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Estructura y replicación
                  del material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                               Tema 6: Estructura y replicación del
                                        material genético
                                                                      1
                  1
Objetivos tema 6:
               Estructura y replicación del material
                             genético
                         Deberán quedar bien claros los siguientes puntos:

                         •Cómo se descubrió la naturaleza química del
                         material hereditario
                         •La composición química de los ácidos nucleicos
                         •La estructura 3D del DNA: naturaleza
                         complementaria y antiparalela de la doble cadena
                         del ácido desoxirribonucleico (DNA)
                         •La extraordinaria capacidad explicativa del
                         modelo del DNA de la función biológica
                         fundamental de esta molécula
                         •La replicación semiconservativa
                         •Enzimología de la replicación
Dr. Antonio Barbadilla

                                                    Tema 6: Estructura y replicación del   2
                  2                                          material genético
La transformación bacteriana en
     Streptococcus pneumoniae (Griffith 1928)


                                    Rugosa


                                             Muerte por neumonía        Cepa resistente

   Lisa




Dr. Antonio Barbadilla

                         No muere            Tema 6: Estructura y replicación del
                                                        Muere                       3
                  3                                   material genético
¿Cuál es el Principio transformante?




                                   Principio


                          Rugosa                           Lisa




Dr. Antonio Barbadilla

                                               Tema 6: Estructura y replicación del   4
                  4                                     material genético
Colin MacLeod

 El elemento transformante                                          Maclyn McCarty

      es el DNA (1944)
                                                                                        Oswald
                                                                                         Avery




                                                                     Ver animación
                                                                      experimento
                                                                     tranformación
                                                                       bacteriana
Dr. Antonio Barbadilla

                      Sólo DNA produce transformación 6: Estructura y replicación del
                                                    Tema                                 5
                  5                                               material genético
Experimento de Alfred Hershey y Martha
              Chase con fagos (1952)




                                                Bacteriófago T4


                                         El DNA es el
                                            material
                                           infeccioso
Dr. Antonio Barbadilla

                            Tema 6: Estructura y replicación del   6
                  6                  material genético
Componentes de los ácidos nucleicos


                                            adenina


                                timina
                                                    guanina


                                         citosina




Dr. Antonio Barbadilla

                                                              Tema 6: Estructura y replicación del   7
                  7                                                    material genético
Reglas de Chargaff




              1. Proporción de purinas = Proporción de pirimidinas

                                A+G=C+T

              2.                    A=T

              3.                    G=C
Dr. Antonio Barbadilla

                                             Tema 6: Estructura y replicación del   8
                  8                                   material genético
1953. Año culminante:
                          J. Watson y F. Crick resuelven la
                         estructura tridimensional del DNA
                               (Nature 171: 737-738)

                                          Watson y yo hemos
                                            encontrado el
                                          secreto de la vida




Dr. Antonio Barbadilla

                                             Tema 6: Estructura y replicación del   9
                  9                                   material genético
1953. Año culminante:



               Dos líneas de evidencia:

               •Reglas de Chargaff

               •Fotografías de difracción de rayos X



Dr. Antonio Barbadilla

                                        Tema 6: Estructura y replicación del   10
                10                               material genético
Significado reglas de Chargaff




                         Complementariedad de lasEstructura y replicación del
                                            Tema 6: bases
Dr. Antonio Barbadilla

                                                                                11
                11                                         material genético
Difracción de rayos X




                     Hemoglobina


                                                            Linus Pauling
Dr. Antonio Barbadilla

                                         Tema 6: Estructura y replicación del   12
                12                                material genético
Interpretación del patrón difracción de rayos X del DNA




                                                                                   Rosalind E.
                                                                                    Franklin




Dr. Antonio Barbadilla
                                                                                Crick
                                                       Tema 6: Estructura y replicación del   13
                13                                              material genético
Modelo en metal
                            del DNA



