1. La taxonomía bacteriana ha evolucionado a través del tiempo con diferentes sistemas de clasificación basados en características fenotípicas y genéticas.
2. Actualmente la clasificación se basa en tres dominios (Bacteria, Archaea y Eukarya) determinados por características celulares y moleculares como la estructura de la membrana y el tipo de ribosomas.
3. Dentro del dominio Bacteria, la clasificación más usada es la del Manual Bergey que agrupa las bacterias en taxones de acuer
4. Nucleoide Citoplasma
Membrana
Cápsula
celular
Pared
Flagelo Pili celular
5. Reino Animalia
Clasificación
tradicional Reino Plantae
Tres Reinos:
Sistema de Haeckel
(1894)
Protistas atípicos
Reino
Protozoa
Protistas
Protophyta
Reino Planta
Reino Animal
6. Esquema de Dominio Reino Bacteria
Margulis: dos Prokarya
dominios y 5 reinos
Reino Protoctista
(1988-1996) Reino Fungi
Dominio
Eukarya Reino Plantae
Reino Animalia
Dominio Subdominio Eubacteria
Cuatro Prokaryota Subdominio Archaebacteria
Subdominios Dominio
(Mayr 1990) Eukaryota
Subdominio Protista
Subdominio
Reino Metaphyta (Plants)
Metabionta
Reino Fungi
Reino Animalia
7. Reino Mychota
Sistema de Copeland: cuatro
Reinos (1956)
Reino Protoctista
Reino Plantae
Reino Animalia
Reino Monera
Reino Protista
Whittaker: Cinco
Reinos (1969)
Reino Plantae
Reino Fungi
Reino Animalia
8. Tres Dominios (Woese 1990) Dominio Bacteria
Dominio Archaea
Dominio Eucarya
Cavalier-Smith 1998 Superreino Prokaryota
Reinos Bacteria
Suprareinos y Seis Reinos Superreino Eukaryota
Reino Protozoa
Reino Animalia
Reino Fungi
Reino Plantae
Reino Chromista
9. La línea verde indica origen bacteriano de los cloroplastos
La línea roja indica origen bacteriano de las mitocondrias
10. DOMINIOS: Caracteres que los
definen
BACTERIA ARCHEA EUKARYA
Células procariotas eucariotas
Núcleo con NO SI
Membranas enlazados por enlaces eter, enlazados por
lipídicas éster, ramificado éster,
no ramificados no ramificados
organelas NO SI
ribosomas 70S 80S
11.
12.
13.
14. La taxonomía es la ciencia de la clasificación, agrupa y separa los
organismos vivos de acuerdo a sus características fenotípicas o
genéticas. Para propósitos de clasificación, los organismos usualmente
son reconocidos en órdenes superiores, familias, géneros, especies y
subespecies.
Es una ciencia ARTIFICIAL, influida por los avances en las
ARTIFICIAL
técnicas.
SE DIVIDE
2. CLASIFICACION
3. NOMENCLATURA
4. IDENTIFICACION
15. “Es la ordenación de los microorganismos en grupos o taxones en
función de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivos”
El objetivo es el de ser ESTABLE, OBJETIVA Y PREDICTIVA
16. “Es la asignación de un nombres específico a los grupos taxonómicos de
acuerdo a criterios y normas preestablecidas y adminitidas
internacionalmente”
17. “Es la parte práctica de la taxonomía, dado que permite encuadrar un
determinado organismo en un grupo taxonómico previamente
establecido”
18. Las distintas categorías taxonómicas se definen por las propiedades y
características que poseen las bacterias que las integran.
Los datos reciben el nombre de caracteres taxonómicos. E incluyen
taxonómicos
caracteres fenotípicos, genéticos y quimiotaxonómicos.
