1. DISCREPANCY IN GENOTYPING OF APOLIPOPROTEIN E BETWEEN ALLELE-SPECIFIC PCR AND FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER OR SEQUENCINGChang-Hun Park, M.D GLORIA STHEFANY TORRES DAZA TERCER SEMESTRE SEPTIEMBRE, 2010

2. INTRODUCTION

3. GENERAL OBJECTIVE Determinate the discrepancy in Genotyping of Apolipoprotein E between Allele-Specific PCR and Fluorescence Resonance Energy Transfer or Sequencing

4. MATERIALES Y MÉTODOS

5. RESULTADOS Se observaron dos casos en los que los resultados de la PCR (AS-PCR) del gen de la APOE no fueron consistentes con los de la resonancia de fluorescenciaTransferencia de energía (FRET) o secuenciación. En estos casos, la genotipificación por AS-PCR mostró que los pacientes fueron homocigotos ε2, mientras que el análisis y la secuenciación FREET demostró que eran ε2/ε3 heterocigotos.

6. FIGURa2

7. FIGURa3

8. FIGURa4

9. DISCUSSION

10. CONCLUSSION Sequencing analysis, As-PCR and FREET are a very important methods, to study the genotype. Sequencing analysis showed errors in genotyping when AS-PCR using the ApoE Genotyping. The ε2 homozygous result requires further evaluation by other methods because that can avoid an error. Evaluation of the results from the AS-PCR and FRET analyses indicated a discrepancy in the results. (AS-PCR, ε2 homozygous; FRET, ε2/ε3 heterozygous).

11. GRACIAS