Mutis fue el primero en dedicarse al estudio de las ciencias naturales en la Nueva Granada. Fundó el primer jardín botánico de Colombia en Mariquita para aclimatar plantas como el café y la quina. Más tarde organizó otro jardín en Santa Fe con semillas traídas de Europa. La infraestructura actual del Jardín Botánico de Bogotá fue diseñada por el arquitecto Pedro Juan Jaramillo y cuenta con colecciones de plantas de diferentes regiones gracias a los conocimientos de Luciano Mora Osejo.