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                                         . m
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             SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
                      .g
                  w
               w
            w
Autor: Maestro en Ciencias Bioquímicas Genaro Matus Ortega
 genaromatus@excite.com, genaro_matus@hotmail.com
Los Aminoácidos y las Proteínas          x
                                               . m
   Las células de todos los organismos,
adquieren por medio de la dieta o por
propia síntesis, los          aminoácidos
                                            o m
                                      .c
necesarios para construir las proteínas.


                                     e
proteínas
                              u    t
   Requerimientos para la síntesis de



mensajero),    aminoácidos, g
DNA, RNA,(transferencia, ribosomal o
                           . enzimas,

                      w
cofactores, coenzimas y nucleótidos
trifosfatados.

                  w
              w
La Síntesis de Proteínas
                              x
                           . m
                   o m
              e.c
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    w
 w
w
¿QUÉ ES UN GEN?
                                                 x
                                              . m
                                      o m
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             w
         w
R = Una secuencia de DNA que codifica para un RNA funcional
(RNAt, RNAr, RNAi, RNAmi) o que puede codificar para una
proteína.
¿QUÉ DEFINE UN GEN?                   x
                                                  . m
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Elementos internos:
•Sitio de inicio de    w        Elementos accesorios (externos):
                                •Secuencias promotoras,
transcripción,
                  w
•Marco de lectura abierta,
                                •Secuencias inhibidoras,
                                •Elementos de respuesta (TF) a

              w
•Sitio de terminación.          factores externos.
x
Arquitectura estructural del gen
          eucarionte
                            . m
                       o m
                   e.c
                ut
             .g
         w
      w
   w
Gen eucariote
                                                    x
                                                 . m
Secuencia de DNA que incluye exones, intrones y regiones de control

funcional.

                                         o m
no codificantes necesarias para la producción de una proteína o un RNA




    Region Reguladora

                                  e.c    Region Codificante



                          u     t
                       .g
                   w
               w
           w
La secuencia de nucleótidos de un gen determina la
       secuencia de aminoácidos de la proteína
                                                                         x
                                                                      . m
                                                         o m
                                               e.c
                                      u      t
                                   .g
                              w
                         w
Secuencia de aminoácidos de la proteína URE-3BP de Entamoeba histolytica


                    w
                    Puede haber más de un marco de lectura (6 ORFs)
La Región Reguladora de un gen es reconocida por
diferentes proteínas que modulan la transcripción.
                                                      x
                                                   . m
                                               o m
                                      e.c
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                          .g
                     w
                 w
            w
 Promotor del gen de tubulina a de Paracentrotus
Un gen debe estar abierto (no super empaquetado) para ser leído
por la RNA polimerasa durante la transcripción.
                                                     x
                                                  . m
                                         o m
                                 e.c
                          u    t
                       .g
                  w
              w
          w
ESTRUCTURA DE LOS PROMOTORES
EUCARIONTES                   x
                           . m
                        o m
                     e.c
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               .g
           w
         w
       w
LA TRANSCRIPCIÓN
                                                   x
La RNA polimerasa abre la doble hélice de DNA   . m
separando las dos cadenas de la molécula.
   Los ribonucleótidos se ensamblan en
                                            o m
                                      .c
dirección 5' a 3‘
   La enzima lee la cadena molde de DNA en la
dirección 3' a 5'.

                                   t e
   La cadena de RNA recién sintetizada es



                            g u
complementaria, a la cadena molde
   La cadena inactiva de DNA (no transcripta)

                           .
es idéntica pero se reemplaza timina (T) por
uracilo (U).

                       w
   El RNA recién sintetizado se separa de la

                   w
cadena molde de DNA.


               w
EVENTOS IMPORTANTES EN LA TRANSCRIPCIÓN

                                x
                             . m
                         o m
                      e.c
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                .g
            w
          w
        w
La RNA polimerasa
                                                        x
                                                     . m
 Cataliza la adición de nucleótidos de DNA. Estas enzimas
 sintetizan nuevas cadenas sólo en la dirección 5' a 3', añadiendo

                                              m
 nucleótidos uno a uno al extremo 3' de la cadena creciente.

