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Taller Seminario de Capacitación RIDAC, Bogotá (Colombia)
21 noviembre 2013

De AGRIS a OpenAGRIS
Stefano.Anibaldi@fao.org
Imma.Subirats@fao.org
http://agris.fao.org
http://aims.fao.org
Sumario
¿Qué es AGRIS?
El camino a los datos vinculados
El flujo de datos y la interoperabilidad
El consumo de datos AGRIS
Centralización
Interconexión

Procedencia
Algunos números
Indexación de AGRIS en Google
AGRIS
Recursos en Ciencias Agrícolas y Tecnología de la Información
Qué es AGRIS
• Sistema cooperativo internacional
• Da acceso libre a recursos bibliográficos y datos
abiertos
• Abarca casi cuarenta años de investigación
agrícola
• Sus metadatos se estructuran e indexan usando
el tesauro AGROVOC
• Mantenido por la FAO
Flujo de datos
Interoperabilidad
OpenAGRIS
• Aplicación web enteramente basada en
estándares de la Web Semántica
• Utiliza la colección AGRIS para crear páginas de
mashup y interconectar los registros a fuentes
externas de información
• OpenAgris utiliza AGROVOC como columna
vertebral para la interconexión con otros
conjuntos de datos existentes (DBPedia,
worldbank, Ontología geopolítica ...)
Flujo de datos
El consumo de datos en AGRIS
• Centralización: referencias bibliográficas en el
dominio AGRIS (la agricultura, la silvicultura, la
ganadería, ciencias acuáticas y la pesca, y la
alimentación humana)
• Interconexión: otro tipo de información
relacionada con el dominio AGRIS (estadísticas,
mapas, perfiles de países, etc)
Centralización: Centro de proceso de datos
•

•
•

•

Los nuevos metadatos se verifican manualmente y
aleatoriamente en busca de inconsistencias o errores
semánticos recurrentes
El formato de entrada se asigna a AGRIS RDF
Los metadatos se convierten en AGRIS RDF, usando
AgroTagger cuando las palabras clave de AGROVOC no
están disponibles
Antes de añadir metadatos al triplestore e indexar en el
índice Solr, se detectan y gestionan los duplicados, ya
que el mismo registro puede ser indexado en varias
colecciones o ser duplicado en el mismo repositorio
Agrotagger
Maui es el nombre
del héroe mitológico
y semidiós
polinesio, que se
transform en
diferentes tipos de
ave para realizar
hazañas

Todavía no se ha
implementado

12
“RDF-ization”
bibo:Article
bibo:abstract
bibo:doi
bibo:isbn
bibo:language
bibo:presentedAt ->
bibo:Conference ->
dct:title
bibo:uri
dct:alternative
dct:creator ->
foaf:organization ->
foaf:name
dct:creator ->
foaf:Person ->
foaf:name

dct:dateSubmitted
dct:description
Elección de
dct:extent
vocabularios y
dct:identifier
equivalencias!
dct:isPartOf
dct:issued
dct:publisher ->
foaf:Organization ->
foaf:name
dct:source
dct:subject
dct:title
dct:type
dct:rights
Procedencia
•

•

•

Cada registro tiene un identificador AGRIS (ARN), que
tiene una estructura predefinida y contiene información
sobre la fuente de datos junto con el año de registro
bibliográfico de creación
"IT 2008 0 00091" se refiere a un registro creado en
2008 a partir de un proveedor específico de datos
AGRIS en Italia, cuyo número progresivo es 91
Datos de proveedores de información se almacenan en
CIARD RING y son “triplificados” en el centros de datos
AGRIS (cada proveedor de datos tiene su propio URI
único)
Enlaces: ¿cómo funcionan?
• AGROVOC es la columna vertebral
• AGROVOC está enlazado con otros tesauros
mediante un procedimiento semi-automático
(skos: exactMatch, skos: closeMatch)
• SPARQL endpoints publicados en la Web
• Webservices y APIs
El Caso IFPRI

Un usuario
consulta el
sistema

Registro AGRIS
con palabras
clave Agrovoc

Por lo menos una palabra
clave Agrovoc es un nombre
de país

El sistema de consultas SPARQL endpoint
IFPRI (http://data.ifpri.org/sparql/)
recupera el Índice Global del Hambre (GHI)
y la tasa de mortalidad infantil relacionada
con el País

16
Enlazando:
Implementación

AGRIS RDF RECORD

AGROVOC

17
Algunos números
•

•

•
•

7.632.842 registros bibliográficos generados por 248
proveedores de contenido ubicados en 153 países, en
52 idiomas en más de 20.000 revistas científicas.
134.544.101 triples en el conjunto de datos AGRIS
http://202.45.142.113:10035/repositories/agris
358.617 triples en la series de datos AGRIS
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13.996 triples en los centros de datos AGRIS
http://202.45.142.113:10035/repositories/centers
Indexación de AGRIS en Google
Maximizando el acceso
Google Scholar
•

