Los Sistemas de Información Geográfica constituye una herramienta fundamental en el desarrollo y gestión de la pesquería y el monitoreo del medio ambiente. Actualmente, toda la información georeferenciada que genera el Instituto del Mar del Perú, es procesada y analizada usando SIG, se ha desarrollado aplicativos para cada área de investigación, siendo los principales en la evaluación de recursos pesqueros, seguimiento de embarcaciones pesqueras usando el sistema satelital y monitoreo del medio ambiente marino empleando imágenes de satélite. Se viene implementado un Sistema de Información Geográfica Pesquero, que integre todas las bases de datos y su publicación vía web.