteína,yNeuroinformática.
The BIOTOOLKIT
Link:http://metallo.scripps.edu/
Entidadadministradora:InstitutodeInvestigaciónScripps.
Descripción: Base de datos y Navegador (MDB) de Metaloproteínas del Instituto de Investigación
Scripps. Contiene información geométrica y molecular que permite la clasificación y búsqueda de
combinaciones particulares de las características del sitio, su visualización y manipulación. Hace
parte de un proyecto para el diseño de metaloproteínas, permitiendo la visualización interactiva de
suinformacióngeométricayfuncional.
Metalloprotein Database and Browser (MDB)
3
Link:www.rcsb.org/pdb/
Entidades administradoras: Fundación Nacional de Ciencias, Instituto Nacional de Ciencias
Médicas Generales, Departamento de Ciencia, Departamento de Energía, Biblioteca Nacional de
Medicina, Instituto Nacional de Cáncer, Centro Nacional para Recursos de Investigación, Instituto
Nacional de Desórdenes y Enfermedades Neurológicas y el Instituto Nacional de Visualización y
BioingenieríaBiomédica.
Descripción: Base de datos en 3-D sobre estructuras de proteínas y ácidos nucleicos. Cada
descripción experimental de la estructura es un archivo de texto con las coordenadas atómicas de
la molécula en formato PDB. Los datos encontrados en PDB generalmente obtenidos por
Cristalografía de rayos X o Resonancia Magnética Nuclear, son enviados por biólogos y
bioquímicosdetodoelmundo.
Link:http://chemfinder.cambridgesoft.com/
Entidadadministradora:CorporaciónCambridgeSoft.
Descripción: Esta base de datos incluye información sobre componentes químicos, estructuras
químicas (estructuras 2D y modelos 3D) y propiedades físicas (MP, BP, CAS RN). De igual forma,
permite realizar búsquedas referenciadas por nombre químico, fórmula, peso molecular y número
de registro CAS. La visualización de estructuras químicas es posible a través de los programas
ChemDrawoChem3D.
ChemFinder
Protein Data Bank
4
BasesDE DATOS
Link:http://www.orgsyn.org/
Entidades administradoras: Rick Danheiser, Dennis Curran, Scott Denmark, Jonathan Ellman,
Alois Fürstner, Mark Lautens, David Mathre, Marvin Millar, John Ragan, Masakatsu Shibasaki,
PeterWipfyCharlesZercher.
Descripción: Base de datos de libre acceso sobre procedimientos detallados para la síntesis de
compuestos orgánicos. Algunos describen métodos prácticos para la preparación de compuestos
químicos de interés, mientras que otros ilustran métodos sintéticos importantes de utilidad
general.
Organic Syntheses
Link:http://www.atsdr.cdc.gov/search.html
Entidadadministradora:AgenciaparaSustanciasTóxicasyRegistrodeEnfermedades(ATSDR).
Descripción: Base de datos sobre contaminación con sustancias peligrosas en el medio y sus
efectos en la salud de poblaciones humanas. Facilita información sobre las características del
lugar afectado, contaminantes encontrados, niveles de concentración del contaminante, impacto
en la población, recomendaciones de la ATSDR, consecuencias en el ambiente y formas de
exposición,entreotras.
Agency for Toxic Substances & Disease Registry
ChemBank
Bases
de
Datos
5
Link:http://chembank.broad.harvard.edu/compounds/?realm=bioactives
Entidades administradoras: Jeremy Muhlich, Jason McIntosh, Erik Brauner, Jim Conley y
CarolineShamu.
Descripción: Colección de datos de libre acceso sobre moléculas pequeñas y recursos para el
estudio de sus propiedades. Además, proporciona datos sobre químicos potencialmente peli-
grosos: registro de efectos tóxicos, aceites y materiales peligrosos, sistemas de información y
respuesta, control de sustancias tóxicas, sistemas integrados de información sobre riesgos, guías
derespuestadeemergenciayparacomponentesquímicospeligrosos.
Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/iproclass.shtml
Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico
UniversitariodeGeorgetown(GUMC).
Descripción: Proporciona enlaces a más de 90 bases de datos biológicas, incluyendo bases de
datos para familias de proteínas, funciones, interacciones, estructuras y clasificaciones estruc-
turales, genes y genomas, literatura y taxonomía. iProClass puede ser utilizado para soportar
anotaciones de secuencias de proteínas, investigaciones sobre genómica o proteómica y
adicionalmente,identificacióndeproteínas.
iPROCLASS
Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pirsf.shtml
PIRSF
6
BasesDE DATOS
Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico
UniversitariodeGeorgetown(GUMC)
.
Descripción: El sistema de clasificación PIRSF está basado en proteínas completas, por lo tanto,
permite la anotación de bioquímicos genéricos y funciones biológicas específicas, así como la cla-
sificación de proteínas sin dominios bien definidos. La estructura de PIRSF es formalmente una
red.
Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pir_psd.shtml
Entidades administradoras: Recursos de Información de Proteínas, Centro de Información de
MunichparaSecuenciasdeProteínasyBasedeDatosInternacionaldeProteínasdeJapón.
Descripción: Primera base de datos de secuencias de proteínas clasificadas. Las secuencias y
anotaciones de PIR-PSD han sido integradas a la base de conocimiento UniProt, con referencias
bidireccionales entre ellas para permitir el rastreo sencillo de las entradas formadas en PIR-PSD.
Las secuencias únicas de PIR-PSD, citaciones de referencia, y datos verificados experimental-
mentepuedenserencontradosenlosregistrosdeUniProt.
PIR-PSD
Swiss-Prot
Link: http://www.expasy.ch/sprot/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss (SIB) y el Instituto de Bioinfor-
máticaEuropeo(EBI).
Bases
de
Datos
7
Descripción: Base de datos de secuencias de proteínas. Genera información detallada acerca de
la secuencia, mutaciones, número de clasificación de enzima (E.C.) requerimiento de cofactores,
modificaciones postraduccionales y bibliografía, entre otros. Proporciona enlaces directos con
múltiples herramientas utilizadas para estimar la masa molecular y el punto isoeléctrico, o para
realizarprediccionesestructurales.
Link:http://www.expasy.org/prosite/
Entidadadministradora:InstitutodeBioinformáticaSwissenGenevayLausanne.
Descripción: Colección de descriptores de motivos dedicada a la identificación de familias de
proteínas y dominios. Con herramientas computacionales apropiadas, resulta rápida y factible la
identificacióndelafamiliaconocidadeproteínasalacualperteneceunanuevasecuencia.
Link:http://www.expasy.ch/ch2d/
Entidades administradoras: Grupo de Investigación en Proteómica Biomédica (BPRG) del
HospitalUniversitariodeGenevayelInstitutodeBioinformáticaSwiss(SIB).
Descripción: Contiene datos sobre identificación de proteínas en varios mapas de referencia.
Puede localizar proteínas en mapas 2-D PAGE o mostrar la región de un mapa 2-D PAGE donde
espera encontrar una proteína de Swiss-Prot. Incluye datos textuales sobre la proteína, tales como
procedimientos de mapeo, información fisiológica y patológica, datos experimentales (punto
isoeléctrico,pesomolecular)yreferenciasbibliográficas.
Prosite
Swiss-2Dpage
8
BasesDE DATOS
Link:http://www.expasy.ch/enzyme/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss y Recursos de Bioinformática
Canadiense.
Descripción: Basededatosconinformaciónsobrenomenclaturadeenzimas,basadaenelComité
de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB). Incluye
sobre cada enzima catalogada el número EC, nombre recomendado, nombres alternativos (si
existen), actividad catalítica, cofactores, enlace a la secuencia de proteína obtenido en Swiss-Prot
correspondiente a la enzima y enlace a las enfermedades humanas asociadas con una deficiencia
delaenzima.
LLink:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?HSDB
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina(NLM).
Descripción: Archivo de datos centrado en la toxicología de químicos potencialmente peligrosos.
Posee información sobre exposición humana, higiene industrial, procedimientos de manejo de
emergencias, consecuencias ambientales, requerimientos regulatorios, y áreas relacionadas.
Todos los datos son referenciados y derivados de una serie de libros, documentos guberna-
mentales,reportestécnicosyliteraturaseleccionada.
Enzyme
Hazardous Substances Data Bank (HSDB®)
ChemIDplus
Bases
de
Datos
9
Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CHEM
Entidadadministradora:BibliotecaNacionaldeMedicina(NLM).
Descripción: Base de datos de libre acceso sobre archivos de estructura y nomenclatura para la
identificación de sustancias químicas citadas en las bases de datos de la Biblioteca Nacional de
Medicina (NLM), incluyendo el sistema TOXNET. También proporciona búsquedas de estructuras y
enlacesdirectosamuchosrecursosbiomédicosenlaNLMyenInternet.
Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?TOXLINE
Entidades administradoras: Biblioteca Nacional de Medicina y el Instituto Nacional de Salud.
Descripción: Proporciona información derivada de 16 fuentes secundarias sobre toxicología,
farmacología, y efectos bioquímicos y fisiológicos de drogas y otros químicos. Toxline Core,
comprende la mayoría de la literatura estándar en toxicología y Toxline Special, complementa a
ToxlineCoreconreferenciasdeunavariedadderevistasespecializadasyotrasfuentes.
Toxline®
Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CCRIS
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina.
Descripción: Banco de datos científicamente evaluado y referenciado. Contiene más de 8000
registros químicos sobre carcinogenicidad, mutagenicidad y resultados de pruebas de inhibición
de tumores. Los datos son derivados de estudios citados en revistas, herramientas de conoci-
miento actuales, informes del NCI y otras fuentes monitoreadas por expertos en carcinogénesis y
mutagénesis.
Chemical Carcinogenesis Research Information System (CCRIS®)
10
BasesDE DATOS
Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?DARTETIC
Entidades administradoras: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®), Agencia de Protección
Ambiental de los Estados Unidos, el Instituto Nacional de Ciencias Ambientales de la Salud y el
CentroNacionalparalaInvestigaciónToxicológicadelaAdministracióndeAlimentosyDrogas.
Descripción: Base de datos sobre información en el área de teratología y otros aspectos de la
toxicología de desarrollo y reproductiva. Posee más de 100.000 referencias de literatura publicada
desde1965.
Developmental and Reproductive Toxicology/Environmental
Teratology Information Center (DART®/ETIC) Database
Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?GENETOX
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina.
Descripción:Contienedatosdepruebasgenéticasdetoxicología(mutagenicidad)obtenidosdela
revisión experta de literatura científica abierta en más de 3.000 químicos. Gene-Tox fue estable-
cido para seleccionar sistemas de ensayo para evaluación, revisión de datos en literatura cien-
tífica, recomendación de protocolos de prueba apropiados y evaluación de procedimientos
adecuadosparaestossistemas.
Gene-Tox
EMBL-Nucleotide Sequence Database
Link:http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-page+query+-libList+EMBL
Bases
de
Datos
11
Entidades administradoras: GenBank, Base de Datos de ADN de Japón (DDBJ) y el Instituto de
BioinformáticaEuropeo.
Descripción: Base de datos constituida por secuencias de nucleótidos. Las principales fuentes de
secuencias de DNA y RNA son obtenidas de investigadores, proyectos de secuenciación genómi-
cayaplicacióndepatentes.EsunadelasbasesdedatosmásimportantesenEuropa.
Link:http://physics.nist.gov/PhysRefData/ASD/index.html
Entidades administradoras: Administración Nacional Aeronáutica y Espacial, Oficina de Ciencias
de Fusión de Energía de Estados Unidos, Departamento de Energía, Programa de Referencia de
Datos Estándar y el Programa de Integración de Sistemas para Manufacturación de Aplicaciones
deNIST.
Descripción: Base de datos con información sobre transiciones radiactivas y niveles de energía
en átomos e iones atómicos. Los datos son incluidos para las transiciones observadas en 99
elementosynivelesdeenergíade56elementos.ASDcontienedatosdecercade950espectrosde
aproximadamente 1 Å (Ångströms) a 200 µm (micrometros), con cerca de 72000 niveles de
energíay102000líneas,40000delascualestienenprobabilidadesdetransiciónlistada.
NIST Atomic Spectra Database
Link:http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/enzymes/
Entidades administradoras: Roman Laskowski, Gail Hutchinson, Alex Michie, Andrew
Wallace, Martin Jones, Andrew Martin, Nick Luscombe, Duncan Milburn, Atsushi Kasuya y
Janet Thornton. Colegio Universitario London.
Enzyme Structures Database
12
BasesDE DATOS
Descripción: Base de datos sobre estructuras de enzimas conocidas depositadas en el Protein
Data Bank (PDB). Ofrece una imagen de cada estructura macromolecular depositada en el PDB y
proporciona diagramas esquemáticos de las moléculas en cada estructura y de las interacciones
entreellas.LasestructurasdelasenzimassonclasificadasporsunúmeroE.C.
Link:http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html
Entidadesadministradoras:RichardRobertsyDanaMacelis.
Descripción:Coleccióndeinformaciónsobreenzimasderestricción,metilasas,microorganismos
de los cuales han sido aisladas, secuencias de reconocimiento, sitios de reconocimiento, especi-
ficidad de metilación, disponibilidad comercial de las enzimas y proteínas relacionadas. Incluye
referenciaspublicadasynopublicadas,datosdesecuencias,entreotros.
REBASE The Restriction Enzyme Database
Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed
Entidadadministradora:BibliotecaNacionaldeMedicinadelosEstadosUnidos.
Descripción: Base de datos bibliográfica más importante de la NLM en las áreas de medicina,
enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. Representa la versión
automatizada de tres índices impresos: Index Medicus, Index to Dental Literature e International
Nursing Index, y reúne referencias bibliográficas de artículos publicados en más de 4.500 revistas
médicas.
Medline
Bases
de
Datos
13
Link:http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/
Entidadesadministradoras:T.Yamada,H.Nikaidou,J.Sese,A.NakayayS.Morishita.
Descripción: Banco de datos sobre información de expresión genética humana y en ratones,
reciente o conocida, en varios tipos de tejidos o de células. La primera generación del mapa fue
creadaporunasecuenciaaleatoriadeclonesen3bibliotecasdirigidasdecDNA.
BodyMap
Link:http://crisp.cit.nih.gov/
Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeSalud.
Descripción: Base de datos cuya interfaz de usuario permite el acceso a resúmenes de conceptos
científicos,tendenciasytécnicasemergentes,proyectosy/oinvestigadoresespecíficos.
Computer Retrieval of Information on Scientific Projects
Link:http://www.affymetrix.com/community/publications/index.affx
Entidadadministradora:Affymetrix.
Scientific Publications
14
BasesDE DATOS
Bases
de
Datos
Descripción: Base de datos con acceso a 4207 resúmenes de publicaciones científicas que
utilizan la tecnología GeneChip® (microarreglos y herramientas de alta densidad para ayudar a
procesaryanalizarpequeñosfragmentosdeADN)ypublicacionesrelevantesdeacuerdoalinterés
investigativo.
15
Qu micaí
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Periodic Table of the Elements
Link:http://periodic.lanl.gov/
Entidadadministradora:DivisióndeQuímica.LaboratorioNacionaldeLosAlamos.
Link:http://www.chemicalelements.com/
Entidadadministradora:YinonBentor.
An Online, Interactive Periodic Table of the Elements
Link:http://www.lenntech.com/espanol/tabla-periodica.htm
Entidadadministradora:Lenntech.
Tabla Periódica Lenntech
Link:http://www.prodigyweb.net.mx/degcorp/Quimica/Tabla_Periodica.htm
Entidadesadministradoras:HumbertoBrambila,BernardoMayayDerekEstrada.
Tabla Periódica De Los Elementos (Behude)
17
A Visual Interpretation of the Table of Elements
Link:http://www.Chemsoc.Org/Viselements/
Entidadadministradora:DavidWatson.UniversidaddeStrathclyde.
Link:http://www.webelements.com/
Entidadadministradora:MarkWinter.UniversidaddeSheffield.
Webelements™ Periodic Table
Link:http://chemlab.pc.maricopa.edu/periodic/periodic.html
Entidadadministradora:ChrisHeilman.
The Pictorial Periodic Table
Link:http://www.chemicool.com/
Entidadadministradora:DavidHsu.InstitutodeTecnologíadeMassachusetts.
Periodic Table
Qu micaí
18
The Wooden Periodic Table
Link:http://www.theodoregray.com/PeriodicTable/
Entidadadministradora:TheodoreGray.
Link:http://www.genesismission.org/educate/scimodule/cosmic/ptable.html
Entidadadministradora:InstitutodeTecnologíadeCalifornia.
Genesis education: modeling the periodic table interactive simulation
Link:http://www.orbit.org/perlib/
Entidadadministradora:BoleanDreamInc.
Periodic Library
Link:http://pubs.acs.org/journals/jacsat/index.html
Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica.
Journal of the American Chemical Society
19
Descripción: Esta revista realiza publicaciones de artículos, comunicaciones al editor, revisiones
de libros, y revisiones de software en todos los campos de la química. Facilita acceso a resúme-
nesytextoscompletosdeartículosypublicaciones.
Link:http://pubs.acs.org/journals/joceah/
Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica.
Descripción: Posee contribuciones originales de investigación fundamental en todas las áreas de
la teoría y práctica de la química orgánica y bio-orgánica. JOC ofrece artículos completos y notas,
asícomomini-revisionesycontribuciones.
The Journal of Organic Chemistry
Link:http://www.chemistry.org/portal/a/c/s/1/acsdisplay.html?DOC=Chemistry%5cindex.html
Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica.
Descripción: Chemistry es un diario en línea creado para todo público interesado en las ciencias
químicas y la Sociedad Americana de Química. Proporciona acceso a los artículos publicados en
unarchivoPDF.
Chemistry Magazine
Link:http://kinetics.nist.gov/
Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeEstándaresyTecnología.
Kinetics Database
Qu micaí
20
Descripción: Incluye esencialmente todos los resultados sobre cinética reportados para las
reacciones químicas. Está diseñada para realizar búsquedas sobre datos de cinética basada en los
reactivos específicos involucrados, datos de reacciones resultantes de productos especificados,
informacióndetodaslasreaccionesdeunaespecieparticular,ounacombinacióndeéstas.
