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  1. Prácticas de Microbiología
  2. Objetivos • Reforzar conocimientos teóricos. • Adquirir habilidades. • Motivación.
  3. Seguridad en el Laboratorio • Reducción a un nivel aceptable, del riesgo inherente a la manipulación de material infeccioso. • El equipamiento y el diseño contribuyen a la seguridad sólo si las personas que trabajan en el laboratorio conocen las normas y las aplican.
  4. Clasificación de agentes biológicos • Grupo 1: Poco probable que cause enfermedad en el ser humano.
  5. Clasificación de agentes biológicos • Grupo 1: Poco probable que cause enfermedad en el ser humano. • Grupo 2: Puede causar enfermedad al ser humano, pero es poco probable que se propague a la colectividad, y existe tratamiento o profilaxis eficaz.
  6. Clasificación de agentes biológicos • Grupo 1: Poco probable que cause enfermedad en el ser humano. • Grupo 2: Puede causar enfermedad al ser humano, pero es poco probable que se propague a la colectividad, y existe tratamiento o profilaxis eficaz. • Grupo 3: Puede causar enfermedad grave, con riesgo de que se propague, pero existe profilaxis o tratamiento eficaz.
  7. Clasificación de agentes biológicos • Grupo 1: Poco probable que cause enfermedad en el ser humano. • Grupo 2: Puede causar enfermedad al ser humano, pero es poco probable que se propague a la , y existe tratamiento o profilaxis eficaz. • Grupo 3: Puede causar enfermedad grave, con riesgo de que se propague, pero existe profilaxis o tratamiento eficaz. • Grupo 4: Causa enfermedad grave, con muchas probabilidades de que se propague y sin profilaxis o tratamiento eficaz.
  8. Seguridad biológica • Equipo de seguridad (barreras primarias): Aparatos y dispositivos (cabinas de seguridad) y prendas de protección personal (batas, guantes).
  9. Seguridad biológica • Equipo de seguridad (barreras primarias): Aparatos y dispositivos (cabinas de seguridad) y prendas de protección personal (batas, guantes). • Diseño y construcción (barreras secundarias): Filtrado de aire, superficies impermeables.
  10. Seguridad biológica • Equipo de seguridad (barreras primarias): Aparatos y dispositivos (cabinas de seguridad, extractores de gases) y prendas de protección personal (batas, guantes). • Diseño y construcción (barreras secundarias): Filtrado de aire, superficies impermeables. • Técnicas de laboratorio: Conocimiento y control de riesgos.
  11. Niveles de contención • Nivel 1: Cuando se emplean cepas no patógenas. Ej. Microbiología de alimentos. • Nivel 2: Para agentes tipo 2. Prácticas de laboratorio en Universidades. • Nivel 3: Agentes tipo 3. Peligro mas frecuente: transmisión por aerosoles o fluidos biológicos (Brucella, Coxiella..). • Nivel 4: Agentes tipo 4, patógenos muy contagiosos y sin tratamiento eficaz.
  12. Normas básicas de seguridad • Acceso limitado al personal autorizado. • Limpiar las superficies de trabajo diariamente y siempre que se produzca un derrame. • No dejar objetos en los pasillos ni en lugares donde interfieran con el trabajo. • Usar SIEMPRE bata de laboratorio. No usar ropa de trabajo que aumente la superficie corporal expuesta (pantalón corto, sandalias). • Si se tiene el cabello largo, llevarlo recogido.
  13. Normas básicas de seguridad • No colocar papeles ni libros en la zona de trabajo. • PROHIBIDO comer, beber, fumar o llevarse objetos a la boca. Evitar tocarse los ojos o la boca. No pipetear con la boca. • Lavarse bien la manos al final de la sesión o siempre que se ensucien. • Desechar agujas y jeringas usadas en los contenedores apropiados. • Si se usan guantes, desecharlos antes de salir del laboratorio y lavarse las manos. No tocar con ellos papeles, teléfono, etc.
