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Instituto Tecnológico de Tijuana                                                             Computación Evolutiva




                                          GPLab ToolBox
Demoant.m


Conjunto de             Antright, antleft, antmove.
terminales
Conjunto de             Antif, antprogn2, antprogn3.
funciones
Fitness                 Antfitness. Regresa el fitness del individuo medido como el numero de bolitas
                        comidas en el camino artificial de la hormiga durante 400 time step. También
                        regresan los resultados obtenidos en cada caso del fitness.
Funcionamiento          Crea programas (arboles) con los parámetros definidos para nodos y hojas.
                        Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos iniciando
                        en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol con el método
                        de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles usando los operadores
                        disponibles.
Parametros              Para definir la selección por ruleta:
                        p.sampling='roulette'

                        Tipo de elitismo utilizado:
                        p.elitism='keepbest'

                        Define el número de             individuos    para   la    próxima   generación:
                        p.survival='fixedpopsize'

                        El cruce de dos puntos:
                        p=setoperators(p,'crossover',2,2)

                        Las funciones o nodos internos:
                        p= setfunctions(p,'antif',2,'antprogn2',2,'antprogn3',3)

                        Las terminales u hojas:
                        p=setterminals(p,'antright','antleft','antmove')

                        La forma cómo calcula el fitness individual basado en los datos con los
                        procedimientos indicados en los parámetros:
                        p.calcfitness='antfitness'

                        Retorna el primer estado de la generación de individuos para la siguiente
                        generación, es lo mismo que fixedpopsize pero en diferente contexto:
                        p.lowerisbetter=0

                        Regresa una matriz con las pistas de la comida y el número de
                        puntos(comida) que pueden ser encontradas en el camino:
                        p.files2data='anttrail'

                        Carga los datos predefinidos en los archivos de texto:
                        p.datafilex='santafetrail.txt'
                        p.datafiley='santafepellets.txt'

                        Aplica calculo de diversidad en la población (hamming ó uniquegen):
                        p.calcdiversity={}
                                                                                               Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana                                                       Computación Evolutiva




                        Calcula la complejidad:
                        p.calccomplexity=0

                        Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en el
                        procedimiento es una adaptación:
                        p.depthnodes='1'
Éxito                   La hormiga encuentra un buen porcentaje de la comida expuesta en la matriz
                        (trail food).

Mejor individuo:

Best individual:
Population size:       20
Maximum generations:        10
Best occurred in generation: 6
Best individual found:
antprogn2(antprogn2(antif(antprogn2(antleft,antright),antleft),antmove),antprogn2(antleft,antprogn2(
antprogn3(antleft,antleft,antmove),antmove)))
Fitness:            21/89
Depth:              5
Nodes:              16




                                                                                         Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana   Computación Evolutiva




                                     Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana                                                                    Computación Evolutiva



Demo.m


Conjunto de terminales             X1
Conjunto de funciones              Times, Plus, Cos, Minus, Sin, Mylog
Fitness                            Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la
                                   diferencias entre los obtenidos y los resultados esperados en un
                                   conjunto de datos Data.
Funcionamiento                     Crea programas (arboles) con los parámetros definidos para nodos y
                                   hojas. Problema de regresión simbólica con adaptación automática de
                                   operadores de probabilidad. Hace plots de las corridas en tiempo de
                                   ejecución y finaliza con el ploteo de dos adicionales post-corridas.
                                   Tipo de población inicial (fullinit) con identificadores únicos iniciando
                                   con LASTID+1 y aleatoriamente crea representaciones de árbol
                                   construyendo con el método “Full” de Koza para inicialización de
                                   arboles (depth = MAXLEVEL), usando los operadores disponibles.
Parametros                         Define operadores de cruce y mutación. El cruce utiliza de dos puntos y
                                   la mutación regresa un individuo creado por la sustitución de un
                                   subárbol aleatorio por un nuevo árbol creado aleatoriamente.
                                   p=setoperators(p,'crossover',2,2,'mutation',1,1)

                                   Tipo de probabilidad de los operadores es variable:
                                   p.operatorprobstype='variable'
                                   p.minprob=0

                                   Obtiene los datos de los archivos de texto:
                                   p.datafilex='quartic_x.txt'
                                   p.datafiley='quartic_y.txt'

                                   Usar datos de prueba, utilice valores de 0 y 1:
                                   p.usetestdata=0

                                   Calcula la diversidad de la población, la diversidad es calculada como
                                   el porcentaje de individuos que cuenta para todos los diferentes
                                   genotipos de la población.
                                   p.calcdiversity={'uniquegen'}

                                   Utiliza valores de 0 y 1:
                                   p.calccomplexity=1

                                   Ploteo de las gráficas:
                                   p.graphics={'plotfitness','plotdiversity','plotcomplexity','plotoperators'}

                                   Significa que el limite no es en profundidad sino en número de nodos:
                                   p.depthnodes='2'

Éxito                              Encuentra un programa (árbol) que resuelve el problema del polinomio
                                   de cuarto grado.