Link:http://www.hclrss.demon.co.uk/
Entidadadministradora:AlanWord.
Descripción: Este compendio contiene todos los nombres estándar aprobados por la ISO para los
pesticidas químicos, así como aquellos nombres aprobados por entidades nacionales e interna-
cionales para pesticidas sin nombres estándar. Más de 1000 de estos nombres oficiales de
pesticidas han sido asignados por la Organización Internacional de Estandarización (ISO), en
acuerdoconunsistemaestablecidodenomenclatura.
Compendium of Pesticide Common Names
Link:http://molo.concord.org/database/
Entidadadministradora:FundaciónNacionaldeCiencia(NSF).
Descripción: Facilita acceso a las actividades basadas en sus modelos computacionales ató-
micos y moleculares. Estas actividades son parcialmente derivadas de proyectos del Concord
Consortium patrocinados por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF). Los modelos son principal-
mentedeinteraccionesdeátomosymoléculas,obasadosenreglasgenéticas.
Molecular Logic
21
Link:http://www.chemtopics.com/hlarchiv.htm
Entidadadministradora:SteveMarsden.
Descripción: Contiene información sobre distintos experimentos en el área de química, incluyen-
doprocedimientosyexplicacióndetalladadecadaactividad.
Honors Chemistry Experiments
Link:http://neon.chem.ox.ac.uk/vrchemistry/
Entidadadministradora:DepartamentodeQuímica.UniversidaddeOxford.
Descripción: Laboratorio de simulación tridimensional para la enseñanza de química. Este
laboratorio es modelado utilizando técnicas de realidad virtual para la enseñanza de la química y
contieneexperimentosinteractivosenmultimedia.
Virtual Experiments
Link:http://www.chemcollective.org/applets/vlab.php
Entidadadministradora:DavidYaron.DepartamentodeQuímica.UniversidadCarnegieMellon.
Descripción: Chemistry Collective inicia con el proyecto de Laboratorio Virtual IrYdium cuyo
objetivo principal es la simulación flexible con fines educativos. El proyecto evoluciona para crear
un escenario de enseñanza de actividades para proveer interactividad, incluyendo materiales con
enlacesaconceptosquímicos.
The Chemistry Collective
Qu micaí
22
Link:http://reactorlab.net/
Entidadadministradora:RichardHerz.UniversidaddeCalifornia.
Descripción: Este software proporciona simulaciones de una gran variedad de reactivos quími-
cos. Permite aprender activamente acerca de los reactivos y reacciones químicas a través del
desarrollodeexperimentosyanálisisdedatos.
The Reactor Lab
Link:http://www.acdlabs.com/products/chem_dsn_lab/chemsketch/
Entidadadministradora:AdvancedChemistryDevelopment,Inc.(ACD/Labs).
Descripción: Permite dibujar moléculas en dos dimensiones y transformarlas en 3D, construir
ecuaciones químicas, estructuras moleculares y diagramas de laboratorio. Adecuado para poder
crearmoléculasdecompuestosorgánicos,experimentarconalgunosinstrumentosdelaboratorio,
resolver ejercicios, visualizar u ocultar enlaces y manipular estructuras de Newman escalonadas
yeclipsadas.
Chemsketch
Link:http://openrasmol.org/
RasMol
23
Entidadadministradora:RogerSayle.
Descripción: Permite visualizar imágenes difíciles de dibujar por ser muy complejas, tales como
estructuras de ADN y de proteínas. Proporciona diversos diseños de presentación de moléculas
(barras de enlace, barras y esferas, modelo compacto) y permite ver, rotar y animar moléculas y
cristales. Admite los formatos moleculares más extendidos: pdb, mol, mdl y xyz, con objeto de
ampliarlasposibilidadesdeobtenermoléculaslistasparavisualizardisponiblesenInternet.
Link:http://www.mdlchime.com/downloads/downloadable/index.jsp
Entidadadministradora:MDLISIS(SistemadeInformaciónCientíficoIntegrado).
Descripción: Este módulo de programa (plug-in) ofrece la posibilidad de manipular represen-
taciones tridimensionales en los navegadores Internet Explorer y Netscape. Su instalación habilita
el navegador para trabajar con archivos de moléculas en formato PDB y permite realizar cambios
en la forma de visualización de la molécula, color, activar o desactivar la rotación y rotular los
átomos.
Chime
Link:http://proteinexplorer.org/
Entidadesadministradoras:FundaciónNacionaldeCienciaylaUniversidaddeMassachusetts.
Protein Explorer
Qu micaí
24
Descripción: Programa derivado de RasMol y basado en el plug-in Chime para Netscape. Permite
investigar la estructura de macromoléculas y su relación con la función que cumplen, visualizar en
tres dimensiones estructuras de proteínas, ADN y macromoléculas, y visualizar interacciones y
enlaces.
Links:http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html
Entidadadministradora:StephenSchimpf.
Descripción: Visualizador de estructuras tridimensionales muy fácil de utilizar; ideal para exponer
temas como la hibridación debido a la fácil representación de moléculas tridimensionales de
compuestosorgánicos.
3-D Angles
Link:http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html
Entidadadministradora:StephenSchimpf.
Descripción: Proporciona modelos tridimensionales de estructuras cristalinas fundamentales
fácilmente manejables. Es posible dar vuelta o rotar las células de la unidad de cualquiera de las
catorceestructurasdelasredesdeBravis.
Crystalline Solids
25
Link:http://www.chm.bris.ac.uk/motm/motm.htm
Entidadadministradora:PaulMay.UniversidaddeBristol.
Descripción: Cada mes una nueva molécula es agregada a la página, en la cual son encontrados
varios enlaces que conducen al sitio Web del Departamento de Química de la Universidad o a sitios
comerciales en cualquier lugar del mundo, donde pueda ser hallada información sobre la molécula
agregada.
The Molecule of the Month
Link:http://www.planaria-software.com/
Entidadadministradora:MarkThompson.PlanariaSoftwareLLC.
Descripción: ArgusLab es un programa de modelación molecular. Consiste en una interfaz de
usuario con soporte para visualización de gráficas OpenGL de estructuras de moléculas y realiza-
cióndecálculosdemecánicacuánticautilizandoelservidorArgus.
ArgusLab
Yasara (Yet Another Scientific Artificial Reality Application)
Link:http://www.yasara.org/
Entidades administradoras: Gregor Högenauer, Günther Koraimann, Andreas Kungl y Gert Vriend.
UniversidaddeGraz,UniversidaddeNijmegen.
Qu micaí
26
Descripción: Programa de modelación y simulación interactiva en tiempo real con campos de
fuerza sumamente exactos de gráficas moleculares, interfaz de usuario intuitiva, gráficas fotorea-
lísticas, visualizaciones y dispositivos de entrada con nuevos niveles de interacción de “realidad
artificial”. Puede interactuar con las moléculas y trabajar con modelos dinámicos en vez de imá-
genesestáticas.Requierelicenciaparagarantizarnuevosdesarrollos,actualizacionesysoporte.
Link:http://dasher.wustl.edu/tinker/
Entidadesadministradoras:FundaciónNacionaldeCienciayelInstitutoNacionaldeSalud.
Descripción: Software de modelación molecular para mecánicas y dinámicas moleculares, con
algunas características especiales para biopolímeros. Posee la habilidad de utilizar cualquiera de
varios grupos de parámetros comunes, como Amber (ff94, ff96, ff98 y ff99), CHARMM (19 y 27),
Allinger MM (MM2-1991 y MM3-2000), OPLS (OPLS-UA, OPLS-AA y OPLS-AA/L), potenciales
polarizablesdeLiamDangysupropiocampodefuerzaatómicopolarizablemultipoloAMOEBA.
Tinker (Software Tools for Molecular Design)
Link:http://www.nuigalway.ie/cryst/software.htm
Entidadadministradora:UniversidadNacionaldeIreland.
Descripción: Este software proporciona un sistema integrado de alta calidad para la construcción
y modelación de moléculas, maneja PC GAMESS y Tinker, y puede resolver, refinar y examinar
pequeñas estructuras de moléculas de cristal. Las películas son efectivas y fáciles de hacer
utilizando RASMOV. El software para la simulación de la pauta de Powder y la detección y
visualizacióndevacíostambiénestádisponible.
Oscail X - Software for Crystallography and Molecular Modelling
27
Link:http://jmol.sourceforge.net/
Entidadadministradora:WarrenDeLano.
Descripción: Proporciona un conjunto de aplicaciones y visores moleculares. Jmol es un visor de
moléculas multiplataforma. JmolApplet es una miniaplicación para el navegador que puede inte-
grarse en páginas Web. La aplicación Jmol es un programa autónomo en Java que funciona local-
mente en el ordenador, fuera del navegador. JmolViewer es un conjunto de herramientas de desa-
rrolloquesepuedeintegrarenotrosprogramasJava.
JMOL
Link:http://www.3dchem.com/index.asp#
Entidadadministradora:KarlHarrison.UniversidaddeOxford.
Descripción: Base de datos de estructuras 3D de más de 400 moléculas activas. Permite
visualizar las estructuras de pequeñas moléculas, medicamentos, enzimas biológicas, proteínas,
ADN, virus en ilustraciones 3D interactivas. Utiliza la tecnología Java de JMOL para mostrar los
modelos.
Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com
JME Molecular Editor
Link:http://www.molinspiration.com/jme/index.html
Qu micaí
28
Entidadadministradora:PeterErtl.
Descripción: JME Molecular Editor proporciona herramientas para dibujar o editar moléculas y
reacciones y para representar moléculas directamente dentro de una página HTML. El applet
puedeserobtenidolibrementedirectamentedesuautoratravésdelcorreoelectrónico.
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/mage.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Programa de vectores 3D para visualización de gráficas tipo "kinemage" utilizado en
diversasaplicacionescomoevaluacionesdecalidaddemodeloscristalográficosderayosX.Mage
visualiza de forma 3D las relaciones entre los datos en un ambiente interactivo permitiendo la
exploraciónabiertaypresentaciónestructurada.
3D Analysis :: Mage Display Software
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/javamage.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Herramienta en Java disponible para visualizar gráficas de tipo “kinemage” a través
deInternet.
JavaMage
29
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/king.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: King es un sistema interactivo para gráficas de vector tridimensionales. Soporta un
grupo primitivo para muchos tipos de gráficos, diagramas, y otras ilustraciones; además su primer
usoeramostrarestructurasmacromolecularesparainvestigaciónbiofísica.
King
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/prekin.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Prekin prepara kinemages moleculares (archivos de entrada para Mage y King) de
archivos en formato PDB coordinados, utilizando opciones de scripts de construcción o
especificacionesflexiblesdelusuario.
Prekin
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/reduce.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Reduce
Qu micaí
30
Descripción: Reduce es un programa para agregar hidrógenos a un archivo de estructura de pro-
teína del Protein DataBank (PDB). Tanto proteínas como ácidos nucleicos pueden ser procesados,
aligualquelosgruposHETmientraslaconectividaddelátomoseaproporcionada.
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Permite la evaluación de paquetes atómicos, dentro o entre las moléculas. Genera
“puntos de contacto” donde los átomos están en contacto cercano. Probe lee las coordenadas
atómicas de los archivos del Protein Databank (PDB) y escribe una lista de puntos para inclusión en
un archivo de tipo kinemage. Alternativamente, la información almacenada puede ser cuantificada
y visualizada en una tabla para interacciones de van der Waals, H-bonds y superposiciones
atómicas("choques").
Probe
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/kincon.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Kin2Dcont y Kin3Dcont lee listas de valores o coordenadas para producir planos
acotados en formato kinemage. Tanto los datos dispersos como los datos uniformes pueden ser
acotados.Kin2DcontpuedeinclusoserusadoparaproduciracotacionesenformatoPostScript.
Contouring Programs
31
Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/dang.php
Entidadadministradora:RichardsonLab.
Descripción: Dang lee coordenadas de archivos de estructuras moleculares del Protein DataBank
(PDB) y genera una tabla de varias medidas geométricas útiles para cada residuo o base. En su
formabásica,generaángulosdiedrales(phi,psi,chi)deahísunombre.
Dang
Link:http://www.expasy.ch/spdbv/mainpage.html
Entidadesadministradoras:GlaxoSmithKlineR&DyelInstitutodeBioinformáticaSwiss.
Descripción: Esta aplicación permite analizar varias proteínas al mismo tiempo. Estas pueden ser
superpuestas con el objeto de deducir alineamientos estructurales y comparar sus sitios activos y
otras partes relevantes. Mutaciones de aminoácidos, enlaces H, ángulos y distancias entre los
átomossonfácilesdeobtenergraciasalainterfazdemenúygráficasintuitiva.
Swiss-PdbViewer
Cells Alive!
Link:http://www.cellsalive.com/
Entidadadministradora:JamesSullivan.QuillGraphics.
Qu micaí
32
Link:http://www.rsc.org/Publishing/CurrentAwareness/AA/index.asp
Entidadadministradora:SociedadRealdeQuímica.
Descripción: Cerca de 1.400 resúmenes son incluidos mensualmente. Incluye las áreas de
cromatografía, electroforesis, espectrometría y métodos radioquímicos; análisis inorgánico, orgá-
nico y organometálico; análisis clínico y bioquímico, incluyendo genómica y proteómica; análisis
farmacéutico, incluyendo medicamentos y fluidos biológicos; y análisis ambiental, agrícola y de
alimentos.
Analytical Abstracts
Link:http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/cgi-bin/direct_frame_top.cgi?lang=eng
Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeCienciayTecnologíaIndustrialAvanzadadeJapón.
Descripción: Compendio de datos de caracterización comunes para más de 10000 compuestos.
La estructura del compuesto, el espectro 1H NMR (resonancia magnética nuclear), 13C NMR y el
espectro de masas pueden ser visualizados al especificar el nombre del compuesto, fórmula
molecularonúmeroderegistroCAS.
Spectral Database for Organic Compounds SDBS
Link:http://www.lib.utexas.edu/thermodex/
ThermoDex
33
Entidadadministradora:UniversidaddeTexas.
Descripción: Registro de datos termoquímicos y termofísicos para compuestos químicos y otras
sustancias. ThermoDex proporciona una lista de manuales con información sobre los compuestos
ypropiedadesseleccionadasenlapáginaprincipal.
Link:http://ois.nist.gov/pah/
Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeEstándaryTecnología.
Descripción: Herramienta de ayuda en la identificación de las estructuras químicas y nomen-
clatura de 660 hidrocarburos aromáticos policíclicos comunes (PAH). La búsqueda puede realizar-
se por nombre y/o peso molecular del compuesto. Las estructuras pueden ser descargadas en
formatosmetafileomolfile.
Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Structure Index
Link:http://www.abinit.org/
Entidadadministradora:GrupoABINIT.
Descripción: Permite encontrar la energía total, densidad de carga y estructura electrónica de
sistemas compuestos de electrones dentro de la Teoría Funcional de Densidad (DFT). Permite
optimizar la geometría de acuerdo con las fuerzas DFT, desarrollar simulaciones moleculares
dinámicas utilizando estas fuerzas, o generar matrices dinámicas, cargas efectivas de Born y
tensoresdieléctricos,entreotroscálculos.
Abinit
Qu micaí
34
Link:http://www.cafun.de/
Entidadadministradora:AndréHomeyer.
Descripción: Cafun permite crear simulaciones de sistemas complejos de una forma sencilla.
Cafun es utilizado por estudiantes e investigadores en procesos de prueba de teorías o visualiza-
cióndesistemascomplejosparaunamejorcomprensión.
Cafun
Link:http://www.chemcraftprog.com/
Entidadesadministradoras:GrigoriyZhurkoyDenisZhurko.
Descripción: ChemCraft es un software gráfico para desarrollos computacionales en química
cuántica y una interfaz gráfica de usuario para los paquetes de software Gamess y Gaussian,
permitiendo importar/exportar coordenadas de los átomos en formato texto. Software comercial
conlimitacionesenversiónlibre.
ChemCraft
Link:http://www.biokin.com/dynafit/
Entidadadministradora:BioKinLtd.
Descripción: El propósito principal del programa DynaFit es desarrollar regresiones no lineales de
cinética química,cinética enzimáticaydatosdeenlaceligandoreceptor.Losdatosexperimentales
puedenservelocidadesinicialesdereacciónocurvasdeprogresodereacciones.
Program DynaFit
35
Qu micaí
Link:http://salilab.org/modeller/modeller.html
Entidadadministradora:BenWebb.UniversidaddeCalifornia.
Descripción: Modeller es usado para homología o modelación comparativa de estructuras tridi-
mensionales de proteínas. El usuario proporciona un alineamiento de una secuencia para ser
modelado con las estructuras relacionadas conocidas y Modeller calcula automáticamente un
modeloquecontengatodoslosátomosnohidrogenados.
Modeller
Link:http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/
Entidadadministradora:TonSpek.
Descripción: Platon es una herramienta cristalográfica versátil que implementa una gran variedad
de cálculos geométricos estándar, pruebas, utilidades, gráficas y varios filtros, y la opción
SQUEEZEparamanejodesolventes.
PLATON
Link:http://pymol.sourceforge.net/
Entidadadministradora:DeLanoScientificLLC.
Descripción:PyMOLesunsistemagráficomoleculardiseñadoparalavisualizaciónentiemporeal
de generación de gráficas moleculares y animaciones de alta calidad. También puede desarrollar
muchas otras tareas como la edición de archivos PDB, con fines de apoyo en los procesos de
investigación.
PyMOL
36
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Link:http://pubs.acs.org/journals/bichaw/
Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica.
Descripción: Proporciona los últimos progresos y avances en las áreas de química, bioquímica y
biología molecular y celular. Incluye estructura, función y regulación de moléculas biológicamente
activas; estructura y expresión del gen; mecanismos bioquímicos; biosíntesis de proteínas; plega-
miento de proteínas; relaciones estructura-función de la membrana; bioenergética; e inmuno-
química.
American Chemical Society Publications: Biochemistry Home Page
Link:http://www.jbc.org/
Entidadadministradora:SociedadAmericanaparalaBioquímicayBiologíaMolecular.