•

Desde cuando, en 2008, el equipo de AGRIS presentó
las primeras XML sitemaps de Google, la base de datos
(o sistema) aumentó la efectividad de rastreo e
indexación de toda la colección AGRIS (3 millones de
visitantes al año).
Esto creó el efecto positivo secundario de aumento de
la visibilidad y por lo tanto la accesibilidad de los datos
proporcionados por las colecciones de los proveedores
de datos que participan en la Red AGRIS.
Búsqueda customizada de Google (1)
•

•

Uno de los aspectos más interesantes - de gran utilidad
para los científicos que realmente quieren tener acceso
al documento - que AGRIS ha implementado en los
últimos años, es la recuperación del texto completo de
un recurso (referencia bibliográfica) cuya información
de URL no está presente en los propio metadatos.
Esto se logra a través de un gadget muy útil, buscar en
la web para el título específico, que toma la información
de las referencias bibliográficas. También para autores y
conferencias.
Búsqueda customizada de Google (2)
•
•
•
•

Esto se logra a través de la API de Google
La idea es buscar documentos de texto completo
disponibles en Internet, si la información acerca del
documento no se encuentra en los metadatos
Google permite una cantidad predeterminada de consultas
La cuota de consulta actual permitida es de 14.000 por
día. Esto significa que, 14.000 veces cada día, AGRIS es
capaz de buscar y recuperar (se calcula aproximadamente
un 60% de las veces) un documento específico, si está
disponible en Internet
AGRIS “Recolector Abierto” (1)
•
•

El objetivo era establecer un mecanismo para la
recolección automática y programada de metadatos y
depositarlos en AGRIS para su posterior indexación
El Recolector Abierto es una aplicación Java basada en
Harvester2 software de código abierto de Jeff Young
(OSS) y adaptado para el flujo AGRIS existente
AGRIS “Recolector Abierto” (2)
•
•

•
•

Fácil de instalar (Tomcat, Java, MySQL)
Sus funcionalidades incluyen un planificador, una única
página para los proveedor de datos que puede ser editada
y una página de estadísticas que enumera todos los
proveedores de datos AGRIS que usa OAI-PMH
Permite a cosechar cualquier formato de metadatos, tal
como define el repositorio abierto originario
Su utilidad está relacionada con el éxito de OAI-PMH
Gracias
Turno de Preguntas
Stefano.Anibaldi@fao.org
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De AGRIS a OpenAGRIS

