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Patrones de variación adaptativa de
          cultivares nativos:
implicaciones para el cambio climático




  Hugo Perales Rivera, El Colegio de la Frontera Sur, San
  Cristóbal, Chiapas, México (hperales@ecosur.mx)
           Kristin Mercer, Ohio State University,
           Columbus, Ohio, EUA
Conservación in situ de cultivares nativos

• Característica común en centros
  de origen.
• La mayor parte de la semilla maíz
  sembrada en México es producida
  por los agricultores.
   – El 75% de la semilla de es de la cosecha
     de los agricultores (Aquino et al.1999).
      • Parte reciclada y creolizada.
• Los subsidios para la conservación
  in situ del maíz (desde 2010) llegan
  a ~ 0.15% de la conservación de
  facto.
   – No hay concesiones a los cultivares
     nativos.
                                                Figura: B. Benz 1997.
Evolución de cultivos
• Darwin propuso tres mecanismos:
  – Selección metódica.
     • Científicos (y técnicos), sistemática, objetivos especificados.
       Posiblemente algunos agricultores.
     • Se formalizó a finales del siglo XIX y ha sido dominante desde
       la segunda mitad del siglo XX.
  – Selección inconsciente (de los agricultores).
     • Ambiente agrícola, agricultores, principalmente involuntario
       (sin objetivo explicito).
     • Dominante hasta el fin del siglo XIX.
     • La conservación in situ es el producto de este proceso.
  – Selección natural (“siempre operando”).
     • Directa en semillas de agricultores.
     • Indirecta en semillas comerciales.
“Mantenimiento del proceso evolutivo”
• Evolución de cultivos
   – Selección metódica
   – Selección inconsciente (de los agricultores)
   – Selección natural (“siempre operando”)

• Continuación de los agricultores como agentes efectivos
  en el proceso evolutivo de los cultivos.
   – Hemos perdido la imaginación de que esto es posible por la
     hegemonía de la selección metódica (y ahora biotecnología)
   – Podrán realmente los fitomejoradores y biotecnólogos dominar
     todos los ambientes.
• Los cultivares nativos que se siembran son la “solución
  evolutiva” de los tres mecanismos para los ambientes
  naturales y socio-económicos.
Selección y flujo de genes
                               Flujo de genes homogeniza,
 Diferenciales de selección   pero introduce nueva variación


                                           A



                                      A’        A*


Clausen et al. 1947
Naturaleza evolutiva dinámica
• Fuerzas evolutivas naturales y humanas
 Procesos evolutivos Naturales              Mediados por
                                            humanos
 Flujo de genes     Hibridización,          Redes de semilla
                    movimiento de semilla
 Selección          Por ambiente            Para caracteres de
                                            interés y por manejo
 Deriva, mutación                           Tamaño de
                                            población

 •   Afecta evolución y caracteres de poblaciones
 •   Produce patrones de diversidad a través del paisaje
Maíz: Selección
• Natural: p.ej. a
  mayores elevaciones
  y latitudes hay una
  asociación del gen
  vgt1, que contribuye
  precocidad en
  floración.
• Humana: algún           (Ducroq et al., 2008)
                          Diferencia entre selección aleatoria y por agricultores
  cambio en                Atributo               Blanc         Chianquiahuitl
  poblaciones, pero        Altura de planta           ns                ns
  aparentemente baja       Altura de mazorca          *                 *
  heredabilidad (Soleri    Peso seco aéreo            ns                ns
  et al. 2000).            Rendimiento                ns                ns
                                                           (Louette and Smale, 2000)
Maiz: flujo de genes
                                                           100%




                                  Frequency of seed lots
                                                           80%
• La comunidad (familia                                    60%
                                                                                                                                                                     Out of state
                                                                                                                                                                     Commercial

  y conocidos)                                             40%

                                                           20%
                                                                                                                                                                     Other community
                                                                                                                                                                     Community

  comparten la mayor                                        0%




                                                                             Indigenous




                                                                                                     Indigenous




                                                                                                                             Indigenous




                                                                                                                                                        Indigenous
                                                                  Mestizos