Descripción: Es publicado semanalmente para un total de 55000 páginas por año de reportes
investigativos originales en bioquímica y biología molecular. Proporciona acceso a resúmenes y
textoscompletosdepublicaciones.
The Journal of Biological Chemistry
Link:http://www.jlr.org/
Entidadadministradora:SociedadAmericanaparalaBioquímicayBiologíaMolecular.
Journal of Lipid Research
38
bioquímica
Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto com-
pleto) con el objeto de promover la investigación básica en el campo de los lípidos. JLR publica
artículos originales y revisiones en toda el área de lípidos biológicos, incluyendo aquellos rela-
cionados con bioquímica, biología molecular, biología estructural, biología celular, medicina mo-
lecular,ymetabolismo.
Link:http://www.genome.ad.jp/dbget/ligand.html
Entidadadministradora:KanehisaLaboratoriodeKyoto.UniversidadCentrodeBioinformática.
Descripción: Contiene información sobre las sustancias químicas y sus reacciones. Es un banco
de datos resultante de la unión de las bases de datos Compound, Drug, Glycan, Reaction, Rpair y
Enzyme.Unacopiadesólolecturadela basededatosrelacionalespúblicamenteaccesible.
Kegg Ligand Database
Link:http://rose.man.poznan.pl/aars/
Entidades administradoras: Maciej Szymanski y Jan Barciszewski de Poznañ. Centro de
SupercomputaciónyRedesenPolonia.
Descripción: Base de datos de secuencias de aminoacil-tRNA sintetasa. Las entradas obtenidas
están basadas en el formato EMBL/Swiss-Prot. En adición a las secuencias de aminoácidos,
incluyen el nombre y número de acceso de la secuencia Swiss-Prot, una corta descripción de la
secuencia, nombre del organismo y su clasificación taxonómica, así como la información
bibliográficabásica.
AARS DataBase
39
Link:http://brenda.bc.uni-koeln.de/
Entidadadministradora:InstitutodeBioquímica.UniversidaddeCologne.
Descripción: Colección de datos sobre enzimas disponible para la comunidad científica. Permite
hacer búsquedas por número EC, nombre de la enzima, organismo, o combinación de éstos. Ha
sidodesarrolladaenunareddesistemas deinformaciónmetabólicosconenlacesalaexpresiónde
enzimas e información de regulación. Disponible libremente para académicos; el uso comercial
requierelicencia.
Brenda
Link:http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/
Entidadadministradora:InstitutodeBioinformáticaEuropeo(EBI).
Descripción: Base de datos de sitios activos de enzimas y residuos catalíticos en enzimas de
estructura 3D. El acceso a CSA es utilizando códigos PDB, entradas SWISS-PROT o número EC.
Cada entrada lista los residuos catalíticos encontrados, utilizando la numeración PDB de residuos,
ycadasitioactivopuedeservisualizadoutilizandoRasMol.
Catalytic Site Atlas
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/GenomeAtlas/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Genome Atlas Database
40
bioquímica
Descripción: Atlas de estructuras de ADN para cromosomas y genomas completos. Representa
unalmacenamientodinámicopararesultadosdebioinformáticaydatosdesecuencia.
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/EasyGene/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Proporciona una lista de genes predichos dada una secuencia de ADN procariótica.
Elusuariosólonecesitaespecificarelorganismoquerecibelasecuenciabuscada.
EasyGene 1.0 Server
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/
Entidadadministradora:CentroparaelAnálisisdeSecuenciasBiológicas.
Descripción: Puede predecir varios genes completos o parciales en una secuencia y sitios de
acoplamiento. Si algunas de las características de una secuencia son conocidas, tales como
proteínas o elementos repetidos, el programa encontrará la mejor estructura génica bajo estas
limitaciones.
HMMgene (v. 1.1)
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetGene2/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Este servidor genera predicciones a través de redes neuronales de los sitios de
acoplamientodeADNenhumanos,C.elegansyA.thaliana.
NetGene2 Server
41
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPGene/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Servidor de predicciones mediante redes neuronales de los sitios de acoplamiento
enelADNdeArabidopsisthaliana.
NetPlantGene Server
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetStart/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Genera predicciones en redes neuronales del comienzo de la traducción de las
secuencias de nucleótidos en vertebrados y Arabidopsis thaliana. NetStart ha sido entrenado en
secuenciasdecDNAyporlotanto,tienemejordesempeñoparacDNAyEST.
NetStart 1.0
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predice los sitios de inicio de transcripción de promotores de vertebrados PoIII en
secuencias de ADN. Ha sido desarrollado como una evolución de factores de transcripción
simulados que interactúan con secuencias en regiones de promotores. Está construido sobre prin-
cipioscomunesalasredesneuronalesyalgoritmosgenéticos.
Promoter 2.0 Prediction Server
GenePublisher 1.03 Serverr
42
bioquímica
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/GenePublisher/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Desempeña análisis de datos automatizado de expresiones génicas en un número
diferente de plataformas. Este servidor acepta tablas de genes o archivos Affymetrix CEL como
entrada, desarrolla análisis numérico y estadístico, enlaces de los resultados a varias bases de
datos,ygeneraunreportedelosresultados.
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/OligoWiz2/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Este servidor realiza un diseño inteligente de oligonucleótidos para microarreglos de
ADN. Es implementado como una solución cliente-servidor, lo cual consiste en un fácil uso de la
Interfaz Gráfica de Usuario (escrita en Java) que delega las operaciones computacionales inten-
sivas a poderosos servidores Multi-CPU ubicados en el Centro para Análisis de Secuencias
Biológicas.Esnecesariodescargarlainterfaz.
OligoWiz 2 Server
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/SecretomeP/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predicción de secreciones de proteínas no clásicas. SecretomeP 2.0 produce
predicciones ab initio. El método busca un largo número de otros servidores de predicción carac-
terísticos para obtener información en varios aspectos de la proteína, los cuales están integrados
enlapredicciónfinaldesecreción.
SecretomeP 2.0 Server
43
Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predice la localización subcelular de proteínas eucarióticas. La asignación de la
localización es basada en la predicción de la presencia de cualquiera de las pre-secuencias N-
terminales:(cTP),(mTP)o(SP).
TargetP 1.1 Server
Link:http://www.bioinf.org.uk/abs/seqtest.html
Entidadadministradora:AndrewMartin.UniversidadCollegeLondon.
Descripción: Esta página permite poner a prueba una secuencia de anticuerpo contra la base de
datos de secuencias Kabat. Esto facilita la identificación de potenciales tecnologías de clonación y
erroresdesecuenciación.
AbCheck - Antibody Sequence Test
Link:http://www.123genomics.com/
Entidadadministradora:Grupo123Genomics.
Descripción: Este sitio posee enlaces a muchos recursos disponibles en Internet gratuitamente
relacionados con genómica y bioinformática. Dentro de las categorías encontradas están Análisis
de Secuencias, Bases de Datos de Secuencias, Genes y Proteínas, Revistas y Publicaciones, entre
otras.
123Genomics
CATH
44
bioquímica
Link:http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/cath.html
Entidadadministradora:UniversidadCollegeLondon.
Descripción: Esta base de datos proporciona clasificación jerárquica de dominios de estructuras
de proteínas en el banco de datos de proteínas Brookhaven. CATH es una nueva clasificación
jerárquica de dominios de estructuras de proteínas, con cuatro niveles principales, Class (C),
Architecture(A),Topology(T)yHomologoussuperfamily(H).
Link:http://protein.toulouse.inra.fr/prodom/current/html/form.php
Entidadadministradora:INRAyCNRS.
Descripción: Completo grupo de dominios de familias de proteínas automáticamente generados
deunacomparaciónglobaldetodaslasbasesdedatosdesecuenciasdeproteínasdisponibles.
Link:http://www.gepasi.org/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática de Virginia y el Grupo de Biología
CuantitativayBiotecnologíaAnalíticaAberystwyth.
Descripción: Gepasi es un paquete de software para la modelación de sistemas bioquímicos.
Realizar simulación de cinética de sistemas de reacciones bioquímicas y proporciona un número
de herramientas para colocar los modelos en datos, optimizar cualquier función del modelo,
desarrollaranálisisdecontrolmetabólicoyanálisisdeestabilidadlineal.
Gepasi
ProDom
45
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
estadsticaÍ
Link:http://www.itl.nist.gov/div898/software/dataplot/
Entidades administradoras: James Filliben y Alan Heckert. Instituto Nacional de Estándares y
Tecnología.
Descripción: Software para visualización científica, análisis estadístico, y modelación no lineal.
Permite dibujar gráficos 2D, 3D, histogramas, símbolos geométricos y eléctricos, diagramas
lógicos, análisis de series de tiempo, cálculos estadísticos y de probabilidad, generación aleatoria
denúmerosysimulación,entreotros.
Dataplot
Link:http://www.cdc.gov/epiinfo/index.htm
Entidades administradoras: Epi Info™ Helpdesk y el Centro para Control de Enfermedades y
PrevencióndeAtlanta.
Descripción: Software de dominio público diseñado para la comunidad mundial de científicos del
área de la salud, epidemiología y medicina. Permite desarrollar rápidamente cuestionarios o
formas, modificar procesos e ingreso de datos, e incorporar y analizar datos con estadísticas epi-
demiológicas,mapasygráficos.
EpiInfo
AM Statistical Software
47
estadsticaÍ
Link:http://am.air.org/default.asp
Entidadadministradora:InstitutoAmericanoparalaInvestigación.
Descripción: Software estadístico que permite analizar datos de muestras complejas,
especialmente de mediciones a gran escala. AM proporciona automáticamente errores estándar
para las muestras utilizando series de Taylor como método de aproximación, gráficos de barras y
líneas,ydiagramasdedensidaddiseñadosparacomparardistribuciones,entreotros.
Link:http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4.html
Entidades administradoras: Jean Thioulouse, Daniel Chessel y Sylvain Dolédec. Ministerio de
AmbienteFrancésyCNRS.
Descripción: Software estadístico para análisis multivariable y generación de gráficas. Incluye
métodos de análisis espacial de datos, análisis de discriminación y de grupos, métodos de re-
gresión lineal incluyendo regresión polinomial, múltiple y regresión ortogonal, métodos de pro-
yección,entreotros.
ADE4 2004 Assessment
Engineering Statistics
Link:http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/
Entidadadministradora:NIST/SEMATECH.
48
Descripción: Este libro proporciona ayuda a científicos e ingenieros en el proceso de incorporar
métodosestadísticosensutrabajodelaformamáseficienteposible.
Link:http://www.microsiris.com/MicrOsiris.htm
Entidadadministradora:VanEckComputerConsulting.
Descripción: Paquete para el manejo de datos y estadísticas. Incluye análisis multivariable de
datos nominales, genera distribuciones de frecuencia univariadas y bivariadas y estadísticas
relacionadas (incluyendo lambdas, gammas, kappa, taus, chi-cuadrado, y coeficientes Gini), esta-
dísticas no paramétricas, análisis de varianza, y análisis de clasificación múltiple (regresión
múltipleutilizandopredoctorescategóricos).
MicrOsiris Statistical and Data Management Software
The Decision Tree for Statistics
Link:http://www.microsiris.com/Statistical%20Decision%20Tree/
Entidadadministradora:VanEckComputerConsulting.
Descripción: Herramienta de ayuda para seleccionar técnicas estadísticas apropiadas para los
propósitos y condiciones de un análisis particular. Es una colección interactiva de páginas Web, la
cual realiza una serie de preguntas simples acerca de los datos (número de variables, escala de
medida,entreotros)yluegopresentarecomendacionessobrelamejortécnicadeaplicación.
Selecting Statistics
49
estadsticaÍ
Link:http://www.socialresearchmethods.net/selstat/ssstart.htm
Entidadadministradora:WilliamTrochim.UniversidadCornell.
Descripción: Colección de páginas Web interactivas de ayuda para seleccionar el mejor método
analítico sobre los datos. El resultado obtenido de una búsqueda es un examen estadístico o una
medida estadística para la situación descrita, proporcionando notas cuando es relevante, y usual-
mentesugiereunprogramaestadísticoquepuedeserutilizadopararealizarelanálisis.
Link:http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/scientificCal.htm#rmenu
Entidadadministradora:HosseinArsham.
Descripción: Este sitio es una parte de los objetos de aprendizaje del JavaScript E-labs para la
toma de decisiones. En el menú principal son presentadas varias áreas de aplicación: Herra-
mientasdedecisiónenEconomía&Finanzas,ModelaciónProbabilísticayEstadística.
A Collection of Javascript E-Labs Learning Objects
Electronic Textbook Statsoft
Link:http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html
Entidadadministradora:StatSoftR&D.
Descripción: Ofrece entrenamiento en la comprensión y aplicación de la estadística, incluyendo
investigación de laboratorio (biomédica, agricultura, entre otros), estadística de negocios, esta-
dística para ciencias sociales, minería de datos, ingeniería y control de calidad de aplicaciones, y
muchas otras. Presenta una introducción a los elementos conceptuales relevantes y continúa con
unaexploraciónmásprofundadeáreasespecíficasdeestadísticayorganizadaspormódulos.
50
Link:http://interstat.statjournals.net/
Entidadadministradora:RichardKrutchkoff.InstitutoPolitécnicodeVirginia.
Descripción: InterStat es una fuente libre de artículos sobre estadísticas. Pueden ser publicados
artículosreferentesacualquieraspectodeinvestigaciónestadísticaométodosinnovadores.
Interstat
[B/D] The Bayes Linear Programming Language
Link:http://fourier.dur.ac.uk:8000/stats/bd/
Entidadesadministradoras:DavidWooffyMichaelGoldstein.UniversidaddeDirham.
Descripción: [B/D] es un lenguaje de programación interactivo. Permite realizar un completo
análisisdiagnósticoyapriorideproblemasdeestadísticalinealdeBayes.
Macanova (A Program for Statistical Analysis and Matrix Algebra)
Link:http://www.stat.umn.edu/macanova/
Entidadesadministradoras:GaryOehlertyChristopherBingham.UniversidaddeMinnesota.
Descripción: MacAnova es un programa libre para realizar análisis estadístico interactivo. Es
particularmente fuerte en (M) ANOVA y modelos lineales e incluye por lo menos ocho archivos de
macros para realizar análisis multivariable, análisis de series de tiempo para dominios de tiempo y
frecuencia,ydiseñodeexperimentosfactoriales,entremuchasotrascosas.
Statistical Calculators
Link:http://calculators.stat.ucla.edu/
Entidadadministradora:DepartamentodeEstadística.UniversidaddeCalifornia.
51
estadsticaÍ
Descripción: Contiene herramientas para realizar cálculos para gran cantidad de funciones de
distribución de probabilidad, incluyendo Normal, Bivariada, t Student, Chi-cuadrado, Fisher F,
Poisson, Log-normal, Exponencial, Beta, Gamma, Binomial, Multinomial, Cauchy, Gumbel, Lapla-
ce,Pareto,Weibull,TriangularyGeométrica,entreotras.
Link:http://members.aol.com/johnp71/pdfs.html
Entidadesadministradoras:JohnPezzullo.
Descripción:Estaherramientapermitecalcularlasfuncionesdedistribucióndeprobabilidadysus
inversasparacuatrodelasdistribucionesestadísticasmáscomunes.
Probability Distribution Functions
The P-Values for the popular distributions
Link:http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/pvalues.htm#rbetaden
Entidadadministradora:HosseinArsham.
Descripción: Presenta programas en JavaScript que calculan los valores P para las distribuciones
más ampliamente utilizadas. Entre las funciones evaluadas encontramos: Función de Densidad,
Función Total Binomial, Densidad de Chi-cuadrado, Densidad Exponencial, Densidad F de Fisher, K-
S: Dos Muestras, Función Total de Poisson, Densidad Estándar Normal, Densidad t de Student y
DensidadUniforme.
Journal of Statistical Software
Link:http://www.jstatsoft.org/
Entidadadministradora:JandeLeeuw.AsociaciónAmericanadeEstadística.
52
Descripción: Esta revista publica manuales, guías de usuario y otras formas de descripción de
software estadístico, ediciones especiales en asuntos de estadística computacional (editores
invitados), una edición especial anual documentando el progreso de mayores proyectos de
software estadístico, revisiones de libros en software y estadística computacional y revisiones y
comparacionesdesoftwareestadístico.
UCLA Statistics
Link:http://www.socr.ucla.edu/Applets.dir/OnlineResources.html
Entidadadministradora:IvoDinov.UniversidaddeCalifornia.
Descripción: Recursos en línea de Probabilidad y Estadísticas: Calculadoras de Distribución de
Alta Precisión: Exponencial, Normal, Chi-Cuadrado, Distribución Poisson, Binomial, Normal, T de
Student y F, tablas, herramientas para procesamiento de funciones y gráficos, demostraciones
conceptuales (Applets), análisis de datos estadísticos de Tiempo Real en línea: WebStat (paquete
desoftwareestadísticoenlíneaparaanálisisdedatos)yANOVA.
INSTAT An Interactive Statistical Package
Link:http://www.rdg.ac.uk/ssc/software/instat/instat.html
Entidadadministradora:EscueladeEstadísticaAplicada.UniversidaddeReading.
Descripción: Paquete general de estadística útil en la enseñanza de conceptos estadísticos,
además de complementar la investigación en cualquier disciplina que requiera el análisis de datos.
Incluye características que ayudan a explicar conceptos claves como intervalos de confianza
(normalmenteconfusoentrelosusuarios).
53
estadsticaÍ
Link:http://www.stat.uiowa.edu/~luke/xls/xlsinfo/xlsinfo.html
Entidadadministradora:LukeTierney.UniversidaddeMinnesota.
Descripción: Lisp-Stat es un ambiente de estadística computacional para análisis de datos,
instrucción estadística e investigación, con énfasis en uso de métodos gráficos dinámicos. Un
sistema de programación orientado a objetos es usado para implementar el sistema gráfico y
también en las representaciones básicas para los modelos estadísticos, como los modelos de
regresiónlinealynolinealymodeloslinealesgeneralizados.
LISP-STAT Information
The R Project for Statistical Computing
Link:http://www.r-project.org/
Entidadadministradora:JohnChambers.LaboratoriosBell.
