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Juan J. Merelo Guervós Univ. de Granada
Francisco Fernández de Vega Univ. de
Extremadura
Motivación



   Modelo de islas mejora secuencial
   Modelos asíncronos mejores
   Poblaciones asíncronas

          Ventajas de la diversidad
Hipótesis


   Intercambiar los mejores individuos no
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                ?
   ?    ?
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            ?
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Hipótesis
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   Simultáneamente:

                 Calidad



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       El más diferente de la población
  
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   El más diferente de la población destino
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¿Cuál es el más diferente
de toda la población
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 Representación de la población:

  El mejor


  La secuencia consenso
Secuencia consenso


  Compuesta por los alelos más frecuentes
    para cada posición del genotipo.

       10111001100010110
       01110010110001011
       00111100001010111
   SC: 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 1 1
Nuestro modelo
     Representación G2 del genotipo


                                      G3
       P1                  P2
G1

            “bastante”
            diferente “bastante”
Pn                                    P3
             de G2     diferente
                        de G3
La implementación


   Cromosomas: cadenas binarias de
      longitud fija
      Cruce: bipunto
  
      Mutación: bit a bit
  
      Implementación en Perl
  
      Escenario paralelo simulado
  
Problemas de estudio
P-Peaks:
                 1
              x= max { N −d H   , Peak i  }
  f P− peaks                   x
                 N i≤i≤ p
                             P=100, N=64
wP-Peaks:
                  1
               x= max { w i N −d H  , Peak i  }
 f w P− peaks                      x
                  N i≤i≤ p
 w1=1.0, wi≠1=0.99
                             P=10, N=50
Problemas de estudio
MMDP:

                            k

                            ∑
          f         s             fitness s
              MMDP  =                      i
                            i=1



 fitnesssi(0) = 1.0             fitnesssi (1) = 0.0
 fitnesssi (2) = 0.360384       fitnesssi (3) = 0.640576
 fitnesssi (4) = 0.360384       fitnesssi (5) = 0.0
 fitnesssi (6) = 1.0

                                                   k=20
Resultados: P-Peaks
Resultados: wP-Peaks
Resultados: MMDP
Entropía: best
Entropía: multikulti-elite
Entropía: medias
Conclusions


   La diversidad mejora los resultados
   siempre y cuando el individuo tenga
   suficiente calidad

   El estudio de entropía muestra una
   mejora real en la diversidad

   Tanto el mejor individuo como la
   secuencia consenso representan
   adeacuadamente la población
Trabajos futuros


   Implementación paralela


   Estudio de otros parámetros: número de
   nodos, individuos enviados, etc.

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Algoritmo Multikulti: migración de genotipos en un modelo de islas y su impacto en la diversidad

  • 1. Lourdes Araujo UNED Juan J. Merelo Guervós Univ. de Granada Francisco Fernández de Vega Univ. de Extremadura
  • 2. Motivación  Modelo de islas mejora secuencial  Modelos asíncronos mejores  Poblaciones asíncronas  Ventajas de la diversidad
  • 3. Hipótesis  Intercambiar los mejores individuos no siempre es lo mejor Población 1 Población 2
  • 4. Hipótesis ? ? ? ? ? ?
  • 6. Hipótesis  Simultáneamente: Calidad Diversidad
  • 7. Criterios de intercambio de individuos El más diferente de la población  destino  El más diferente de la población destino elegido entre una élite
  • 8. ¿Cuál es el más diferente de toda la población destino? Representación de la población:  El mejor  La secuencia consenso
  • 9. Secuencia consenso Compuesta por los alelos más frecuentes para cada posición del genotipo. 10111001100010110 01110010110001011 00111100001010111 SC: 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 1 1
  • 10. Nuestro modelo Representación G2 del genotipo G3 P1 P2 G1 “bastante” diferente “bastante” Pn P3 de G2 diferente de G3
  • 11. La implementación  Cromosomas: cadenas binarias de longitud fija Cruce: bipunto  Mutación: bit a bit  Implementación en Perl  Escenario paralelo simulado 
  • 12. Problemas de estudio P-Peaks: 1 x= max { N −d H   , Peak i  } f P− peaks  x N i≤i≤ p P=100, N=64 wP-Peaks: 1 x= max { w i N −d H  , Peak i  } f w P− peaks  x N i≤i≤ p w1=1.0, wi≠1=0.99 P=10, N=50
  • 13. Problemas de estudio MMDP: k ∑ f s fitness s MMDP  = i i=1 fitnesssi(0) = 1.0 fitnesssi (1) = 0.0 fitnesssi (2) = 0.360384 fitnesssi (3) = 0.640576 fitnesssi (4) = 0.360384 fitnesssi (5) = 0.0 fitnesssi (6) = 1.0 k=20
  • 20. Conclusions  La diversidad mejora los resultados siempre y cuando el individuo tenga suficiente calidad  El estudio de entropía muestra una mejora real en la diversidad  Tanto el mejor individuo como la secuencia consenso representan adeacuadamente la población
  • 21. Trabajos futuros  Implementación paralela  Estudio de otros parámetros: número de nodos, individuos enviados, etc.  Estudio de otros problemas