                     J. Watson y F. Crick
                    Concluyen: La estructura del DNA es una
                   doble hélice, formada por cadenas orientadas
                   en direcciones opuestas (antiparalelas). La
                   estructura se mantiene gracias a enlaces de
                   hidrógeno entre las bases nitrogenadas que se
                   encuentran orientadas hacia el interior de las
Dr. Antonio Barbadilla

                                           Tema 6: Estructura y replicación del 14
                14 cadenas                          material genético
Doble hélice, formada    La estructura se mantiene gracias
                         por cadenas orientadas    a enlaces de hidrógeno entre las
                                                        bases nitrogenadas que se
                         en direcciones opuestas
                                                    encuentran orientadas hacia el
Dr. Antonio Barbadilla
                         (antiparalelas).                 interior de las cadenas15
                                               Tema 6: Estructura y replicación del
                15                                   material genético
Desnaturalización del DNA

                   •Separación de las dos hebras por calor
                   •Una mayor proporción G-C tiene una mayor
                   temperatura de desnaturalización (‘fusión’)
                                            100
                         Porcentaje G + C



                                            80

                                            60

                                            40

                                            20


Dr. Antonio Barbadilla
                                                     70     80     90     100 110
                                             Temperatura de fusión (desnaturalización)
                                                                        Tema 6: Estructura y replicación del   16
                16                                                                 material genético
Dr. Antonio Barbadilla
                         Hélices levógiras y dextrógiras
                                            Tema 6: Estructura y replicación del   17
                17                                   material genético
DNA-B dextrógira
Dr. Antonio Barbadilla

                                    Tema 6: Estructura y replicación del   18
                18                                   material genético
Ver artículo
                                  Nature
                                   1953
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   19
                19                material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   20
                20                material genético
La estructura del DNA suministra una
                         explicación         asombrosamente
                          simple del fenómeno de la herencia
              La estructura explica:

              •La naturaleza de la secuencia lineal de los genes
              (información digital cuaternaria en secuencias
              unidimensionales de monómeros A,T,G,C)
              •El mecanismo de replicación exacta de los
              genes
              •La naturaleza química de las mutaciones
              •Por qué la mutación, la recombinación y la
              expresión génica son fenómenos separables a
              nivel molecular
Dr. Antonio Barbadilla

                                         Tema 6: Estructura y replicación del 21
                21                                     material genético
Esencial a la relación
                         íntima entre estructura
                            molecular y función
                          genética del DNA es el
                            concepto de molde
                 La complementariedad de las
                 bases nitrogenadas permite que
                 la secuencia de una cadena
                 sencilla de DNA actúe como un
                 molde para la formación de una
                 copia complementaria de DNA
                 (replicación) o de mRNA
                 (transcripción)
Dr. Antonio Barbadilla

                                             Tema 6: Estructura y replicación del   22
                22                                    material genético
Y ahora las declaraciones de Watson y
                         Crick sobre el ADN. Esto es para mí la
                         prueba verdadera de la existencia de Dios
                                            Salvador Dalí




                         Antes pensábamos que nuestro futuro
                         estaba en las estrellas. Ahora sabemos que
                         está en nuestros genes.
                                                            James Watson

Dr. Antonio Barbadilla

                                               Tema 6: Estructura y replicación del   23
                23                                      material genético
Una estructura
                                          tan bonita tenía,
                                           por fuerza, que
                                               existir
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   24
                24                material genético   J. Watson
Una estructura
                                                  tan bonita tenía,
                                                  por fuerza, que
                                                  existir
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   J. 25
                                                                   Watson
                25                material genético
El DNA
contiene información
digital cuaternaria en
secuencias unidimensionales
de monómeros A,T,G,C
 Dr. Antonio Barbadilla



(cristal aperiódico)
       26
                              Tema 6: Estructura y replicación del
                                       material genético
                                                                     26
Hay grandeza en esta concepción de la
vida,... que mientras este planeta ha ido
girando según la constante ley de la
gravitación, se han desarrollado y se están
desarrollando, a partir de un comienzo tan
                            una molécula
helicoidal asombrosa, infinidad de formas
sencillo, infinidad de formas cada vez más
cada vez más bellas
bellas y maravillosasy maravillosas
                         Charles Darwin




Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   27
                27                material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   28
                28                material genético
Replicación del DNA




Dr. Antonio Barbadilla

                                     Tema 6: Estructura y replicación del   29
                29                            material genético
25 de Abril 1953




                                            It has not escaped our notice that the
                                            specific pairing we have postulated
                                            immediately suggests a possible copying
                                            mechanism for the genetic material.




