Este documento describe la investigación del profesor Jan H. Jensen sobre el plegamiento y modelado computacional de proteínas. Explica que las estructuras de proteínas son importantes para el desarrollo de medicamentos y que, aunque son difíciles de medir, ahora es posible calcularlas computacionalmente usando ecuaciones como la ecuación de Schrödinger dependiente del tiempo. También presenta varios programas y sitios web que permiten simulaciones y modelado de proteínas a nivel atómico.

1. Department)of)Chemistry)
CC1BY) 1)
Proteiner(du(kan(regne(med(
(
Jan)H.)Jensen)
Kemisk)Ins;tut,)Københavns)Universitet)
twi0er:)@janhjensen)
Google+:)+JanJensenCopenhagen)
Youtube:)molmodbasics)
Blog:)Molecular)Modeling)Basics)&)Proteins)and)Wave)Func;ons))
Baggrund(
Ærøbo)
USA)1986)1)2006)
Lektor/Professor)KU)2006)1)nu)
Beregnings(bio)kemiker)

2. Department)of)Chemistry)
2)
4JQI)
h]p://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/)
~40%)af)moderne)lægemidler)binder)
;l)denne)proteinfamilie)
Proteinstrukturer(er(vig9ge(

3. Department)of)Chemistry)
3)
Mange(lægemidler(er(molekyler(der(binder(9l(proteiner(
(
proteinstrukturer)=)hur;gere)lægemiddeludvikling)

4. Department)of)Chemistry)
4)
Proteinstrukturer(er(svære(at(måle(

5. Department)of)Chemistry)
5)
Kan(vi(udregne(proteinstrukturer(i(stedet(for(at(måle(dem?(

6. Department)of)Chemistry)
6)
The)underlying)physical)laws)necessary)for)the)
mathema;cal)theory)of)a)large)part)of)physics)and)the)
whole)of)chemistry)are)thus)completely)known,)and)the)
difficulty)is)only)that)the)exact)applica;on)of)these)laws)
leads)to)equa;ons)much)too)complicated)to)be)soluble.)
)
Paul(Dirac,(1929((
i
∂
∂t
Ψ = ˆHΨ
The(9meJdependent(Schrödinger(Equa9on((1926)(
Computa9onal(Chemistry(

7. Department)of)Chemistry)
7)
Molecular(Calculator(
molcalc.org)
kvantekemi)på)din)mobiltelefon)

8. Department)of)Chemistry)
8)
Avogadro(
avogadro.openmolecules.net)

9. Department)of)Chemistry)
9)
Molecular(Workbench(
mw.concord.org)

10. Department)of)Chemistry)
10)

11. Department)of)Chemistry)
11)
What(is(possible(with(today’s(computers(

12. Department)of)Chemistry)
12)
h0p://m.socra9ve.com(
Room(number(9076(
Hvis);dskridtet)er)1)femtosekund)
hvor)mange)skridt)skal)jeg)tage)for)at)simulere)en)process)
der)varer)et)millisecond?))
A. 1)milliard)
)
B. 1)billion)
)
C. 1)trillion)
)
D. Ved)ikke)

13. Department)of)Chemistry)
14)
Hvor)mange)par;cle)par)har)vi)i)denne)simula;on?)
A.))
A. 6)
B. 15)
C. 36)
D. Ved)ikke))

14. Department)of)Chemistry)
16)
h]p://mmtsb.org/workshops/mmtsb1ctbp_workshop_2009/Tutorials/
ChEq_DomainSwap_Tutorial/ChEq_DomainSwap_Tutorial.html)
vandatomerne)er)lige)så)vig;ge)som)proteinatomerne)

15. Department)of)Chemistry)
17)
INFER)
Min(forskning(

16. Department)of)Chemistry)
18)
fold.it(

17. Department)of)Chemistry)
19)fold.it/portal/info/science#folditpub)

18. Department)of)Chemistry)
20)
Proteiner(du(kan(regne(med(
(
Jan)H.)Jensen)
Kemisk)Ins;tut,)Københavns)Universitet)
twi0er:)@janhjensen)
Google+:)+JanJensenCopenhagen)
Youtube:)molmodbasics)
Blog:)Molecular)Modeling)Basics)&)Proteins)and)Wave)Func;ons))
Spørgsmål?(
Proteinfolding/beregningskemi)
Forskning)
Programmering)
Universitetet)
…)