  • 1. Taller Seminario de Capacitación RIDAC, Bogotá (Colombia) 21 noviembre 2013 De AGRIS a OpenAGRIS Stefano.Anibaldi@fao.org Imma.Subirats@fao.org http://agris.fao.org http://aims.fao.org
  • 2. Sumario ¿Qué es AGRIS? El camino a los datos vinculados El flujo de datos y la interoperabilidad El consumo de datos AGRIS Centralización Interconexión Procedencia Algunos números Indexación de AGRIS en Google
  • 3. AGRIS Recursos en Ciencias Agrícolas y Tecnología de la Información
  • 4. Qué es AGRIS • Sistema cooperativo internacional • Da acceso libre a recursos bibliográficos y datos abiertos • Abarca casi cuarenta años de investigación agrícola • Sus metadatos se estructuran e indexan usando el tesauro AGROVOC • Mantenido por la FAO
  • 7. OpenAGRIS • Aplicación web enteramente basada en estándares de la Web Semántica • Utiliza la colección AGRIS para crear páginas de mashup y interconectar los registros a fuentes externas de información • OpenAgris utiliza AGROVOC como columna vertebral para la interconexión con otros conjuntos de datos existentes (DBPedia, worldbank, Ontología geopolítica ...)
  • 9.
  • 10. El consumo de datos en AGRIS • Centralización: referencias bibliográficas en el dominio AGRIS (la agricultura, la silvicultura, la ganadería, ciencias acuáticas y la pesca, y la alimentación humana) • Interconexión: otro tipo de información relacionada con el dominio AGRIS (estadísticas, mapas, perfiles de países, etc)
  • 11. Centralización: Centro de proceso de datos • • • • Los nuevos metadatos se verifican manualmente y aleatoriamente en busca de inconsistencias o errores semánticos recurrentes El formato de entrada se asigna a AGRIS RDF Los metadatos se convierten en AGRIS RDF, usando AgroTagger cuando las palabras clave de AGROVOC no están disponibles Antes de añadir metadatos al triplestore e indexar en el índice Solr, se detectan y gestionan los duplicados, ya que el mismo registro puede ser indexado en varias colecciones o ser duplicado en el mismo repositorio
  • 12. Agrotagger Maui es el nombre del héroe mitológico y semidiós polinesio, que se transform en diferentes tipos de ave para realizar hazañas Todavía no se ha implementado 12
  • 13. “RDF-ization” bibo:Article bibo:abstract bibo:doi bibo:isbn bibo:language bibo:presentedAt -> bibo:Conference -> dct:title bibo:uri dct:alternative dct:creator -> foaf:organization -> foaf:name dct:creator -> foaf:Person -> foaf:name dct:dateSubmitted dct:description Elección de dct:extent vocabularios y dct:identifier equivalencias! dct:isPartOf dct:issued dct:publisher -> foaf:Organization -> foaf:name dct:source dct:subject dct:title dct:type dct:rights
  • 14. Procedencia • • • Cada registro tiene un identificador AGRIS (ARN), que tiene una estructura predefinida y contiene información sobre la fuente de datos junto con el año de registro bibliográfico de creación "IT 2008 0 00091" se refiere a un registro creado en 2008 a partir de un proveedor específico de datos AGRIS en Italia, cuyo número progresivo es 91 Datos de proveedores de información se almacenan en CIARD RING y son “triplificados” en el centros de datos AGRIS (cada proveedor de datos tiene su propio URI único)
  • 15. Enlaces: ¿cómo funcionan? • AGROVOC es la columna vertebral • AGROVOC está enlazado con otros tesauros mediante un procedimiento semi-automático (skos: exactMatch, skos: closeMatch) • SPARQL endpoints publicados en la Web • Webservices y APIs
  • 16. El Caso IFPRI Un usuario consulta el sistema Registro AGRIS con palabras clave Agrovoc Por lo menos una palabra clave Agrovoc es un nombre de país El sistema de consultas SPARQL endpoint IFPRI (http://data.ifpri.org/sparql/) recupera el Índice Global del Hambre (GHI) y la tasa de mortalidad infantil relacionada con el País 16
  • 18. Algunos números • • • • 7.632.842 registros bibliográficos generados por 248 proveedores de contenido ubicados en 153 países, en 52 idiomas en más de 20.000 revistas científicas. 134.544.101 triples en el conjunto de datos AGRIS http://202.45.142.113:10035/repositories/agris 358.617 triples en la series de datos AGRIS http://202.45.142.113:10035/repositories/jad 13.996 triples en los centros de datos AGRIS http://202.45.142.113:10035/repositories/centers
  • 19. Indexación de AGRIS en Google Maximizando el acceso
  • 20. Google Scholar • • Desde cuando, en 2008, el equipo de AGRIS presentó las primeras XML sitemaps de Google, la base de datos (o sistema) aumentó la efectividad de rastreo e indexación de toda la colección AGRIS (3 millones de visitantes al año). Esto creó el efecto positivo secundario de aumento de la visibilidad y por lo tanto la accesibilidad de los datos proporcionados por las colecciones de los proveedores de datos que participan en la Red AGRIS.
  • 21. Búsqueda customizada de Google (1) • • Uno de los aspectos más interesantes - de gran utilidad para los científicos que realmente quieren tener acceso al documento - que AGRIS ha implementado en los últimos años, es la recuperación del texto completo de un recurso (referencia bibliográfica) cuya información de URL no está presente en los propio metadatos. Esto se logra a través de un gadget muy útil, buscar en la web para el título específico, que toma la información de las referencias bibliográficas. También para autores y conferencias.
  • 22. Búsqueda customizada de Google (2) • • • • Esto se logra a través de la API de Google La idea es buscar documentos de texto completo disponibles en Internet, si la información acerca del documento no se encuentra en los metadatos Google permite una cantidad predeterminada de consultas La cuota de consulta actual permitida es de 14.000 por día. Esto significa que, 14.000 veces cada día, AGRIS es capaz de buscar y recuperar (se calcula aproximadamente un 60% de las veces) un documento específico, si está disponible en Internet
  • 23. AGRIS “Recolector Abierto” (1) • • El objetivo era establecer un mecanismo para la recolección automática y programada de metadatos y depositarlos en AGRIS para su posterior indexación El Recolector Abierto es una aplicación Java basada en Harvester2 software de código abierto de Jeff Young (OSS) y adaptado para el flujo AGRIS existente
  • 24. AGRIS “Recolector Abierto” (2) • • • • Fácil de instalar (Tomcat, Java, MySQL) Sus funcionalidades incluyen un planificador, una única página para los proveedor de datos que puede ser editada y una página de estadísticas que enumera todos los proveedores de datos AGRIS que usa OAI-PMH Permite a cosechar cualquier formato de metadatos, tal como define el repositorio abierto originario Su utilidad está relacionada con el éxito de OAI-PMH