Una aproximación a lo que es la biología de sistemas y la biología. sintética
Conferencia ofrecida en la Universidad de la Salle, sede chapinero Auditorio F100, Ed. Fundadores.
Ciclo de Conferencias Departamento de Ciencias Básicas.
Introducción a la Química de los sistemas biológicos - Organización de la cát...Quimica_introductorio
Este documento presenta la organización de la cátedra de Introducción a la Química de los Sistemas Biológicos en la Universidad Nacional del Comahue. La asignatura tiene 4 horas semanales con 1 hora de teoría y 3 horas de práctica en grupos. Los estudiantes deben aprobar 3 exámenes parciales y 3 trabajos experimentales para promocionar sin examen final. Para aprobar con examen final deben aprobar los parciales y trabajos. También pueden rendir un examen libre sin cursada.
Introducción a la Química de los sistemas biológicos - Programa analítico 2008Quimica_introductorio
Este documento presenta la introducción a un curso de Química de Sistemas Biológicos. Explica que la química es fundamental para comprender los procesos biológicos y ha permitido mejoras en la calidad de vida. El curso aplicará conceptos de química general, inorgánica y orgánica a sistemas biológicos para que los estudiantes puedan interpretar procesos en organismos vivos.
This document discusses systems biology and the revolution in biotechnology. It provides a brief history of major developments in biotechnology from Edward Jenner's discovery of vaccination in the late 18th century to modern therapeutic cloning and gene therapy. It then discusses how systems biology takes a holistic approach using multidisciplinary teams to conduct research in cell function and dynamics. The goal is to develop mathematical models of important biological systems using techniques like metabolic flux analysis.
Este documento presenta una breve descripción de la asignatura de Bioquímica impartida en la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad de Carabobo. Describe la estructura organizacional del departamento de Bioquímica, la distribución de las clases teóricas y prácticas, el sistema de evaluación, las normas para las clases y el laboratorio, y los medios de contacto recomendados.
Este documento trata sobre ecología y ecosistemas. Explica que la ecología estudia las interacciones entre organismos vivos y su ambiente. Define conceptos como población, relaciones interespecíficas, ecosistema, biomas terrestres y acuáticos, cadenas alimentarias y tróficas, y el flujo de energía y materiales a través de los ecosistemas.
Este documento ofrece información sobre cómo publicar investigaciones en las mejores revistas académicas. Explica cómo identificar las revistas más relevantes en un tema específico utilizando bases de datos bibliográficas y herramientas de medición de impacto como el Journal Citation Reports. También cubre cómo verificar otros indicadores de calidad de revistas y libros, y cómo registrar publicaciones en la plataforma de la Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación.
El sistema de clasificación los 3 dominios deRosmakoch
El documento describe la clasificación de los tres dominios de los seres vivos propuesta por Carl Woese en 1990: las Arqueas, las Bacterias y los Eucariotas. Woese propuso esta clasificación tras estudios a nivel molecular del ADN que mostraron que las Arqueas son genéticamente distintas de las Bacterias.
Aplicaciones de la química en el campo de la agricultura, la medicina, la cos...Diego Uv
La química se aplica en diversos campos como la agricultura, medicina, cosmética, alimentación e industria. En la agricultura, ayuda a mejorar los rendimientos y la conservación de alimentos. En la medicina, ha permitido el desarrollo de equipos médicos y medicamentos. En cosmética, estudia los componentes químicos de los productos. En alimentación, se usa en la fabricación y diseño de alimentos procesados. En industria, transforma materias primas en nuevos materiales y productos.
Introducción a la Química de los sistemas biológicos - Organización de la cát...Quimica_introductorio
Este documento presenta la organización de la cátedra de Introducción a la Química de los Sistemas Biológicos en la Universidad Nacional del Comahue. La asignatura tiene 4 horas semanales con 1 hora de teoría y 3 horas de práctica en grupos. Los estudiantes deben aprobar 3 exámenes parciales y 3 trabajos experimentales para promocionar sin examen final. Para aprobar con examen final deben aprobar los parciales y trabajos. También pueden rendir un examen libre sin cursada.