                                                                                                      Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana   Computación Evolutiva



Mejor individuo:

  Creating generation 25
  #Individuals: 50
  UsedResources: 954
  Best so far: 1052
  Fitness:    0.497978
  Depth:      6
  Nodes:       25




                                     Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana                                                                 Computación Evolutiva



Demoparity.m


Conjunto de terminales             X1, X2.
Conjunto de funciones              nand, nor, and, or.
Fitness                            Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la
                                   diferencias entre los obtenidos y los resultados esperados en un
                                   conjunto de datos Data.
Funcionamiento                     Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos
                                   iniciando en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol
                                   con el método de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles
                                   usando los operadores disponibles.
Parametros                         Para definir la selección por torneo:
                                   p.sampling='tournament'

                                   Tipo de elitismo utilizado:
                                   p.elitism='replace'

                                   Define el número de individuos para la próxima generación:
                                   p.survival='fixedpopsize'

                                   El cruce de dos puntos:
                                   p=setoperators(p,'crossover',2,2)

                                   Las funciones o nodos internos:
                                   p=setfunctions(p,'nand',2,'nor',2,'and',2,'or',2)

                                   Las terminales u hojas:
                                   p=setterminals(p)

                                   Carga los datos predefinidos en los archivos de texto.
                                   p.datafilex='parity3bit_x.txt'
                                   p.datafiley='parity3bit_y.txt’

                                   Tipo de probabilidad de los operadores es definido como fijo:
                                   p.operatorprobstype='fixed'

                                   Aplica calculo de diversidad en la población:
                                   p.calcdiversity={'hamming'}

                                   Calcula la complejidad:
                                   p.calccomplexity=1

                                   Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en
                                   el procedimiento es una adaptación:
                                   p.depthnodes='1'

                                   Ploteo de los datos:
                                   p.graphics={'plotfitness','plotdiversity','plotcomplexity'}

Éxito                              Encontrar al menos un programa que de una solución buena para
                                   resolver el problema.


                                                                                                   Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana   Computación Evolutiva



Mejor individuo:

Creating generation 20
  #Individuals: 50
  UsedResources: 1670
  Best so far: 527
  Fitness:    1.000000
  Depth:      7
  Nodes:       55




                                     Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana                                                             Computación Evolutiva



Demoplexer.m


Conjunto de terminales             Variables (X1,X2,X3,X4,X5,X6,X7,X8,X9,X10,X11.)
Conjunto de funciones              And, or, not,myif.
Fitness                            Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la diferencias
                                   entre los obtenidos y los resultados esperados en un conjunto de datos
                                   Data.
Funcionamiento                     Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos iniciando
                                   en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol con el método
                                   de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles usando los operadores
                                   disponibles.
Parametros                         Devuelve los individuos de la población ordenada por su orden de aparición
                                   de la próxima generación, asegurando que el número total de nodos de
                                   estas personas no exceda STATE.MAXRESOURCES, o el aumento de
                                   STATE.MAXRESOURCES.
                                   p.survival='resources';

                                   Recursos dinamicos:
                                   p.dynamicresources='2'
                                   p.veryheavy=0

                                   Funciones o nodos internos:
                                   p=setfunctions(p,'and',2,'or',2,'not',1,'myif',3);

                                   Regresa parámetros actualizados variables donde la información de las
                                   terminales (nombre-aridad es siempre nulo) será el conjunto de datos
                                   proveído en los argumentos de la función TERMNAME. Algunas terminales
                                   pueden ser conjunto al mismo tiempo que agregan algunos argumentos
                                   TERMNAME.
                                   p=setterminals(p);

                                   Operadores utilizados, es cruce de dos puntos:
                                   p=setoperators(p,'crossover',2,2);

                                   Probabilidad del tipo de cruce es fijo:
                                   p.operatorprobstype='fixed';

                                   Archivos de datos:
                                   p.datafilex='11-multiplexer_x.txt';
                                   p.datafiley='11-multiplexer_y.txt';

                                   Calcula diversidad:
                                   p.calcdiversity={};
                                   p.calccomplexity=0;
                                   p.fixedlevel=0;
                                   p.dynamiclevel='0'

                                   Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en el
                                   procedimiento es una adaptación.
                                   Depthnodes='1'

                                   Tipo de seleccion:
                                   p.sampling='tournament'

                                                                                               Xochilt Ramírez García
Instituto Tecnológico de Tijuana                                                         Computación Evolutiva



                                   p.tournamentsize=0.05

                                   Hits por default:
                                   p.hits='[100 0]'

                                   Desactiva el ploteo de graficas:
                                   p.graphics={}

Éxito                              Encuentra al menos un programa (árbol) que resuelve el problema.

