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Nomenclatura y
clasificación.
Aristóteles
400 años A.C.
2 grupos:
• Reino animal- Aire, mar y tierra.
• Reino vegetal.
Teofrasto. Botánico
griego, discípulo de Aristóteles
Reino vegetal. Tipo de crecimiento:
• Hierbas: sin tallo leñoso
• Arbustos: Muchos tallos leñosos.
• Árboles: Tallo leñoso principal.
John Ray.
Reino vegetal. Plantas con semillas.
• Asigna nombre en latín.
Taxonomía.
Ciencia que estudia la clasificación
u ordenamiento sistemático de los
organismos en grupos o
categorías, denominados taxón.
Charles Linneo.
Biólogo sueco
Padre de la Taxonomía.
Sistema de clasificación Binaria:
• Genero
• Especie
Ernest H. Haeckel
Biologò aleman: (1834-1919).
Existencia 3 reino:
• Reino animal.
• Reino vegetal.
• Protista: Organismos primitivos, uni, pluri y
multicelulares.
R. Stainer. Microbiologo
canadiense (1957).
4to. Reino:
• Reino animal.
• Reino vegetal.
• Protista superior: organismos eucariontes, algas,
hongos y protozoarios.
• Protista inferior: Organismos procariontes,
bacterias y algas cianofíceas.
R. H. Whittaker.
Biólogo EEUU (1969).
5to. Reino.
• Reino animal-...
• Reino vegetal.
• Monera: unicelulares y procariontes, bacterias y algas
cianofíceas.
• Protista : Organismos eucariontes unicelulares y
protozoarios.
• Fungi: hongos macroscópicos y levaduras.
La clasificación de los microorganismos implica:
• Disposición en niveles taxonómicos jerárquicos.
• Los m.o situados en cada rango o nivel comparten una serie común
de rasgos específicos.
• Los rasgos se agrupan en una estructura jerárquica sin
superposiciones, de tal forma que cada nivel incluye no sólo los
rasgos que definen al rango que se encuentra por encima, sino
además una nueva serie de rasgos más restrictivos.
Sistema de clasificación actual basado en la relación
evolutiva de la secuencia 16S del rDNA: con tres
dominios mayores:
• Bacterias: cianobacterias, micoplasmas y bacterias
• verdaderas.
• Arqueas (procariotes): bacterias que crecen en
condiciones extremas
• Eucariotes: animales, hongos y plantas. (Sarethy y Danquah,
2014).
Manual de Bergey`s
Código internacional de
nomenclatura.. 3 dominios.
BACTERIA:
• Eubacterias.
• Aerobios y anaerobios.
• Gram (+) y Gram(-)
• Quimiorganotrofos..
• Fototrofos.
ARCHAE:
• Procariontes sencillos.
• Halófilas.
• Termófilas.
EUCARIA:
• Animales.
• Hongos.
• Plantas.
• Flagelados.
• Ciliados.
Las cepas dentro de una especie pueden clasificarse en:
A) Biovariedades: Variantes de cepas bacterianas caracterizadas por diferencias
bioquímicas y fisiológicas.
B) Morfovariedades: Se diferencian desde el punto de vista morfológico
.
C) Serovariedades: Presentan propiedades antigénicas diferentes.
D) Patovariedad: Se diferencían por el proceso y grado de patogenicidad.
E) Fagovariedad: Presentan diferente especificidad por los fagos.
F) Ecotipo: Se han adaptado a ocupar un mismo nicho ecológico.
Nomenclatura de microorganismos
NOMENCLATURA
BINOMIAL
Considera:
• Genero: grupo de especies
estrechamente relacionadas
entre sí.
• Especie: unidad básica de
clasificación; grupo de
individuos con
características en común..
PRIMERA PALABRA:
• Indica el género al que
pertenece el organismo.
• Primera letra se escribe en
mayúscula.
SEGUNDA PALABRA:
• Indica la especie.
• Escribe en cursiva y
subrayada.
Ejemplos:
(Rana) R. pipiens.- Rana leopardo.
(Canis) C. Familiaris. Perro.
NOMBRE CIENTIFICO: Letra
cursiva, completo
Caracterización fenética.
Los enfoques clásicos hacen uso de características:
• morfológicas,
• fisiológicas,
• bioquímicas,
• ecológicas y genéticas.
Son muy útiles en la identificación rutinaria y proporcionan información
filogenética.
Características morfológicas: expresión de genes (estables), no varían de
forma sustancial con los cambios ambientales, indicador del parentesco
filogenético.
Características fisiológicas y metabólicas: relacinan la naturaleza y
actividad de enzimas y proteínas de transporte. Puesto (proteínas son
productos genéticos), el análisis proporciona una comparación indirecta de
los genomas microbianos.
Características ecológicas: capacidad de un microorganismo para
colonizer un ambiente concreto es una propiedad valiosa en taxonomía.
Identificación morfológica de los microorganismos.
Es la observación microscópica, para lo cual
empleamos distintas tinciones que nos
permiten visualizar mejor las características
de las células:
• Frotis.