                                            o
Tipo     Molécula sintetizada
                                     e.c
 I          RNA ribosomal
                             u     t
II          RNA mensajero
                          .g
III                  w
        RNA de transferencia
                 w
             w
Los ribosomas
                                                          x
formada por un complejo de RNA ribosomal y proteínas.
                                                       . m
Están constituidos por dos subunidades, cada una de las cuales está


                           RNA ribosomal

                                               o m
Tipo de molécula de RNA que se encuentra junto con proteínas


                                        .c
características en los ribosomas; se transcribe a partir del DNA de los
bucles de cromatina que forman el nucléolo.


                                     t e
                             g u
                            .
                        w
                    w
               w
RNA de transferencia (Lat. trans, a través + ferre, llevar)
                                                               x
   Clase de RNA pequeños con dos sitios funcionales

1) Reconoce un aminoácido específico activado               . m
aminoácido.
                                                   o m
2) El otro sitio lleva el triplete de (anticodón) para ese




                                           .c
   Cada tipo de tRNA acepta un aminoácido activado específico y
lo transfiere a una cadena polipeptídica naciente, según lo

                                          e
traducido.

                                  u     t
especifica la secuencia de nucleótidos del mRNA que está siendo


   Los RNAt son necesarios para acarrear los aminoácidos desde el

polipéptido.
                               .g
citosol hasta el ribosoma en donde se construirá el nuevo

   Estas reacciones son catalizadas por un grupo de enzimas

                          w
activadoras (sintetasas), que necesitan de Mg2+ y energía en forma


                     w
de ATP para funcionar.



                w
Los RNAt
                                                    x
   Generalmente, se le representa con tres brazos en forma de

real es de L)                                    . m
trébol, uno de los cuales porta el triplete anticodón (la forma




                                         o m
                                  e.c
                            u   t
                         .g
                     w
                 w
             w                    RNA de transferencia
El RNA mensajero
                                               x
                                            . m
Un tipo de moléculas de RNA, cada una de las cuales es
complementaria de una hebra de DNA. Lleva la información

proteína.
                                    o m
genética del cromosoma a los ribosomas, donde se traduce a




                              e.c
                        u   t
                     .g
                 w
             w
         w
Transcripción y Traducción


RNA mensajero                   x
                             . m
                      o m
                   e.c
                ut
             .g
         w
       w
     w
Maduración del RNAm eucarionte
                                             x
                                          . m
   La secuencia de nucleótidos se puede diferenciar en
segmentos más o menos grandes llamados intrones (no
codificadas) y exones (codificada)

                                   o m
  Al RNA premensajero se cortan los intrones (RNA maduro)



                             e.c
                       u   t
                    .g
                w
             w
         w
LA TRADUCCIÓN
                                                x
                                             . m
   La secuencia de tripletes, codones del RNAm, es traducida
en una secuencia de aminoácidos.


                                     o
   Se unen mediante enlaces peptídicos
                                       m       originando   la

                                .c
estructura primaria de la proteína.

                               e
                        u    t
  Al finalizar la síntesis del polipéptido, este tomará la
conformación necesaria y se unirá a las moléculas debidas para
desempeñar su función como proteína activa.

                     .g
                 w
             w
          w
Ribosomas (El sitio de traducción proteica)
                                                     x
Están constituidos por dos subunidades, cada
una de las cuales está formada por un             . m
complejo de RNA ribosomal y proteínas.

                                               o m
                                      e.c
                               u    t
                            .g
                        w
                    w
                w
Los dos super-reinos Eucaria y bacteria tienen ribosomas distintos,
pero homólogos
                                                      x
                                                   . m
 Procariota

                                           o
                                    Eucariotam
                                    e.c
                             u    t
                          .g
                      w
                  w
              w
1) Inicio de la Traducción                  x
  El RNA mensajero se une a la                   . m
subunidad menor del ribosoma.