                                                                                          Mestizos




                                                                                                                  Mestizos




                                                                                                                                             Mestizos
  parte de las semillas,
  pero algunos flujos de                                                 0-900            900-1400 1400-2000 2000-2500

  mayor distancia.                                         Origen de semilla and Ethnic group
                                                                Altitude class (masl)
                                                                                      en Chiapas
                                                                                                                                          (Brush and Perales, 2007)

• Aislamiento por
  distancia estructura
  diversidad genética
  neutra.
                 Correlaciones para
                 accesos de las
                 Americas                                                                                                            (Vigouroux et al., 2008)
Cambio climático: efectos en la productividad
 de cultivares nativos y en su conservación




• ¿Qué podemos esperar?
  – Expectativas teóricas.
  – Factores que pueden cambiar a través de
    cultivos y regiones.
  – Experimentación (maíz en Chiapas).
                                              Figure 10.8
Expectativas teóricas

• Mejor posibilidad: alta diversidad genética
  amortigua cambios.
• Peor posibilidad: adaptación local hace
  vulnerables a las variedades nativas.
• Procesos evolutivos gobiernan respuesta:
   – Plasticidad fenotípica
   – Adaptación y flujo de genes
   – Extinción local => pérdida de poblaciones y razas


                         (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
Plasticidad fenotípica
• Cambios en morfología, fenología o fisiología
   – No se requieren cambios genéticos.
   – Plasticidad fenotípica adaptativa: puede mantener
     adecuación (fitness).
• Restricciones en la plasticidad en respuesta a
  cambios en múltiples variables ambientales.
   – Por ejemplo, zacate Pseudoroegneria spicata: respuesta
     fisiológica a humedad y temperatura => restricción
     fisiológica al responder a dos factores (Fraser et al.
     2009).
                         (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
Adaptación
• Puede permitir que los cultivares nativos mantengan
  productividad
• Evidencia de cambio evolutivo al clima,




Evolución en mijo perla de floración
                                       Frecuencias de alelo PHYC
más temprana en respuesta a
condiciones más secas.                           (Vigoroux et al. 2011)
Adaptación

• ¿Podrán las poblaciones evolucionar
  suficientemente rápido?            (Jump and Penuelas 2005, Shaw et al 2012)   .
  – Respuesta a selección: R=sh2
     • s = presión de selección, h2 = heredabilidad
     • Requiere suficiente variación en loci importante para
       productividad bajo nuevas condiciones
  – Restricciones
     • Correlaciones genéticas negativas entre caracteres bajo
       selección o presiones de selección contradictorias.

                          (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
El flujo de genes
• El flujo de genes puede proveer de la variación necesaria,
  pero puede no evitar la pérdida de poblaciones o
  reducciones en extensión de hábitats.

                              •   Poblaciones en las orillas de un
                                  gradiente climático pueden requerir
                                  adquisición de fenotipo “f”, que no
                                  existía en la población.

                              •   Si las poblaciones en las orillas pueden
                                  migrar podrían mantener adecuación
                                  bajo condiciones similares a las
                                  previas.

                              •   Si el clima cambia muy rápido y las
                                  poblaciones no pueden migrar estas
                                  tienen que evolucionar o se perderán.

                                                  (Davis and Shaw 2001)
Posible extinción local
• Las poblaciones no son suficientemente plásticas, o no
  pueden evolucionar suficientemente rápido
  =>decremento de poblaciones
• Respuestas de los agricultores
   – Cambio de semillas y fuentes de semillas, pérdida de poblaciones
       • Apoyo para modificar acceso en los sistemas de semillas
   – Deja de sembrar cultivo particular
• Cambios en la percepción de la utilidad
   – Factores sociales, culturales, económicos
• Pérdida de variación genética dentro de cultivar, pérdida
  de cultivar, pérdida de especie
                                   (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
Desenlace depende de
• Amplitud de distribución a través de gradientes ambientales
• Patrones de variación genética dentro y entre poblaciones del
  cultivo
   – Síndromes de polinización, sexual o asexual
   – Sistemas de semillas
• Intensidad y variabilidad de presiones de selección
   – Variación en condiciones ambientales puede seleccionar para plasticidad
• Introgresión de genes de cutivares nativos o comerciales

 Se requiere investigar posible respuesta de
 cultivares nativos.
El maíz en México
• ¿Cómo es la adaptación local de los cultivares
  nativos?
• ¿Qué tan bien podrían responder los cultivares
  nativos frente a ambientes nuevos?




