Este documento trata sobre bioinformática y resume sus principales áreas de investigación como alineamiento de secuencias, predicción de genes y estructuras de proteínas. Explica que la bioinformática aplica tecnología computacional para el análisis y gestión de datos biológicos y clasifica los servicios bioinformáticos básicos como búsquedas en bases de datos, herramientas de análisis y alineamientos múltiples.
2. Contenidos
Unidad 1 Unidad 2
Información
Introducción a la biológica en formato
computación
electrónico
Unidad 3 Unidad 4
Métodos Métodos
computacionales en computacionales en
secuencias estructuras
genéticas genéticas
Unidad 5
Predicción de
estructuras de
proteínas
3. Unidad N 1
La Bioinformática
• es la aplicación de tecnología de computadores a la
gestión y análisis de datos biológicos.
• Los términos bioinformática, biología
computacional y, en ocasiones, biocomputación,
son utilizados en muchas situaciones como
sinónimos.
• proporciona la interpretación de los datos
experimentales e importantes pistas para seguir la
investigación experimental.
4. Las principales áreas de investigación en
bioinformática incluyen:
• Alineamiento de secuencias
• Predicción de genes
• Montaje del genoma
• Alineamiento estructural de
proteínas
• Predicción de estructura de
proteínas
• Predicción de la expresión génica
• Interacciones proteína-proteína
• Modelado de la evolución
5. Los servicios bioinformáticos básicos
pueden clasificarse en:
•Servicios de obtención de información en
línea (consultas a bases de datos, por
ejemplo).
•Herramientas de análisis (por ejemplo,
servicios que den acceso a EMBOSS).
•Búsquedas de similitudes entre secuencias
(servicios de acceso a FASTA o BLAST, por
ejemplo).
•Alineamientos múltiples de secuencias
(acceso a ClustalW o T-Coffee).
•Análisis estructural (acceso a servicios de
alineamiento estructural de proteínas, por
ejemplo).
• Servicios de acceso a literatura
especializada y ontologías
6. Unidad N 2
BASE DE DATOS
Buena parte del trabajo en bioinformática
consiste en la construcción y/o explotación
de bases de datos de información biológica.
Se usan, por ejemplo para:
• Añadir o buscar información
(“anotaciones”)
• Buscar similitudes o patrones
• Hacer predicciones
–De estructura o función en
proteínas
–De genes en genomas
7. Para qué se utilizan las bases de datos
•Búsqueda de información.
• Por palabra clave, números de acceso,
autores...
•Búsqueda de homologías
• ¿Hay secuencias igual o parecidas a la
mía ?
•Búsqueda de patrones
• ¿Mi secuencia contienen patrones
conocidos?
•Predicciones
•¿Puedo encontrar proteínas parecidas a
la mía, pero con función conocida?
8. Tipos de bases de datos
Existen cientos de BD en número tan elevado que no es
práctico enumerarlas .
Por el tipo de información que contienen distinguimos:
•Bases de datos bibliográficas
•Bases de datos taxonómicas
•Bases de datos de nucleótidos
•Bases de datos genómicas
•Bases de datos de proteinas
•Bases de datos de microarrays
9. Referencias
Source Flick
Title"Figure 3“
Owner Libertas Académica
Licence http://creativecommons.org/licenses/by/2.0
Source Flick
Title” Singularity University Banner - Biotecnology and
Bioinformatics“
Owner David Orban
Licence http://creativecommons.org/licenses/by/2.0
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combina dos de ...
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