Dr. Antonio Barbadilla

                                                        Tema 6: Estructura y replicación del   30
                30                                               material genético
Posibles modelos de replicación




Dr. Antonio Barbadilla

                                           Tema 6: Estructura y replicación del   31
                31                                  material genético
Replicación del DNA
         •Semiconservativa: una cadena sirve de molde para una
         nueva cadena
            •El experimento de M. Meselson y F. Stahl (1958)
            demuestra que la replicación es semiconservativa




Mathew Meselson                                                         Frank Stahl
Dr. Antonio Barbadilla

                                        Tema 6: Estructura y replicación del   32
                32                               material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   33
                33                material genético
Replicación del DNA
       •Enzimas que sintetizan (replican) el DNA
          •E. coli
              •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
              •DNA polimerasa II y III (función principal en
              la síntesis)
                  •Añade bases en ambas cadenas en la
                  dirección 5’   3’
                  •Requiere un 3’ OH final
          •Eucariotas
              •5 polimerasas
                  • y principal en replicación
                  • , y exonucleasas
          •Corrección de pruebas: actividad 3’      5’
          exonucleotídica. Sustituye bases mal emparejadas
          (10-5) por correctas (10-7); mecanismos de reparación
                 adicionales la reducen hasta 10-10
Dr. Antonio Barbadilla

                                                      Tema 6: Estructura y replicación del   34
                34                                             material genético
3’   5’
                          Las polimerasas
                         conocidas añaden
                            nucleótidos
                          solamente en la
                         dirección 5’   3’




Dr. Antonio Barbadilla

                                                       Tema 6: Estructura y replicación del   35
                35                                              material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   36
                36                material genético
¿Por qué no hay una enzima que
                         polimerice en la dirección 3´-> 5?

                     No funcionaría la corrección de errores por
                       falta de un trifosfato que suministre la
                     energía de enlace covalente azúcar-fosfato




Dr. Antonio Barbadilla

                                             Tema 6: Estructura y replicación del   37
                37                                    material genético
Adición 5’3’




Dr. Antonio Barbadilla

                                 Tema 6: Estructura y replicación del   38
                38                        material genético
P

                         P

                                      P

                                            P

                                                        P


                                                                 P


                                                                              P




                                                                                                     P
                 P




                                                                                           P
 OH




                                                   OH
                                           P
            P

                         P

                                 P
       5’                        3’
                                      PP   + H2O
                             P

                                      P

                                               P

                                                        P


                                                                  P


                                                                               P




                                                                                                     P
                  P
                  P




                                                                                           P
  OH




                                                            OH



Dr. Antonio Barbadilla

                                                             Tema 6: Estructura y replicación del   39
                                           P

                                                    P
             P

                         P

                                  P




                39                                                    material genético
Adición 3’5’
                          (hipotética)




Dr. Antonio Barbadilla

                                 Tema 6: Estructura y replicación del   40
                40                        material genético
P




                                                P
     P




                                     P

                                            P




                                                         P

                                                                      P

                                                                                  P
                          P




                                                                                            OH
OH


          P
          P

                          P
                          P

                              P
                              P

                                      P
                                      P
     3’                       5’

                               PP   + H2O
                              P




                                                P
     P




                                     P

                                            P




                                                         P

                                                                      P

                                                                                  P
                          P




                                                                                            OH
                                                      Adición 3’5’
OH




                                                       (hipotética)
          P
          P

                          P
                          P

                              P
                              P

                                      P
                                      P

                                            P
                                            P




 Dr. Antonio Barbadilla

                                                Tema 6: Estructura y replicación del   41
                 41                                      material genético
Corrección de errores