                                          o m
  El aminoácido iniciador (unido a
                                  .c
RNAt) forma un complejo de iniciación.
                                 e         Complejo de pre-iniciación




                           u   t
   El RNAt con el aminoácido iniciador
se aparea con un triplete nucleotídico

                        .g
o codón específico presente en el
RNAm (comienzo de la cadena
                    w
                                             Complejo de iniciación
polipeptídica)

                w
   Requerimientos     necesarios    GTP

            w
(energía) y factores de iniciación.
x
                    . m
                 o m
              e.c
           ut
        .g
    w
 w
w
2) Elongación de la Traducción
                                                   x
   Se prolonga la cadena polipeptídica por la   . m
unión de aminoácidos sucesivos.

                                           o m
                                       .c
  RNAt aparea sus bases respondiendo a un
codón específico del RNAm.

                                    t e
   Requerimientos, unión de la subunidad


                           g u
pesada del ribosoma, energía en forma de
GTP, factores de elongación y de
transferasas.             .
                      w       GTP



                  w           GDP




              w
Elongación
                           x
                        . m
                     o m
               e.c
           u t
        .g
    w
 w
w
El Código Genético
                                          x
                                       . m
                              o m
                      e.c
               u    t
            .g
       w
   w
  Aminoácidos hidrofóbicos ---hidrofílicos
w
Máxima amortiguación en cambios puntuales
Transcripción y Traducción



                           El Código Genético                       x
                                                                 . m
  Es la correspondencia entre los codones (grupo de tres nucleótidos) y los
aminoácidos.


palabra es traducida por un aminoácido.
                                                    o m
   El codón, constituye una palabra en el lenguaje de los ácidos nucléicos y esta




                                            .c
  El código es universal, desde las bacterias hasta el hombre.



                                           e
   La interpretación de los codones por aminoácidos es igual en todas las células,


                                         t
todas "leen" de la misma manera los genes.


                                  u
                               .g
                          w
                     w
                w
Transcripción y Traducción



                                                       x
   El código esta basado en tripletes, sin puntuaciones ni
   sobrelapamientos.
   Es un código degenerado.
   No es ambiguo.                                   . m
                                           o m
   Existe 1 codon de Inicio y tres codones de término.


                                   .c
   AUG           Eventualmente puede aparecer GUG y
                 UUG


                                t e
                        g u
                       .
  El código genético es universal.


                   w
        Siempre y cuando no se considere el código de los
organelos (vgr: UGA = Trp en mitocóndria)

              w
         w
3) Terminación y Liberación
                                           x
                                        . m
                                     o m
                                   .c
   El RNAm encuentra un “codón
de terminación o sin sentido” (no
codifica para ningún aminoácido)
                                t e
                          g u
   Se libera el polipéptido del
ribosoma, por los factores de
liberación.
                         .
                     w
                 w
             w
4) Plegamiento y Transformación:
                                                                  x
   La conformación tridimensional del
polipéptido le da su característica activa.                    . m
   Antes o después del plegamiento, el
                                                            o m
                                               .c
polipéptido  puede experimentar    una
transformación:

- Elimina el aminoácido iniciador.
                                            t e
- Introduce
                                  g
                    grupos fosfatos,u          metilos,
carboxilos             u otros.
                                 .
                            w
-Modificaciones postraduccionales:

                      w
Glicosilaciones, unión de grupos prostéticos., coenzimas,
metales, ubiquitinación, zumoilación,      fosforilación,
cortes proteolíticos (zimógenos), puentes disulfuro,
péptido señal…
                 w
MAPA CONCEPTUAL:                                               Síntesis Proteica
                                                                                                      x
                                                                       Ribosoma
                                                                                                   . m
                                                                                      m
            Duplicación