quimiotaxonómicos
20. GENÉTICOS
• 1 ) ADN / ARN: contenido de G+C, hibridación
ADN-ADN, secuenciación del ARNr
21. QUIMIOTAXONÓMICOS
• 1) MEMBRANA CITOPLASMÁTICA: ácidos grasos,
tipos de lípidos polares, presencia de ácidos
micólicos
• 2) PARED CELULAR: tipos de peptidoglucano,
presencia de ácidos teicoicos
• 3) PROTEÍNAS: comparación perfil proteínas,
secuencia de aminoácidos
22. T
A
ENFOQUE
X CLÁSICO
O
N TAXONOMÍA
NUMÉRICA
O
M
Í ENFOQUE GENÉTICO O
MOLECULAR
A
23. RASGO O CARACTERISTICA
Forma Constituyentes de pared celular
Tamaño Fuente de energía
Morfología de colonia Productos de fermentación
Temperatura óptima de desarrollo y
Características ultraestructurales
rango
Tinción Tolerancia osmótica
Mecanismo de motilidad Relación con el oxígeno
Inclusiones celulares pH óptimo y rango
Sensibilidad a inhibidores y
Fuentes de carbono y nitrógeno
antibióticos
24. Usa las características bioquímicas, morfológicas y culturales, así como
las susceptibilidad a los antibióticos y compuestos inorgánicos, para
determinar el grado de similitud entre organismos.
Se calcula luego un coeficiente o porcentaje de similitud.
similitud
Se construye un dendrograma o matriz de similitudes entre los
organismos.
25. Ejemplo de codificación de datos
Estados
Característico Cepa A Cepa B Cepa C Cepa D
1 s + + - 0
2 + + + +
3 + + + -
4 - + 0 0
5 + + + +
6 + + - +
7 + + - 0
8 0 - + +
9 + + + +
10 + + + -
11 + 0 - 0
12 + + + -
28. DENDROGRAMA
GRUPO
50 60 70 80 90 100
C freundii 1
Citrobacter
C diversus
2
Escherichia coli
3
GÉNERO Y ESPECIE
29. El significado ideal de la identificación y clasificación debe
ser comparar la secuencia de cada secuencia de genes en una
cepa dada, con la secuencia de genes para cada especie conocida.
El método que se usa es la hibridización.
hibridización
Este método puede ser usado para medir el número de secuencias
de DNA que dos organismos cualesquiera tienen en común y para
estimar el porcentaje de divergencia dentro de las secuencias de DNA
que están relacionadas pero no son idénticas.
30. VEN
CLASI TAJAS DE
FICAC L
ION G A
ENETI
CA
• BRINDA UN CONCEPTO MÁS UNIFICADO
DE ESPECIE
• ES MÁS OBJETIVA Y ESTABLE
• SE PUEDEN ORGANIZAR ESQUEMAS DE
IDENTIFICACIÓN FIDEDIGNOS
• INDICA CÓMO EVOLUCIONARON LOS
MICROORGANISMOS Y CÓMO PUEDEN
AGRUPARSE
31. ESPECIE
Grupo taxonómico básico
Menos definido que para organismos superiores
Rasgos morfológicos no tan importantes
Puede ser considerada como una colección de cepas que
muestras muchos rasgos en común y difieren
considerablemente de otras cepas
Una CEPA de una especie es considerada como CEPA TIPO
(comparar)
32. SUBESPECIE
Basada en variaciones fenotípicas y genotípicas
menores, pero constantes. Es la categoría más baja
aceptada oficialmente
33. CATEGORÍAS
INFRASUBESPECIE
Nombre preferido Sinónimo Cepas que tienen
biovar biotipo prop bioquímicas o fisiológicas
especiales
serovar serotipo prop antigénicas distintivas
patovar patotipo prop patogénicas para ciertos
animales
fagovar fagotipo lisis por ciertos fagos
morfovar morfotipo rasgos morfológicos
especiales
36. Se comparan macromoléculas que se comportan como
“cronómetros evolutivos”.