Descripción: R es un lenguaje y ambiente para computación estadística y gráfica. R proporciona
una amplia variedad de técnicas estadísticas (modelación lineal y no lineal, examen estadístico
clásico, análisis de series de tiempo, clasificación, entre otros) y gráficas. Posee gran calidad de
publicaciónenlosdiagramasgenerados,incluyendosímbolosmatemáticosyfórmulas.
WinIDAMS
Link: http://portal.unesco.org/ci/en/ev.phpURL_ID=2070&URL_DO=DO_TOPIC&URL_SECTION
=201.html
Entidadesadministradoras:UNESCOencooperaciónconexpertosdevariospaíses.
54
Descripción:Paquetedesoftwareparalavalidación,manipulaciónyanálisisestadísticodedatos.
Ofrece un amplio rango de técnicas de análisis de datos como análisis de regresión, análisis
discriminante, análisis clúster, análisis de correspondencias, tipología de segmentación e
iterativa, entre otras, componentes interactivos para la construcción de tablas multidimensionales
ysupresentacióngráfica,paralaexploracióngráficadedatosyparaanálisisdeseriesdetiempo.
IRRISTAT
Link:http://www.irri.org/science/software/irristat.asp
Entidadadministradora:InstitutoInternacionaldeInvestigaciónRice(IRRI).
Descripción: Software para el manejo de datos y análisis estadístico básico de datos
experimentales. IRRISTAT ha sido desarrollado primariamente para el análisis de datos de campos
agrícolas, pero muchos de sus atributos pueden ser usados para el análisis de datos de otras
fuentes. Los módulos principales y facilidades son manejo de datos con hojas de cálculo, editor de
texto,análisisdevarianzayRegresiónyCorrelación.
VISTA The Visual Statistics System
Link:http://forrest.psych.unc.edu/research/
Entidadadministradora:ForrestYoung.UniversidaddeCarolinadelNorte.
Descripción: Vista proporciona visualizaciones estadísticas altamente dinámicas e interactivas.
La visualización intuitiva de Vista y el acercamiento computacional intensivo en el análisis de los
datos estadísticos son diseñados para clarificar su significado, de modo que pueda verse la
informacióncontenidaenestosdatos.Poseeinterfaz gráficaestructurada ypermitevisualización
55
estadsticaÍ
estadísticaunivariadaymultivariadayanálisisdedatos.
Gretl
Link:http://gretl.sourceforge.net/
Entidades administradoras: Allin Cottrell y Riccardo Lucchetti. Universidad Wake Forest y
UniversidaddeAncona.
Descripción: Es un paquete de software para análisis econométrico. Posee instrucciones
sencillas para realizar contraste de Dickey-Fuller aumentado, contraste de estabilidad estructural
de Chow, auto regresiones vectoriales o estimación de modelos ARMA. Estructura de bucles de
instruccionesparasimulacionesdeMonteCarloyprocedimientosdeestimacióniterativos.
Salstat Statistics
Link:http://salstat.sourceforge.net/index.php?index
Entidadadministradora:AlanJamesSalmoni.
Descripción: Rápido análisis estadístico de datos científicos bajo GPL. SalStat es una aplicación
diseñada para el análisis de datos científicos: el tipo de datos comúnmente vistos en psicología,
por ejemplo. Puede realizar un rango de pruebas, desde estadística descriptiva hasta análisis de
varianzaysusequivalentesnoparamétricos.
ZELIG: Everyone's Statistical Software
56
Link:http://gking.harvard.edu/zelig/
Entidadesadministradoras:KosukeImai,GaryKingyOliviaLau.
Descripción: Zelig un programa fácil de usar que puede estimar, ayudar a interpretar, y presentar
losresultadosdeunlargorangodemétodosestadísticos.
Biostatistics
Link:http://biostatistics.oxfordjournals.org/
Entidadadministradora:UniversidaddeOxford.
Descripción: El objetivo de Biostatistic es el avance en las ciencias estadísticas y su aplicación en
problemas de salud humana y enfermedades. Biostatistics publica artículos que desarrollan
métodos estadísticos innovadores con aplicaciones en la comprensión de salud humana y enfer-
medades,incluyendocienciasbiomédicasbásicas.
QuickCalcs
Link:http://www.graphpad.com/quickcalcs/index.cfm
Entidadadministradora:GraphPadSoftware.
Descripción: Este sitio contiene libre acceso a calculadoras en líneas para cálculos de radio-
actividad,pruebast,ANOVA,entreotros.
GraphPad Library
Link:http://www.graphpad.com/index.cfm?cmd=library.index
57
estadsticaÍ
Entidadadministradora:GraphPadSoftware.
Descripción: Contiene información de ayuda sobre el análisis de datos dirigido a biólogos (y otros
científicos). Esta “biblioteca” contiene artículos y manuales escritos por GraphPad, así como enla-
cesaotrossitiosweb.
MIX
Link:http://tigger.uic.edu/~hedeker/mix.html
Entidadesadministradoras:DonaldHedekeryRobertGibbons.UniversidaddeIllinois.
Descripción: Incluye programas para realizar regresión lineal, regresión logística para resultados
nominalesuordinales,regresióndePoisson,entreotros.
VassarStats
Link:http://faculty.vassar.edu/lowry/VassarStats.html
Entidadadministradora:RichardLowry.VassarCollege.
Descripción: Contiene útiles herramientas para el desarrollo de computación estadística. Incluye
calculadoras estadísticas, herramientas para el desarrollo de regresiones múltiples, correlación
parcial,probabilidadesbinomiales,entreotras.
B-Course
58
Link:http://b-course.cs.helsinki.fi/
Entidadadministradora:GrupodeSistemasdeComputaciónComplejos.UniversidaddeHelsinki.
Descripción: B-Course es una herramienta en línea para el análisis de datos para modelación
Bayesiana, en particular dependencia y modelación de clasificación. B-Course puede ser utilizada
como una herramienta de análisis para cualquier investigación. Es de libre acceso para propósitos
educacionales.
BUGS
Link:http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/welcome.shtml
Entidades administradoras: Imperial College School of Medicine at St Mary's y University of
Helsinki.
Descripción: BUGS es un software flexible para desarrollar análisis Bayesiano de modelos
estadísticos complejos utilizando cadenas de Markov y métodos de Monte Carlo. Es necesario un
conocimientopreviodeestadísticaBayesiana.
GeoR
Link:http://www.est.ufpr.br/geoR/
Entidadesadministradoras:PauloRibeiroyPeterDiggle.
Descripción: Este es un paquete para análisis geoestadístico de datos utilizando el software
estadísticodelibreaccesoR.
59
estadsticaÍ
STARS
Link:http://stars-py.sourceforge.net/
Entidadadministradora:SergioRey.GrupoSTARS.
Descripción: STARS es un paquete de libre acceso diseñado para el análisis de datos reales
tomados en un intervalo de tiempo. Une varios métodos recientes de desarrollo de análisis de es-
pacio-tiempoenunambientegráfico.Esútilcomoherramientaparaanálisisexploratoriodedatos.
SciGraphica
Link:http://scigraphica.sourceforge.net/
Entidadadministradora:AdrianFeiguin.
Descripción: Aplicación científica para el análisis de datos y gráficas técnicas. Es algo similar a
Sigmaplot y pretende ser un clon de la aplicación comercial Microcal Origin. Es de libre acceso y
códigoabierto.EstádisponibleparaplataformasLinux.
60
Buscadores
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed
Descripción: PubMed es un servicio de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos
que incluye más de 16 millones de citaciones de artículos biomédicos de MEDLINE y otras revistas
de ciencias biológicas. PubMed incluye enlaces al resumen y texto completo de los artículos y
otrosrecursosrelacionados.
Entrez Pubmed
Link:http://www.sciencedirect.com/
Descripción: Science Direct permite el acceso a resúmenes de artículos (texto completo para
usuarios registrados) de más de 1400 revistas sobre ciencia, tecnología y medicina mundial de la
editorial Elsevier Science, así como de editores asociados, y a los índices de las revistas no
suscritas. Además posee acceso a bases de datos bibliográficas y obras integradas en Science
Direct.
ScienceDirect
Link:http://intl.highwire.org/
Descripción: Buscador de publicaciones científicas realizado en colaboración estrecha de
científicos, bibliotecarios y editoriales. Mediante la introducción de enlaces entre autores,
artículos y citas, capacidades de búsqueda avanzada, imágenes de alta resolución, multimedia e
interactividad, las versiones electrónicas ofrecen un notable valor añadido a la información
ofrecidaenlasrevistasimpresas.
HighWire Press
62
Link:http://scholar.google.com/
Descripción: Google Scholar proporciona acceso a literatura científica. Puede realizar búsquedas
sobre muchas disciplinas y fuentes: artículos revisados, tesis, libros, resúmenes y artículos aca-
démicos, de sociedades profesionales, universidades y otras organizaciones escolares. Google
Scholaridentificalainformaciónmásrelevanteenelcampodelainvestigacióncientífica.
Google Scholar
Scirus
Link:http://www.scirus.com/srsapp/
Descripción: Scirus es el más completo buscador de ciencia en Internet. Busca sobre 200
millones de páginas de ciencia en la Web, permitiendo hallar los principales datos científicos,
escolares, técnicos y médicos, encontrar los últimos informes, artículos revisados, patentes, re-
vistasyobtenerfuncionalidadesúnicasdiseñadasparacientíficoseinvestigadores.
Cheminfo
Link:http://www.indiana.edu/~cheminfo/search.html
Descripción: CHEMINFO (Chemical Information Sources) es diseñado para buscar y enseñar
cómo utilizar recursos de información química en Internet y otros lugares. Integra sitios Web de la
UniversidaddeIndianaconinformaciónquímicasignificativa.
Buscadores
63
Link:http://www.ojose.com/
Descripción: OJOSE (Online JOurnal Search Engine) es un poderoso buscador científico que
permite hacer exploraciones en diferentes bases de datos utilizando un solo campo de búsqueda.
Es posible encontrar, descargar o comprar publicaciones científicas (revistas, artículos, reportes
deinvestigación,entreotros)enmásde60basesdedatosdiferentes.
WWW.OJOSE.COM: Online Journals Search Engine
Link:http://www.sciseek.com/
Descripción: SciSeek ofrece noticias de carácter científico desde su página principal, e
indudablemente el mayor interés radica en su amplio directorio, que consta de numerosos temas y
subtemas. Los resultados del buscador incluyen la dirección de la página web, el número de votos
que ha conseguido por parte de los usuarios y los comentarios realizados por los mismos
visitantes.
Sciseek
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Descripción: BiologyBrowser, es un sitio web desarrollado por BIOSIS. Ofrece recursos de
informaciónsobrecienciasbiológicasparalacomunidad.BiologyBrowserpresentaoportunidades
únicas para los científicos, como la utilización de recursos de información exclusivamente
producidosporBIOSISyencuentrainformaciónrelevantedeotrasfuentesyenlaces.
Biology Browser
64
Link:http://www.chmoogle.com/
Descripción: Chmoogle, un buscador que permite localizar productos químicos, sus propiedades
físicas e incluso su estructura, utilizando java o, en el peor de los casos, de un software específico
disponiblesóloparaWindows.
Chmoogle
Chemedia
Link:http://www.chemedia.com/
Descripción: ElíndicetemáticodeChemediaesundirectoriojerárquicosobrediferentestemasde
ciencia y tecnología, con aproximadamente 125000 palabras indexadas y 53000 páginas con
informaciónrelevantealmacenadaenlabasededatos.
ChemIndustry.com
Link:http://chemindustry.com/
Descripción: ChemIndustry.com es el directorio y buscador más completo para sustancias
químicas y profesionales relacionados con la industria. La base de datos de sitios web incluye más
de 45000 industrias químicas y entidades relacionadas y contiene textos completos de millones
depáginas.
Buscadores
65
Link:http://ull.chemistry.uakron.edu/erd/
Descripción: Esta base de datos permite al usuario obtener información de cualquiera de los
23495 químicos peligrosos o entradas 'genéricas' basadas en la búsqueda. Las fórmulas son
presentadasenformatoHillyformatodescriptivoparalavisualización.
The Chemical Database
Link:http://www.ccoo.es/istas/rs/rsrx.htm
Descripción: Risctox ofrece informacióntoxicológica sobre productos de utilizaciónindustrial que
actualmente incluye unos 1.000 productos, para cada uno de los cuales es ofrecida la siguiente
información: descripción de las características del producto, límites de exposición, efectos
agudosycrónicosydatossobreefectosmedioambientales.
Risctox
Link:http://www.biocrawler.com/
Descripción: Biocrawler.com es una enciclopedia escrita con varios colaboradores. El propósito
deestaesofrecerunaenciclopediacientíficacomprendidaentodoslosnivelescientíficos.
Biocrawler
66
Link:http://www.sciencemag.org/
Descripción: Science es la revista de ciencia líder en la presentación de noticias científicas, e
investigacióndevanguardiaEnlíneaestándisponibleslosresúmenesdesuspublicaciones(textos
completosrequierensuscripción).
Science
ChemSpy.com
Link:http://www.chemspy.com/index.html
Descripción: ChemSpy.com es el primer portal para búsqueda de sustancias químicas y bases de
datos, ofreciendo información de sustancias químicas en la industria a científicos, ingenieros,
estudiantesycualquierinteresado.
Molecular and Cellular Proteomics
Link:http://www.mcponline.org/
Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto
completo) de artículos y revisiones cortas sobre las propiedades estructurales y funcionales de las
proteínas y su expresión, particularmente con respecto al desarrollo. Hace énfasis en la
determinación de cómo la presencia o ausencia de proteínas afecta las respuestas biológicas y
cómolainteraccióndeproteínasconcélulasasociadaspermitesufuncionamiento.
Buscadores
67
Link:http://biome.ac.uk/
Descripción: BIOME es un catálogo de libre acceso de recursos de Internet seleccionados y
evaluados Internet para estudiantes, lectores e investigadores en las áreas de ciencias médicas y
de la salud, enfermería y profesiones de la salud afines, salud animal y ciencias veterinarias, inves-
tigaciónbiológicaybiomédica,elmundonatural,agriculturayalimentación.
BIOME
Link:http://www.fiz-chemie.de/guides/
Descripción: ChemGuide y MedPharmGuide son buscadores de información en Internet en el área
de la química, medicina y farmacología. PublishersGuide es un buscador en servidores web de
publicaciones,instituciones,sociedades,etc.,enlasáreasdecienciaytecnología.
FIZ CHEMIE Berlin Guides
Link:http://e-biosci.embo.org:8080/index.jsp
Descripción: Buscador en los campos de biología molecular, y genética, con enfoque en genética
humana.Labúsquedaesrealizadasobreliteratura,patentes,genesyproteínas.
E-BioSci
68
Link:http://infomine.ucr.edu/
Descripción: INFOMINE es una biblioteca virtual de herramientas de Internet relevantes para
estudiantes e investigadores. Contiene recursos de Internet útiles tales como bases de datos,
revistas electrónicas, libros electrónicos, boletines, listas de correo, artículos, directorio de inves-
tigadores,entreotros.
INFOMINE
BioHunt
Link:http://au.expasy.org/BioHunt/
Descripción: Buscador de Biología Molecular. Permite realizar búsquedas simples y avanzadas es
áreasespecíficastalescomoeducación,organizaciones,gobierno,entreotras.
Bioinformatics.Net
Link:http://www.bioinformatics.vg/cgi-bin/odp/index.cgi
Descripción: Bioinformatics.Net es un catálogo en línea de información en ciencias biológicas,
especializado en herramientas de bioinformática. Dirigido a biólogos moleculares y otros cien-
tíficos biológicos trabajando en investigación científica, incluyendo biotecnología y medicina,
tantoenlaindustriacomoeláreaacadémica.
Buscadores
69
Link:http://www.atgenetics.com/genetics/
Descripción: Buscador de Internet de información y recursos en las áreas de Genética y Biología
Molecular.
@Genetics
YAHOO SEARCH
Link:http://wdcm.nig.ac.jp/
Descripción: WFCC-MIRCEN proporciona un completo directorio de bases de datos en las líneas
demicrobiosycélulas,yenlacesaproyectossobrebiodiversidad,biologíamolecularygenómica.
WFCC-MIRCEN
Link:http://www.organic-chemistry.org/
Descripción:BuscadordeInternetparareaccionesorgánicas.
Organic-Chemistry
Link:http://dir.yahoo.com/Science/chemistry/
Descripción:InformaciónsobrequímicaenelDirectoriodeYahoo.
70
METACRAWLER
Link:http://www.metacrawler.com
Descripción: MetaCrawler utiliza la tecnología innovadora de búsqueda de los buscadores más
representativos en Internet, incluyendo Google, Yahoo! Search, MSN Search, Ask Jeeves, About,
MIVA, LookSmart y muchos otros. Con un simple click, MetaCrawler busca los mejores resultados
obtenidosdelacombinacióndelosmejoresbuscadoresmundiales.
GALAXY
Link:http://galaxy.einet.net/galaxy/Science.html
Descripción: Galaxy emplea la mejor tecnología y experticia humana para organizar la infor-
mación de tal forma que sea comprensible y altamente relevante con respecto a las necesidades
de los usuarios. Como parte del proceso, son eliminados sitios con contenido para adultos, sitios
ofensivosyconpocaoningunainformacióndevalor.
ASK JEEVES
Link:http://www.askjeeves.com
Descripción: Ask.com ofrece muchas características y herramientas innovadoras para ayudar a
conseguirinformaciónrápidayfácilmente.
Buscadores
71
Diseño, diagramación e ilustración
Angélica Semacarit R.

