Importar mapas de MaxEnt a un programa SIG
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El documento describe los pasos para generar un mapa predictivo usando MaxEnt, incluyendo seleccionar el formato GRID para los archivos de salida, visualizar los archivos de salida en DIVA-GIS y editar los colores de cada categoría, y agregar el archivo resultante BMP a otros programas SIG manteniendo la escala de grises seleccionada.
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Modelos para la predicción de la distribución de especies
Este documento describe modelos para predecir la distribución de especies. Explica la importancia de conocer la distribución ecológica y geográfica de las especies. Detalla los tipos de datos necesarios para hacer modelaje, incluyendo datos de ocurrencia y datos ambientales. También describe diferentes métodos de modelado como BIOCLIM, DOMAIN, GARP y MaxEnt. Finalmente, cubre temas como la evaluación de modelos a través de curvas ROC y la interpretación de los resultados.
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This tutorial sets out the easy steps to displaying aerial photography and data from the most well known mapping applications on the web in your QGIS project. Please note that each of the data providers have a set of terms and conditions for the use of their data, please refer to these terms and conditions before using or publishing the data.
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Morphophylogeny in 41 sand flies species (Diptera: Phlebotominae) of medical ...Universidad Regional Amazónica Ikiam / Universidad de Carabobo
This document summarizes a PhD thesis on the morphophylogeny of 41 sand fly species of medical importance using different data sources. The study used traditional morphology data, wing and head landmark data from geometric morphometrics, and DNA sequence data to generate phylogenetic trees. The best tree was produced using all data blocks and showed good support for relationships within the Lutzomyiina subtribe and the Bichoromyia genus based on head morphology and molecular synapomorphies. Comparisons of trees from different data blocks showed that wing landmarks were important but that all blocks together provided the best phylogenetic hypothesis. Relationships of some groups were consistent with previous studies using multiple genetic markers. This study was the first to combine different character blocksPráctica n3 Cladística UCE
Esta es la guía de prácticas del taller de Cladística que doctamos en la Universidad Central del Ecuador - Junio 2017
Brooks et al_1994_ch13_phylogenetics_systematics
Brooks et al_1994_ch13_phylogenetics_systematicsUniversidad Regional Amazónica Ikiam / Universidad de Carabobo
This document provides materials for a laboratory exercise on phylogenetic systematics. Students are tasked with reconstructing the evolutionary relationships among major amniote groups using 10 morphological characters from skeletal and physiological systems. They collect data on character states, polarize characters against an amphibian outgroup, and construct a phylogenetic tree through successive grouping of taxa sharing derived characters. Finally, students classify the taxa based on their inferred evolutionary relationships and analyze features of amniote evolution implied by the tree. The exercise aims to give students hands-on experience with phylogenetic methods and systematic biology.Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT
Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnTUniversidad Regional Amazónica Ikiam / Universidad de Carabobo
El documento describe los resultados de un análisis filogenético de menos de 15 taxones utilizando TNT. Se muestra un árbol más parsimonioso con 7 caracteres sinapomórficos. Además, se enumeran las reconstrucciones de cada estado de carácter en el árbol.Recomendados
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El documento analiza tres temas principales: 1) La vigencia de las Normas de Homologación que determinan los sueldos de los profesores universitarios. 2) La inconstitucionalidad de dos cláusulas del proyecto de Convención Colectiva que tratan temas ajenos al régimen laboral. 3) Recomendaciones para mejorar el proceso de discusión de la Convención Colectiva y proteger la autonomía universitaria.
Clase biocenosis urbana
Este documento presenta un curso sobre entomología urbana que tiene el objetivo de capacitar a los participantes sobre la biología, hábitos y diversidad de los artrópodos importantes en áreas urbanas y suburbanas, así como los métodos de manejo de estas plagas. El curso cubre temas como la introducción a la entomología urbana, la biodiversidad en las ciudades, y características del ecosistema y biocenosis urbana.
Filogeografia en Suramerica
This review analyzes 214 published phylogeography studies of South American organisms to identify emerging patterns. The studies find striking genetic divergence among lineages, suggesting high undocumented diversity. Pleistocene climate oscillations and Pliocene/Miocene geological events shaped modern distributions in tropical and temperate regions. Herpetofauna diverged earlier than other groups. Forest species' ranges contracted more in glacial periods, while open habitat species responded variably to climate change. The results reveal a complex mosaic of phylogeography patterns across South America.
Venezuela_2011.ppt
Este documento resume los principales puntos sobre el criterio de parsimonia en el análisis filogenético. Explica que la parsimonia asume que sabemos poco sobre los mecanismos evolutivos y busca establecer conclusiones basadas en la evidencia en lugar de suposiciones. También discute cómo la parsimonia se alinea con el enfoque de Darwin de clasificar los seres vivos en una jerarquía natural de grupos dentro de grupos basada en la ascendencia común.
GB2TNT_MANUAL.pdf
GB TNT is a program that allows users to easily create data sets for the phylogenetic analysis program TNT from GenBank files. It extracts defined genomic regions from GenBank sequences, filters the data, aligns the sequences, and merges them into a single TNT matrix. The program handles all steps automatically, from parsing GenBank files to generating a ready-to-analyze TNT matrix. It also incorporates taxonomic information from GenBank into sequence names to facilitate analysis and interpretation of results in TNT.