  14. Trabajo en el laboratorio • Puntualidad. Bata de laboratorio. • Lectura y comprensión previa del trabajo a realizar. • Orden: Se realizan varios experimentos a la vez. • Evitar movimientos bruscos. • Identificar claramente placas y tubos (rotulador impermeable al agua). Placas boca abajo.
  15. Trabajo en el laboratorio • Flamear asa de siembra antes y después de usarla, poniéndola al rojo vivo. • Material contaminado de un solo uso: Bolsas de polipropileno y autoclave. Los objetos punzantes (agujas, portaobjetos etc.) deben depositarse en contenedores especiales. • Material de vidrio contaminado: doce horas en desinfectante, luego se autoclava, se lava y se seca.
  16. Equipamiento de laboratorio • Microscopio: Observar objetos >2micras no visibles a simple vista. • Lentes: objetivos y oculares. • Fuente de iluminación y diafragma. • Micrométrico y macrométrico.
  17. Equipamiento de laboratorio • Estufa: temperatura adecuada para crecimiento de microorganismos. Temperaturas selectivas. • Nevera: Conservación de muestras, reactivos,
  18. Equipamiento de laboratorio • Autoclave: Preparación de medios, esterilización de material e instrumental, esterilización de basura.
  19. Equipamiento de laboratorio • Material de vidrio: Vidrio borosilicado (Pyrex). Volumétrico y no volumétrico. • Material plástico: Un solo uso.
  20. Equipamiento de laboratorio • Mechero Bunsen: Base sólida y tubo vertical. Abrir el regulador de aire se produce llama azul. Parte mas calurosa de la llama justo encima del cono azul interno. • Usos: flamear el asa, calentar medios, esterilizar el aire de la zona de trabajo .
  21. Diagnóstico microbiológico • El microbiólogo clínico veterinario debe colaborar con los veterinarios clínicos y con otros miembros del equipo de salud para proporcionar el diagnóstico y manejo óptimo de los animales con enfermedades infecciosas y para prevenir la diseminación de la enfermedad. Es importante: documentar la presencia de una infección, determinar su naturaleza y administrar la terapia adecuada.
  22. Funciones del laboratorio • Aislar e identificar microorganismos. • Estudiar su sensibilidad. • Determinar la naturaleza de las infecciones. • Formar a los clínicos en técnica de toma de muestras y transporte. • Informar al personal responsable y a las autoridades sanitarias sobre la aparición de determinadas infecciones. • Colaborar en la prevención y control de las infecciones.
  23. Diagnóstico de infecciones • Información a través de la historia clínica (dueño, visitas previas) y el examen clínico.
  24. Diagnóstico de infecciones • Información a través de la historia clínica (dueño, visitas previas) y el examen clínico. • Pruebas complementarias: Radiografías, ecografías, electrocardiogramas, RMN,
  25. Diagnóstico de infecciones • Información a través de la historia clínica (dueño, visitas previas) y el examen clínico. • Pruebas complementarias: Radiografías, ecografías, electrocardiogramas, RMN, • Análisis clínicos: bioquímica, hematología, MICROBIOLOGÍA.
  26. Utilidad de los análisis microbiológicos • Diagnóstico de infecciones. • Seguir la evolución de la enfermedad: curva de aparición y desaparición de Ag y Ak en serología; cultivos de control. • Determinar la eficacia de un tratamiento cuando los síntomas de mejora no sean claros (ej. Infección urinaria).
  27. Diagnóstico microbiológico • Diagnóstico directo: Poner de manifiesto la presencia del microorganismo (tinción, cultivo). • Diagnóstico indirecto: Demostrar la huella que el microorganismo deja en el enfermo (serología, técnicas genéticas).
