El escudo de la Iglesia Nacional Presbiteriana de México contiene varios símbolos cristianos. En el centro hay una coraza protectora que contiene una zarza ardiente, un cayado pastoral, una antorcha con 7 estrellas y un lema bíblico. También incluye ramas de laurel y olivo, una Biblia abierta, una paloma descendente y las letras que forman el nombre oficial de la iglesia, todo enmarcado en un círculo de color azul.

1. Nuestro Escudo Al centro una coraza protectora, dentro de la cual se ubican los símbolos siguientes:

2. Nuestro Escudo En la parte superior izquierda, el emblema de la zarza ardiente, que significa la supervivencia e indestructibilidad de la Iglesia al través de los siglos.

3. Nuestro Escudo En el centro, y en forma diagonal, de derecha a izquierda, el cayado o bastón del Pastor, que significa tanto la guía como la obra eficaz del Buen Pastor, así como la vocación para aquellos que son llamados a dirigir el Rebaño de Dios.

4. Nuestro Escudo En la parte inferior derecha, una antorcha encendida, inclinada hacia la derecha que representa con su llama incandescente de una fe verdadera (sola fide) puesta en el único Dios verdadero. Esta antorcha está rodeada por las 7 estrellas indicadas en el libro del Apocalipsis, lo cual implica también la universalidad de la Iglesia en el tiempo y en el espacio.

5. Nuestro Escudo Debajo de las ramas y dentro de una franja de tres ondulaciones, el lema oficial de la Iglesia en español el cual en forma oficial se enuncia así: «LA LUZ EN LAS TINIEBLAS RESPLANDECE» Basado en el Evangelio de San Juan 1:5

6. Nuestro Escudo En la parte inferior, e inmediatamente después de la coraza protectora, hacia la izquierda la rama de laurel y hacía la derecha la rama de olivo que significan–la rama de olivo– la realidad de una vida de paz, unidad, armonía y perpetuidad de la Iglesia y, la rama de laurel, la vida victoriosa de la Iglesia,

7. Nuestro Escudo En la parte superior de la coraza protectora, en medio de su línea superior, una Biblia abierta, que significa la centralidad de la Palabra de Dios, reconocida por la Iglesia, como la suprema autoridad en cuestiones de fe y práctica y uno de los principios fundamentales de la Reforma del Siglo XVI: Sola Scriptura.

8. Nuestro Escudo Como coronación de todo el escudo, la paloma descendente con sus alas extendidas, rodeada de rayos de luz, lo cual significa la presencia permanente del Espíritu Santo, quien da vida y energía espiritual a la Iglesia y la capacita para cumplir su misión en el mundo.

9. Alrededor de todo lo antes descrito y formando un circulo yen letras mayúsculas, el nombre oficial de la iglesia: IGLESIA NACIONAL PRESBITERIANA DE MEXICO, A. R.

10. Enmarcando todos estos símbolos, en un círculo perfecto de azul rey.