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- 11. Base estructural de aril-2-aminopirimidina Figura 15. Representación bidimensional de la base estructural de los inhibidores CDK2. 33
- 12. DISEÑO DEL MAPA FARMACOFÓRICO BASADO EN LA ESTRUCTURA CRISTALINA DE CDK2 Figura 18. Mapa farmacofórico basado en la estructura cristalina de 4KD1. 37
- 13. DISEÑO DEL MAPA FARMACOFÓRICO BASADO EN LA ESTRUCTURA CRISTALINA DE CDK2 Figura 19. Mapa farmacofórico basado en la estructura cristalina de 2W05. 38 4KD1: Val007, Asn136, Leu148 2W05: Val029, Ile035, Phe146, y Leu296 Ala144 Leu134 Leu83 HOH HOH HOH Lys89 Asp86 Val18 Ala31 Val64 Ile10
- 14. Mapa farmacofórico basado en la estructura cristalina de 2W05 39 MAPAS FARMACOFÓRICO DISEÑADOS Mapa farmacofórico basado en la estructura cristalina de 4KD1 Mapa farmacofórico basado en ligandos
- 15. SITIO ACTIVO DE LA PROTEÍNA Aminoácidos centrales de GridBox Agua catalítica Grid Box Coordenadas Dimensiones Leu 83 H2O 1190 X: -8.492 X: 60 Asp 86 H2O 1196 Y: -12.126 Y: 60 H2O 1168 Z: -14.199 Z: 60 Figura 20. CDK2 en complejo con Roniciclib (Código PDB 5IEV) 49
- 16. Valor de ΔG= -10.18 kcal/mol 51 Figura 22. Modo de unión de Glipizida en el sitio de reconocimiento de CDK2. Diagrama de interacciones 2D y (der.) estructura conformacional más estable del complejo ligando-proteína (izq.). SULFONILUREA
- 17. FÁRMACOS PROMISORIOS PARA REPOSICIONAMIENTO Valor de ΔG= -10.13 kcal/mol 52 Figura 23. Modo de unión de Rilpivirina en el sitio de reconocimiento de CDK2. Diagrama de interacciones 2D y (der.) estructura conformacional más estable del complejo ligando-proteína (izq.).
- 18. FÁRMACOS PROMISORIOS PARA REPOSICIONAMIENTO Valor de ΔG= -9.88 kcal/mol 53 Figura 24. Modo de unión de Netarsudil en el sitio de reconocimiento de CDK2. Diagrama de interacciones 2D y (der.) estructura conformacional más estable del complejo ligando-proteína (izq.).
- 19. FÁRMACOS PROMISORIOS PARA REPOSICIONAMIENTO Valor de ΔG= -9.82 kcal/mol 54 Figura 25. Modo de unión de Cefprozil en el sitio de reconocimiento de CDK2. Diagrama de interacciones 2D y (der.) estructura conformacional más estable del complejo ligando-proteína (izq.). betalactama
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Notas del editor
- Inhibidores de CDK2 Competitivos a ATP