Mejor individuo:

   Creating generation 20 -
   (decreasing max resources to 3148)
   #Individuals: 29
   MaxResources: 3148
   UsedResources: 3148
   Best so far: 1279
   Fitness:    640.000000
   Depth:      8
   Nodes:       28




                                                                                           Xochilt Ramírez García

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  • 1. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva GPLab ToolBox Demoant.m Conjunto de Antright, antleft, antmove. terminales Conjunto de Antif, antprogn2, antprogn3. funciones Fitness Antfitness. Regresa el fitness del individuo medido como el numero de bolitas comidas en el camino artificial de la hormiga durante 400 time step. También regresan los resultados obtenidos en cada caso del fitness. Funcionamiento Crea programas (arboles) con los parámetros definidos para nodos y hojas. Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos iniciando en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol con el método de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles usando los operadores disponibles. Parametros Para definir la selección por ruleta: p.sampling='roulette' Tipo de elitismo utilizado: p.elitism='keepbest' Define el número de individuos para la próxima generación: p.survival='fixedpopsize' El cruce de dos puntos: p=setoperators(p,'crossover',2,2) Las funciones o nodos internos: p= setfunctions(p,'antif',2,'antprogn2',2,'antprogn3',3) Las terminales u hojas: p=setterminals(p,'antright','antleft','antmove') La forma cómo calcula el fitness individual basado en los datos con los procedimientos indicados en los parámetros: p.calcfitness='antfitness' Retorna el primer estado de la generación de individuos para la siguiente generación, es lo mismo que fixedpopsize pero en diferente contexto: p.lowerisbetter=0 Regresa una matriz con las pistas de la comida y el número de puntos(comida) que pueden ser encontradas en el camino: p.files2data='anttrail' Carga los datos predefinidos en los archivos de texto: p.datafilex='santafetrail.txt' p.datafiley='santafepellets.txt' Aplica calculo de diversidad en la población (hamming ó uniquegen): p.calcdiversity={} Xochilt Ramírez García
  • 2. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Calcula la complejidad: p.calccomplexity=0 Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en el procedimiento es una adaptación: p.depthnodes='1' Éxito La hormiga encuentra un buen porcentaje de la comida expuesta en la matriz (trail food). Mejor individuo: Best individual: Population size: 20 Maximum generations: 10 Best occurred in generation: 6 Best individual found: antprogn2(antprogn2(antif(antprogn2(antleft,antright),antleft),antmove),antprogn2(antleft,antprogn2( antprogn3(antleft,antleft,antmove),antmove))) Fitness: 21/89 Depth: 5 Nodes: 16 Xochilt Ramírez García
  • 3. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Xochilt Ramírez García
  • 4. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Demo.m Conjunto de terminales X1 Conjunto de funciones Times, Plus, Cos, Minus, Sin, Mylog Fitness Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la diferencias entre los obtenidos y los resultados esperados en un conjunto de datos Data. Funcionamiento Crea programas (arboles) con los parámetros definidos para nodos y hojas. Problema de regresión simbólica con adaptación automática de operadores de probabilidad. Hace plots de las corridas en tiempo de ejecución y finaliza con el ploteo de dos adicionales post-corridas. Tipo de población inicial (fullinit) con identificadores únicos iniciando con LASTID+1 y aleatoriamente crea representaciones de árbol construyendo con el método “Full” de Koza para inicialización de arboles (depth = MAXLEVEL), usando los operadores disponibles. Parametros Define operadores de cruce y mutación. El cruce utiliza de dos puntos y la mutación regresa un individuo creado por la sustitución de un subárbol aleatorio por un nuevo árbol creado aleatoriamente. p=setoperators(p,'crossover',2,2,'mutation',1,1) Tipo de probabilidad de los operadores es variable: p.operatorprobstype='variable' p.minprob=0 Obtiene los datos de los archivos de texto: p.datafilex='quartic_x.txt' p.datafiley='quartic_y.txt' Usar datos de prueba, utilice valores de 0 y 1: p.usetestdata=0 Calcula la diversidad de la población, la diversidad es calculada como el porcentaje de individuos que cuenta para todos los diferentes genotipos de la población. p.calcdiversity={'uniquegen'} Utiliza valores de 0 y 1: p.calccomplexity=1 Ploteo de las gráficas: p.graphics={'plotfitness','plotdiversity','plotcomplexity','plotoperators'} Significa que el limite no es en profundidad sino en número de nodos: p.depthnodes='2' Éxito Encuentra un programa (árbol) que resuelve el problema del polinomio de cuarto grado. Xochilt Ramírez García