  28. Servicio de Microbiología Solicitud de análisis Datos del paciente Especie: Raza: Edad: Sexo: Propietario (nombre y teléfono): Solicitado por: Orientación diagnóstica: Tratamiento previo: Petición:  Tinción  Cultivo  Anaerobios  Micobacterias  Hongos  Serología  Otros: Muestra:  Orina  Heces  Sangre  Exudado  Sangre  LCR  Esputo  Otros: Fecha y hora de la obtención: Observaciones: Resultados: Observaciones: Fecha y hora de entrada: Fecha de informe: Firma:
  29. Toma de muestras: Normas generales • Enviarlas por separado, bien empaquetadas y correctamente identificadas. • Acompañadas de volante de petición. • Tomarlas lo mas pronto posible en relación a la aparición de síntomas. • Antes de iniciar tratamiento. • Toma aséptica.
  30. Toma de muestras: Normas generales II • Evitar la desecación (especialmente hisopos). • Tomar la muestra de los bordes de las lesiones (zona de replicación). • Conservación según el tipo de muestra. En general, refrigeradas pero no congeladas. Sueros congelados. Sangre, LCR, etc. A temperatura ambiente o en estufa.
  31. Toma de muestras: Orina • Teóricamente líquido estéril. • Evitar contaminación durante su recogida. • Usar frascos estériles de poliestireno. • Tiempo mas breve posible entre recogida y procesamiento. • Si es mas de 1 hora, refrigerar pero no congelar.
  32. Toma de muestras: Orina II • Tres métodos de recogida: directa, sondaje y punción suprapúbica.. • Preferible directo. Necesidad de controlar al animal y de que éste coopere. Descartar la primera parte de la micción, recoger la parte central y descartar el resto.
  33. Toma de muestras: Orina III • Sondaje: Riesgos. Podemos provocar una infeccción si la sonda no está estéril. Descartar la primera parte de la micción (flora de arrastre). • Punción suprapúbica o cistocentesis: Extraer la orina directamente de la vejiga con aguja y jeringa estériles. No hay flora de arrastre. Riesgos.
  34. Toma de muestras: Heces • Recogida en frasco limpio, no imprescindible que sea estéril. • Tienen flora habitual. Buscamos patógenos o desequilibrios. • Recoger en suelo limpio. Evitar la contaminación con otros materiales: serrín, tierra.... Asegurarse de que sea el animal correcto. • Dificultad para obtener la muestra: Hisopos rectales. • Si hay demora, refrigerar, pero es mejor evitarlo.
  35. Toma de muestras: Sangre • Cortar el pelo y desinfectar la zona de la punción. Evitar su contaminación posterior. • Aguja y jeringa estériles; inyectar a frascos que contengan medio de cultivo (aerobios y anaerobios). • Conservar en estufa o tª ambiente. • Varias muestras a lo largo de 24 h ya que la bacteriemia suele ser intermitente. • Perros y gatos, venas de las patas (safena lateral, cefálica).
  36. Toma de muestras: Líquidos corporales • Afeitar y desinfectar la zona. • Punción aséptica con aguja y jeringa estériles. • Conservar en estufa o a temperatura ambiente. • Ej.: LCR, líquido pleural, articular, etc.
  37. Toma de muestras con hisopo • Hisopo: pequeño trozo de algodón enrrollado alrededor del extremo de una varilla de madera. Estériles y empaquetados en un tubo. • Alginato cálcico: no inhibe el crecimiento bacteriano, no interfiere en la acción de antibióticos y no irrita los tejidos. • Muestras: piel (heridas, pústulas, abcesos); secreciones (vulva, prepucio); exudados (ojos, oídos, nasales); hisopos rectales.
  38. Toma de muestras: Pus • Si no se puede tomar con hisopo, se aspira con aguja y jeringa estéril. • Si se sospechan anaerobios, evitar la entrada de oxígeno en la muestra.
  39. Examen y cultivo de las muestras: bacteriología • Tinciones: Gram, Ziehl-Nielsen, Azul de algodón,.. • Cultivo en diversos medios.
  40. Tinción de Gram • Fijar la preparación: poner una gota de la muestra en el centro de un portaobjetos y extender con el asa de siembra. Dejar secar al aire y FIJAR haciendo cortes a la llama del mechero. • Si lo que teñimos es una colonia que está en un medio sólido, poner una gota de agua en el portaobjetos y disolver en ella la colonia.