• Tinción.
Tinción de Gram: este tipo de tinción es el más
empleado, revela la forma de la célula bacteriana,
su agrupación y grupo taxonómico al que
pertenece, ya sea Gram positivo o Gram negativo.
• Esféricos: Cocos, Diplococos, estreptococos,
sarcinas y estafilococos.
• Alargados: bacilos, diplobasilos,
estreptobacilos, empalizadas.
Tinción de cápsula: se tiñe de color azul pálido,
mientras que la célula y su interior de color azul obscuro.
Caracterización genotípica.
Análisis comparativo de genomas proporciona numerosos
rasgos que permiten
discriminar distintas especies bacterianas, proporciona una
visión a nivel del DNA. (secuencia del gen 16S del rDNA).
Filogenia microbiana.
Los datos filogenéticos se usan cada vez más en la taxonomía
bacteriana para complementar la información fenotípica y
genotípica.
Los conocimientos sobre la biología de los microorganismos, a los
avances de la informática y uso de las características moleculares
para determinar relaciones filogenéticas entre microorganismos
(Willey et al., 2009).
Algunas de las técnicas que se emplean para estudiar la filogenia
microbiana son:
A) Cronómetros moleculares. Secuencias de ácidos nucleicos y
proteínas cambian con el tiempo cronómetros moleculares dentro
del reloj evolutivo.
La secuencia de muchos rRNA y proteínas cambian
gradualmente con el tiempo.
B) Árboles filogenéticos. Las relaciones filogenéticas se
representan en diagramas
ramificados o árboles.
Árboles filogenéticos.
Es la representación gráfica de la relación existente entre secuencias
de diferentes organismos que muestra una historia evolutiva a partir de
diferencias en la secuencia de nucleótidos en un formato de tipo árbol
genealógico.
Muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades
que se cree que tienen un ancestro en común y está representado por
ramas y nodos (Solomon et al 2008).
• Los nodos internos representan a los ancestros,
• los nodos intermedios representan los puntos en el curso de la
evolución donde se produjo la divergencia del ancestro en las nuevas
entidades, y las ramas representan las nuevas especies evolutivas.
• La longitud de cada rama corresponde al número de cambios que se
• han sucedido a lo largo de dicha rama.
En los árboles filogenéticos se pueden diferenciar varios grupos de
especies dependiendo del origen evolutivo de las especies:
A) Monofilético: grupo de organismos que presentan un antepasado
común con todos y cada uno de sus descendientes.
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  • 2. Aristóteles 400 años A.C. 2 grupos: • Reino animal- Aire, mar y tierra. • Reino vegetal. Teofrasto. Botánico griego, discípulo de Aristóteles Reino vegetal. Tipo de crecimiento: • Hierbas: sin tallo leñoso • Arbustos: Muchos tallos leñosos. • Árboles: Tallo leñoso principal. John Ray. Reino vegetal. Plantas con semillas. • Asigna nombre en latín. Taxonomía. Ciencia que estudia la clasificación u ordenamiento sistemático de los organismos en grupos o categorías, denominados taxón. Charles Linneo. Biólogo sueco Padre de la Taxonomía. Sistema de clasificación Binaria: • Genero • Especie
  • 3. Ernest H. Haeckel Biologò aleman: (1834-1919). Existencia 3 reino: • Reino animal. • Reino vegetal. • Protista: Organismos primitivos, uni, pluri y multicelulares. R. Stainer. Microbiologo canadiense (1957). 4to. Reino: • Reino animal. • Reino vegetal. • Protista superior: organismos eucariontes, algas, hongos y protozoarios. • Protista inferior: Organismos procariontes, bacterias y algas cianofíceas. R. H. Whittaker. Biólogo EEUU (1969). 5to. Reino. • Reino animal-... • Reino vegetal. • Monera: unicelulares y procariontes, bacterias y algas cianofíceas. • Protista : Organismos eucariontes unicelulares y protozoarios. • Fungi: hongos macroscópicos y levaduras.
  • 4.
  • 5.
  • 6.
  • 7. La clasificación de los microorganismos implica: • Disposición en niveles taxonómicos jerárquicos. • Los m.o situados en cada rango o nivel comparten una serie común de rasgos específicos. • Los rasgos se agrupan en una estructura jerárquica sin superposiciones, de tal forma que cada nivel incluye no sólo los rasgos que definen al rango que se encuentra por encima, sino además una nueva serie de rasgos más restrictivos.
  • 8. Sistema de clasificación actual basado en la relación evolutiva de la secuencia 16S del rDNA: con tres dominios mayores: • Bacterias: cianobacterias, micoplasmas y bacterias • verdaderas. • Arqueas (procariotes): bacterias que crecen en condiciones extremas • Eucariotes: animales, hongos y plantas. (Sarethy y Danquah, 2014).