Introducción a la Química de los sistemas biológicos - Programa analítico 2008Quimica_introductorio
Este documento presenta la introducción a un curso de Química de Sistemas Biológicos. Explica que la química es fundamental para comprender los procesos biológicos y ha permitido mejoras en la calidad de vida. El curso aplicará conceptos de química general, inorgánica y orgánica a sistemas biológicos para que los estudiantes puedan interpretar procesos en organismos vivos.
This document discusses systems biology and the revolution in biotechnology. It provides a brief history of major developments in biotechnology from Edward Jenner's discovery of vaccination in the late 18th century to modern therapeutic cloning and gene therapy. It then discusses how systems biology takes a holistic approach using multidisciplinary teams to conduct research in cell function and dynamics. The goal is to develop mathematical models of important biological systems using techniques like metabolic flux analysis.
Este documento presenta una breve descripción de la asignatura de Bioquímica impartida en la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad de Carabobo. Describe la estructura organizacional del departamento de Bioquímica, la distribución de las clases teóricas y prácticas, el sistema de evaluación, las normas para las clases y el laboratorio, y los medios de contacto recomendados.
Este documento trata sobre ecología y ecosistemas. Explica que la ecología estudia las interacciones entre organismos vivos y su ambiente. Define conceptos como población, relaciones interespecíficas, ecosistema, biomas terrestres y acuáticos, cadenas alimentarias y tróficas, y el flujo de energía y materiales a través de los ecosistemas.
Este documento ofrece información sobre cómo publicar investigaciones en las mejores revistas académicas. Explica cómo identificar las revistas más relevantes en un tema específico utilizando bases de datos bibliográficas y herramientas de medición de impacto como el Journal Citation Reports. También cubre cómo verificar otros indicadores de calidad de revistas y libros, y cómo registrar publicaciones en la plataforma de la Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación.
El sistema de clasificación los 3 dominios deRosmakoch
El documento describe la clasificación de los tres dominios de los seres vivos propuesta por Carl Woese en 1990: las Arqueas, las Bacterias y los Eucariotas. Woese propuso esta clasificación tras estudios a nivel molecular del ADN que mostraron que las Arqueas son genéticamente distintas de las Bacterias.
Aplicaciones de la química en el campo de la agricultura, la medicina, la cos...Diego Uv
La química se aplica en diversos campos como la agricultura, medicina, cosmética, alimentación e industria. En la agricultura, ayuda a mejorar los rendimientos y la conservación de alimentos. En la medicina, ha permitido el desarrollo de equipos médicos y medicamentos. En cosmética, estudia los componentes químicos de los productos. En alimentación, se usa en la fabricación y diseño de alimentos procesados. En industria, transforma materias primas en nuevos materiales y productos.
Biological technologies allow editing of biological information at the nucleic acid level to obtain desirable traits. Key tools include DNA sequencing to read genetic information, restriction enzymes to cut DNA at specific sites, polymerase chain reaction (PCR) to amplify DNA, and newer genome editing techniques like CRISPR/Cas9 that allow rewriting of genetic information. These methods are applied in fields like medicine, agriculture, and biotechnology.
Conceptos básicos de lo que se conoce popularmente como Datamining y Machine Learning como introducción a un taller practico en análisis de genómica funcional.
Este documento presenta una introducción a los conceptos básicos de la propiedad intelectual y su relación con las ciencias médicas. Explica que la propiedad intelectual incluye el derecho de autor, que protege las creaciones intelectuales como obras literarias y artísticas, y la propiedad industrial, que protege invenciones, marcas, diseños industriales y otros signos distintivos. También describe los diferentes tipos de derechos que otorgan el derecho de autor y la propiedad industrial, así como las normas legales y excepciones rel
Es un ejemplo de como funciona los Beneficios tributarios de INVERSION para las empresas que quieran poner dinero en un proyecto con un grupo de investigación reconocido por colciencias.
The document describes Carlos Manuel Estévez-Bretón's doctoral research on functionally characterizing metabolic networks. The goals are to classify metabolic pathways based solely on their functional features using machine learning methods, develop a system for functionally representing metabolic networks, and apply machine learning methods to study systems biology in new ways. The methodology involves using data from MetaCyc and KEGG databases, developing a functional representation model, classifying networks with supervised and unsupervised machine learning methods, and evaluating the results using various metrics.