  41. Tinción de Gram II • Cubrir la preparación con cristal violeta (1 min). • Decantar y lavar con agua. • Cubrir la preparación con lugol (1 min) • Decantar y lavar con agua. • Decolorar con alcohol-acetona (30 sg.). • Decantar y lavar con agua. • Cubrir con safranina (15 seg). • Decantar, lavar y dejar secar al aire.
  42. Tinción de Gram III • Observar al microscopio con objetivo de inmersión tras añadir una gota de aceite. • Divide a las bacterias con pared en Gram positivas (violeta) y Gram negativas (rosa).
  43. Ejemplos de Gram
  44. Tinción de Ziehl-Neelsen • Fijar la preparación. • Carbolfucsina 20 min. Flamear cada 8 min. hasta desprender vapor. • Decolorar con alcohol- Ac. Clorhídrico, 2 min. • Azul de metileno 1 min. • Decantar y lavar en cada paso.
  45. Ejemplos de tinción de ZN
  46. Tinción de ZN
  47. Medios de cultivo • Por su consistencia: Líquidos (nutrientes + sol. Tampón), sólidos (líquido + agar). • Por su origen: sintéticos (químicamente definidos), semisintéticos (sintético + extracto orgánico), naturales (composición inconstante). • Por su composición: comunes (bacterias poco exigentes), enriquecidos (añadir factores de crecimiento, para bacterias exigentes).
  48. Medios de cultivo II • De enriquecimiento: Medio LIQUIDO que favorece el desarrollo de unas bacterias e inhibe a otras. • Selectivo: Medio SOLIDO que favorece el desarrollo de unas bacterias e inhibe a otras (pH, tª, Pr. Osmótica, antisépticos, atbs.) • Diferenciales: las bacterias actúan sobre uno o varios de sus componentes poniendo de manifiesto sus características.
  49. Cultivo de muestras • Placas de Petri (medios sólidos) o tubos (medios sólidos o líquidos). • Siembra con asa. A veces con hisopo. • Asa: mango + filamento (platino o nicrom) • Asas: de picadura (recta) o de bucle (calibrada). • Flamear siempre el asa antes y después de usarla.
  50. Técnicas de siembra en placa • Recuento, aislamiento, césped. • Flamear el asa antes y después de usarla. • Recuento: contar el nº de bacterias. • Aislamiento: separarlas para ver cuantos tipos hay, hacerles pruebas etc. • Césped: Antibiograma.
  51. Aislamiento
  52. Recuento
  53. Siembra en césped
  54. Siembra en tubo • Medios líquidos: inclinar el tubo, depositar la muestra en la pared, y mezclar moviendo suavemente. • No generar aerosoles. • Flamear la boca del tubo y mantener el tapón en la mano.
  55. Siembra en tubo • Medios sólidos: rectos o en pico de flauta (plano inclinado). • Flamear la boca del tubo y mantener el tapón en la mano. • No tocar con el mango del asa el medio.
  56. Análisis de orina • Examen físico (aspecto, color, olor) y químico (pH, glucosa, nitritos). • Sedimento urinario: 10 a 15 mL de orina en un tubo cónico, centrifugar a 1000 rpm 5-10 min, eliminar sobrenadante y poner una gota del sedimento entre porta y cubre. Observar a microscopio. • Indicación de lo que podemos obtener en el cultivo y otros datos (cristales, levaduras, células).
  57. Cultivo de orina • Sembrar en un medio en el que crezcan Gram +, Gram – y levaduras (ej. CLED, Agar sangre); y en un medio selectivo para Gram – (ej. Agar McConkey). • La mayoría de las infecciones urinarias las causan enterobacterias y Pseudomonas. • Recuento en el medio rico (CLED) y aislamiento en el selectivo (McConkey).
