Varias especies silvestres del Ecuador se encuentran amenazadas o en peligro de extinción debido a la deforestación, el comercio ilegal y la cacería furtiva. Entre ellas se encuentran el tutú, el tatú carreta y el lince, cuyas poblaciones han disminuido por la perturbación y caza de sus hábitats. Otras especies en riesgo son el oso panda, la pava aliblanca y la cortar rama peruana, cuya supervivencia depende de la protección de sus bosques nativos.