                          ADN                 Transcripción               ARNm

                                                                                    o                    ARNt                 ARNr




                                                                     e.c
 Heterocromatina
  (condensada)
                                   Eucromatina
                                  (laxa o abierta)
                                                        u          t
                                                                 Regiones Intrónicas (no
                                                                      codificantes)
                                                                 Exónicas (codificantes
                                                                                                      Decodificador
                                                                                                       del código
                                                                                                        genético
                                                                                                                               Región
                                                                                                                            estructural y
                                                                                                                            catalítica del
                                                                                                                              ribosoma


    Territorios no
    codificantes, y
                                                     .g
                           Gen o región codificante definida
                           por un marco de lectura abierto
                                                                                                                                             T
                                                                                                                                             r
                                                                                                                                             a



                                             w
                              y regiones no codificantes            Etapas de la Traducción (lectura y decodificación del ORF ):
elementos regulatorios.                                                                                                                      d
                                      accesorias.
                                                                 Inicio (separación de las subunidades del ribosoma y unión al RNAm)         u
                                                               Elongación (formación de enlaces peptídicos de los aa llevados por RNAt),     c



                                     w
              Etapas de la Transcripción:
Inicio: apertura del DNA, reclutamiento de la RNApol
                                                                Termino (disociación de la proteína del ribosoma por un codón de STOP)       c
                                                                                                                                             i
                                                                                                                                             ó



                             w
Elongación: Avance de la RNApol sobre el molde de DNA
Termino: Liberación de la RNApol y del RNAm del DNA.                                                                                         n
                                                                   Plegamiento y modificaciones postraduccionales que definen la
                                                                                regulación de la actividad proteica
INTEGRA LO APRENDIDO:
                               x
                            . m
                         o m
                      e.c
                   ut
                .g
            w
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       w

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Clase 6 La Síntesis Proteica