Dr. Antonio Barbadilla

                                     Tema 6: Estructura y replicación del   42
                42                            material genético
P
                 P

                         P

                                      P

                                            P

                                                        P


                                                                 P


                                                                              P

                                                                                           P

                                                                                                     P
 OH




                                                   OH
                                           P
            P

                         P

                                 P
       5’                        3’
                                      PP   + H2O
                             P

                                      P

                                               P

                                                        P


                                                                  P


                                                                               P




                                                                                                     P
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                                                                    Adición 5’3’
                                                            OH



Dr. Antonio Barbadilla

                                                             Tema 6: Estructura y replicación del   43
                                           P

                                                    P
             P

                         P

                                  P




                43                                                    material genético
P
     P

                          P

                              P

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                                                                                        OH
OH


          P
          P

                          P
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                                    P
                                    P
     3’                       5’




                                   Adición 3’5’
 Dr. Antonio Barbadilla




                 44
                                    (hipotètica)
                                            Tema 6: Estructura y replicación del
                                                     material genético
                                                                                   44
Replicación del DNA (2)
 •Replicación: continua (cadena adelantada, cebador
 sólo inicio) y discontinua (cadena retrasada)

           •Discontinua
              •Cebador (pequeño RNA 2-60 nucleótidos
              añadido por enzima primasa o RNA pol que
              provee 3’ OH.
              •Fragmento de Okazaki por DNA pol III
              (1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas)
              •Pol I elimina cebador 3’ -> 5’ y llena huecos
              (gap)
              •Ligación (DNA ligasa, enlace fosfodiéster)
Dr. Antonio Barbadilla

                                        Tema 6: Estructura y replicación del   45
                45                               material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   46
                46                material genético
Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   47
                47                material genético
Polimerasa III




                                                 Polimerasa I




Dr. Antonio Barbadilla

                         Tema 6: Estructura y replicación del   48
                48                material genético
¿Por qué el cebador es RNA?



             El cebador es más proclive al error, por
                lo que debería eliminarse y el RNA
                   puede detectarse y eliminarse
                    fácilmente por la DNApol I




Dr. Antonio Barbadilla

                                         Tema 6: Estructura y replicación del   49
                49                                material genético
Replicación del DNA (3)
                     El replisoma: complejo enzimático de la
                     replicación que coordina la síntesis de las
                     dos cadenas, maquinaria molecular
                     •Dímero de la DNA pol III (núcleos
                     catalíticos)
                     •Primosoma: formado por dos enzimas
                           •Primasa
                           •Helicasa (desenrolla el DNA)
                     •Proteína de unión a cadena sencilla, ssb
                     (Unión Y, estabiliza el DNA de cadena
                     sencilla)
                     •Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena)
                     y II (rotura de dos cadenas) junto a DNA
                     ligasa -> Relajación del superenrollamiento50
Dr. Antonio Barbadilla

                                               Tema 6: Estructura y replicación del
                50                                           material genético
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria




Dr. Antonio Barbadilla

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                51                                                 material genético
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria




Dr. Antonio Barbadilla

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El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria


                                    DNA pol III + abrazadera beta -> Enzima procesiva




Dr. Antonio Barbadilla

                                                          Tema 6: Estructura y replicación del   53
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El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria




Dr. Antonio Barbadilla

                                                          Tema 6: Estructura y replicación del   54
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Topoisomerasas




Dr. Antonio Barbadilla

                                          Tema 6: Estructura y replicación del   55
                55                                 material genético
Replicación del DNA (4)
         •Origen de replicación:
            •Secuencia reconocida (Ori C en E. coli) por
            proteínas iniciadoras. Varios orígenes en
            eucariotas
            •La replicación es bidireccional



Horquilla
replicación




Dr. Antonio Barbadilla

                                         Tema 6: Estructura y replicación del   56
                56                                material genético
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de
                         replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada
                             unidad de replicación es un replicón. La replicación es
                                                 bidireccional