                                     R. Hijmans, not published
Distribución de cultivares dominantes
                en Chiapas
     n = 69            10           28           8                     Frecuencias promedio de lotes
   100
                                                                       de semilla por comunidad (n)
    90
                                                          Cubano
                                                                       para muestra entre 2000-2004.
    80

    70                                                    Zapalote

    60                                                    Tehua

    50
                                                          Tepecintle
    40
                                                          Olotillo
    30
                                                          Oloton
    20
                                                          Tuxpeño
    10
    0                                                     Comiteco
              0-900    900-1400   1400-2000   2000-2500


         Altitudinal class (masl)



• Adaptación altitudinal fuerte                                            Tuxpeño Comiteco Olotón
• Algún grado de adaptación local
Muestra y diseño de experimento


 2100 msnm
                                                               Temp Max media


             1500 msnm



         800 msnm


                50 m de objetivo
              3 comunidades/ambiente                           Ppt anual media

              3 agricultores/comunidad



  Tres jardines recíprocos, 4 repeticiones, datos por planta
  Cruzas recíprocas (hxm, mxh) entre dos colectas por raza
Adaptación local



                    Adecuación ajustada (g/plt)
                                                  120

Adecuación                                        100
ajustada (aa)                                     80

aa=s x r                                          60                                             Highland
s = probabilidad                                                                                 Midland
                                                  40
de producir                                                                                      Lowland
semilla                                           20
r = rendimiento
                                                   0
                                                        Lowland   Midland       Highland
                                                                  Jardín

    • Condiciones más calidad reducen productividad de
      cultivares semi-cálidos y templados.
                                                                            (Mercer y Perales, no publicado
Probabilidad de producir semilla

Cada raza tiene mayor                                   1
rendimiento y semillas más


                             Probabilidad de producir
                                                  0.8
grandes en su jardín local
                                                  0.6


                                      semilla
                                                  0.4

                                                  0.2

                                                        0
                                                            Lowland   Midland   Highland
                                                                      Jardín


   • La probabilidad de producir semilla de cultivares de
     clima cálido es siempre alta, pero dan menos semillas y
     más chicas en clima templado.          (Mercer y Perales, no publicado
Existe variación significativa entre
                                              poblaciones
                           140
                                                                  LL1
                                  Poblaciones clima cálido
Adjusted Fitness (g/plt)




                           120                                    LL2

                                                                         • Similitud, con variación
                                                                  LL3
                           100
                                                                  LL4
                                                                  LL5
                            80
                                                                  LL6
                                                                           de interés
                            60
                                                                  LL7
                            40                                    LL8
                                                                  LL9
                                                                         • Algunos cultivares de
                            20
                                                                           altura son similares a
                             0
                           140                                             patrón semi-calido,
Adjusted Fitness (g/plt)




                                                                  HL19
                           120   Poblaciones clima templado                otros más sensibles a
                                                                  HL20
                           100

                            80
                                                                  HL21
                                                                           temperatura
                                                                  HL22
                            60

                            40
                                                                  HL23
                                                                  HL24
                                                                         • Más variación en sus
                            20                                    HL25     ambientes locales que en
                                                                  HL26
                             0
                                                                  HL27
                                                                           ambientes foráneos
                                  Lowland    Midland   Highland
                                            Garden
Híbridos entre ambientes: posible vía
                                          para el cambio climático
                              140

                                                                                 • Los híbridos pueden ser
Adecuación ajustada (g/plt)




