Bollullos del Condado fue poblado desde el Paleolítico. Durante la Edad Media fue dominio musulmán hasta su conquista por Alfonso X en el siglo XIII. Ha sufrido epidemias de peste en los siglos XI y XII. En los siglos XVIII y XX prosperó gracias a la producción de vino. Actualmente es parte de la provincia de Huelva y cuenta con parcelaciones agrícolas desde finales de los años 1920.