Dr. Antonio Barbadilla

                                                        Tema 6: Estructura y replicación del   57
                57                                               material genético
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de
                         replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada
                             unidad de replicación es un replicón. La replicación es
                                                 bidireccional




Dr. Antonio Barbadilla

                                                        Tema 6: Estructura y replicación del   58
                58                                               material genético
Links de interés
                         Watson-Crick original paper (1953 Nature)
                         Trabajos estelares del descubrimiento de la doble
                         hélice
                         DNA: el secreto de la vida (Animación)
                         Celebración 50 aniversario descubrimiento de la
                         doble hélice en la UAB
                         DNA Structure
                         The Search for DNA - The Birth of Molecular
                         Biology
                         Image Library of Biological Macromolecules - DNA
                         DNA berkeley
                         DNA Learning Center
                         Beginner's guide to Molecular Biology
                         Glosario de Genética molecular
                         DNA Replication
                         Animación de la replicación
Dr. Antonio Barbadilla

                                                       Tema 6: Estructura y replicación del   59
                59                                              material genético

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Esructura y replicacion del material genetico

  • 1. Estructura y replicación del material genético Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del material genético 1 1
  • 2. Objetivos tema 6: Estructura y replicación del material genético Deberán quedar bien claros los siguientes puntos: •Cómo se descubrió la naturaleza química del material hereditario •La composición química de los ácidos nucleicos •La estructura 3D del DNA: naturaleza complementaria y antiparalela de la doble cadena del ácido desoxirribonucleico (DNA) •La extraordinaria capacidad explicativa del modelo del DNA de la función biológica fundamental de esta molécula •La replicación semiconservativa •Enzimología de la replicación Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 2 2 material genético
  • 3. La transformación bacteriana en Streptococcus pneumoniae (Griffith 1928) Rugosa Muerte por neumonía Cepa resistente Lisa Dr. Antonio Barbadilla No muere Tema 6: Estructura y replicación del Muere 3 3 material genético
  • 4. ¿Cuál es el Principio transformante? Principio Rugosa Lisa Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 4 4 material genético
  • 5. Colin MacLeod El elemento transformante Maclyn McCarty es el DNA (1944) Oswald Avery Ver animación experimento tranformación bacteriana Dr. Antonio Barbadilla Sólo DNA produce transformación 6: Estructura y replicación del Tema 5 5 material genético
  • 6. Experimento de Alfred Hershey y Martha Chase con fagos (1952) Bacteriófago T4 El DNA es el material infeccioso Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 6 6 material genético
  • 7. Componentes de los ácidos nucleicos adenina timina guanina citosina Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 7 7 material genético
  • 8. Reglas de Chargaff 1. Proporción de purinas = Proporción de pirimidinas A+G=C+T 2. A=T 3. G=C Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 8 8 material genético
  • 9. 1953. Año culminante: J. Watson y F. Crick resuelven la estructura tridimensional del DNA (Nature 171: 737-738) Watson y yo hemos encontrado el secreto de la vida Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 9 9 material genético
  • 10. 1953. Año culminante: Dos líneas de evidencia: •Reglas de Chargaff •Fotografías de difracción de rayos X Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 10 10 material genético
  • 11. Significado reglas de Chargaff Complementariedad de lasEstructura y replicación del Tema 6: bases Dr. Antonio Barbadilla 11 11 material genético
  • 12. Difracción de rayos X Hemoglobina Linus Pauling Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 12 12 material genético
  • 13. Interpretación del patrón difracción de rayos X del DNA Rosalind E. Franklin Dr. Antonio Barbadilla Crick Tema 6: Estructura y replicación del 13 13 material genético
  • 14. Modelo en metal del DNA J. Watson y F. Crick Concluyen: La estructura del DNA es una doble hélice, formada por cadenas orientadas en direcciones opuestas (antiparalelas). La estructura se mantiene gracias a enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas que se encuentran orientadas hacia el interior de las Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 14 14 cadenas material genético