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  • 3. Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html Entidadadministradora:BasedeDatosInternacionaldeSecuenciasdeNucleótidos. Descripción: Base de datos de secuencias genéticas. Proporciona reciente y detallada informa- ción sobre secuencias de ADN. Incluye una descripción concisa de la secuencia, el nombre científico y taxonomía del organismo, fuente, y una tabla de características que identifican las re- giones de codificación y otros sitios de significancia biológica, tales como unidades de trans- cripción,sitiosdemutaciones,yrepeticiones. Link:http://www.medbioworld.com/ Entidadadministradora:Healthnostics,Inc. Descripción: Directorio médico y de biociencias más grande en Internet. Posee actualmente 8200 revistas dentro de 80 especialidades médicas y 101 campos de biociencias, 7000 asociaciones médicas y de biociencias, 30000 nuevos artículos de Salud e Industria Reuters, 3100 bases de datosmédicasydebiocienciasymásde2000empresasdebiocienciasasociadas. GenBank MedBioWorld Biological & Environmental Research Abstracts Database Link:http://www.osti.gov/oberabstracts/ 2
  • 4. BasesDE DATOS Bases de Datos Entidad administradora: Oficina de Investigaciones Biológicas y Ambientales. Departamento de EnergíadelosEstadosUnidos. Descripción: Esta base de datos contiene resúmenes de proyectos de investigación en cuatro áreas específicas: ciencias biológicas, investigación de cambios climáticos, remediación am- biental y ciencias médicas. Los proyectos son apoyados por el programa de Investigaciones Bioló- gicasyAmbientales. Link:http://www.biosupplynet.com/biotoolkit/ Entidadadministradora:BioSupplyNet. Descripción: Base de datos con más de 900 recursos en línea de interés para biólogos y neuro- biólogos moleculares. Está dividida en cinco secciones: Análisis del ácido nucleico, Recursos so- bregenómica,ProyeccióndeimagenyAnálisisestructuraldelaproteína,yNeuroinformática. The BIOTOOLKIT Link:http://metallo.scripps.edu/ Entidadadministradora:InstitutodeInvestigaciónScripps. Descripción: Base de datos y Navegador (MDB) de Metaloproteínas del Instituto de Investigación Scripps. Contiene información geométrica y molecular que permite la clasificación y búsqueda de combinaciones particulares de las características del sitio, su visualización y manipulación. Hace parte de un proyecto para el diseño de metaloproteínas, permitiendo la visualización interactiva de suinformacióngeométricayfuncional. Metalloprotein Database and Browser (MDB) 3
  • 5. Link:www.rcsb.org/pdb/ Entidades administradoras: Fundación Nacional de Ciencias, Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales, Departamento de Ciencia, Departamento de Energía, Biblioteca Nacional de Medicina, Instituto Nacional de Cáncer, Centro Nacional para Recursos de Investigación, Instituto Nacional de Desórdenes y Enfermedades Neurológicas y el Instituto Nacional de Visualización y BioingenieríaBiomédica. Descripción: Base de datos en 3-D sobre estructuras de proteínas y ácidos nucleicos. Cada descripción experimental de la estructura es un archivo de texto con las coordenadas atómicas de la molécula en formato PDB. Los datos encontrados en PDB generalmente obtenidos por Cristalografía de rayos X o Resonancia Magnética Nuclear, son enviados por biólogos y bioquímicosdetodoelmundo. Link:http://chemfinder.cambridgesoft.com/ Entidadadministradora:CorporaciónCambridgeSoft. Descripción: Esta base de datos incluye información sobre componentes químicos, estructuras químicas (estructuras 2D y modelos 3D) y propiedades físicas (MP, BP, CAS RN). De igual forma, permite realizar búsquedas referenciadas por nombre químico, fórmula, peso molecular y número de registro CAS. La visualización de estructuras químicas es posible a través de los programas ChemDrawoChem3D. ChemFinder Protein Data Bank 4
  • 6. BasesDE DATOS Link:http://www.orgsyn.org/ Entidades administradoras: Rick Danheiser, Dennis Curran, Scott Denmark, Jonathan Ellman, Alois Fürstner, Mark Lautens, David Mathre, Marvin Millar, John Ragan, Masakatsu Shibasaki, PeterWipfyCharlesZercher. Descripción: Base de datos de libre acceso sobre procedimientos detallados para la síntesis de compuestos orgánicos. Algunos describen métodos prácticos para la preparación de compuestos químicos de interés, mientras que otros ilustran métodos sintéticos importantes de utilidad general. Organic Syntheses Link:http://www.atsdr.cdc.gov/search.html Entidadadministradora:AgenciaparaSustanciasTóxicasyRegistrodeEnfermedades(ATSDR). Descripción: Base de datos sobre contaminación con sustancias peligrosas en el medio y sus efectos en la salud de poblaciones humanas. Facilita información sobre las características del lugar afectado, contaminantes encontrados, niveles de concentración del contaminante, impacto en la población, recomendaciones de la ATSDR, consecuencias en el ambiente y formas de exposición,entreotras. Agency for Toxic Substances & Disease Registry ChemBank Bases de Datos 5
  • 7. Link:http://chembank.broad.harvard.edu/compounds/?realm=bioactives Entidades administradoras: Jeremy Muhlich, Jason McIntosh, Erik Brauner, Jim Conley y CarolineShamu. Descripción: Colección de datos de libre acceso sobre moléculas pequeñas y recursos para el estudio de sus propiedades. Además, proporciona datos sobre químicos potencialmente peli- grosos: registro de efectos tóxicos, aceites y materiales peligrosos, sistemas de información y respuesta, control de sustancias tóxicas, sistemas integrados de información sobre riesgos, guías derespuestadeemergenciayparacomponentesquímicospeligrosos. Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/iproclass.shtml Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico UniversitariodeGeorgetown(GUMC). Descripción: Proporciona enlaces a más de 90 bases de datos biológicas, incluyendo bases de datos para familias de proteínas, funciones, interacciones, estructuras y clasificaciones estruc- turales, genes y genomas, literatura y taxonomía. iProClass puede ser utilizado para soportar anotaciones de secuencias de proteínas, investigaciones sobre genómica o proteómica y adicionalmente,identificacióndeproteínas. iPROCLASS Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pirsf.shtml PIRSF 6
  • 8. BasesDE DATOS Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico UniversitariodeGeorgetown(GUMC) . Descripción: El sistema de clasificación PIRSF está basado en proteínas completas, por lo tanto, permite la anotación de bioquímicos genéricos y funciones biológicas específicas, así como la cla- sificación de proteínas sin dominios bien definidos. La estructura de PIRSF es formalmente una red. Link:http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pir_psd.shtml Entidades administradoras: Recursos de Información de Proteínas, Centro de Información de MunichparaSecuenciasdeProteínasyBasedeDatosInternacionaldeProteínasdeJapón. Descripción: Primera base de datos de secuencias de proteínas clasificadas. Las secuencias y anotaciones de PIR-PSD han sido integradas a la base de conocimiento UniProt, con referencias bidireccionales entre ellas para permitir el rastreo sencillo de las entradas formadas en PIR-PSD. Las secuencias únicas de PIR-PSD, citaciones de referencia, y datos verificados experimental- mentepuedenserencontradosenlosregistrosdeUniProt. PIR-PSD Swiss-Prot Link: http://www.expasy.ch/sprot/ Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss (SIB) y el Instituto de Bioinfor- máticaEuropeo(EBI). Bases de Datos 7
  • 9. Descripción: Base de datos de secuencias de proteínas. Genera información detallada acerca de la secuencia, mutaciones, número de clasificación de enzima (E.C.) requerimiento de cofactores, modificaciones postraduccionales y bibliografía, entre otros. Proporciona enlaces directos con múltiples herramientas utilizadas para estimar la masa molecular y el punto isoeléctrico, o para realizarprediccionesestructurales. Link:http://www.expasy.org/prosite/ Entidadadministradora:InstitutodeBioinformáticaSwissenGenevayLausanne. Descripción: Colección de descriptores de motivos dedicada a la identificación de familias de proteínas y dominios. Con herramientas computacionales apropiadas, resulta rápida y factible la identificacióndelafamiliaconocidadeproteínasalacualperteneceunanuevasecuencia. Link:http://www.expasy.ch/ch2d/ Entidades administradoras: Grupo de Investigación en Proteómica Biomédica (BPRG) del HospitalUniversitariodeGenevayelInstitutodeBioinformáticaSwiss(SIB). Descripción: Contiene datos sobre identificación de proteínas en varios mapas de referencia. Puede localizar proteínas en mapas 2-D PAGE o mostrar la región de un mapa 2-D PAGE donde espera encontrar una proteína de Swiss-Prot. Incluye datos textuales sobre la proteína, tales como procedimientos de mapeo, información fisiológica y patológica, datos experimentales (punto isoeléctrico,pesomolecular)yreferenciasbibliográficas. Prosite Swiss-2Dpage 8
  • 10. BasesDE DATOS Link:http://www.expasy.ch/enzyme/ Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss y Recursos de Bioinformática Canadiense. Descripción: Basededatosconinformaciónsobrenomenclaturadeenzimas,basadaenelComité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB). Incluye sobre cada enzima catalogada el número EC, nombre recomendado, nombres alternativos (si existen), actividad catalítica, cofactores, enlace a la secuencia de proteína obtenido en Swiss-Prot correspondiente a la enzima y enlace a las enfermedades humanas asociadas con una deficiencia delaenzima. LLink:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?HSDB Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de Medicina(NLM). Descripción: Archivo de datos centrado en la toxicología de químicos potencialmente peligrosos. Posee información sobre exposición humana, higiene industrial, procedimientos de manejo de emergencias, consecuencias ambientales, requerimientos regulatorios, y áreas relacionadas. Todos los datos son referenciados y derivados de una serie de libros, documentos guberna- mentales,reportestécnicosyliteraturaseleccionada. Enzyme Hazardous Substances Data Bank (HSDB®) ChemIDplus Bases de Datos 9
  • 11. Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CHEM Entidadadministradora:BibliotecaNacionaldeMedicina(NLM). Descripción: Base de datos de libre acceso sobre archivos de estructura y nomenclatura para la identificación de sustancias químicas citadas en las bases de datos de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM), incluyendo el sistema TOXNET. También proporciona búsquedas de estructuras y enlacesdirectosamuchosrecursosbiomédicosenlaNLMyenInternet. Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?TOXLINE Entidades administradoras: Biblioteca Nacional de Medicina y el Instituto Nacional de Salud. Descripción: Proporciona información derivada de 16 fuentes secundarias sobre toxicología, farmacología, y efectos bioquímicos y fisiológicos de drogas y otros químicos. Toxline Core, comprende la mayoría de la literatura estándar en toxicología y Toxline Special, complementa a ToxlineCoreconreferenciasdeunavariedadderevistasespecializadasyotrasfuentes. Toxline® Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CCRIS Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de Medicina. Descripción: Banco de datos científicamente evaluado y referenciado. Contiene más de 8000 registros químicos sobre carcinogenicidad, mutagenicidad y resultados de pruebas de inhibición de tumores. Los datos son derivados de estudios citados en revistas, herramientas de conoci- miento actuales, informes del NCI y otras fuentes monitoreadas por expertos en carcinogénesis y mutagénesis. Chemical Carcinogenesis Research Information System (CCRIS®) 10
  • 12. BasesDE DATOS Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?DARTETIC Entidades administradoras: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®), Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos, el Instituto Nacional de Ciencias Ambientales de la Salud y el CentroNacionalparalaInvestigaciónToxicológicadelaAdministracióndeAlimentosyDrogas. Descripción: Base de datos sobre información en el área de teratología y otros aspectos de la toxicología de desarrollo y reproductiva. Posee más de 100.000 referencias de literatura publicada desde1965. Developmental and Reproductive Toxicology/Environmental Teratology Information Center (DART®/ETIC) Database Link:http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?GENETOX Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de Medicina. Descripción:Contienedatosdepruebasgenéticasdetoxicología(mutagenicidad)obtenidosdela revisión experta de literatura científica abierta en más de 3.000 químicos. Gene-Tox fue estable- cido para seleccionar sistemas de ensayo para evaluación, revisión de datos en literatura cien- tífica, recomendación de protocolos de prueba apropiados y evaluación de procedimientos adecuadosparaestossistemas. Gene-Tox EMBL-Nucleotide Sequence Database Link:http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-page+query+-libList+EMBL Bases de Datos 11
  • 13. Entidades administradoras: GenBank, Base de Datos de ADN de Japón (DDBJ) y el Instituto de BioinformáticaEuropeo. Descripción: Base de datos constituida por secuencias de nucleótidos. Las principales fuentes de secuencias de DNA y RNA son obtenidas de investigadores, proyectos de secuenciación genómi- cayaplicacióndepatentes.EsunadelasbasesdedatosmásimportantesenEuropa. Link:http://physics.nist.gov/PhysRefData/ASD/index.html Entidades administradoras: Administración Nacional Aeronáutica y Espacial, Oficina de Ciencias de Fusión de Energía de Estados Unidos, Departamento de Energía, Programa de Referencia de Datos Estándar y el Programa de Integración de Sistemas para Manufacturación de Aplicaciones deNIST. Descripción: Base de datos con información sobre transiciones radiactivas y niveles de energía en átomos e iones atómicos. Los datos son incluidos para las transiciones observadas en 99 elementosynivelesdeenergíade56elementos.ASDcontienedatosdecercade950espectrosde aproximadamente 1 Å (Ångströms) a 200 µm (micrometros), con cerca de 72000 niveles de energíay102000líneas,40000delascualestienenprobabilidadesdetransiciónlistada. NIST Atomic Spectra Database Link:http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/enzymes/ Entidades administradoras: Roman Laskowski, Gail Hutchinson, Alex Michie, Andrew Wallace, Martin Jones, Andrew Martin, Nick Luscombe, Duncan Milburn, Atsushi Kasuya y Janet Thornton. Colegio Universitario London. Enzyme Structures Database 12
  • 14. BasesDE DATOS Descripción: Base de datos sobre estructuras de enzimas conocidas depositadas en el Protein Data Bank (PDB). Ofrece una imagen de cada estructura macromolecular depositada en el PDB y proporciona diagramas esquemáticos de las moléculas en cada estructura y de las interacciones entreellas.LasestructurasdelasenzimassonclasificadasporsunúmeroE.C. Link:http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html Entidadesadministradoras:RichardRobertsyDanaMacelis. Descripción:Coleccióndeinformaciónsobreenzimasderestricción,metilasas,microorganismos de los cuales han sido aisladas, secuencias de reconocimiento, sitios de reconocimiento, especi- ficidad de metilación, disponibilidad comercial de las enzimas y proteínas relacionadas. Incluye referenciaspublicadasynopublicadas,datosdesecuencias,entreotros. REBASE The Restriction Enzyme Database Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed Entidadadministradora:BibliotecaNacionaldeMedicinadelosEstadosUnidos. Descripción: Base de datos bibliográfica más importante de la NLM en las áreas de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. Representa la versión automatizada de tres índices impresos: Index Medicus, Index to Dental Literature e International Nursing Index, y reúne referencias bibliográficas de artículos publicados en más de 4.500 revistas médicas. Medline Bases de Datos 13
  • 15. Link:http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/ Entidadesadministradoras:T.Yamada,H.Nikaidou,J.Sese,A.NakayayS.Morishita. Descripción: Banco de datos sobre información de expresión genética humana y en ratones, reciente o conocida, en varios tipos de tejidos o de células. La primera generación del mapa fue creadaporunasecuenciaaleatoriadeclonesen3bibliotecasdirigidasdecDNA. BodyMap Link:http://crisp.cit.nih.gov/ Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeSalud. Descripción: Base de datos cuya interfaz de usuario permite el acceso a resúmenes de conceptos científicos,tendenciasytécnicasemergentes,proyectosy/oinvestigadoresespecíficos. Computer Retrieval of Information on Scientific Projects Link:http://www.affymetrix.com/community/publications/index.affx Entidadadministradora:Affymetrix. Scientific Publications 14
  • 16. BasesDE DATOS Bases de Datos Descripción: Base de datos con acceso a 4207 resúmenes de publicaciones científicas que utilizan la tecnología GeneChip® (microarreglos y herramientas de alta densidad para ayudar a procesaryanalizarpequeñosfragmentosdeADN)ypublicacionesrelevantesdeacuerdoalinterés investigativo. 15
  • 17. Qu micaí RECURSOS DE INTERNET PARA CIENTÍFICOS DEL ÁREA DE LAS CIENCIAS QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
  • 18. Periodic Table of the Elements Link:http://periodic.lanl.gov/ Entidadadministradora:DivisióndeQuímica.LaboratorioNacionaldeLosAlamos. Link:http://www.chemicalelements.com/ Entidadadministradora:YinonBentor. An Online, Interactive Periodic Table of the Elements Link:http://www.lenntech.com/espanol/tabla-periodica.htm Entidadadministradora:Lenntech. Tabla Periódica Lenntech Link:http://www.prodigyweb.net.mx/degcorp/Quimica/Tabla_Periodica.htm Entidadesadministradoras:HumbertoBrambila,BernardoMayayDerekEstrada. Tabla Periódica De Los Elementos (Behude) 17
  • 19. A Visual Interpretation of the Table of Elements Link:http://www.Chemsoc.Org/Viselements/ Entidadadministradora:DavidWatson.UniversidaddeStrathclyde. Link:http://www.webelements.com/ Entidadadministradora:MarkWinter.UniversidaddeSheffield. Webelements™ Periodic Table Link:http://chemlab.pc.maricopa.edu/periodic/periodic.html Entidadadministradora:ChrisHeilman. The Pictorial Periodic Table Link:http://www.chemicool.com/ Entidadadministradora:DavidHsu.InstitutodeTecnologíadeMassachusetts. Periodic Table Qu micaí 18
