Las expediciones desde Panamá resultaron en el descubrimiento y conquista de Nicaragua y Perú. Las Reales Audiencias fueron los más altos tribunales judiciales en las Indias y estaban ubicados en Santo Domingo, México y Panamá. El hallazgo de oro en California y la construcción del ferrocarril hicieron que la zona de tránsito en Panamá se desarrollara de nuevo y los negocios como el transporte florecieran.