Segunda circular xracb
Este documento proporciona información sobre la 10a Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía, que se llevará a cabo del 29 al 31 de mayo de 2012 en Mendoza, Argentina. Incluye detalles sobre la comisión organizadora, las actividades planificadas como simposios y conferencias, el proceso de envío de resúmenes, los requisitos de inscripción y pagos, y la dirección del sitio web donde se publicará información actualizada.
Panbiogeografia en Haemagogus
El documento habla sobre mapas que incluyen Blue Marble, placas tectónicas, y países. También discute la panbiogeografía en Haemagogus usando métodos como Minimum Spanning Tree y análisis espaciales para crear trazos individuales y generalizados con varios programas como PASSAGE, GvSIG, Trazos2004 y Martitracks.
Sistemática: su historia, sus métodos y sus aplicaciones
Sistemática: su historia, sus métodos y sus aplicacionesUniversidad Regional Amazónica Ikiam / Universidad de Carabobo
Este documento resume brevemente la historia de la sistemática, desde las clasificaciones de las culturas preliterarias hasta los desarrollos más recientes. También describe algunos conceptos fundamentales de la sistemática filogenética y presenta un estudio de caso sobre las serpientes del género Conopsis, analizando los datos morfológicos, moleculares y su combinación, así como las consecuencias taxonómicas de los resultados. Finalmente, el documento fue publicado en la revista Ciencia Ergo Sum de la Universidad Autónoma del Estado de México.Supplement schmitt
This document provides background information on Willi Hennig, the scientist known for introducing phylogenetic systematics. It describes that he was the firstborn son of a railroad worker and maid, grew up moving frequently with his family, and received encouragement towards science from a private tutor. As a young man, Hennig volunteered at a natural history museum where he was mentored by a curator and began publishing scientific works. The document aims to understand Hennig's personality and the influences that led to his revolutionary approach to systematics.
Supplement_Schmitt.pdf
Willi Hennig was born in 1913 in Germany to working class parents. He showed an early interest in natural history and worked at a natural history museum during his schooling. He received his PhD studying fly genitalia. Hennig began developing his ideas about phylogenetic systematics in the 1930s, emphasizing genealogical relationships and monophyly. His 1950 book formalized phylogenetic systematics, prioritizing shared derived characters over similarity. Though controversial, Hennig's approach revolutionized taxonomy by requiring classifications to reflect evolutionary history.
Amorin d 2001_dos_amazonias
La Unión Europea está considerando nuevas regulaciones para las empresas de tecnología. Estas regulaciones incluirían multas más altas por violaciones a la privacidad de datos y nuevas reglas para evitar el uso indebido de datos personales por parte de las grandes compañías. La UE busca proteger mejor los derechos digitales de los ciudadanos.
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La Unión Europea ha anunciado nuevas sanciones contra Rusia por su invasión de Ucrania. Las sanciones incluyen prohibiciones de viaje y congelamiento de activos para más funcionarios rusos, así como restricciones a las importaciones de productos rusos de acero y tecnología. Los líderes de la UE esperan que estas medidas adicionales aumenten la presión económica sobre Rusia y la disuadan de continuar su guerra contra Ucrania.Tutorial TnT
Este documento describe las diversas herramientas disponibles en el programa TNT para el análisis filogenético de árboles, incluyendo opciones para abrir y editar matrices de datos, reconstruir árboles usando métodos tradicionales y nuevas tecnologías como búsquedas sectoriales aleatorias y constreñidas, y fusionar y descartar árboles subóptimos.
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Este documento presenta instrucciones para trabajar con los programas Nona y Winclada para realizar análisis filogenéticos. Explica cómo preparar datos en formato de matriz y cómo ejecutar análisis cladísticos con estos programas. También describe cómo interpretar los resultados de los análisis, incluidos el número de árboles obtenidos, la longitud del árbol, y los índices de consistencia y retención.
Construccion de cladogramas con el programa winclada
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El documento presenta una introducción a los Sistemas de Información Geográfica (SIG). Explica que los SIG emergieron en los años 1960-1970 para valorar recursos y planificar usando mapas. En los 1980s, los SIG se habían convertido en sistemas completamente operativos gracias al avance de la tecnología de computadoras. Los SIG digitalizan, almacenan y manipulan datos espaciales y no espaciales para generar nueva información mediante análisis espaciales. Proporcionan soporte para la toma de decisiones
CINE COMO RECURSO DIDÁCTICO para utilizar en TUTORÍA
Dos cortos y ocho películas para tratar en el aula.
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- 1. En esta pestaña se elige, el formato de salida del mapa predictivo. Por defecto se encuentra en “asc” o ASCII
- 2. Al desplegar se aprecian cuatro opciones. Se selecciona “grd” para indicar el formato GRID.
- 3. Corrida típica de MaxEnt, donde se aprecia la escritura del archivo GRID.
- 4. Es esta carpeta se observan los archivos de salida.
- 5. Abrimos DIVA-GIS, y a continuación agregamos la capa del archivo grd.
- 6. Si hacemos doble click en la leyenda, se pueden editar los colores de cada categoría. También podemos hacer que el fondo sea transparente ( NoData )
- 7. Algo interesante: Una vez agregada la capa grd en DIVA-GIS, se crea un archivo bmp. Este archivo tiene las categorías y colores que seleccionamos al final. También este archivo bmp puede abrirse con un programa SIG.
- 8. Se puede agregar en GVSIG la capa raster bmp. Fíjense que conserva la escala de gris que se seleccionó en DIVA-GIS. También se pueden agregar otras capas (ejemplo: vectoriales en formato shp)