  58. Resultados de cultivo de orina • Valorar la presencia de bacterias en función del número y del tipo. • Punción suprapúbica: cualquier nº de bacterias indica infección. • Sondaje y recogida directa: flora de arrastre. Infección si hay >100000 ufc/mL; entre 10000 y 100000, repetir y menos de 1000, contaminación. En la mayoría de los casos 1 solo tipo de bacterias; en un 10%, 2 tipos.
  59. Casos especiales • Levaduras y algunos Gram positivos: infección con menos de 100000 ufc/mL. • Considerar el estado general del animal: diabéticos, tratados con inmunosupresores, etc.
  60. Lectura de resultados Cultivo de orina
  61. Recuento • CLED: Fermentadores de lactosa (amarillos) no fermentadores de lactosa (de su color). • Crecen Gram +, Gram – y levaduras. • Asa calibrada: calcular el nº de ufc/mL
  62. Aislamiento • Separar las colonias para ver cuantos tipos y poder hacer separadamente las pruebas. • Agar McConkey: Fermentan lactosa (rojo-rosado); no la fermentan (de su color).
  63. Protocolo básico para cultivo de heces • Medio de enriquecimiento para Salmonella. Ej. Caldo de selenito. Incubar a 37ºC, 24 h y resembrar en medio sólido (Agar SS). • Medios sólidos: Sembrar por aislamiento. Detección de patógenos mas frecuentes. Agar McConkey, Agar Salmonella-Shigella, Agar Verde Brillante, Agar con sal y manitol, Agar Sabouraud.
  64. Agar McConkey • Observar el equilibrio de la flora. • Solo crecen Gram negativos. • Fermentan la lactosa, de color rojo. No la fermentan, de su color. • Normal: varios tipos.
  65. Agar Salmonella-Shigella (SS) • Moderadamente selectivo para Salmonella y Shigella. • Fermentan la lac, rojas- rosadas; no la fermentan, de su color. • Producción de SH2, precipitados negros. • Sospecha de Salmonella: transparentes con precipitados negros. Colonias en ojo de muñeca.
  66. Producción de SH2
  67. Agar Verde Brillante (BG) • Muy selectivo para Salmonella. • Fermentan lactosa, color diverso (amarillas, verdosas); no la fermentan, rojo. • Sospechas de Salmonella, coloración rojiza.
  68. Agar con sal y manitol (MSA) • Alta concentración salina. • Selectivo para Staphylococcus. • Sospecha de Staphylococcus aureus, color amarillo (fermentación de manitol).
  69. Agar Sabouraud • Favorece el desarrollo de levaduras. • Pueden crecer otros microorganismos. • Incubar 48 horas a 37ºC. • Colonias sospechosas de levaduras: blancas nacaradas con olor a pan. Tipo Candida, mas frecuentes en intestino.
  70. Heces • Existe flora normal. Buscamos patógenos. • Presencia/ausencia. No importa el número • Disbacteriosis: desequilibrio de la flora habitual del intestino (ej. Excesivo consumo de antibióticos). • Importancia de la orientación diagnóstica para elegir los medios.
  71. Exudados • La flora habitual y los patógenos mas frecuentes varían según la zona del cuerpo que se estudie, y según la especie animal. • Normalmente sembramos en un medio rico (Cled, Agar Sangre) y en un medio selectivo para Gram neg. (McConkey). Se puede añadir un medio para hongos y levaduras, un medio para anaerobios etc. • Sembramos por aislamiento.
  72. Anaerobios • Examen directo (ej. Gram), cultivo, identificación y antibiograma. Pero todo en ausencia de oxígeno, desde la recogida de muestra hasta la identificación y los antibiogramas. • Morfología típica en los Gram. • Siembra en medios prerreducidos. Añadir atb que inhiban la flora aerobia (ej aminoglicósidos).
  73. Anaerobios • Cultivo en jarras para anaerobios. Generar anaerobiosis por medios químicos (reactivos que al añadir agua genera hidrógeno que se combina con el oxígeno). Vela que consume el oxígeno. • Identificación por Gram, sensibilidad a atb, aspecto de las colonias...
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