  • 5. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Mejor individuo: Creating generation 25 #Individuals: 50 UsedResources: 954 Best so far: 1052 Fitness: 0.497978 Depth: 6 Nodes: 25 Xochilt Ramírez García
  • 6. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Demoparity.m Conjunto de terminales X1, X2. Conjunto de funciones nand, nor, and, or. Fitness Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la diferencias entre los obtenidos y los resultados esperados en un conjunto de datos Data. Funcionamiento Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos iniciando en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol con el método de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles usando los operadores disponibles. Parametros Para definir la selección por torneo: p.sampling='tournament' Tipo de elitismo utilizado: p.elitism='replace' Define el número de individuos para la próxima generación: p.survival='fixedpopsize' El cruce de dos puntos: p=setoperators(p,'crossover',2,2) Las funciones o nodos internos: p=setfunctions(p,'nand',2,'nor',2,'and',2,'or',2) Las terminales u hojas: p=setterminals(p) Carga los datos predefinidos en los archivos de texto. p.datafilex='parity3bit_x.txt' p.datafiley='parity3bit_y.txt’ Tipo de probabilidad de los operadores es definido como fijo: p.operatorprobstype='fixed' Aplica calculo de diversidad en la población: p.calcdiversity={'hamming'} Calcula la complejidad: p.calccomplexity=1 Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en el procedimiento es una adaptación: p.depthnodes='1' Ploteo de los datos: p.graphics={'plotfitness','plotdiversity','plotcomplexity'} Éxito Encontrar al menos un programa que de una solución buena para resolver el problema. Xochilt Ramírez García
  • 7. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Mejor individuo: Creating generation 20 #Individuals: 50 UsedResources: 1670 Best so far: 527 Fitness: 1.000000 Depth: 7 Nodes: 55 Xochilt Ramírez García
  • 8. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva Demoplexer.m Conjunto de terminales Variables (X1,X2,X3,X4,X5,X6,X7,X8,X9,X10,X11.) Conjunto de funciones And, or, not,myif. Fitness Regfitness. El fitness del individuo medido como la suma de la diferencias entre los obtenidos y los resultados esperados en un conjunto de datos Data. Funcionamiento Tipo inicial de la población (rampedinit) con identificadores únicos iniciando en LASTID+1 aleatoriamente crea representaciones de árbol con el método de Koza “Half and Half” para inicialización de arboles usando los operadores disponibles. Parametros Devuelve los individuos de la población ordenada por su orden de aparición de la próxima generación, asegurando que el número total de nodos de estas personas no exceda STATE.MAXRESOURCES, o el aumento de STATE.MAXRESOURCES. p.survival='resources'; Recursos dinamicos: p.dynamicresources='2' p.veryheavy=0 Funciones o nodos internos: p=setfunctions(p,'and',2,'or',2,'not',1,'myif',3); Regresa parámetros actualizados variables donde la información de las terminales (nombre-aridad es siempre nulo) será el conjunto de datos proveído en los argumentos de la función TERMNAME. Algunas terminales pueden ser conjunto al mismo tiempo que agregan algunos argumentos TERMNAME. p=setterminals(p); Operadores utilizados, es cruce de dos puntos: p=setoperators(p,'crossover',2,2); Probabilidad del tipo de cruce es fijo: p.operatorprobstype='fixed'; Archivos de datos: p.datafilex='11-multiplexer_x.txt'; p.datafiley='11-multiplexer_y.txt'; Calcula diversidad: p.calcdiversity={}; p.calccomplexity=0; p.fixedlevel=0; p.dynamiclevel='0' Significa que el limite no es en profundidad, pero el numero de nodos en el procedimiento es una adaptación. Depthnodes='1' Tipo de seleccion: p.sampling='tournament' Xochilt Ramírez García
  • 9. Instituto Tecnológico de Tijuana Computación Evolutiva p.tournamentsize=0.05 Hits por default: p.hits='[100 0]' Desactiva el ploteo de graficas: p.graphics={} Éxito Encuentra al menos un programa (árbol) que resuelve el problema. Mejor individuo: Creating generation 20 - (decreasing max resources to 3148) #Individuals: 29 MaxResources: 3148 UsedResources: 3148 Best so far: 1279 Fitness: 640.000000 Depth: 8 Nodes: 28 Xochilt Ramírez García