  • 15. Doble hélice, formada La estructura se mantiene gracias por cadenas orientadas a enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas que se en direcciones opuestas encuentran orientadas hacia el Dr. Antonio Barbadilla (antiparalelas). interior de las cadenas15 Tema 6: Estructura y replicación del 15 material genético
  • 16. Desnaturalización del DNA •Separación de las dos hebras por calor •Una mayor proporción G-C tiene una mayor temperatura de desnaturalización (‘fusión’) 100 Porcentaje G + C 80 60 40 20 Dr. Antonio Barbadilla 70 80 90 100 110 Temperatura de fusión (desnaturalización) Tema 6: Estructura y replicación del 16 16 material genético
  • 17. Dr. Antonio Barbadilla Hélices levógiras y dextrógiras Tema 6: Estructura y replicación del 17 17 material genético
  • 18. DNA-B dextrógira Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 18 18 material genético
  • 19. Ver artículo Nature 1953 Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 19 19 material genético
  • 20. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 20 20 material genético
  • 21. La estructura del DNA suministra una explicación asombrosamente simple del fenómeno de la herencia La estructura explica: •La naturaleza de la secuencia lineal de los genes (información digital cuaternaria en secuencias unidimensionales de monómeros A,T,G,C) •El mecanismo de replicación exacta de los genes •La naturaleza química de las mutaciones •Por qué la mutación, la recombinación y la expresión génica son fenómenos separables a nivel molecular Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 21 21 material genético
  • 22. Esencial a la relación íntima entre estructura molecular y función genética del DNA es el concepto de molde La complementariedad de las bases nitrogenadas permite que la secuencia de una cadena sencilla de DNA actúe como un molde para la formación de una copia complementaria de DNA (replicación) o de mRNA (transcripción) Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 22 22 material genético
  • 23. Y ahora las declaraciones de Watson y Crick sobre el ADN. Esto es para mí la prueba verdadera de la existencia de Dios Salvador Dalí Antes pensábamos que nuestro futuro estaba en las estrellas. Ahora sabemos que está en nuestros genes. James Watson Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 23 23 material genético
  • 24. Una estructura tan bonita tenía, por fuerza, que existir Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 24 24 material genético J. Watson
  • 25. Una estructura tan bonita tenía, por fuerza, que existir Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del J. 25 Watson 25 material genético
  • 26. El DNA contiene información digital cuaternaria en secuencias unidimensionales de monómeros A,T,G,C Dr. Antonio Barbadilla (cristal aperiódico) 26 Tema 6: Estructura y replicación del material genético 26
  • 27. Hay grandeza en esta concepción de la vida,... que mientras este planeta ha ido girando según la constante ley de la gravitación, se han desarrollado y se están desarrollando, a partir de un comienzo tan una molécula helicoidal asombrosa, infinidad de formas sencillo, infinidad de formas cada vez más cada vez más bellas bellas y maravillosasy maravillosas Charles Darwin Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 27 27 material genético
  • 28. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 28 28 material genético
  • 29. Replicación del DNA Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 29 29 material genético
  • 30. 25 de Abril 1953 It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 30 30 material genético
  • 31. Posibles modelos de replicación Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 31 31 material genético
  • 32. Replicación del DNA •Semiconservativa: una cadena sirve de molde para una nueva cadena •El experimento de M. Meselson y F. Stahl (1958) demuestra que la replicación es semiconservativa Mathew Meselson Frank Stahl Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 32 32 material genético
  • 33. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 33 33 material genético
  • 34. Replicación del DNA •Enzimas que sintetizan (replican) el DNA •E. coli •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara) •DNA polimerasa II y III (función principal en la síntesis) •Añade bases en ambas cadenas en la dirección 5’ 3’ •Requiere un 3’ OH final •Eucariotas •5 polimerasas • y principal en replicación • , y exonucleasas •Corrección de pruebas: actividad 3’ 5’ exonucleotídica. Sustituye bases mal emparejadas (10-5) por correctas (10-7); mecanismos de reparación adicionales la reducen hasta 10-10 Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 34 34 material genético
