EndNote Web es un gestor de referencias basado en la web que permite a los investigadores y estudiantes gestionar hasta 10,000 referencias, importarlas manualmente o desde otros recursos, exportarlas, buscar referencias, organizarlas y compartirlas con otros, crear bibliografías e insertar citas en documentos. Se accede a través de la página Web of Knowledge o directamente en myendnoteweb.com y requiere registrarse en WOK.