  • 20. The Wooden Periodic Table Link:http://www.theodoregray.com/PeriodicTable/ Entidadadministradora:TheodoreGray. Link:http://www.genesismission.org/educate/scimodule/cosmic/ptable.html Entidadadministradora:InstitutodeTecnologíadeCalifornia. Genesis education: modeling the periodic table interactive simulation Link:http://www.orbit.org/perlib/ Entidadadministradora:BoleanDreamInc. Periodic Library Link:http://pubs.acs.org/journals/jacsat/index.html Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica. Journal of the American Chemical Society 19
  • 21. Descripción: Esta revista realiza publicaciones de artículos, comunicaciones al editor, revisiones de libros, y revisiones de software en todos los campos de la química. Facilita acceso a resúme- nesytextoscompletosdeartículosypublicaciones. Link:http://pubs.acs.org/journals/joceah/ Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica. Descripción: Posee contribuciones originales de investigación fundamental en todas las áreas de la teoría y práctica de la química orgánica y bio-orgánica. JOC ofrece artículos completos y notas, asícomomini-revisionesycontribuciones. The Journal of Organic Chemistry Link:http://www.chemistry.org/portal/a/c/s/1/acsdisplay.html?DOC=Chemistry%5cindex.html Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica. Descripción: Chemistry es un diario en línea creado para todo público interesado en las ciencias químicas y la Sociedad Americana de Química. Proporciona acceso a los artículos publicados en unarchivoPDF. Chemistry Magazine Link:http://kinetics.nist.gov/ Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeEstándaresyTecnología. Kinetics Database Qu micaí 20
  • 22. Descripción: Incluye esencialmente todos los resultados sobre cinética reportados para las reacciones químicas. Está diseñada para realizar búsquedas sobre datos de cinética basada en los reactivos específicos involucrados, datos de reacciones resultantes de productos especificados, informacióndetodaslasreaccionesdeunaespecieparticular,ounacombinacióndeéstas. Link:http://www.hclrss.demon.co.uk/ Entidadadministradora:AlanWord. Descripción: Este compendio contiene todos los nombres estándar aprobados por la ISO para los pesticidas químicos, así como aquellos nombres aprobados por entidades nacionales e interna- cionales para pesticidas sin nombres estándar. Más de 1000 de estos nombres oficiales de pesticidas han sido asignados por la Organización Internacional de Estandarización (ISO), en acuerdoconunsistemaestablecidodenomenclatura. Compendium of Pesticide Common Names Link:http://molo.concord.org/database/ Entidadadministradora:FundaciónNacionaldeCiencia(NSF). Descripción: Facilita acceso a las actividades basadas en sus modelos computacionales ató- micos y moleculares. Estas actividades son parcialmente derivadas de proyectos del Concord Consortium patrocinados por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF). Los modelos son principal- mentedeinteraccionesdeátomosymoléculas,obasadosenreglasgenéticas. Molecular Logic 21
  • 23. Link:http://www.chemtopics.com/hlarchiv.htm Entidadadministradora:SteveMarsden. Descripción: Contiene información sobre distintos experimentos en el área de química, incluyen- doprocedimientosyexplicacióndetalladadecadaactividad. Honors Chemistry Experiments Link:http://neon.chem.ox.ac.uk/vrchemistry/ Entidadadministradora:DepartamentodeQuímica.UniversidaddeOxford. Descripción: Laboratorio de simulación tridimensional para la enseñanza de química. Este laboratorio es modelado utilizando técnicas de realidad virtual para la enseñanza de la química y contieneexperimentosinteractivosenmultimedia. Virtual Experiments Link:http://www.chemcollective.org/applets/vlab.php Entidadadministradora:DavidYaron.DepartamentodeQuímica.UniversidadCarnegieMellon. Descripción: Chemistry Collective inicia con el proyecto de Laboratorio Virtual IrYdium cuyo objetivo principal es la simulación flexible con fines educativos. El proyecto evoluciona para crear un escenario de enseñanza de actividades para proveer interactividad, incluyendo materiales con enlacesaconceptosquímicos. The Chemistry Collective Qu micaí 22
  • 24. Link:http://reactorlab.net/ Entidadadministradora:RichardHerz.UniversidaddeCalifornia. Descripción: Este software proporciona simulaciones de una gran variedad de reactivos quími- cos. Permite aprender activamente acerca de los reactivos y reacciones químicas a través del desarrollodeexperimentosyanálisisdedatos. The Reactor Lab Link:http://www.acdlabs.com/products/chem_dsn_lab/chemsketch/ Entidadadministradora:AdvancedChemistryDevelopment,Inc.(ACD/Labs). Descripción: Permite dibujar moléculas en dos dimensiones y transformarlas en 3D, construir ecuaciones químicas, estructuras moleculares y diagramas de laboratorio. Adecuado para poder crearmoléculasdecompuestosorgánicos,experimentarconalgunosinstrumentosdelaboratorio, resolver ejercicios, visualizar u ocultar enlaces y manipular estructuras de Newman escalonadas yeclipsadas. Chemsketch Link:http://openrasmol.org/ RasMol 23
  • 25. Entidadadministradora:RogerSayle. Descripción: Permite visualizar imágenes difíciles de dibujar por ser muy complejas, tales como estructuras de ADN y de proteínas. Proporciona diversos diseños de presentación de moléculas (barras de enlace, barras y esferas, modelo compacto) y permite ver, rotar y animar moléculas y cristales. Admite los formatos moleculares más extendidos: pdb, mol, mdl y xyz, con objeto de ampliarlasposibilidadesdeobtenermoléculaslistasparavisualizardisponiblesenInternet. Link:http://www.mdlchime.com/downloads/downloadable/index.jsp Entidadadministradora:MDLISIS(SistemadeInformaciónCientíficoIntegrado). Descripción: Este módulo de programa (plug-in) ofrece la posibilidad de manipular represen- taciones tridimensionales en los navegadores Internet Explorer y Netscape. Su instalación habilita el navegador para trabajar con archivos de moléculas en formato PDB y permite realizar cambios en la forma de visualización de la molécula, color, activar o desactivar la rotación y rotular los átomos. Chime Link:http://proteinexplorer.org/ Entidadesadministradoras:FundaciónNacionaldeCienciaylaUniversidaddeMassachusetts. Protein Explorer Qu micaí 24
  • 26. Descripción: Programa derivado de RasMol y basado en el plug-in Chime para Netscape. Permite investigar la estructura de macromoléculas y su relación con la función que cumplen, visualizar en tres dimensiones estructuras de proteínas, ADN y macromoléculas, y visualizar interacciones y enlaces. Links:http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html Entidadadministradora:StephenSchimpf. Descripción: Visualizador de estructuras tridimensionales muy fácil de utilizar; ideal para exponer temas como la hibridación debido a la fácil representación de moléculas tridimensionales de compuestosorgánicos. 3-D Angles Link:http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html Entidadadministradora:StephenSchimpf. Descripción: Proporciona modelos tridimensionales de estructuras cristalinas fundamentales fácilmente manejables. Es posible dar vuelta o rotar las células de la unidad de cualquiera de las catorceestructurasdelasredesdeBravis. Crystalline Solids 25
  • 27. Link:http://www.chm.bris.ac.uk/motm/motm.htm Entidadadministradora:PaulMay.UniversidaddeBristol. Descripción: Cada mes una nueva molécula es agregada a la página, en la cual son encontrados varios enlaces que conducen al sitio Web del Departamento de Química de la Universidad o a sitios comerciales en cualquier lugar del mundo, donde pueda ser hallada información sobre la molécula agregada. The Molecule of the Month Link:http://www.planaria-software.com/ Entidadadministradora:MarkThompson.PlanariaSoftwareLLC. Descripción: ArgusLab es un programa de modelación molecular. Consiste en una interfaz de usuario con soporte para visualización de gráficas OpenGL de estructuras de moléculas y realiza- cióndecálculosdemecánicacuánticautilizandoelservidorArgus. ArgusLab Yasara (Yet Another Scientific Artificial Reality Application) Link:http://www.yasara.org/ Entidades administradoras: Gregor Högenauer, Günther Koraimann, Andreas Kungl y Gert Vriend. UniversidaddeGraz,UniversidaddeNijmegen. Qu micaí 26
  • 28. Descripción: Programa de modelación y simulación interactiva en tiempo real con campos de fuerza sumamente exactos de gráficas moleculares, interfaz de usuario intuitiva, gráficas fotorea- lísticas, visualizaciones y dispositivos de entrada con nuevos niveles de interacción de “realidad artificial”. Puede interactuar con las moléculas y trabajar con modelos dinámicos en vez de imá- genesestáticas.Requierelicenciaparagarantizarnuevosdesarrollos,actualizacionesysoporte. Link:http://dasher.wustl.edu/tinker/ Entidadesadministradoras:FundaciónNacionaldeCienciayelInstitutoNacionaldeSalud. Descripción: Software de modelación molecular para mecánicas y dinámicas moleculares, con algunas características especiales para biopolímeros. Posee la habilidad de utilizar cualquiera de varios grupos de parámetros comunes, como Amber (ff94, ff96, ff98 y ff99), CHARMM (19 y 27), Allinger MM (MM2-1991 y MM3-2000), OPLS (OPLS-UA, OPLS-AA y OPLS-AA/L), potenciales polarizablesdeLiamDangysupropiocampodefuerzaatómicopolarizablemultipoloAMOEBA. Tinker (Software Tools for Molecular Design) Link:http://www.nuigalway.ie/cryst/software.htm Entidadadministradora:UniversidadNacionaldeIreland. Descripción: Este software proporciona un sistema integrado de alta calidad para la construcción y modelación de moléculas, maneja PC GAMESS y Tinker, y puede resolver, refinar y examinar pequeñas estructuras de moléculas de cristal. Las películas son efectivas y fáciles de hacer utilizando RASMOV. El software para la simulación de la pauta de Powder y la detección y visualizacióndevacíostambiénestádisponible. Oscail X - Software for Crystallography and Molecular Modelling 27
  • 29. Link:http://jmol.sourceforge.net/ Entidadadministradora:WarrenDeLano. Descripción: Proporciona un conjunto de aplicaciones y visores moleculares. Jmol es un visor de moléculas multiplataforma. JmolApplet es una miniaplicación para el navegador que puede inte- grarse en páginas Web. La aplicación Jmol es un programa autónomo en Java que funciona local- mente en el ordenador, fuera del navegador. JmolViewer es un conjunto de herramientas de desa- rrolloquesepuedeintegrarenotrosprogramasJava. JMOL Link:http://www.3dchem.com/index.asp# Entidadadministradora:KarlHarrison.UniversidaddeOxford. Descripción: Base de datos de estructuras 3D de más de 400 moléculas activas. Permite visualizar las estructuras de pequeñas moléculas, medicamentos, enzimas biológicas, proteínas, ADN, virus en ilustraciones 3D interactivas. Utiliza la tecnología Java de JMOL para mostrar los modelos. Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com JME Molecular Editor Link:http://www.molinspiration.com/jme/index.html Qu micaí 28
  • 30. Entidadadministradora:PeterErtl. Descripción: JME Molecular Editor proporciona herramientas para dibujar o editar moléculas y reacciones y para representar moléculas directamente dentro de una página HTML. El applet puedeserobtenidolibrementedirectamentedesuautoratravésdelcorreoelectrónico. Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/mage.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Programa de vectores 3D para visualización de gráficas tipo "kinemage" utilizado en diversasaplicacionescomoevaluacionesdecalidaddemodeloscristalográficosderayosX.Mage visualiza de forma 3D las relaciones entre los datos en un ambiente interactivo permitiendo la exploraciónabiertaypresentaciónestructurada. 3D Analysis :: Mage Display Software Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/javamage.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Herramienta en Java disponible para visualizar gráficas de tipo “kinemage” a través deInternet. JavaMage 29
  • 31. Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/king.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: King es un sistema interactivo para gráficas de vector tridimensionales. Soporta un grupo primitivo para muchos tipos de gráficos, diagramas, y otras ilustraciones; además su primer usoeramostrarestructurasmacromolecularesparainvestigaciónbiofísica. King Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/prekin.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Prekin prepara kinemages moleculares (archivos de entrada para Mage y King) de archivos en formato PDB coordinados, utilizando opciones de scripts de construcción o especificacionesflexiblesdelusuario. Prekin Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/reduce.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Reduce Qu micaí 30
  • 32. Descripción: Reduce es un programa para agregar hidrógenos a un archivo de estructura de pro- teína del Protein DataBank (PDB). Tanto proteínas como ácidos nucleicos pueden ser procesados, aligualquelosgruposHETmientraslaconectividaddelátomoseaproporcionada. Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Permite la evaluación de paquetes atómicos, dentro o entre las moléculas. Genera “puntos de contacto” donde los átomos están en contacto cercano. Probe lee las coordenadas atómicas de los archivos del Protein Databank (PDB) y escribe una lista de puntos para inclusión en un archivo de tipo kinemage. Alternativamente, la información almacenada puede ser cuantificada y visualizada en una tabla para interacciones de van der Waals, H-bonds y superposiciones atómicas("choques"). Probe Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/kincon.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Kin2Dcont y Kin3Dcont lee listas de valores o coordenadas para producir planos acotados en formato kinemage. Tanto los datos dispersos como los datos uniformes pueden ser acotados.Kin2DcontpuedeinclusoserusadoparaproduciracotacionesenformatoPostScript. Contouring Programs 31
  • 33. Link:http://kinemage.biochem.duke.edu/software/dang.php Entidadadministradora:RichardsonLab. Descripción: Dang lee coordenadas de archivos de estructuras moleculares del Protein DataBank (PDB) y genera una tabla de varias medidas geométricas útiles para cada residuo o base. En su formabásica,generaángulosdiedrales(phi,psi,chi)deahísunombre. Dang Link:http://www.expasy.ch/spdbv/mainpage.html Entidadesadministradoras:GlaxoSmithKlineR&DyelInstitutodeBioinformáticaSwiss. Descripción: Esta aplicación permite analizar varias proteínas al mismo tiempo. Estas pueden ser superpuestas con el objeto de deducir alineamientos estructurales y comparar sus sitios activos y otras partes relevantes. Mutaciones de aminoácidos, enlaces H, ángulos y distancias entre los átomossonfácilesdeobtenergraciasalainterfazdemenúygráficasintuitiva. Swiss-PdbViewer Cells Alive! Link:http://www.cellsalive.com/ Entidadadministradora:JamesSullivan.QuillGraphics. Qu micaí 32
  • 34. Link:http://www.rsc.org/Publishing/CurrentAwareness/AA/index.asp Entidadadministradora:SociedadRealdeQuímica. Descripción: Cerca de 1.400 resúmenes son incluidos mensualmente. Incluye las áreas de cromatografía, electroforesis, espectrometría y métodos radioquímicos; análisis inorgánico, orgá- nico y organometálico; análisis clínico y bioquímico, incluyendo genómica y proteómica; análisis farmacéutico, incluyendo medicamentos y fluidos biológicos; y análisis ambiental, agrícola y de alimentos. Analytical Abstracts Link:http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/cgi-bin/direct_frame_top.cgi?lang=eng Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeCienciayTecnologíaIndustrialAvanzadadeJapón. Descripción: Compendio de datos de caracterización comunes para más de 10000 compuestos. La estructura del compuesto, el espectro 1H NMR (resonancia magnética nuclear), 13C NMR y el espectro de masas pueden ser visualizados al especificar el nombre del compuesto, fórmula molecularonúmeroderegistroCAS. Spectral Database for Organic Compounds SDBS Link:http://www.lib.utexas.edu/thermodex/ ThermoDex 33
  • 35. Entidadadministradora:UniversidaddeTexas. Descripción: Registro de datos termoquímicos y termofísicos para compuestos químicos y otras sustancias. ThermoDex proporciona una lista de manuales con información sobre los compuestos ypropiedadesseleccionadasenlapáginaprincipal. Link:http://ois.nist.gov/pah/ Entidadadministradora:InstitutoNacionaldeEstándaryTecnología. Descripción: Herramienta de ayuda en la identificación de las estructuras químicas y nomen- clatura de 660 hidrocarburos aromáticos policíclicos comunes (PAH). La búsqueda puede realizar- se por nombre y/o peso molecular del compuesto. Las estructuras pueden ser descargadas en formatosmetafileomolfile. Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Structure Index Link:http://www.abinit.org/ Entidadadministradora:GrupoABINIT. Descripción: Permite encontrar la energía total, densidad de carga y estructura electrónica de sistemas compuestos de electrones dentro de la Teoría Funcional de Densidad (DFT). Permite optimizar la geometría de acuerdo con las fuerzas DFT, desarrollar simulaciones moleculares dinámicas utilizando estas fuerzas, o generar matrices dinámicas, cargas efectivas de Born y tensoresdieléctricos,entreotroscálculos. Abinit Qu micaí 34
  • 36. Link:http://www.cafun.de/ Entidadadministradora:AndréHomeyer. Descripción: Cafun permite crear simulaciones de sistemas complejos de una forma sencilla. Cafun es utilizado por estudiantes e investigadores en procesos de prueba de teorías o visualiza- cióndesistemascomplejosparaunamejorcomprensión. Cafun Link:http://www.chemcraftprog.com/ Entidadesadministradoras:GrigoriyZhurkoyDenisZhurko. Descripción: ChemCraft es un software gráfico para desarrollos computacionales en química cuántica y una interfaz gráfica de usuario para los paquetes de software Gamess y Gaussian, permitiendo importar/exportar coordenadas de los átomos en formato texto. Software comercial conlimitacionesenversiónlibre. ChemCraft Link:http://www.biokin.com/dynafit/ Entidadadministradora:BioKinLtd. Descripción: El propósito principal del programa DynaFit es desarrollar regresiones no lineales de cinética química,cinética enzimáticaydatosdeenlaceligandoreceptor.Losdatosexperimentales puedenservelocidadesinicialesdereacciónocurvasdeprogresodereacciones. Program DynaFit 35
