Los nodos anidados en un mapa conceptual permiten incluir información adicional sobre un concepto sin afectar visualmente el mapa. Se crean seleccionando conceptos y enlaces y eligiendo la opción "nodo anidado/crear". Para quitar elementos de un nodo anidado se seleccionan y elige la opción "nodo anidado/remover del padre", y para eliminar un nodo completo se hace clic en él y se elige la opción "nodo anidado/separar del hijo".