                              120

                              100

                              80
                                                                                   intermedios
                                                                    Highland
                              60                                    High x Mid   • Cual es la planta madre
                              40                                    Mid x High

                              20                                    Midland
                                                                                   importa
                               0                                                 • Posibilidad de incorporar
                                    Lowland    Midland   Highland
                              140
                                               Garden
                                                                                   alelos para temperatura
Adecuación ajustada (g/plt)




                              120

                              100
                                                                                   en cultivares templados
                              80
                                                                                    – ¿Seguir con retrocruzas o
                                                                    Highland
                              60                                    High x Low
                                                                                      fraternos?
                              40                                    Low x High
                                                                    Lowland
                                                                                 • Mejoramiento evolutivo
                              20

                               0
                                                                                   y/o participativo
                                     Lowland   Midland   Highland
                                               Garden
Investigación necesaria (entre otra)
• Encontrar caracteres y genes importantes para
  adaptación y respuestas plásticas a ambientes
  nuevos.
• Cuantificar adaptación de cultivares nativos al
  cambio climático y sus tasas.
   – Experimentalmente
   – Comparaciones históricas (vs. colectas en bancos) en
     ambientes con cambio climático registrado
• Producir este tipo de conocimiento para cultivos
  mayores en centros de origen

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  • 1. Patrones de variación adaptativa de cultivares nativos: implicaciones para el cambio climático Hugo Perales Rivera, El Colegio de la Frontera Sur, San Cristóbal, Chiapas, México (hperales@ecosur.mx) Kristin Mercer, Ohio State University, Columbus, Ohio, EUA
  • 2. Conservación in situ de cultivares nativos • Característica común en centros de origen. • La mayor parte de la semilla maíz sembrada en México es producida por los agricultores. – El 75% de la semilla de es de la cosecha de los agricultores (Aquino et al.1999). • Parte reciclada y creolizada. • Los subsidios para la conservación in situ del maíz (desde 2010) llegan a ~ 0.15% de la conservación de facto. – No hay concesiones a los cultivares nativos. Figura: B. Benz 1997.
  • 3. Evolución de cultivos • Darwin propuso tres mecanismos: – Selección metódica. • Científicos (y técnicos), sistemática, objetivos especificados. Posiblemente algunos agricultores. • Se formalizó a finales del siglo XIX y ha sido dominante desde la segunda mitad del siglo XX. – Selección inconsciente (de los agricultores). • Ambiente agrícola, agricultores, principalmente involuntario (sin objetivo explicito). • Dominante hasta el fin del siglo XIX. • La conservación in situ es el producto de este proceso. – Selección natural (“siempre operando”). • Directa en semillas de agricultores. • Indirecta en semillas comerciales.