  • 1. x . m o m e.c u t SÍNTESIS DE PROTEÍNAS .g w w w Autor: Maestro en Ciencias Bioquímicas Genaro Matus Ortega genaromatus@excite.com, genaro_matus@hotmail.com
  • 2. Los Aminoácidos y las Proteínas x . m Las células de todos los organismos, adquieren por medio de la dieta o por propia síntesis, los aminoácidos o m .c necesarios para construir las proteínas. e proteínas u t Requerimientos para la síntesis de mensajero), aminoácidos, g DNA, RNA,(transferencia, ribosomal o . enzimas, w cofactores, coenzimas y nucleótidos trifosfatados. w w
  • 3. La Síntesis de Proteínas x . m o m e.c ut .g w w w
  • 4. ¿QUÉ ES UN GEN? x . m o m e.c u t .g w w w R = Una secuencia de DNA que codifica para un RNA funcional (RNAt, RNAr, RNAi, RNAmi) o que puede codificar para una proteína.
  • 5. ¿QUÉ DEFINE UN GEN? x . m o m e.c ut .g Elementos internos: •Sitio de inicio de w Elementos accesorios (externos): •Secuencias promotoras, transcripción, w •Marco de lectura abierta, •Secuencias inhibidoras, •Elementos de respuesta (TF) a w •Sitio de terminación. factores externos.
  • 6. x Arquitectura estructural del gen eucarionte . m o m e.c ut .g w w w
  • 7. Gen eucariote x . m Secuencia de DNA que incluye exones, intrones y regiones de control funcional. o m no codificantes necesarias para la producción de una proteína o un RNA Region Reguladora e.c Region Codificante u t .g w w w
  • 8. La secuencia de nucleótidos de un gen determina la secuencia de aminoácidos de la proteína x . m o m e.c u t .g w w Secuencia de aminoácidos de la proteína URE-3BP de Entamoeba histolytica w Puede haber más de un marco de lectura (6 ORFs)
  • 9. La Región Reguladora de un gen es reconocida por diferentes proteínas que modulan la transcripción. x . m o m e.c u t .g w w w Promotor del gen de tubulina a de Paracentrotus
  • 10. Un gen debe estar abierto (no super empaquetado) para ser leído por la RNA polimerasa durante la transcripción. x . m o m e.c u t .g w w w
  • 11. ESTRUCTURA DE LOS PROMOTORES EUCARIONTES x . m o m e.c ut .g w w w
  • 12. LA TRANSCRIPCIÓN x La RNA polimerasa abre la doble hélice de DNA . m separando las dos cadenas de la molécula. Los ribonucleótidos se ensamblan en o m .c dirección 5' a 3‘ La enzima lee la cadena molde de DNA en la dirección 3' a 5'. t e La cadena de RNA recién sintetizada es g u complementaria, a la cadena molde La cadena inactiva de DNA (no transcripta) . es idéntica pero se reemplaza timina (T) por uracilo (U). w El RNA recién sintetizado se separa de la w cadena molde de DNA. w
  • 13. EVENTOS IMPORTANTES EN LA TRANSCRIPCIÓN x . m o m e.c ut .g w w w
  • 14. La RNA polimerasa x . m Cataliza la adición de nucleótidos de DNA. Estas enzimas sintetizan nuevas cadenas sólo en la dirección 5' a 3', añadiendo m nucleótidos uno a uno al extremo 3' de la cadena creciente. o Tipo Molécula sintetizada e.c I RNA ribosomal u t II RNA mensajero .g III w RNA de transferencia w w
  • 15. Los ribosomas x formada por un complejo de RNA ribosomal y proteínas. . m Están constituidos por dos subunidades, cada una de las cuales está RNA ribosomal o m Tipo de molécula de RNA que se encuentra junto con proteínas .c características en los ribosomas; se transcribe a partir del DNA de los bucles de cromatina que forman el nucléolo. t e g u . w w w
  • 16. RNA de transferencia (Lat. trans, a través + ferre, llevar) x Clase de RNA pequeños con dos sitios funcionales 1) Reconoce un aminoácido específico activado . m aminoácido. o m 2) El otro sitio lleva el triplete de (anticodón) para ese .c Cada tipo de tRNA acepta un aminoácido activado específico y lo transfiere a una cadena polipeptídica naciente, según lo e traducido. u t especifica la secuencia de nucleótidos del mRNA que está siendo Los RNAt son necesarios para acarrear los aminoácidos desde el polipéptido. .g citosol hasta el ribosoma en donde se construirá el nuevo Estas reacciones son catalizadas por un grupo de enzimas w activadoras (sintetasas), que necesitan de Mg2+ y energía en forma w de ATP para funcionar. w
  • 17. Los RNAt x Generalmente, se le representa con tres brazos en forma de real es de L) . m trébol, uno de los cuales porta el triplete anticodón (la forma o m e.c u t .g w w w RNA de transferencia
  • 18. El RNA mensajero x . m Un tipo de moléculas de RNA, cada una de las cuales es complementaria de una hebra de DNA. Lleva la información proteína. o m genética del cromosoma a los ribosomas, donde se traduce a e.c u t .g w w w
  • 19. Transcripción y Traducción RNA mensajero x . m o m e.c ut .g w w w