  • 35. 3’ 5’ Las polimerasas conocidas añaden nucleótidos solamente en la dirección 5’ 3’ Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 35 35 material genético
  • 36. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 36 36 material genético
  • 37. ¿Por qué no hay una enzima que polimerice en la dirección 3´-> 5? No funcionaría la corrección de errores por falta de un trifosfato que suministre la energía de enlace covalente azúcar-fosfato Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 37 37 material genético
  • 38. Adición 5’3’ Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 38 38 material genético
  • 39. P P P P P P P P P P OH OH P P P P 5’ 3’ PP + H2O P P P P P P P P P P OH OH Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 39 P P P P P 39 material genético
  • 40. Adición 3’5’ (hipotética) Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 40 40 material genético
  • 41. P P P P P P P P P OH OH P P P P P P P P 3’ 5’ PP + H2O P P P P P P P P P OH Adición 3’5’ OH (hipotética) P P P P P P P P P P Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 41 41 material genético
  • 42. Corrección de errores Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 42 42 material genético
  • 43. P P P P P P P P P P OH OH P P P P 5’ 3’ PP + H2O P P P P P P P P P P OH Adición 5’3’ OH Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 43 P P P P P 43 material genético
  • 44. P P P P P P P P P OH OH P P P P P P P P 3’ 5’ Adición 3’5’ Dr. Antonio Barbadilla 44 (hipotètica) Tema 6: Estructura y replicación del material genético 44
  • 45. Replicación del DNA (2) •Replicación: continua (cadena adelantada, cebador sólo inicio) y discontinua (cadena retrasada) •Discontinua •Cebador (pequeño RNA 2-60 nucleótidos añadido por enzima primasa o RNA pol que provee 3’ OH. •Fragmento de Okazaki por DNA pol III (1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas) •Pol I elimina cebador 3’ -> 5’ y llena huecos (gap) •Ligación (DNA ligasa, enlace fosfodiéster) Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 45 45 material genético
  • 46. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 46 46 material genético
  • 47. Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 47 47 material genético
  • 48. Polimerasa III Polimerasa I Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 48 48 material genético
  • 49. ¿Por qué el cebador es RNA? El cebador es más proclive al error, por lo que debería eliminarse y el RNA puede detectarse y eliminarse fácilmente por la DNApol I Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 49 49 material genético
  • 50. Replicación del DNA (3) El replisoma: complejo enzimático de la replicación que coordina la síntesis de las dos cadenas, maquinaria molecular •Dímero de la DNA pol III (núcleos catalíticos) •Primosoma: formado por dos enzimas •Primasa •Helicasa (desenrolla el DNA) •Proteína de unión a cadena sencilla, ssb (Unión Y, estabiliza el DNA de cadena sencilla) •Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena) y II (rotura de dos cadenas) junto a DNA ligasa -> Relajación del superenrollamiento50 Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 50 material genético
  • 51. El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 51 51 material genético
  • 52. El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 52 52 material genético
  • 53. El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria DNA pol III + abrazadera beta -> Enzima procesiva Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 53 53 material genético
  • 54. El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 54 54 material genético
  • 55. Topoisomerasas Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 55 55 material genético
  • 56. Replicación del DNA (4) •Origen de replicación: •Secuencia reconocida (Ori C en E. coli) por proteínas iniciadoras. Varios orígenes en eucariotas •La replicación es bidireccional Horquilla replicación Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 56 56 material genético
  • 57. En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada unidad de replicación es un replicón. La replicación es bidireccional Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 57 57 material genético
  • 58. En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada unidad de replicación es un replicón. La replicación es bidireccional Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 58 58 material genético
  • 59. Links de interés Watson-Crick original paper (1953 Nature) Trabajos estelares del descubrimiento de la doble hélice DNA: el secreto de la vida (Animación) Celebración 50 aniversario descubrimiento de la doble hélice en la UAB DNA Structure The Search for DNA - The Birth of Molecular Biology Image Library of Biological Macromolecules - DNA DNA berkeley DNA Learning Center Beginner's guide to Molecular Biology Glosario de Genética molecular DNA Replication Animación de la replicación Dr. Antonio Barbadilla Tema 6: Estructura y replicación del 59 59 material genético