1. Induced topological changes in DNAcomplexes: influence of DNA sequencesand small molecule structures Pontifica Bolivariana University Mariacamila Foronda Campuzano – Andres Duarte Ruiz Medicine Students Molecular Biology 2011

2. AUTHORS Rebecca A. Hunt, ManojMunde, ArvindKumar, Mohamed A. Ismail, Abdelbasset A. Farahat, Reem K. Arafa, MartialSay, Adalgisa Batista-Parra, Denise Tevis, David W. Boykin and W. David Wilson*

3. INTRODUCTION

4. DNA STRUCTURE

6. Doublechain

8. MATERIALES Y METODOS Compuestos de unión al ADN Los compuestos fueron seleccionados por la prueba de detección basada en las modificaciones sistemáticas a cada una de las unidades moleculares de la DB75.

9. MATERIALES Y MÉTODOS Oligonucleótidos del AND

10. Oligonucleótidos del AND Secuencias dobles de ADN usadas

11. MATERIALES Y METODOS Ligamientos La reaccion fue incubada por 20 minutos a 65°C, seguido de enzimas desactivadoras por 25 minutos

12. MATERIALES Y MÉTODOS Gel de electroforesis Permite separar especies químicas (ácidos nucleídos o proteínas) a lo largo de un campo eléctrico en función de su tamaño y de su carga eléctrica Los ligamientos fueron separados usando poliacrilamida. La electroforesis fue hecha a por 140 minutos a 25°C

13. MATERIALES Y METODOS Biosensores

14. RESULTADOS FIGURA 2 A5 muestran un aumento de la movilidad (fv) Las secuencias ATATA tienen una movilidad reducida (fa) DB75 no efectos topológicos detectables en T3A2 en estas condiciones(Fros) El DB75 aumenta la movilidad de los AAATT en una medida aún mayor que con A5(fn)

15. RESULTADOS FIGURA 2

16. Resultados figura 3 DB921 redujo la movilidad de los cuatro dúplex cis-ligado de interés por cantidades similares en ambos ensayos y los resultados son bastante diferentes de aquellos con DB75 TTTAA y ATATA hay unas manchas de las bandas en la figura 3a que no están presentes en la Figura 3B

17. RESULTADOS FIGURA 3

18. RESULTADOS FIGURA 4

19. Discussion

20. Discussion

21. BIBLIOGRAFIA Hunt RA, Munde M, Kumar A, Ismail MA, Farahat AA, Arafa RK, Say M, Batista-Parra A, et al. Inducedtopologicalchanges in DNA complexes: influence of DNA sequences and smallmoleculestructures. NucleicAcids Res. 2011 Jan 25. DNA [Internet]. Medellin en: Google: 2011 [Febrero 12 de 2011]. Disponible en: http://www.google.com/images?hl=es&q=dna&wrapid=tlif129773830691310&um=1&ie=UTF-8&source=og&sa=N&tab=wi&biw=1003&bih=394 Geles de Electroforésis [Internet]. Medellin en: Google: 2011 [Febrero 11 de 2011. Disponible en: http://javeriana.edu.co/Facultades/Ciencias/neurobioquimica/libros/celular/electroforesis.html

22. Por: Mariacamila Foronda Campuzano

23. Conclusions Thisstudyisveryimportanttoevitsomeantiparasitichuman deseases since ADN structure Wehavetosee deseases sincethe molecular point of view, because i thinkitseasilierto trate