  • 37. Qu micaí Link:http://salilab.org/modeller/modeller.html Entidadadministradora:BenWebb.UniversidaddeCalifornia. Descripción: Modeller es usado para homología o modelación comparativa de estructuras tridi- mensionales de proteínas. El usuario proporciona un alineamiento de una secuencia para ser modelado con las estructuras relacionadas conocidas y Modeller calcula automáticamente un modeloquecontengatodoslosátomosnohidrogenados. Modeller Link:http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/ Entidadadministradora:TonSpek. Descripción: Platon es una herramienta cristalográfica versátil que implementa una gran variedad de cálculos geométricos estándar, pruebas, utilidades, gráficas y varios filtros, y la opción SQUEEZEparamanejodesolventes. PLATON Link:http://pymol.sourceforge.net/ Entidadadministradora:DeLanoScientificLLC. Descripción:PyMOLesunsistemagráficomoleculardiseñadoparalavisualizaciónentiemporeal de generación de gráficas moleculares y animaciones de alta calidad. También puede desarrollar muchas otras tareas como la edición de archivos PDB, con fines de apoyo en los procesos de investigación. PyMOL 36
  • 38. RECURSOS DE INTERNET PARA CIENTÍFICOS DEL ÁREA DE LAS CIENCIAS QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
  • 39. Link:http://pubs.acs.org/journals/bichaw/ Entidadadministradora:SociedadAmericanadeQuímica. Descripción: Proporciona los últimos progresos y avances en las áreas de química, bioquímica y biología molecular y celular. Incluye estructura, función y regulación de moléculas biológicamente activas; estructura y expresión del gen; mecanismos bioquímicos; biosíntesis de proteínas; plega- miento de proteínas; relaciones estructura-función de la membrana; bioenergética; e inmuno- química. American Chemical Society Publications: Biochemistry Home Page Link:http://www.jbc.org/ Entidadadministradora:SociedadAmericanaparalaBioquímicayBiologíaMolecular. Descripción: Es publicado semanalmente para un total de 55000 páginas por año de reportes investigativos originales en bioquímica y biología molecular. Proporciona acceso a resúmenes y textoscompletosdepublicaciones. The Journal of Biological Chemistry Link:http://www.jlr.org/ Entidadadministradora:SociedadAmericanaparalaBioquímicayBiologíaMolecular. Journal of Lipid Research 38
  • 40. bioquímica Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto com- pleto) con el objeto de promover la investigación básica en el campo de los lípidos. JLR publica artículos originales y revisiones en toda el área de lípidos biológicos, incluyendo aquellos rela- cionados con bioquímica, biología molecular, biología estructural, biología celular, medicina mo- lecular,ymetabolismo. Link:http://www.genome.ad.jp/dbget/ligand.html Entidadadministradora:KanehisaLaboratoriodeKyoto.UniversidadCentrodeBioinformática. Descripción: Contiene información sobre las sustancias químicas y sus reacciones. Es un banco de datos resultante de la unión de las bases de datos Compound, Drug, Glycan, Reaction, Rpair y Enzyme.Unacopiadesólolecturadela basededatosrelacionalespúblicamenteaccesible. Kegg Ligand Database Link:http://rose.man.poznan.pl/aars/ Entidades administradoras: Maciej Szymanski y Jan Barciszewski de Poznañ. Centro de SupercomputaciónyRedesenPolonia. Descripción: Base de datos de secuencias de aminoacil-tRNA sintetasa. Las entradas obtenidas están basadas en el formato EMBL/Swiss-Prot. En adición a las secuencias de aminoácidos, incluyen el nombre y número de acceso de la secuencia Swiss-Prot, una corta descripción de la secuencia, nombre del organismo y su clasificación taxonómica, así como la información bibliográficabásica. AARS DataBase 39
  • 41. Link:http://brenda.bc.uni-koeln.de/ Entidadadministradora:InstitutodeBioquímica.UniversidaddeCologne. Descripción: Colección de datos sobre enzimas disponible para la comunidad científica. Permite hacer búsquedas por número EC, nombre de la enzima, organismo, o combinación de éstos. Ha sidodesarrolladaenunareddesistemas deinformaciónmetabólicosconenlacesalaexpresiónde enzimas e información de regulación. Disponible libremente para académicos; el uso comercial requierelicencia. Brenda Link:http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/ Entidadadministradora:InstitutodeBioinformáticaEuropeo(EBI). Descripción: Base de datos de sitios activos de enzimas y residuos catalíticos en enzimas de estructura 3D. El acceso a CSA es utilizando códigos PDB, entradas SWISS-PROT o número EC. Cada entrada lista los residuos catalíticos encontrados, utilizando la numeración PDB de residuos, ycadasitioactivopuedeservisualizadoutilizandoRasMol. Catalytic Site Atlas Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/GenomeAtlas/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Genome Atlas Database 40
  • 42. bioquímica Descripción: Atlas de estructuras de ADN para cromosomas y genomas completos. Representa unalmacenamientodinámicopararesultadosdebioinformáticaydatosdesecuencia. Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/EasyGene/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Proporciona una lista de genes predichos dada una secuencia de ADN procariótica. Elusuariosólonecesitaespecificarelorganismoquerecibelasecuenciabuscada. EasyGene 1.0 Server Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ Entidadadministradora:CentroparaelAnálisisdeSecuenciasBiológicas. Descripción: Puede predecir varios genes completos o parciales en una secuencia y sitios de acoplamiento. Si algunas de las características de una secuencia son conocidas, tales como proteínas o elementos repetidos, el programa encontrará la mejor estructura génica bajo estas limitaciones. HMMgene (v. 1.1) Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetGene2/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Este servidor genera predicciones a través de redes neuronales de los sitios de acoplamientodeADNenhumanos,C.elegansyA.thaliana. NetGene2 Server 41
  • 43. Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPGene/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Servidor de predicciones mediante redes neuronales de los sitios de acoplamiento enelADNdeArabidopsisthaliana. NetPlantGene Server Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetStart/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Genera predicciones en redes neuronales del comienzo de la traducción de las secuencias de nucleótidos en vertebrados y Arabidopsis thaliana. NetStart ha sido entrenado en secuenciasdecDNAyporlotanto,tienemejordesempeñoparacDNAyEST. NetStart 1.0 Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Predice los sitios de inicio de transcripción de promotores de vertebrados PoIII en secuencias de ADN. Ha sido desarrollado como una evolución de factores de transcripción simulados que interactúan con secuencias en regiones de promotores. Está construido sobre prin- cipioscomunesalasredesneuronalesyalgoritmosgenéticos. Promoter 2.0 Prediction Server GenePublisher 1.03 Serverr 42
  • 44. bioquímica Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/GenePublisher/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Desempeña análisis de datos automatizado de expresiones génicas en un número diferente de plataformas. Este servidor acepta tablas de genes o archivos Affymetrix CEL como entrada, desarrolla análisis numérico y estadístico, enlaces de los resultados a varias bases de datos,ygeneraunreportedelosresultados. Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/OligoWiz2/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Este servidor realiza un diseño inteligente de oligonucleótidos para microarreglos de ADN. Es implementado como una solución cliente-servidor, lo cual consiste en un fácil uso de la Interfaz Gráfica de Usuario (escrita en Java) que delega las operaciones computacionales inten- sivas a poderosos servidores Multi-CPU ubicados en el Centro para Análisis de Secuencias Biológicas.Esnecesariodescargarlainterfaz. OligoWiz 2 Server Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/SecretomeP/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Predicción de secreciones de proteínas no clásicas. SecretomeP 2.0 produce predicciones ab initio. El método busca un largo número de otros servidores de predicción carac- terísticos para obtener información en varios aspectos de la proteína, los cuales están integrados enlapredicciónfinaldesecreción. SecretomeP 2.0 Server 43
  • 45. Link:http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/ Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica Danés. Descripción: Predice la localización subcelular de proteínas eucarióticas. La asignación de la localización es basada en la predicción de la presencia de cualquiera de las pre-secuencias N- terminales:(cTP),(mTP)o(SP). TargetP 1.1 Server Link:http://www.bioinf.org.uk/abs/seqtest.html Entidadadministradora:AndrewMartin.UniversidadCollegeLondon. Descripción: Esta página permite poner a prueba una secuencia de anticuerpo contra la base de datos de secuencias Kabat. Esto facilita la identificación de potenciales tecnologías de clonación y erroresdesecuenciación. AbCheck - Antibody Sequence Test Link:http://www.123genomics.com/ Entidadadministradora:Grupo123Genomics. Descripción: Este sitio posee enlaces a muchos recursos disponibles en Internet gratuitamente relacionados con genómica y bioinformática. Dentro de las categorías encontradas están Análisis de Secuencias, Bases de Datos de Secuencias, Genes y Proteínas, Revistas y Publicaciones, entre otras. 123Genomics CATH 44
  • 46. bioquímica Link:http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/cath.html Entidadadministradora:UniversidadCollegeLondon. Descripción: Esta base de datos proporciona clasificación jerárquica de dominios de estructuras de proteínas en el banco de datos de proteínas Brookhaven. CATH es una nueva clasificación jerárquica de dominios de estructuras de proteínas, con cuatro niveles principales, Class (C), Architecture(A),Topology(T)yHomologoussuperfamily(H). Link:http://protein.toulouse.inra.fr/prodom/current/html/form.php Entidadadministradora:INRAyCNRS. Descripción: Completo grupo de dominios de familias de proteínas automáticamente generados deunacomparaciónglobaldetodaslasbasesdedatosdesecuenciasdeproteínasdisponibles. Link:http://www.gepasi.org/ Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática de Virginia y el Grupo de Biología CuantitativayBiotecnologíaAnalíticaAberystwyth. Descripción: Gepasi es un paquete de software para la modelación de sistemas bioquímicos. Realizar simulación de cinética de sistemas de reacciones bioquímicas y proporciona un número de herramientas para colocar los modelos en datos, optimizar cualquier función del modelo, desarrollaranálisisdecontrolmetabólicoyanálisisdeestabilidadlineal. Gepasi ProDom 45
  • 47. RECURSOS DE INTERNET PARA CIENTÍFICOS DEL ÁREA DE LAS CIENCIAS QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS estadsticaÍ
  • 48. Link:http://www.itl.nist.gov/div898/software/dataplot/ Entidades administradoras: James Filliben y Alan Heckert. Instituto Nacional de Estándares y Tecnología. Descripción: Software para visualización científica, análisis estadístico, y modelación no lineal. Permite dibujar gráficos 2D, 3D, histogramas, símbolos geométricos y eléctricos, diagramas lógicos, análisis de series de tiempo, cálculos estadísticos y de probabilidad, generación aleatoria denúmerosysimulación,entreotros. Dataplot Link:http://www.cdc.gov/epiinfo/index.htm Entidades administradoras: Epi Info™ Helpdesk y el Centro para Control de Enfermedades y PrevencióndeAtlanta. Descripción: Software de dominio público diseñado para la comunidad mundial de científicos del área de la salud, epidemiología y medicina. Permite desarrollar rápidamente cuestionarios o formas, modificar procesos e ingreso de datos, e incorporar y analizar datos con estadísticas epi- demiológicas,mapasygráficos. EpiInfo AM Statistical Software 47
  • 49. estadsticaÍ Link:http://am.air.org/default.asp Entidadadministradora:InstitutoAmericanoparalaInvestigación. Descripción: Software estadístico que permite analizar datos de muestras complejas, especialmente de mediciones a gran escala. AM proporciona automáticamente errores estándar para las muestras utilizando series de Taylor como método de aproximación, gráficos de barras y líneas,ydiagramasdedensidaddiseñadosparacomparardistribuciones,entreotros. Link:http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4.html Entidades administradoras: Jean Thioulouse, Daniel Chessel y Sylvain Dolédec. Ministerio de AmbienteFrancésyCNRS. Descripción: Software estadístico para análisis multivariable y generación de gráficas. Incluye métodos de análisis espacial de datos, análisis de discriminación y de grupos, métodos de re- gresión lineal incluyendo regresión polinomial, múltiple y regresión ortogonal, métodos de pro- yección,entreotros. ADE4 2004 Assessment Engineering Statistics Link:http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/ Entidadadministradora:NIST/SEMATECH. 48
  • 50. Descripción: Este libro proporciona ayuda a científicos e ingenieros en el proceso de incorporar métodosestadísticosensutrabajodelaformamáseficienteposible. Link:http://www.microsiris.com/MicrOsiris.htm Entidadadministradora:VanEckComputerConsulting. Descripción: Paquete para el manejo de datos y estadísticas. Incluye análisis multivariable de datos nominales, genera distribuciones de frecuencia univariadas y bivariadas y estadísticas relacionadas (incluyendo lambdas, gammas, kappa, taus, chi-cuadrado, y coeficientes Gini), esta- dísticas no paramétricas, análisis de varianza, y análisis de clasificación múltiple (regresión múltipleutilizandopredoctorescategóricos). MicrOsiris Statistical and Data Management Software The Decision Tree for Statistics Link:http://www.microsiris.com/Statistical%20Decision%20Tree/ Entidadadministradora:VanEckComputerConsulting. Descripción: Herramienta de ayuda para seleccionar técnicas estadísticas apropiadas para los propósitos y condiciones de un análisis particular. Es una colección interactiva de páginas Web, la cual realiza una serie de preguntas simples acerca de los datos (número de variables, escala de medida,entreotros)yluegopresentarecomendacionessobrelamejortécnicadeaplicación. Selecting Statistics 49
  • 51. estadsticaÍ Link:http://www.socialresearchmethods.net/selstat/ssstart.htm Entidadadministradora:WilliamTrochim.UniversidadCornell. Descripción: Colección de páginas Web interactivas de ayuda para seleccionar el mejor método analítico sobre los datos. El resultado obtenido de una búsqueda es un examen estadístico o una medida estadística para la situación descrita, proporcionando notas cuando es relevante, y usual- mentesugiereunprogramaestadísticoquepuedeserutilizadopararealizarelanálisis. Link:http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/scientificCal.htm#rmenu Entidadadministradora:HosseinArsham. Descripción: Este sitio es una parte de los objetos de aprendizaje del JavaScript E-labs para la toma de decisiones. En el menú principal son presentadas varias áreas de aplicación: Herra- mientasdedecisiónenEconomía&Finanzas,ModelaciónProbabilísticayEstadística. A Collection of Javascript E-Labs Learning Objects Electronic Textbook Statsoft Link:http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html Entidadadministradora:StatSoftR&D. Descripción: Ofrece entrenamiento en la comprensión y aplicación de la estadística, incluyendo investigación de laboratorio (biomédica, agricultura, entre otros), estadística de negocios, esta- dística para ciencias sociales, minería de datos, ingeniería y control de calidad de aplicaciones, y muchas otras. Presenta una introducción a los elementos conceptuales relevantes y continúa con unaexploraciónmásprofundadeáreasespecíficasdeestadísticayorganizadaspormódulos. 50
  • 52. Link:http://interstat.statjournals.net/ Entidadadministradora:RichardKrutchkoff.InstitutoPolitécnicodeVirginia. Descripción: InterStat es una fuente libre de artículos sobre estadísticas. Pueden ser publicados artículosreferentesacualquieraspectodeinvestigaciónestadísticaométodosinnovadores. Interstat [B/D] The Bayes Linear Programming Language Link:http://fourier.dur.ac.uk:8000/stats/bd/ Entidadesadministradoras:DavidWooffyMichaelGoldstein.UniversidaddeDirham. Descripción: [B/D] es un lenguaje de programación interactivo. Permite realizar un completo análisisdiagnósticoyapriorideproblemasdeestadísticalinealdeBayes. Macanova (A Program for Statistical Analysis and Matrix Algebra) Link:http://www.stat.umn.edu/macanova/ Entidadesadministradoras:GaryOehlertyChristopherBingham.UniversidaddeMinnesota. Descripción: MacAnova es un programa libre para realizar análisis estadístico interactivo. Es particularmente fuerte en (M) ANOVA y modelos lineales e incluye por lo menos ocho archivos de macros para realizar análisis multivariable, análisis de series de tiempo para dominios de tiempo y frecuencia,ydiseñodeexperimentosfactoriales,entremuchasotrascosas. Statistical Calculators Link:http://calculators.stat.ucla.edu/ Entidadadministradora:DepartamentodeEstadística.UniversidaddeCalifornia. 51
  • 53. estadsticaÍ Descripción: Contiene herramientas para realizar cálculos para gran cantidad de funciones de distribución de probabilidad, incluyendo Normal, Bivariada, t Student, Chi-cuadrado, Fisher F, Poisson, Log-normal, Exponencial, Beta, Gamma, Binomial, Multinomial, Cauchy, Gumbel, Lapla- ce,Pareto,Weibull,TriangularyGeométrica,entreotras. Link:http://members.aol.com/johnp71/pdfs.html Entidadesadministradoras:JohnPezzullo. Descripción:Estaherramientapermitecalcularlasfuncionesdedistribucióndeprobabilidadysus inversasparacuatrodelasdistribucionesestadísticasmáscomunes. Probability Distribution Functions The P-Values for the popular distributions Link:http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/pvalues.htm#rbetaden Entidadadministradora:HosseinArsham. Descripción: Presenta programas en JavaScript que calculan los valores P para las distribuciones más ampliamente utilizadas. Entre las funciones evaluadas encontramos: Función de Densidad, Función Total Binomial, Densidad de Chi-cuadrado, Densidad Exponencial, Densidad F de Fisher, K- S: Dos Muestras, Función Total de Poisson, Densidad Estándar Normal, Densidad t de Student y DensidadUniforme. Journal of Statistical Software Link:http://www.jstatsoft.org/ Entidadadministradora:JandeLeeuw.AsociaciónAmericanadeEstadística. 52