Las enfermedades infecciosas causan el 90% de las muertes de los jóvenes. Seis enfermedades (SIDA, diarrea, tuberculosis, malaria, rubéola y ERA) representan la mayoría de estas muertes. La gripe causa millones de consultas médicas y miles de millones de dólares en pérdidas cada año. Sin embargo, muchas enfermedades infecciosas son prevenibles a bajo costo siguiendo las recomendaciones de la OMS. La aplicación Contagion proporcionará alertas y
El documento plantea varias preguntas sobre el negocio de la televisión, incluyendo qué mercados abarca la TV, quiénes se lucran directamente y cómo, el modelo de negocio, la diferencia entre TV pública y por cable, y la interacción entre la TV e Internet. El autor también menciona haber visto algo y pregunta qué conocen sobre el tema.
Este documento discute las perspectivas actuales sobre las TICs y el medio ambiente. Aborda los efectos directos, indirectos y sistémicos de las TICs en la economía, sociedad e instituciones públicas, así como los roles y retos asociados con la producción y redes inteligentes en el contexto del desarrollo sostenible.
El documento describe la computación voluntaria y el software BOINC. Explica que la computación voluntaria involucra al público en proyectos científicos utilizando el exceso de capacidad de procesamiento de sus computadoras personales. BOINC es un middleware de código abierto que permite a los voluntarios participar simultáneamente en múltiples proyectos de investigación descargando tareas, ejecutándolas en segundo plano y enviando los resultados. El documento proporciona una breve historia de la computación voluntaria y explica cómo
Este documento contiene las diapositivas de presentación para un seminario sobre innovación educativa con énfasis en tecnologías de la información y comunicación. El seminario incluye secciones sobre una visión de los estudiantes de hoy, neuroplasticidad, reglas para compartir, todos somos aprendices, herramientas para la navegación y el ambiente personal de aprendizaje.
El documento describe la infraestructura de bioinformática y comunicación de un centro colombiano de metagenómica y bioinformática, incluyendo plataformas como Liferay, Lims, Taverna y flujos de trabajo, así como hardware como 8 servidores Sun Fire X 4150 y 4 terabytes de almacenamiento. Se proporciona información sobre licencias Creative Commons que permiten el uso no comercial y la distribución de derivados bajo la misma licencia, siempre que se reconozca la fuente original.
Soluciones Examen de Selectividad. Geografía junio 2024 (Convocatoria Ordinar...Juan Martín Martín
Criterios de corrección y soluciones al examen de Geografía de Selectividad (EvAU) Junio de 2024 en Castilla La Mancha.
Soluciones al examen.
Convocatoria Ordinaria.
Examen resuelto de Geografía
conocer el examen de geografía de julio 2024 en:
https://blogdegeografiadejuan.blogspot.com/2024/06/soluciones-examen-de-selectividad.html
http://blogdegeografiadejuan.blogspot.com/
Biological technologies allow editing of biological information at the nucleic acid level to obtain desirable traits. Key tools include DNA sequencing to read genetic information, restriction enzymes to cut DNA at specific sites, polymerase chain reaction (PCR) to amplify DNA, and newer genome editing techniques like CRISPR/Cas9 that allow rewriting of genetic information. These methods are applied in fields like medicine, agriculture, and biotechnology.
Conceptos básicos de lo que se conoce popularmente como Datamining y Machine Learning como introducción a un taller practico en análisis de genómica funcional.
Este documento presenta una introducción a los conceptos básicos de la propiedad intelectual y su relación con las ciencias médicas. Explica que la propiedad intelectual incluye el derecho de autor, que protege las creaciones intelectuales como obras literarias y artísticas, y la propiedad industrial, que protege invenciones, marcas, diseños industriales y otros signos distintivos. También describe los diferentes tipos de derechos que otorgan el derecho de autor y la propiedad industrial, así como las normas legales y excepciones rel
Es un ejemplo de como funciona los Beneficios tributarios de INVERSION para las empresas que quieran poner dinero en un proyecto con un grupo de investigación reconocido por colciencias.
