la tecnología

1. La Química y las Supercomputadoras Dr. Jorge Garza Olguín Coordinador del Laboratorio de Supercómputo y Visualización en Paralelo Universidad Autónoma Metropolitana - Iztapalapa

3. Industria Farmacéutica

4. Biomoléculas

5. Partes de una computadora: * Monitor * Teclado * CPU - Memoria RAM - Memoria en Disco Duro - Procesador

7. Sistemas de Memoria Compartida 18 Procesadores R10000 R A M P P P P P

8. Sistemas de Memoria Distribuida CM5 (Thinking Machine) 32 Proces adores R A M P P P P P R R R R R

9. Cúmulos de PCs Nodos Esclavos Nodo Maestro

10. Diferentes tipos de cúmulos * Tareas no concurrentes * Tareas concurrentes Técnicas de Programación * PVM * MPI Diferente conectividad

11. Filosofía de programación con MPI Maestro Paso de Mensaje Paso de mensaje: Terminación de tareas, paso de datos

12. Dentro de un programa se puede paralelizar solamente una parte Empieza programa ... Empieza MPI ... Termina MPI ... Final del programa

13. Ancho de Banda y Latencia En todos los nodos se ejecuta el mismo programa Cada nodo está etiquetado cuando transcurre el proceso

14. Diferentes tipos de conectividad * Fast Ethernet (10-100 Mb/s) * Gigabit Ethernet ( > 1000 Mb/s) * Giganet * Myrinet * Quadrics TCP/IP > 1000 Mb/s

15. Primer Cúmulo en la UAMI (2000): Presupuesto : $71,000.00 USD 20 nodos duales Pentium III * 1 GHz * 1 Gb RAM 1 Switch Giganet con 3 2 P uertos 1.25 Gb/s 24 Tarjetas de red cLAN Giganet

17. Software: * SO/LINUX * GNU compilers * NWChem * Gaussian 98 * DFT++

18. CO 3 = HF/aug-cc-pV T Z (220 basis set functions)

19. Dipéptido de Alanina MP2/6-311G** 8 procesadores SP2: 7000 s/iter Izta: 5300 s/iter 252 funciones de base

20. Cúmulo de Xeones (2003) * 32 Procesadores Xeon a 2.8 GHz Conectado con un swicth Gigabit Ethernet * 64 Procesadores Xeon a 2.8 GHz Conectados con un switch Myrinet

22. * Cúmulo de G5 (2004) 12 procesadores G5 * Cúmulo de Itanium (2004) 12 procesadores Itanium 2

23. SGI GRID PIII X-I X-II It2 G5 Master Node

26. Directorio Dr. Tomás Viveros Dr. Jorge Garza [email_address] Dr. Andrés Cedillo [email_address] Dr. Enrique Díaz [email_address] Ing. Juan Carlos Rosas [email_address]