La región andina tiene una gran variedad de fauna incluyendo aves como el cóndor y águila, mamíferos como serpientes, y plantas como orquídeas, musgos y palmas debido a su clima variable. La región caribe tiene especies de animales en peligro de extinción como el mico tití, caimán y boca chico. La región también tiene flora única como el manglar y frailejones. La región insular se caracteriza por su diversidad de peces, tortugas, caracoles y langostas.