The document describes Carlos Manuel Estévez-Bretón's doctoral research on functionally characterizing metabolic networks. The goals are to classify metabolic pathways based solely on their functional features using machine learning methods, develop a system for functionally representing metabolic networks, and apply machine learning methods to study systems biology in new ways. The methodology involves using data from MetaCyc and KEGG databases, developing a functional representation model, classifying networks with supervised and unsupervised machine learning methods, and evaluating the results using various metrics.
Las enfermedades infecciosas causan el 90% de las muertes de los jóvenes. Seis enfermedades (SIDA, diarrea, tuberculosis, malaria, rubéola y ERA) representan la mayoría de estas muertes. La gripe causa millones de consultas médicas y miles de millones de dólares en pérdidas cada año. Sin embargo, muchas enfermedades infecciosas son prevenibles a bajo costo siguiendo las recomendaciones de la OMS. La aplicación Contagion proporcionará alertas y
El documento plantea varias preguntas sobre el negocio de la televisión, incluyendo qué mercados abarca la TV, quiénes se lucran directamente y cómo, el modelo de negocio, la diferencia entre TV pública y por cable, y la interacción entre la TV e Internet. El autor también menciona haber visto algo y pregunta qué conocen sobre el tema.
Este documento discute las perspectivas actuales sobre las TICs y el medio ambiente. Aborda los efectos directos, indirectos y sistémicos de las TICs en la economía, sociedad e instituciones públicas, así como los roles y retos asociados con la producción y redes inteligentes en el contexto del desarrollo sostenible.
El documento describe la computación voluntaria y el software BOINC. Explica que la computación voluntaria involucra al público en proyectos científicos utilizando el exceso de capacidad de procesamiento de sus computadoras personales. BOINC es un middleware de código abierto que permite a los voluntarios participar simultáneamente en múltiples proyectos de investigación descargando tareas, ejecutándolas en segundo plano y enviando los resultados. El documento proporciona una breve historia de la computación voluntaria y explica cómo
Este documento contiene las diapositivas de presentación para un seminario sobre innovación educativa con énfasis en tecnologías de la información y comunicación. El seminario incluye secciones sobre una visión de los estudiantes de hoy, neuroplasticidad, reglas para compartir, todos somos aprendices, herramientas para la navegación y el ambiente personal de aprendizaje.
El documento describe la infraestructura de bioinformática y comunicación de un centro colombiano de metagenómica y bioinformática, incluyendo plataformas como Liferay, Lims, Taverna y flujos de trabajo, así como hardware como 8 servidores Sun Fire X 4150 y 4 terabytes de almacenamiento. Se proporciona información sobre licencias Creative Commons que permiten el uso no comercial y la distribución de derivados bajo la misma licencia, siempre que se reconozca la fuente original.
Soluciones Examen de Selectividad. Geografía junio 2024 (Convocatoria Ordinar...Juan Martín Martín
Criterios de corrección y soluciones al examen de Geografía de Selectividad (EvAU) Junio de 2024 en Castilla La Mancha.
Soluciones al examen.
Convocatoria Ordinaria.
Examen resuelto de Geografía
conocer el examen de geografía de julio 2024 en:
https://blogdegeografiadejuan.blogspot.com/2024/06/soluciones-examen-de-selectividad.html
http://blogdegeografiadejuan.blogspot.com/
En la ciudad de Pasto, estamos revolucionando el acceso a microcréditos y la formalización de microempresarios informales con nuestra aplicación CrediAvanza. Nuestro objetivo es empoderar a los emprendedores locales proporcionándoles una plataforma integral que facilite el acceso a servicios financieros y asesoría profesional.
