Petroecuador ha estado involucrado en varios escándalos de corrupción en los últimos años. Funcionarios de alto rango han sido acusados de aceptar sobornos a cambio de contratos lucrativos y de desviar fondos de la empresa estatal hacia cuentas privadas. A pesar de las investigaciones en curso, la corrupción sigue siendo un gran problema en Petroecuador que ha costado miles de millones de dólares al pueblo ecuatoriano.