  • 4. “Mantenimiento del proceso evolutivo” • Evolución de cultivos – Selección metódica – Selección inconsciente (de los agricultores) – Selección natural (“siempre operando”) • Continuación de los agricultores como agentes efectivos en el proceso evolutivo de los cultivos. – Hemos perdido la imaginación de que esto es posible por la hegemonía de la selección metódica (y ahora biotecnología) – Podrán realmente los fitomejoradores y biotecnólogos dominar todos los ambientes. • Los cultivares nativos que se siembran son la “solución evolutiva” de los tres mecanismos para los ambientes naturales y socio-económicos.
  • 5. Selección y flujo de genes Flujo de genes homogeniza, Diferenciales de selección pero introduce nueva variación A A’ A* Clausen et al. 1947
  • 6. Naturaleza evolutiva dinámica • Fuerzas evolutivas naturales y humanas Procesos evolutivos Naturales Mediados por humanos Flujo de genes Hibridización, Redes de semilla movimiento de semilla Selección Por ambiente Para caracteres de interés y por manejo Deriva, mutación Tamaño de población • Afecta evolución y caracteres de poblaciones • Produce patrones de diversidad a través del paisaje
  • 7. Maíz: Selección • Natural: p.ej. a mayores elevaciones y latitudes hay una asociación del gen vgt1, que contribuye precocidad en floración. • Humana: algún (Ducroq et al., 2008) Diferencia entre selección aleatoria y por agricultores cambio en Atributo Blanc Chianquiahuitl poblaciones, pero Altura de planta ns ns aparentemente baja Altura de mazorca * * heredabilidad (Soleri Peso seco aéreo ns ns et al. 2000). Rendimiento ns ns (Louette and Smale, 2000)
  • 8. Maiz: flujo de genes 100% Frequency of seed lots 80% • La comunidad (familia 60% Out of state Commercial y conocidos) 40% 20% Other community Community comparten la mayor 0% Indigenous Indigenous Indigenous Indigenous Mestizos Mestizos Mestizos Mestizos parte de las semillas, pero algunos flujos de 0-900 900-1400 1400-2000 2000-2500 mayor distancia. Origen de semilla and Ethnic group Altitude class (masl) en Chiapas (Brush and Perales, 2007) • Aislamiento por distancia estructura diversidad genética neutra. Correlaciones para accesos de las Americas (Vigouroux et al., 2008)
  • 9. Cambio climático: efectos en la productividad de cultivares nativos y en su conservación • ¿Qué podemos esperar? – Expectativas teóricas. – Factores que pueden cambiar a través de cultivos y regiones. – Experimentación (maíz en Chiapas). Figure 10.8
  • 10. Expectativas teóricas • Mejor posibilidad: alta diversidad genética amortigua cambios. • Peor posibilidad: adaptación local hace vulnerables a las variedades nativas. • Procesos evolutivos gobiernan respuesta: – Plasticidad fenotípica – Adaptación y flujo de genes – Extinción local => pérdida de poblaciones y razas (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
  • 11. Plasticidad fenotípica • Cambios en morfología, fenología o fisiología – No se requieren cambios genéticos. – Plasticidad fenotípica adaptativa: puede mantener adecuación (fitness). • Restricciones en la plasticidad en respuesta a cambios en múltiples variables ambientales. – Por ejemplo, zacate Pseudoroegneria spicata: respuesta fisiológica a humedad y temperatura => restricción fisiológica al responder a dos factores (Fraser et al. 2009). (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
  • 12. Adaptación • Puede permitir que los cultivares nativos mantengan productividad • Evidencia de cambio evolutivo al clima, Evolución en mijo perla de floración Frecuencias de alelo PHYC más temprana en respuesta a condiciones más secas. (Vigoroux et al. 2011)
  • 13. Adaptación • ¿Podrán las poblaciones evolucionar suficientemente rápido? (Jump and Penuelas 2005, Shaw et al 2012) . – Respuesta a selección: R=sh2 • s = presión de selección, h2 = heredabilidad • Requiere suficiente variación en loci importante para productividad bajo nuevas condiciones – Restricciones • Correlaciones genéticas negativas entre caracteres bajo selección o presiones de selección contradictorias. (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
  • 14. El flujo de genes • El flujo de genes puede proveer de la variación necesaria, pero puede no evitar la pérdida de poblaciones o reducciones en extensión de hábitats. • Poblaciones en las orillas de un gradiente climático pueden requerir adquisición de fenotipo “f”, que no existía en la población. • Si las poblaciones en las orillas pueden migrar podrían mantener adecuación bajo condiciones similares a las previas. • Si el clima cambia muy rápido y las poblaciones no pueden migrar estas tienen que evolucionar o se perderán. (Davis and Shaw 2001)