ACERTIJO DESCIFRANDO CÓDIGO DEL CANDADO DE LA TORRE EIFFEL EN PARÍS. Por JAVI...JAVIER SOLIS NOYOLA
El Mtro. JAVIER SOLIS NOYOLA crea y desarrolla el “DESCIFRANDO CÓDIGO DEL CANDADO DE LA TORRE EIFFEL EN PARIS”. Esta actividad de aprendizaje propone el reto de descubrir el la secuencia números para abrir un candado, el cual destaca la percepción geométrica y conceptual. La intención de esta actividad de aprendizaje lúdico es, promover los pensamientos lógico (convergente) y creativo (divergente o lateral), mediante modelos mentales de: atención, memoria, imaginación, percepción (Geométrica y conceptual), perspicacia, inferencia y viso-espacialidad. Didácticamente, ésta actividad de aprendizaje es transversal, y que integra áreas del conocimiento: matemático, Lenguaje, artístico y las neurociencias. Acertijo dedicado a los Juegos Olímpicos de París 2024.
DESARROLLO DE LAS RELACIONES CON LOS STAKEHOLDERS.pdf
Biologia de Sistemas y Biologia Sintetica
1. Biología de sistemas y
Biología sintética
Carlos Manuel Estévez-Bretón
viernes 17 de abril de 2009
2. Que es la Biología de Sistemas
Orígenes
Técnicas Asociadas
Modelamiento
Que es Biología Sintética
Orígenes
Logros
Aspectos adicionales
viernes 17 de abril de 2009
3. Área de estudio
interdisciplinaria basada
en la Biología
http://www.flickr.com/photos/amin_tabrizi/72684909/
viernes 17 de abril de 2009
4. Enfocada en el estudio
Sistemático de
interacciones complejas
sistemas biológicos
viernes 17 de abril de 2009
5. Uno de sus objetivos es
descubrir nuevas
propiedades
emergentes
viernes 17 de abril de 2009
8. Otros que es el antónimo
del reduccionismo
viernes 17 de abril de 2009
9. Multiescalaridad
http://www.flickr.com/photos/ianturk/269291890/
viernes 17 de abril de 2009
10. quot;Systems biology...is about
putting together rather than
taking apart, integration rather
than reduction. It requires that
we develop ways of thinking
about integration that are as
rigorous as our reductionist
programmes, but different....It
means changing our philosophy,
in the full sense of the termquot;
Denis Noble (2006). The Music of Life: Biology beyond the genome. Oxford University Press. ISBN 978-0199295739. p21
viernes 17 de abril de 2009
11. The Music of
Life: A new view
on Nature and
Nurture
http://www.pulse-project.org/node/32
viernes 17 de abril de 2009
12. Principios
http://www.flickr.com/photos/spilt-milk/164145237/
viernes 17 de abril de 2009
13. 1. La funcionalidad
biológica es multinivel
Noble,D. Claude Bernard, the first systems biologist,and the future of physiology Experimental Physiology (2008)Published online 19th October 2007 expphysiol.
2007.038695v1
viernes 17 de abril de 2009
14. 2. La transmisión de
información no es en
una sola vía.
viernes 17 de abril de 2009
15. 3. El DNA no es el
único transmisor de la
herencia.
viernes 17 de abril de 2009
16. 4. La teoría de
relatividad biológica: no
hay un nivel privilegiado
de causalidad.
viernes 17 de abril de 2009
17. 5. La Ontología
Genética (GO) fallará si
no se consideran
niveles superiores de
penetración
viernes 17 de abril de 2009
18. 6. No hay programa
genético
viernes 17 de abril de 2009
19. 7. No hay programas a
ningún otro nivel
viernes 17 de abril de 2009
20. 8. No hay programas en
el cerebro.
viernes 17 de abril de 2009
21. 9. El cuerpo no es un
objeto
viernes 17 de abril de 2009
22. 10. Hay mucho mas por
ser descubierto; no
existe todavía una
genuina teoría biológica
viernes 17 de abril de 2009
24. Modelos
cuantitativos de
cinética enzimática
http://www.flickr.com/photos/mydailycommute/19354158/
viernes 17 de abril de 2009
25. Modelos Simulaciones
cuantitativos de (neurofisiología)
cinética enzimática
http://www.flickr.com/photos/mydailycommute/19354158/
viernes 17 de abril de 2009
26. Modelos Simulaciones
cuantitativos de (neurofisiología)
cinética enzimática
•Teoría de Control
•Cibernética
http://www.flickr.com/photos/mydailycommute/19354158/
viernes 17 de abril de 2009
27. Teoría de CONTROL
http://www.flickr.com/photos/santoposmoderno/3300496591/
viernes 17 de abril de 2009
30. Karl Ludwig von Bertalanffy
September 19, 1901, Vienna, Austria – June 12, 1972, New York, USA
Teoría General de Sistemas
viernes 17 de abril de 2009
31. 1963 Premio Nobel de -Fisiología o Medicina
viernes 17 de abril de 2009
32. Alan Lloyd Hodgkin
5 February 1914, Banbury, Oxfordshire, England
– 20 December 1998 Cambridge
viernes 17 de abril de 2009
33. Sir Andrew Fielding Huxley
OM, FRS.