Sus característcias son:
3. distribución universal
4. realizar la misma función en todos los seres vivos
5. sus secuencias deben permitir la identificación de
regiones de homología y heterogeneidad
6. la tasa de cambio de la secuencia de la
macromolécula debe estar en correlación con la
distancia evolutiva
EL USADO ES EL ARNr, Y DENTRO DE ELLOS EL 16S
37. A. TINCIÓN: Gram, AAR, Cápsula
B. MÉTODOS BIOQUÍMICOS: actividad enzimática, medios selectivos
C. MÉTODOS SEROLÓGICOS: aglutinación en porta, ELISA, IFI
D. TIPIFICACIÓN POR BACTERIÓFAGOS: altamente específicos (placa)
E. SECUECIACIÓN DE AMINOÁCIDOS
F. PERFIL DE ÁCIDOS GRASOS
G. COMPOSICIÓN DE BASES DEL DNA: % de G+C
H. HIBRIDIZACIÓN DEL DNA
38. CULTIVO PURO
MORFOLOGÍA DE COLONIA Y GRAM
CARACTERÍSTICAS DE PROPIEDADES PROPIEDADES
BIOQUÍMICAS
CRECIMIENTO ANTIGÉNICAS
CARACTERÍSTICAS GENÉTICAS O MOLECULARES
PORCENTAJE DE G+C HIBRIDACION ESTABILIDAD TÉRMICA
39. DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIÓN
• Asegurarse que se trabaja con un cultivo PURO
• Trabajar desde categorías mayores a menores
• APLICAR EL SENTIDO COMÚN EN CADA PASO
• Usar el menor número de pruebas
• Comparar el aislamiento con cepas tipo o de
referencia
40. DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIÓN
CUANDO NO SE LOGRA IDENTIFICAR EL
AISLAMIENTO:
• Controlar pureza
• Asegurarse que se han realizado las pruebas
apropiadas
• Controlar que los métodos sean confiables
• Que se han usado correctamente las distintas claves y
tablas
41. Diagnóstico Investigaciones
Clínico No microbiológicas
Tomar correctamente
Rotular y embalar adecuadamente
Almacenar y transportar correctamente
No teñidos o
teñidos con Gram u
otra tinción
Característica de colonia,
morfología, hemólisis, pigmento,
etc.
Por difusión en
discos
Serología Tecnologías
o MIC de DNA
42.
43. CLASIFICACION DEL DOMINIO BACTERIA (Bergey 2001)
El Manual Bergey categoriza a las bacterias en taxones basados en la secuencia
de ARNr
Por otra parte lista características identificatorias de las bacterias tales como:
morfología celular, coloración de Gram, requerimientos de oxígeno
las bacterias del phylum Proteobacterias son Gram negativas
• Alfa Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum crecen
con niveles bajos de nutrientes (oligotróficos), algunos poseen
prostecas (prolongaciones celulares) . Incluye a fijadores de
nitrógeno, quimioautotrofos y quimioheterotrofos
• Beta Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum habitan
en el agua y suelo. Algunos son patógenos humanos, incluyen
quimioautotrofos y quimioheterotrofos. Bordetella, Burkholderia,
Neisseria
44. • Gama Proteobacterias: incluye los ordenes Pseudomonadales,
Legionellales, Vibrionales, Enterobacteriales, Pasteurellales,
Francisella
• Delta Proteobacterias: incluye los géneros Myxococcus y
Bdellovibrio, parásitos de otras bacterias y el género Desulfovibrio
• Epsilon Proteobacterias: incluye los patógenos humanos
Campylobacter y Helicobacter
45. Bacterias Gram negativas No-proteobacterias
Las phyla de bacterias Gram negativas no relacionadas filogeneticamente a
Proteobacteria se clasifican en varios phyla de Gram negativas no
Proteobacterias
1. El phylum Cyanobacteria corresponde a los fotoautotrofos que utilizan la
luz como fuente de energía y CO2 como fuente de carbono y producen
O2 durante la fotosíntesis
2. Los quimioheterotrofos incluyen Chlamydia (phylum Planctomyces),
Bacteroides (phylum Bacteroides), Fusobacterium (phylum
Fusobacteria) y Treponema, Borrelia y Leptospira (phylum Spirochetes).
Muchos de ellos patógenos humanos
46. El Manual Bergey divide a las bacterias Gram Positivas de
acuerdo a su contenido de G+C
1. Bacterias Gram Positivas de alto contenido de G+C (phylum Actinobacteria)
incluye el importante género Mycobacterium y los géneros filamentosos
Actinomyces y Streptomyces, formadores de conidiosporas. Los no
formadores Nocardia y Frankia también se incluyen aquí. Corynebacterium,
Propionibacterium
2. Bacterias Gram Positivas de bajo contenido de G+C (phylum Firmicutes)
incluye a las bacterias del suelo, las lácticas y numerosos patógenos. Los
órdenes Clostridiales (Clostridium), Bacillales (Bacillus) Lacobacilalles
(Staphylococcus, Streptococcus, Listeria y Lactobacillus). También incluye a
Micoplasmas (todavía clasificados como Gram negativos), pero como se
tiñen débilmente por su falta de pared, se incluyen entre las bacterias Gram
positivas de bajo contenido de G+C
47. Las bacterias fotosintetizadoras verdes (sulfúreas y no sulfúreas) y las púrpuras
(sulfúreas y no sulfúreas) son fotoautotrofas gram negativas que usan energía
luminosa y CO2 como fuente de carbono y no producen O2 (anoxigénicas). Se las
clasifica por una parte dentro de dos sub-phyla diferentes de las Proteobacterias
y por otra dentro de las no Proteobacterias
48.