  • 9. Manual de Bergey`s Código internacional de nomenclatura.. 3 dominios. BACTERIA: • Eubacterias. • Aerobios y anaerobios. • Gram (+) y Gram(-) • Quimiorganotrofos.. • Fototrofos. ARCHAE: • Procariontes sencillos. • Halófilas. • Termófilas. EUCARIA: • Animales. • Hongos. • Plantas. • Flagelados. • Ciliados.
  • 10.
  • 11. Las cepas dentro de una especie pueden clasificarse en: A) Biovariedades: Variantes de cepas bacterianas caracterizadas por diferencias bioquímicas y fisiológicas. B) Morfovariedades: Se diferencian desde el punto de vista morfológico . C) Serovariedades: Presentan propiedades antigénicas diferentes. D) Patovariedad: Se diferencían por el proceso y grado de patogenicidad. E) Fagovariedad: Presentan diferente especificidad por los fagos. F) Ecotipo: Se han adaptado a ocupar un mismo nicho ecológico.
  • 12. Nomenclatura de microorganismos NOMENCLATURA BINOMIAL Considera: • Genero: grupo de especies estrechamente relacionadas entre sí. • Especie: unidad básica de clasificación; grupo de individuos con características en común.. PRIMERA PALABRA: • Indica el género al que pertenece el organismo. • Primera letra se escribe en mayúscula. SEGUNDA PALABRA: • Indica la especie. • Escribe en cursiva y subrayada. Ejemplos: (Rana) R. pipiens.- Rana leopardo. (Canis) C. Familiaris. Perro. NOMBRE CIENTIFICO: Letra cursiva, completo
  • 13. Caracterización fenética. Los enfoques clásicos hacen uso de características: • morfológicas, • fisiológicas, • bioquímicas, • ecológicas y genéticas. Son muy útiles en la identificación rutinaria y proporcionan información filogenética. Características morfológicas: expresión de genes (estables), no varían de forma sustancial con los cambios ambientales, indicador del parentesco filogenético. Características fisiológicas y metabólicas: relacinan la naturaleza y actividad de enzimas y proteínas de transporte. Puesto (proteínas son productos genéticos), el análisis proporciona una comparación indirecta de los genomas microbianos. Características ecológicas: capacidad de un microorganismo para colonizer un ambiente concreto es una propiedad valiosa en taxonomía.
  • 14.
  • 15. Identificación morfológica de los microorganismos. Es la observación microscópica, para lo cual empleamos distintas tinciones que nos permiten visualizar mejor las características de las células: • Frotis. • Tinción. Tinción de Gram: este tipo de tinción es el más empleado, revela la forma de la célula bacteriana, su agrupación y grupo taxonómico al que pertenece, ya sea Gram positivo o Gram negativo. • Esféricos: Cocos, Diplococos, estreptococos, sarcinas y estafilococos. • Alargados: bacilos, diplobasilos, estreptobacilos, empalizadas. Tinción de cápsula: se tiñe de color azul pálido, mientras que la célula y su interior de color azul obscuro.
  • 16.
  • 17. Caracterización genotípica. Análisis comparativo de genomas proporciona numerosos rasgos que permiten discriminar distintas especies bacterianas, proporciona una visión a nivel del DNA. (secuencia del gen 16S del rDNA).
  • 18.
  • 19. Filogenia microbiana. Los datos filogenéticos se usan cada vez más en la taxonomía bacteriana para complementar la información fenotípica y genotípica. Los conocimientos sobre la biología de los microorganismos, a los avances de la informática y uso de las características moleculares para determinar relaciones filogenéticas entre microorganismos (Willey et al., 2009). Algunas de las técnicas que se emplean para estudiar la filogenia microbiana son: A) Cronómetros moleculares. Secuencias de ácidos nucleicos y proteínas cambian con el tiempo cronómetros moleculares dentro del reloj evolutivo. La secuencia de muchos rRNA y proteínas cambian gradualmente con el tiempo. B) Árboles filogenéticos. Las relaciones filogenéticas se representan en diagramas ramificados o árboles.
  • 20. Árboles filogenéticos. Es la representación gráfica de la relación existente entre secuencias de diferentes organismos que muestra una historia evolutiva a partir de diferencias en la secuencia de nucleótidos en un formato de tipo árbol genealógico. Muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree que tienen un ancestro en común y está representado por ramas y nodos (Solomon et al 2008). • Los nodos internos representan a los ancestros, • los nodos intermedios representan los puntos en el curso de la evolución donde se produjo la divergencia del ancestro en las nuevas entidades, y las ramas representan las nuevas especies evolutivas. • La longitud de cada rama corresponde al número de cambios que se • han sucedido a lo largo de dicha rama.
  • 21. En los árboles filogenéticos se pueden diferenciar varios grupos de especies dependiendo del origen evolutivo de las especies: A) Monofilético: grupo de organismos que presentan un antepasado común con todos y cada uno de sus descendientes. B) Parafilético: Se forma en el caso de que falten algunos de los C) Polifilético: Se construye cuando hay organismos de varios clados, es decir, que no proceden de un antepasado común cercano; simplemente, se han reunido por conveniencia de los investigadores.