22 November 1917, Hampstead, London
viernes 17 de abril de 2009
34. Marcapasos
Denis Noble
viernes 17 de abril de 2009
35. 1966 international symposium at the Case Institute of
Technology in Cleveland, Ohio
quot;Systems Theory and Biology”
Mihajlo D. Mesarovic
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48. Systems Biology
Markup Languaje
• Descrito por Hucka et al. (2003), es una
form ade representar redes bioquímicas.
• Es una extensión de eXtensible Markup
Languaje.
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49. SBML
• El modelo consiste en listas de:
• funciones
• unidades
• compartimientos
• especies
• parámetros
• reglas
• reacciones
• eventos
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viernes 17 de abril de 2009
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viernes 17 de abril de 2009
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70. <?xml version=”1.0” encoding=”UTF-8”?>
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viernes 17 de abril de 2009
71. <?xml version=”1.0” encoding=”UTF-8”?>
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viernes 17 de abril de 2009
72. SBML: unidades
• La lista es opcional de unidades permite la
definición y redefinición de unidades usadas
por el modelo.
viernes 17 de abril de 2009
73. SBML: unidades
• La lista es opcional de unidades permite la
definición y redefinición de unidades usadas
por el modelo.
<listOfUnitDefinitions>
<unitDefinition id=”substancia”>
<listOfUnits>
<unit kind =”item”/>
</listOfUnits>
</unitDefinition>
</listOfUnitDefinitions>
viernes 17 de abril de 2009
74. SBML: compartimientos
• Lista los estados simples de los
compartimientos en el modelo.
• Si tiene dos compartimiento anidados sería:
• La unidad de volumen por omisión es litro
• Se debe declarar el compartimiento que está “afuera”
viernes 17 de abril de 2009
75. SBML: compartimientos
• Lista los estados simples de los
compartimientos en el modelo.
• Si tiene dos compartimiento anidados sería:
<listOfCompartments>
<compartment id=”Celula” size=”1”/>
<compartment id=”Nucleo” size”1” outside”Celula”/>
</listCompartments>
• La unidad de volumen por omisión es litro
• Se debe declarar el compartimiento que está “afuera”
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76. SBML: especies
• Lista los estados simples de las moléculas
• Las unidades son las establecidas en
“unidades”
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77. SBML: especies
• Lista los estados simples de las moléculas
• Las unidades son las establecidas en
“unidades”
<listOfSpecies>
<species id=”Gen” compartment=”Celula” initialAmount=”10”
hasOnlySubstanceUnits=”true”/>
<species id=”P2Gen” name=”P2Gen”compartment=”Celula”
initialAmount=”0” hasOnlySubstanceUnits=”true”/>
<species id=”RNA” compartment=”Celula” initialAmount=”0”
hasOnlySubstanceUnits=”true”/>
<species id=”P” compartment=”Celula” initialAmount=”0”
hasOnlySubstanceUnits=”true”/>
<species id=”P2” compartment=”Celula” initialAmount=”0”
hasOnlySubstanceUnits=”true”/>
</listOfSpecies>
viernes 17 de abril de 2009
78. SBML: parámetros
• La sección de parámetros se puede usar
para declarar nombres de variables
numéricas para ser usadas en fórmulas
algebráicas.
• Generalmente se usan para declarar
constantes para las leyes de cinética o
reacciones bioquímicas.
viernes 17 de abril de 2009
79. SBML: parámetros
• La sección de parámetros se puede usar
para declarar nombres de variables
numéricas para ser usadas en fórmulas
algebráicas.