49. “El estudio científico de los tipos y diversidad de
organismos y de cualquiera y todas las relaciones
entre ellos " (Simpson, 1961)
50. REINOS
Animalia
• 1753 C. Linnaeus 2 Reinos
Plantae
Animalia
• 1800´s E. Haeckel 3 Reinos Plantae
Protista
53. REINO REINO
Animalia Procaryotae
Phylum: Cordata Gracilicutes
Clase: Mammalia Scotobacteria
Orden: Primates Spirochaetales
Familia: Hominidae Spirochaetaceae
Género: Homo Treponema
Especie: sapiens pallidum
54. Las Proteobacterias son uno de los principales grupos de bacterias.
Patógenas y de vida libre, e incluyen muchas de las bacterias responsables
de la fijación del nitrógeno.Gram negativas, con una pared celular formada
principalmente de lipopolisacáridos. Muchas se mueven utilizando flagelos.
La mayoría de las proteobacterias son anaerobias, pero hay muchas
excepciones. La nutrición es usualmente heterótrofa,pero hay grupos que
realizan fotosíntesis. Las proteobacterias se dividen en cinco grupos, usualmente
considerados clases, según los estudios de las secuencias de ARNr.
Estos grupos se denominan según las letras griegas de alpha a epsilon
55. Proteobacterias alpha
Las proteobacterias alpha abarcan la mayoría de los géneros fototrofos,
pero también varios géneros que metabolizan componentes C1,
simbiontes de plantas (por ejemplo, rhizobia) y de animales y un
grupo de patógenos peligrosos, Rickettsiaceae. Por otra parte, se
piensa que los precursores de las mitocondrias de la células
eucariotas se han originado en este grupo bacteriano.
56. Proteobacterias beta
Las proteobacterias beta abarcan varios grupos de las bacterias aerobias
o facultativas que son a menudo altamente versátiles en sus capacidades
de degradación, pero también contienen géneros quimiolitotróficos
y algunos fototrofos. Las Proteobacterias beta juegan un papel importante en la
fijación de nitrógeno en varios tipos de plantas, oxidando amonio para producir
nitrito, un producto químico importante para la función de las plantas.
Muchas de ellas se encuentran en muestras ambientales, tales como aguas residuales
o el suelo. Especies patógenas dentro de esta clase son Neisseriaceae
(que causa gonorrea y meningoencefalitis) y las especies del género Burkholderia.
57. Proteobacterias gamma
Las proteobacterias gamma abarcan varios grupos de bacterias importantes para
la ciencia y la medicina tales como Enterobacteriaceae, Vibrionaceae y
Pseudomonadaceae.
Este grupo incluye varios patógenos importantes, como por ejemplo, Salmonella
(enteritis y fiebre tifoidea), Yersinia (peste), Vibrio (cólera), Pseudomonas aeruginosa
(infecciones del pulmón en pacientes hospitalizados o con fibrosis quística).
58. Proteobacterias delta
Abarcan un grupo de géneros predominante aerobios, myxobacteria, que
forman cuerpos fructíferos y un grupo de géneros estrictamente anaerobios,
que contienen la mayor parte de las bacterias reductoras de sulfato y de las
bacterias reductoras de sulfuro junto con otras bacterias anaerobias con
diferente fisiología.
59. Proteobacterias epsilon
Comprenden solamente unos pocos géneros, principalmente Wolinella, Helicobacter y
Campylobacter,que tienen forma helicoidal. La mayor parte de las especies conocidas
habitan en el tracto digestivo de seres humanos y animales y proporcionan servicio como
simbiontes (Wolinella en el ganado vacuno) o son patógenos (Helicobacter en el
estómago, Campylobacter en el duodeno). También se han recuperado numerosas
secuencias ambientales de respiraderos fríos e hidrotermales.