  • 15. Posible extinción local • Las poblaciones no son suficientemente plásticas, o no pueden evolucionar suficientemente rápido =>decremento de poblaciones • Respuestas de los agricultores – Cambio de semillas y fuentes de semillas, pérdida de poblaciones • Apoyo para modificar acceso en los sistemas de semillas – Deja de sembrar cultivo particular • Cambios en la percepción de la utilidad – Factores sociales, culturales, económicos • Pérdida de variación genética dentro de cultivar, pérdida de cultivar, pérdida de especie (Mercer y Perales 2010, Evolutionary Applications)
  • 16. Desenlace depende de • Amplitud de distribución a través de gradientes ambientales • Patrones de variación genética dentro y entre poblaciones del cultivo – Síndromes de polinización, sexual o asexual – Sistemas de semillas • Intensidad y variabilidad de presiones de selección – Variación en condiciones ambientales puede seleccionar para plasticidad • Introgresión de genes de cutivares nativos o comerciales Se requiere investigar posible respuesta de cultivares nativos.
  • 17. El maíz en México • ¿Cómo es la adaptación local de los cultivares nativos? • ¿Qué tan bien podrían responder los cultivares nativos frente a ambientes nuevos? R. Hijmans, not published
  • 18. Distribución de cultivares dominantes en Chiapas n = 69 10 28 8 Frecuencias promedio de lotes 100 de semilla por comunidad (n) 90 Cubano para muestra entre 2000-2004. 80 70 Zapalote 60 Tehua 50 Tepecintle 40 Olotillo 30 Oloton 20 Tuxpeño 10 0 Comiteco 0-900 900-1400 1400-2000 2000-2500 Altitudinal class (masl) • Adaptación altitudinal fuerte Tuxpeño Comiteco Olotón • Algún grado de adaptación local
  • 19. Muestra y diseño de experimento 2100 msnm Temp Max media 1500 msnm 800 msnm 50 m de objetivo 3 comunidades/ambiente Ppt anual media 3 agricultores/comunidad Tres jardines recíprocos, 4 repeticiones, datos por planta Cruzas recíprocas (hxm, mxh) entre dos colectas por raza
  • 20. Adaptación local Adecuación ajustada (g/plt) 120 Adecuación 100 ajustada (aa) 80 aa=s x r 60 Highland s = probabilidad Midland 40 de producir Lowland semilla 20 r = rendimiento 0 Lowland Midland Highland Jardín • Condiciones más calidad reducen productividad de cultivares semi-cálidos y templados. (Mercer y Perales, no publicado
  • 21. Probabilidad de producir semilla Cada raza tiene mayor 1 rendimiento y semillas más Probabilidad de producir 0.8 grandes en su jardín local 0.6 semilla 0.4 0.2 0 Lowland Midland Highland Jardín • La probabilidad de producir semilla de cultivares de clima cálido es siempre alta, pero dan menos semillas y más chicas en clima templado. (Mercer y Perales, no publicado
  • 22. Existe variación significativa entre poblaciones 140 LL1 Poblaciones clima cálido Adjusted Fitness (g/plt) 120 LL2 • Similitud, con variación LL3 100 LL4 LL5 80 LL6 de interés 60 LL7 40 LL8 LL9 • Algunos cultivares de 20 altura son similares a 0 140 patrón semi-calido, Adjusted Fitness (g/plt) HL19 120 Poblaciones clima templado otros más sensibles a HL20 100 80 HL21 temperatura HL22 60 40 HL23 HL24 • Más variación en sus 20 HL25 ambientes locales que en HL26 0 HL27 ambientes foráneos Lowland Midland Highland Garden
  • 23. Híbridos entre ambientes: posible vía para el cambio climático 140 • Los híbridos pueden ser Adecuación ajustada (g/plt) 120 100 80 intermedios Highland 60 High x Mid • Cual es la planta madre 40 Mid x High 20 Midland importa 0 • Posibilidad de incorporar Lowland Midland Highland 140 Garden alelos para temperatura Adecuación ajustada (g/plt) 120 100 en cultivares templados 80 – ¿Seguir con retrocruzas o Highland 60 High x Low fraternos? 40 Low x High Lowland • Mejoramiento evolutivo 20 0 y/o participativo Lowland Midland Highland Garden
  • 24. Investigación necesaria (entre otra) • Encontrar caracteres y genes importantes para adaptación y respuestas plásticas a ambientes nuevos. • Cuantificar adaptación de cultivares nativos al cambio climático y sus tasas. – Experimentalmente – Comparaciones históricas (vs. colectas en bancos) en ambientes con cambio climático registrado • Producir este tipo de conocimiento para cultivos mayores en centros de origen