México cuenta con 49 aduanas dispersas en zonas fronterizas del norte y sur, interiores, y marítimas. Las aduanas más activas son Manzanillo, que realiza más del 46% del comercio exterior del país, y la del Aeropuerto Internacional de la Ciudad de México. La aduana de Cancún también es importante debido al alto tráfico turístico en esa región.