Los seguimientos en el SIUCE son las actividades que realiza el establecimiento educativo después del primer reporte para hacer seguimiento al caso y verificar que se cumplan los protocolos. Para cerrar un caso se deben registrar al menos tres seguimientos, y los casos enviados a la Policía o al ICBF sólo se cerrarán cuando estas entidades registren sus propios seguimientos. El SIUCE permite reportar seguimientos al ICBF para gestionar casos tipo II y reporta automáticamente casos tipo III a la Policía Nacional.