• Generalmente se usan para declarar
constantes para las leyes de cinética o
reacciones bioquímicas.
<listOfParamaters>
<parameter id=”k1” vaue=”0,01”/>
<parameter id=”k2” vaue=”0,1”/>
</listParameters>
viernes 17 de abril de 2009
80. SBML: reacciones
• Es un listado de reacciones
• Una reacción consta de reactantes,
productos y tazas de cambio.
• También puede declarar un especies
modificadoras “modifier” que no son
reactantes o productos pero que
intervienen en la reacción
viernes 17 de abril de 2009
84. Software Infrastructure
Model representation Software tools
Standard representation
method of biological
models
CellDesigner
Database
Translator RoadRunner AutoLayout
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85. CellDesigner
+ + +
= CellDesigner
Modeling tool for biochemical and
viernes 17 de abril de 2009
89. Area de investigación biológica.
Combina ciencia e ingeniería.
Para diseñar y construir
(quot;sintetizarquot;) noveles sistemas y
funciones biológicas.
viernes 17 de abril de 2009
90. En1974, el Genetista
Polaco Waclaw
Szybalski introduce
el término
viernes 17 de abril de 2009
91. El represilador es un
oscilador artificial que
se construye mediante
una red de reguladores
génicos.
A Synthetic Oscillatory Network of Transcriptional Regulators; Michael B. Elowitz and Stanislas Leibler;
Nature. 2000 Jan 20;403(6767):335-8.
viernes 17 de abril de 2009
92. Consiste en 3 genes
conectados en un bucle de
retroalimentación.
viernes 17 de abril de 2009
93. •Cada gen reprime al al siguiente
en un bucle.
•Cada gen es reprimido por el
gen anterior.
viernes 17 de abril de 2009
94. Una proteina
fluorescente se usa
como reportero.
viernes 17 de abril de 2009
97. A Synthetic Oscillatory Network of Transcriptional Regulators; Michael B. Elowitz and Stanislas Leibler;
Nature. 2000 Jan 20;403(6767):335-8.
viernes 17 de abril de 2009
98. La red se compone de
tres genes:
LacI, extraído de la
bacteria E. coli, tetR del
transposón Tn10 y cI
del fago λ
viernes 17 de abril de 2009
99. UT Austin 2004 Synthetic Biology competition photo. Courtesy of Jeff Tabor and
Randy Rettberg
http://en.wikipedia.org/wiki/File:UT_HelloWorld.jpg
viernes 17 de abril de 2009
100. Una biopelícula hecha por el equipo de 2004 de
Biología Sintética de UT Austin / UCSF.
Despliega el mensaje quot;Hello worldquot;,
comúnmente utilizado como muestra en
lenguajes de programación.
viernes 17 de abril de 2009
114. Molecular Systems Biology 2 Article number: 69 doi:10.1038/msb4100104
Published online: 12 December 2006
Citation: Molecular Systems Biology 2:69
viernes 17 de abril de 2009
118. •ET Synthetic Biology
•IET Systems Biology
•Springer - Systems and Synthetic Biology
•BMC Systems Biology
•Nature - Molecular Systems Biology
•PLoS - Computational Biology
•Elsevier - Biosystems
•World Scientific - Journal of Bioinformatics and Computational
Biology
•World Scientific - Journal of Biological Systems
•Journal of the Royal Society - Focus on Systems Biology
•Biophysical Journal
•RSC Publishing - Molecular Biosystems
•PNAS
•Virtual Journal of Biological Physics Research
•EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology
•In Silico Biology
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119. 7:57
http://www.youtube.com/watch?v=A-mCWIGVgmQ
viernes 17 de abril de 2009
120. • Science Today: Synthetic Biology/UC Berkeley
http://www.youtube.com/watch?v=PCxSa6vGEFY
• Renewable Energy from Synthetic Biology http://
www.youtube.com/watch?v=GZge1v7GDq0
• The Implications of Synthetic Biology http://
mitworld.mit.edu/video/363
viernes 17 de abril de 2009
121. Carlos Manuel Estévez-Bretón Riveros MSc.
karelman@gmail.com
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