  • 20. Maduración del RNAm eucarionte x . m La secuencia de nucleótidos se puede diferenciar en segmentos más o menos grandes llamados intrones (no codificadas) y exones (codificada) o m Al RNA premensajero se cortan los intrones (RNA maduro) e.c u t .g w w w
  • 21. LA TRADUCCIÓN x . m La secuencia de tripletes, codones del RNAm, es traducida en una secuencia de aminoácidos. o Se unen mediante enlaces peptídicos m originando la .c estructura primaria de la proteína. e u t Al finalizar la síntesis del polipéptido, este tomará la conformación necesaria y se unirá a las moléculas debidas para desempeñar su función como proteína activa. .g w w w
  • 22. Ribosomas (El sitio de traducción proteica) x Están constituidos por dos subunidades, cada una de las cuales está formada por un . m complejo de RNA ribosomal y proteínas. o m e.c u t .g w w w
  • 23. Los dos super-reinos Eucaria y bacteria tienen ribosomas distintos, pero homólogos x . m Procariota o Eucariotam e.c u t .g w w w
  • 24. 1) Inicio de la Traducción x El RNA mensajero se une a la . m subunidad menor del ribosoma. o m El aminoácido iniciador (unido a .c RNAt) forma un complejo de iniciación. e Complejo de pre-iniciación u t El RNAt con el aminoácido iniciador se aparea con un triplete nucleotídico .g o codón específico presente en el RNAm (comienzo de la cadena w Complejo de iniciación polipeptídica) w Requerimientos necesarios GTP w (energía) y factores de iniciación.
  • 25. x . m o m e.c ut .g w w w
  • 26. 2) Elongación de la Traducción x Se prolonga la cadena polipeptídica por la . m unión de aminoácidos sucesivos. o m .c RNAt aparea sus bases respondiendo a un codón específico del RNAm. t e Requerimientos, unión de la subunidad g u pesada del ribosoma, energía en forma de GTP, factores de elongación y de transferasas. . w GTP w GDP w
  • 27. Elongación x . m o m e.c u t .g w w w
  • 28. El Código Genético x . m o m e.c u t .g w w Aminoácidos hidrofóbicos ---hidrofílicos w Máxima amortiguación en cambios puntuales
  • 29. Transcripción y Traducción El Código Genético x . m Es la correspondencia entre los codones (grupo de tres nucleótidos) y los aminoácidos. palabra es traducida por un aminoácido. o m El codón, constituye una palabra en el lenguaje de los ácidos nucléicos y esta .c El código es universal, desde las bacterias hasta el hombre. e La interpretación de los codones por aminoácidos es igual en todas las células, t todas "leen" de la misma manera los genes. u .g w w w
  • 30. Transcripción y Traducción x El código esta basado en tripletes, sin puntuaciones ni sobrelapamientos. Es un código degenerado. No es ambiguo. . m o m Existe 1 codon de Inicio y tres codones de término. .c AUG Eventualmente puede aparecer GUG y UUG t e g u . El código genético es universal. w Siempre y cuando no se considere el código de los organelos (vgr: UGA = Trp en mitocóndria) w w
  • 31. 3) Terminación y Liberación x . m o m .c El RNAm encuentra un “codón de terminación o sin sentido” (no codifica para ningún aminoácido) t e g u Se libera el polipéptido del ribosoma, por los factores de liberación. . w w w
  • 32. 4) Plegamiento y Transformación: x La conformación tridimensional del polipéptido le da su característica activa. . m Antes o después del plegamiento, el o m .c polipéptido puede experimentar una transformación: - Elimina el aminoácido iniciador. t e - Introduce g grupos fosfatos,u metilos, carboxilos u otros. . w -Modificaciones postraduccionales: w Glicosilaciones, unión de grupos prostéticos., coenzimas, metales, ubiquitinación, zumoilación, fosforilación, cortes proteolíticos (zimógenos), puentes disulfuro, péptido señal… w
  • 33. MAPA CONCEPTUAL: Síntesis Proteica x Ribosoma . m m Duplicación ADN Transcripción ARNm o ARNt ARNr e.c Heterocromatina (condensada) Eucromatina (laxa o abierta) u t Regiones Intrónicas (no codificantes) Exónicas (codificantes Decodificador del código genético Región estructural y catalítica del ribosoma Territorios no codificantes, y .g Gen o región codificante definida por un marco de lectura abierto T r a w y regiones no codificantes Etapas de la Traducción (lectura y decodificación del ORF ): elementos regulatorios. d accesorias. Inicio (separación de las subunidades del ribosoma y unión al RNAm) u Elongación (formación de enlaces peptídicos de los aa llevados por RNAt), c w Etapas de la Transcripción: Inicio: apertura del DNA, reclutamiento de la RNApol Termino (disociación de la proteína del ribosoma por un codón de STOP) c i ó w Elongación: Avance de la RNApol sobre el molde de DNA Termino: Liberación de la RNApol y del RNAm del DNA. n Plegamiento y modificaciones postraduccionales que definen la regulación de la actividad proteica
  • 34. INTEGRA LO APRENDIDO: x . m o m e.c ut .g w w w