La biorremediación utiliza organismos vivos como bacterias, hongos, plantas y nemátodos para restaurar ambientes contaminados eliminando contaminantes orgánicos. La biorremediación es diferente de la depuración porque restaura ecosistemas ya contaminados en lugar de eliminar contaminantes antes de que alcancen el medio ambiente. Los microorganismos, especialmente las bacterias con su gran capacidad metabólica, son los organismos más usados en biorremediación pudiendo degradar una amplia variedad de compuestos orgánicos.