Este documento discute las dificultades que tienen los estudiantes y docentes con el concepto de estructura molecular. Los estudiantes tienen problemas para entender la tridimensionalidad de las moléculas y relacionar las fórmulas químicas con representaciones particuladas. También tienen dificultades identificando el tipo de hibridación de átomos de carbono. Los docentes, por otro lado, tienen problemas representando la tridimensionalidad de moléculas orgánicas en el aula y conciben erróneamente que los modelos son reales.