  • 54. Descripción: Esta revista publica manuales, guías de usuario y otras formas de descripción de software estadístico, ediciones especiales en asuntos de estadística computacional (editores invitados), una edición especial anual documentando el progreso de mayores proyectos de software estadístico, revisiones de libros en software y estadística computacional y revisiones y comparacionesdesoftwareestadístico. UCLA Statistics Link:http://www.socr.ucla.edu/Applets.dir/OnlineResources.html Entidadadministradora:IvoDinov.UniversidaddeCalifornia. Descripción: Recursos en línea de Probabilidad y Estadísticas: Calculadoras de Distribución de Alta Precisión: Exponencial, Normal, Chi-Cuadrado, Distribución Poisson, Binomial, Normal, T de Student y F, tablas, herramientas para procesamiento de funciones y gráficos, demostraciones conceptuales (Applets), análisis de datos estadísticos de Tiempo Real en línea: WebStat (paquete desoftwareestadísticoenlíneaparaanálisisdedatos)yANOVA. INSTAT An Interactive Statistical Package Link:http://www.rdg.ac.uk/ssc/software/instat/instat.html Entidadadministradora:EscueladeEstadísticaAplicada.UniversidaddeReading. Descripción: Paquete general de estadística útil en la enseñanza de conceptos estadísticos, además de complementar la investigación en cualquier disciplina que requiera el análisis de datos. Incluye características que ayudan a explicar conceptos claves como intervalos de confianza (normalmenteconfusoentrelosusuarios). 53
  • 55. estadsticaÍ Link:http://www.stat.uiowa.edu/~luke/xls/xlsinfo/xlsinfo.html Entidadadministradora:LukeTierney.UniversidaddeMinnesota. Descripción: Lisp-Stat es un ambiente de estadística computacional para análisis de datos, instrucción estadística e investigación, con énfasis en uso de métodos gráficos dinámicos. Un sistema de programación orientado a objetos es usado para implementar el sistema gráfico y también en las representaciones básicas para los modelos estadísticos, como los modelos de regresiónlinealynolinealymodeloslinealesgeneralizados. LISP-STAT Information The R Project for Statistical Computing Link:http://www.r-project.org/ Entidadadministradora:JohnChambers.LaboratoriosBell. Descripción: R es un lenguaje y ambiente para computación estadística y gráfica. R proporciona una amplia variedad de técnicas estadísticas (modelación lineal y no lineal, examen estadístico clásico, análisis de series de tiempo, clasificación, entre otros) y gráficas. Posee gran calidad de publicaciónenlosdiagramasgenerados,incluyendosímbolosmatemáticosyfórmulas. WinIDAMS Link: http://portal.unesco.org/ci/en/ev.phpURL_ID=2070&URL_DO=DO_TOPIC&URL_SECTION =201.html Entidadesadministradoras:UNESCOencooperaciónconexpertosdevariospaíses. 54
  • 56. Descripción:Paquetedesoftwareparalavalidación,manipulaciónyanálisisestadísticodedatos. Ofrece un amplio rango de técnicas de análisis de datos como análisis de regresión, análisis discriminante, análisis clúster, análisis de correspondencias, tipología de segmentación e iterativa, entre otras, componentes interactivos para la construcción de tablas multidimensionales ysupresentacióngráfica,paralaexploracióngráficadedatosyparaanálisisdeseriesdetiempo. IRRISTAT Link:http://www.irri.org/science/software/irristat.asp Entidadadministradora:InstitutoInternacionaldeInvestigaciónRice(IRRI). Descripción: Software para el manejo de datos y análisis estadístico básico de datos experimentales. IRRISTAT ha sido desarrollado primariamente para el análisis de datos de campos agrícolas, pero muchos de sus atributos pueden ser usados para el análisis de datos de otras fuentes. Los módulos principales y facilidades son manejo de datos con hojas de cálculo, editor de texto,análisisdevarianzayRegresiónyCorrelación. VISTA The Visual Statistics System Link:http://forrest.psych.unc.edu/research/ Entidadadministradora:ForrestYoung.UniversidaddeCarolinadelNorte. Descripción: Vista proporciona visualizaciones estadísticas altamente dinámicas e interactivas. La visualización intuitiva de Vista y el acercamiento computacional intensivo en el análisis de los datos estadísticos son diseñados para clarificar su significado, de modo que pueda verse la informacióncontenidaenestosdatos.Poseeinterfaz gráficaestructurada ypermitevisualización 55
  • 57. estadsticaÍ estadísticaunivariadaymultivariadayanálisisdedatos. Gretl Link:http://gretl.sourceforge.net/ Entidades administradoras: Allin Cottrell y Riccardo Lucchetti. Universidad Wake Forest y UniversidaddeAncona. Descripción: Es un paquete de software para análisis econométrico. Posee instrucciones sencillas para realizar contraste de Dickey-Fuller aumentado, contraste de estabilidad estructural de Chow, auto regresiones vectoriales o estimación de modelos ARMA. Estructura de bucles de instruccionesparasimulacionesdeMonteCarloyprocedimientosdeestimacióniterativos. Salstat Statistics Link:http://salstat.sourceforge.net/index.php?index Entidadadministradora:AlanJamesSalmoni. Descripción: Rápido análisis estadístico de datos científicos bajo GPL. SalStat es una aplicación diseñada para el análisis de datos científicos: el tipo de datos comúnmente vistos en psicología, por ejemplo. Puede realizar un rango de pruebas, desde estadística descriptiva hasta análisis de varianzaysusequivalentesnoparamétricos. ZELIG: Everyone's Statistical Software 56
  • 58. Link:http://gking.harvard.edu/zelig/ Entidadesadministradoras:KosukeImai,GaryKingyOliviaLau. Descripción: Zelig un programa fácil de usar que puede estimar, ayudar a interpretar, y presentar losresultadosdeunlargorangodemétodosestadísticos. Biostatistics Link:http://biostatistics.oxfordjournals.org/ Entidadadministradora:UniversidaddeOxford. Descripción: El objetivo de Biostatistic es el avance en las ciencias estadísticas y su aplicación en problemas de salud humana y enfermedades. Biostatistics publica artículos que desarrollan métodos estadísticos innovadores con aplicaciones en la comprensión de salud humana y enfer- medades,incluyendocienciasbiomédicasbásicas. QuickCalcs Link:http://www.graphpad.com/quickcalcs/index.cfm Entidadadministradora:GraphPadSoftware. Descripción: Este sitio contiene libre acceso a calculadoras en líneas para cálculos de radio- actividad,pruebast,ANOVA,entreotros. GraphPad Library Link:http://www.graphpad.com/index.cfm?cmd=library.index 57
  • 59. estadsticaÍ Entidadadministradora:GraphPadSoftware. Descripción: Contiene información de ayuda sobre el análisis de datos dirigido a biólogos (y otros científicos). Esta “biblioteca” contiene artículos y manuales escritos por GraphPad, así como enla- cesaotrossitiosweb. MIX Link:http://tigger.uic.edu/~hedeker/mix.html Entidadesadministradoras:DonaldHedekeryRobertGibbons.UniversidaddeIllinois. Descripción: Incluye programas para realizar regresión lineal, regresión logística para resultados nominalesuordinales,regresióndePoisson,entreotros. VassarStats Link:http://faculty.vassar.edu/lowry/VassarStats.html Entidadadministradora:RichardLowry.VassarCollege. Descripción: Contiene útiles herramientas para el desarrollo de computación estadística. Incluye calculadoras estadísticas, herramientas para el desarrollo de regresiones múltiples, correlación parcial,probabilidadesbinomiales,entreotras. B-Course 58
  • 60. Link:http://b-course.cs.helsinki.fi/ Entidadadministradora:GrupodeSistemasdeComputaciónComplejos.UniversidaddeHelsinki. Descripción: B-Course es una herramienta en línea para el análisis de datos para modelación Bayesiana, en particular dependencia y modelación de clasificación. B-Course puede ser utilizada como una herramienta de análisis para cualquier investigación. Es de libre acceso para propósitos educacionales. BUGS Link:http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/welcome.shtml Entidades administradoras: Imperial College School of Medicine at St Mary's y University of Helsinki. Descripción: BUGS es un software flexible para desarrollar análisis Bayesiano de modelos estadísticos complejos utilizando cadenas de Markov y métodos de Monte Carlo. Es necesario un conocimientopreviodeestadísticaBayesiana. GeoR Link:http://www.est.ufpr.br/geoR/ Entidadesadministradoras:PauloRibeiroyPeterDiggle. Descripción: Este es un paquete para análisis geoestadístico de datos utilizando el software estadísticodelibreaccesoR. 59
  • 61. estadsticaÍ STARS Link:http://stars-py.sourceforge.net/ Entidadadministradora:SergioRey.GrupoSTARS. Descripción: STARS es un paquete de libre acceso diseñado para el análisis de datos reales tomados en un intervalo de tiempo. Une varios métodos recientes de desarrollo de análisis de es- pacio-tiempoenunambientegráfico.Esútilcomoherramientaparaanálisisexploratoriodedatos. SciGraphica Link:http://scigraphica.sourceforge.net/ Entidadadministradora:AdrianFeiguin. Descripción: Aplicación científica para el análisis de datos y gráficas técnicas. Es algo similar a Sigmaplot y pretende ser un clon de la aplicación comercial Microcal Origin. Es de libre acceso y códigoabierto.EstádisponibleparaplataformasLinux. 60
  • 62. Buscadores RECURSOS DE INTERNET PARA CIENTÍFICOS DEL ÁREA DE LAS CIENCIAS QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS RECURSOS DE INTERNET PARA CIENTÍFICOS DEL ÁREA DE LAS CIENCIAS QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
  • 63. Link:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed Descripción: PubMed es un servicio de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos que incluye más de 16 millones de citaciones de artículos biomédicos de MEDLINE y otras revistas de ciencias biológicas. PubMed incluye enlaces al resumen y texto completo de los artículos y otrosrecursosrelacionados. Entrez Pubmed Link:http://www.sciencedirect.com/ Descripción: Science Direct permite el acceso a resúmenes de artículos (texto completo para usuarios registrados) de más de 1400 revistas sobre ciencia, tecnología y medicina mundial de la editorial Elsevier Science, así como de editores asociados, y a los índices de las revistas no suscritas. Además posee acceso a bases de datos bibliográficas y obras integradas en Science Direct. ScienceDirect Link:http://intl.highwire.org/ Descripción: Buscador de publicaciones científicas realizado en colaboración estrecha de científicos, bibliotecarios y editoriales. Mediante la introducción de enlaces entre autores, artículos y citas, capacidades de búsqueda avanzada, imágenes de alta resolución, multimedia e interactividad, las versiones electrónicas ofrecen un notable valor añadido a la información ofrecidaenlasrevistasimpresas. HighWire Press 62
  • 64. Link:http://scholar.google.com/ Descripción: Google Scholar proporciona acceso a literatura científica. Puede realizar búsquedas sobre muchas disciplinas y fuentes: artículos revisados, tesis, libros, resúmenes y artículos aca- démicos, de sociedades profesionales, universidades y otras organizaciones escolares. Google Scholaridentificalainformaciónmásrelevanteenelcampodelainvestigacióncientífica. Google Scholar Scirus Link:http://www.scirus.com/srsapp/ Descripción: Scirus es el más completo buscador de ciencia en Internet. Busca sobre 200 millones de páginas de ciencia en la Web, permitiendo hallar los principales datos científicos, escolares, técnicos y médicos, encontrar los últimos informes, artículos revisados, patentes, re- vistasyobtenerfuncionalidadesúnicasdiseñadasparacientíficoseinvestigadores. Cheminfo Link:http://www.indiana.edu/~cheminfo/search.html Descripción: CHEMINFO (Chemical Information Sources) es diseñado para buscar y enseñar cómo utilizar recursos de información química en Internet y otros lugares. Integra sitios Web de la UniversidaddeIndianaconinformaciónquímicasignificativa. Buscadores 63
  • 65. Link:http://www.ojose.com/ Descripción: OJOSE (Online JOurnal Search Engine) es un poderoso buscador científico que permite hacer exploraciones en diferentes bases de datos utilizando un solo campo de búsqueda. Es posible encontrar, descargar o comprar publicaciones científicas (revistas, artículos, reportes deinvestigación,entreotros)enmásde60basesdedatosdiferentes. WWW.OJOSE.COM: Online Journals Search Engine Link:http://www.sciseek.com/ Descripción: SciSeek ofrece noticias de carácter científico desde su página principal, e indudablemente el mayor interés radica en su amplio directorio, que consta de numerosos temas y subtemas. Los resultados del buscador incluyen la dirección de la página web, el número de votos que ha conseguido por parte de los usuarios y los comentarios realizados por los mismos visitantes. Sciseek Link:http://www.biologybrowser.org/ Descripción: BiologyBrowser, es un sitio web desarrollado por BIOSIS. Ofrece recursos de informaciónsobrecienciasbiológicasparalacomunidad.BiologyBrowserpresentaoportunidades únicas para los científicos, como la utilización de recursos de información exclusivamente producidosporBIOSISyencuentrainformaciónrelevantedeotrasfuentesyenlaces. Biology Browser 64
  • 66. Link:http://www.chmoogle.com/ Descripción: Chmoogle, un buscador que permite localizar productos químicos, sus propiedades físicas e incluso su estructura, utilizando java o, en el peor de los casos, de un software específico disponiblesóloparaWindows. Chmoogle Chemedia Link:http://www.chemedia.com/ Descripción: ElíndicetemáticodeChemediaesundirectoriojerárquicosobrediferentestemasde ciencia y tecnología, con aproximadamente 125000 palabras indexadas y 53000 páginas con informaciónrelevantealmacenadaenlabasededatos. ChemIndustry.com Link:http://chemindustry.com/ Descripción: ChemIndustry.com es el directorio y buscador más completo para sustancias químicas y profesionales relacionados con la industria. La base de datos de sitios web incluye más de 45000 industrias químicas y entidades relacionadas y contiene textos completos de millones depáginas. Buscadores 65
  • 67. Link:http://ull.chemistry.uakron.edu/erd/ Descripción: Esta base de datos permite al usuario obtener información de cualquiera de los 23495 químicos peligrosos o entradas 'genéricas' basadas en la búsqueda. Las fórmulas son presentadasenformatoHillyformatodescriptivoparalavisualización. The Chemical Database Link:http://www.ccoo.es/istas/rs/rsrx.htm Descripción: Risctox ofrece informacióntoxicológica sobre productos de utilizaciónindustrial que actualmente incluye unos 1.000 productos, para cada uno de los cuales es ofrecida la siguiente información: descripción de las características del producto, límites de exposición, efectos agudosycrónicosydatossobreefectosmedioambientales. Risctox Link:http://www.biocrawler.com/ Descripción: Biocrawler.com es una enciclopedia escrita con varios colaboradores. El propósito deestaesofrecerunaenciclopediacientíficacomprendidaentodoslosnivelescientíficos. Biocrawler 66
  • 68. Link:http://www.sciencemag.org/ Descripción: Science es la revista de ciencia líder en la presentación de noticias científicas, e investigacióndevanguardiaEnlíneaestándisponibleslosresúmenesdesuspublicaciones(textos completosrequierensuscripción). Science ChemSpy.com Link:http://www.chemspy.com/index.html Descripción: ChemSpy.com es el primer portal para búsqueda de sustancias químicas y bases de datos, ofreciendo información de sustancias químicas en la industria a científicos, ingenieros, estudiantesycualquierinteresado. Molecular and Cellular Proteomics Link:http://www.mcponline.org/ Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto completo) de artículos y revisiones cortas sobre las propiedades estructurales y funcionales de las proteínas y su expresión, particularmente con respecto al desarrollo. Hace énfasis en la determinación de cómo la presencia o ausencia de proteínas afecta las respuestas biológicas y cómolainteraccióndeproteínasconcélulasasociadaspermitesufuncionamiento. Buscadores 67
  • 69. Link:http://biome.ac.uk/ Descripción: BIOME es un catálogo de libre acceso de recursos de Internet seleccionados y evaluados Internet para estudiantes, lectores e investigadores en las áreas de ciencias médicas y de la salud, enfermería y profesiones de la salud afines, salud animal y ciencias veterinarias, inves- tigaciónbiológicaybiomédica,elmundonatural,agriculturayalimentación. BIOME Link:http://www.fiz-chemie.de/guides/ Descripción: ChemGuide y MedPharmGuide son buscadores de información en Internet en el área de la química, medicina y farmacología. PublishersGuide es un buscador en servidores web de publicaciones,instituciones,sociedades,etc.,enlasáreasdecienciaytecnología. FIZ CHEMIE Berlin Guides Link:http://e-biosci.embo.org:8080/index.jsp Descripción: Buscador en los campos de biología molecular, y genética, con enfoque en genética humana.Labúsquedaesrealizadasobreliteratura,patentes,genesyproteínas. E-BioSci 68
  • 70. Link:http://infomine.ucr.edu/ Descripción: INFOMINE es una biblioteca virtual de herramientas de Internet relevantes para estudiantes e investigadores. Contiene recursos de Internet útiles tales como bases de datos, revistas electrónicas, libros electrónicos, boletines, listas de correo, artículos, directorio de inves- tigadores,entreotros. INFOMINE BioHunt Link:http://au.expasy.org/BioHunt/ Descripción: Buscador de Biología Molecular. Permite realizar búsquedas simples y avanzadas es áreasespecíficastalescomoeducación,organizaciones,gobierno,entreotras. Bioinformatics.Net Link:http://www.bioinformatics.vg/cgi-bin/odp/index.cgi Descripción: Bioinformatics.Net es un catálogo en línea de información en ciencias biológicas, especializado en herramientas de bioinformática. Dirigido a biólogos moleculares y otros cien- tíficos biológicos trabajando en investigación científica, incluyendo biotecnología y medicina, tantoenlaindustriacomoeláreaacadémica. Buscadores 69
  • 71. Link:http://www.atgenetics.com/genetics/ Descripción: Buscador de Internet de información y recursos en las áreas de Genética y Biología Molecular. @Genetics YAHOO SEARCH Link:http://wdcm.nig.ac.jp/ Descripción: WFCC-MIRCEN proporciona un completo directorio de bases de datos en las líneas demicrobiosycélulas,yenlacesaproyectossobrebiodiversidad,biologíamolecularygenómica. WFCC-MIRCEN Link:http://www.organic-chemistry.org/ Descripción:BuscadordeInternetparareaccionesorgánicas. Organic-Chemistry Link:http://dir.yahoo.com/Science/chemistry/ Descripción:InformaciónsobrequímicaenelDirectoriodeYahoo. 70
  • 72. METACRAWLER Link:http://www.metacrawler.com Descripción: MetaCrawler utiliza la tecnología innovadora de búsqueda de los buscadores más representativos en Internet, incluyendo Google, Yahoo! Search, MSN Search, Ask Jeeves, About, MIVA, LookSmart y muchos otros. Con un simple click, MetaCrawler busca los mejores resultados obtenidosdelacombinacióndelosmejoresbuscadoresmundiales. GALAXY Link:http://galaxy.einet.net/galaxy/Science.html Descripción: Galaxy emplea la mejor tecnología y experticia humana para organizar la infor- mación de tal forma que sea comprensible y altamente relevante con respecto a las necesidades de los usuarios. Como parte del proceso, son eliminados sitios con contenido para adultos, sitios ofensivosyconpocaoningunainformacióndevalor. ASK JEEVES Link:http://www.askjeeves.com Descripción: Ask.com ofrece muchas características y herramientas innovadoras para ayudar a conseguirinformaciónrápidayfácilmente. Buscadores 71
  • 73. Diseño, diagramación e ilustración Angélica Semacarit R.